H6亚型禽流感病毒血凝素蛋白线性表位的预测与鉴定

应用生物信息学方法预测H6亚型禽流感病毒血凝素蛋白(HA)线性抗原表位,并对所获表位的免疫原性进行初步鉴定,为流感病毒表位疫苗研制和H6亚型特异性ELISA检测方法奠定基础。依据近年流感病毒流行趋势,从GenBank下载具有代表性的H6、H5、H7和H9亚型禽流感病毒血凝素蛋白的氨基酸序列。利用DNA Star软件进行H6同亚型间氨基酸序列保守性分析,再将H6与H5、H7、H9不同亚型之间氨基酸同源性进行比较,然后借助在线服务器ExPASy和IEDB对序列进行抗原性、亲水性、柔韧性、二级结构和表面可及性预测。最后去除H6与H5、H7、H9亚型氨基酸同源区域,选择H6亚型氨基酸相对保守区域并且抗原表位综合预测结果较优的几个片段,所选择表位长度为15个氨基酸。合成所获得的优势线性表位,并用间接ELISA方法对所获表位的免疫原性进行鉴定。预测后获得4个线性抗原表位,经鉴定免疫原性最好的为表位A,最差的为表位B。     

猴免疫缺陷病毒p27蛋白单克隆抗体结合抗原表位的鉴定

为鉴定抗猴免疫缺陷病毒(SIV)衣壳蛋白p27单克隆抗体(MAb) p27-A5、p27-C7和p27-D2所识别的抗原表位,本研究通过间接ELISA法相加试验对这3株MAbs结合抗原表位进行初步分析,并利用部分重叠的短肽对MAbs的结合抗原表位进行鉴定.结果表明p27-C7和p27-A5的结合抗原表位位于p27蛋白的aa61～aa76(氨基酸序列为61SEGCTPYDINQMLNCV76);p27-D2的结合抗原表位则位于aa191～aa206(氨基酸序列为191EQTDAAVKNWMTQTLL206).该结果为进一步深入了解p27的抗原特性和建立该蛋白的检测方法奠定了基础.     

抗原表位研究方法进展

抗原表位是抗原分子中的主要功能单位,能有效刺激机体的细胞免疫和体液免疫。随着免疫学和生物信息学技术的不断发展,用于研究T细胞表位和B细胞表位的方法得到了很大的提高。论文中概述了近几年用于研究T细胞表位的预测方法和鉴定方法,以及在B细胞表位研究中所用的表位肽扫描技术、蛋白质"切割"法、噬菌体展示技术、X-衍射与核磁共振、表位预测方法等技术,并对每种研究方法进行了比较,为从事抗原表位研究的人员提供参考,从而更有利于表位肽疫苗的研制和诊断方法的建立。     

猪繁殖与呼吸综合征病毒GP5羧基端抗原表位的鉴定

为了鉴定和分析猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)GP5羧基端的抗原表位，采用Goldkey软件分析PRRSV GP5羧基端抗原表位，经人工合成的方法获得编码GP5的部分基因，Eag Ⅰ酶切后插入经Eag Ⅰ线性化处理的噬菌体M13KE gⅢ克隆载体，转化至ER2738细胞，得到多株重组噬菌体，提取噬菌体的ssDNA进行PCR及序列鉴定，获得了展示GP5羧基端11个氨基酸的重组噬菌体，用PRRS阳性血清检测重组噬菌体，结果显示噬菌体展示的表位可被PRRSV感染血清所识别，从而证明GP5羧基末端的11个氨基酸是PRRSV的一个抗原表位。     

鹅细小病毒VP3蛋白B细胞线性表位的精确定位

本试验旨在利用获得的4株抗鹅细小病毒(GPV)VP3的单克隆抗体,进一步对GPV VP3 B细胞线性抗原表位精确定位。根据笔者实验室已鉴定的线性抗原表位区结果,筛选出单抗所针对的优势抗原表位区。设计并合成互相重叠5 aa的10 aa短肽寡聚核酸片段,退火后,连入pET-32a载体,经转化鉴定,诱导表达后,获得相应的小片段融合蛋白,并利用单抗通过Western blot进行抗原性鉴定。同样方法进行短肽片段两端氨基酸的逐个缺失设计,进一步精确定位,结果鉴定出2个抗原表位,分别为430-435 aa和643-647 aa。     

口蹄疫O型、亚洲Ⅰ型二价合成肽疫苗对山羊免疫持续期的研究

合成肽疫苗即是根据免疫抗原表位的氨基酸序列合成的抗原决定基小肽制作的疫苗。一般是从蛋白质的一级结构并结合单克隆抗体的分析,推导出蛋白质免疫主要抗原表位的氨基酸顺序,然后合成或基因工程表达这一段肽作为抗原。     

猪δ冠状病毒RBD蛋白多肽抗体的制备与鉴定

【目的】设计合成猪δ冠状病毒(Porcine deltacoronavirus, PDCoV)受体结合结构域(receptor binding domain, RBD)的抗原表位,制备并鉴定多克隆抗体。【方法】为了特异性检测PDCoV RBD抗原,应用生物信息学技术预测其潜在抗原表位,将表位氨基酸序列与δ冠状病毒属中的其他15株病毒株以及14株其他猪冠状病毒株进行相似性比对,将筛选的优势抗原表位与载体蛋白血蓝蛋白(keyhole limpet hemocyanin, KLH)偶联,合成多肽并免疫小鼠,制备PDCoV RBD特异性抗体。通过Western blotting试验对不同系统表达的PDCoV RBD以及PDCoV、TGEV和PEDV感染ST细胞表达的S蛋白进行鉴定,通过间接ELISA方法测定抗体效价。【结果】经序列比对,利用生物信息学技术预测合成的表位抗原与δ冠状病毒属中的其他15株病毒株(0～14.28%)以及14株其他猪冠状病毒株(0～7.14%)序列相似性非常低,具有良好的保守性;Western blotting结果显示,制备的多肽抗体1∶500、1∶1 000、1∶2 ...     

鸭坦布苏病毒E蛋白抗原表位的鉴定及其表位交叉反应性分析

为鉴定鸭坦布苏病毒(DTMUV)E蛋白的抗原表位,本研究以纯化的抗DTMUV E蛋白单克隆抗体(MAb)3B6为固相筛选分子,对噬菌体随机12肽库进行淘选,通过对阳性噬菌体克隆测序分析,确定DTMUV E蛋白的模拟表位氨基酸序列,将模拟表位序列与GST蛋白融合表达并进行western blot验证。利用DNAStar对表位序列进行同源性分析,并通过dot blotting方法分析抗原表位在黄病毒阳性血清间的交叉反应性。结果鉴定了DTMUV E蛋白的一个线性抗原表位EVEPPFG,并且该表位在DTMUV与其它黄病毒中均具有高度的保守性。Dot blotting结果显示抗原表位EVEPPFG在黄病毒阳性血清间具有交叉反应性。因此,EVEPPFG为黄病毒共享型的抗原表位,这对于黄病毒E蛋白的抗原结构功能的研究以及研制表位疫苗和诊断抗原等具有重要意义。     

口蹄疫O型、亚洲I型二价合成肽疫苗对山羊免疫持续期的研究

合成肽疫苗即是根据免疫抗原表位的氨基酸序列合成的抗原决定基小肽制作的疫苗。一般是从蛋白质的一级结构并结合单克隆抗体的分析，推导出蛋白质免疫主要抗原表位的氨基酸顺序，然后合成或基因工程表达这一段肽作为抗原。     

细胞的抗原表位研究方法

多表位疫苗有望成为预防多种病原体感染的理想疫苗,因而被认为是将来疫苗的发展方向。抗原表位是研究抗原的免疫机制和表位疫苗的基础,近年来在表位研究方面取得了一些可喜的进展,特别是抗原表位的研究方法。B细胞表位的研究方法已经不局限于通过交叠合成多肽进行研究,又诞生了噬菌体随机肽库以及表位预测等方法;在T细胞抗原表位的研究方面也有了相应的预测方法,尤其是将ELISPOT试验、体外抗原提呈试验等应用于T细胞表位活性的鉴定,极大的促进了T细胞表位的研究进展。文章全面系统地对B细胞表位与T细胞表位的研究方法的进展进行了综述。旨在为表位和表位疫苗的研究提供先进的多种技术方法。     

猪内源氨基酸测定技术评述

氨基酸的真消化率是评价饲料蛋白质生物学效价的重要指标,而要测定氨基酸的真消化率,就必须对内源氨基酸排泄量进行估测。本文就目前内源氨基酸的测定方法进行了综述,并对各种方法的优缺点进行了评述。在内源氨基酸的测定方法中,以传统方法(无氮日粮法、回归外延法和完全可消化蛋白源或静脉灌注平衡氨基酸法)最为常用,但存在种种缺陷。为克服传统方法的缺陷,学者们提出了新的估测内源氨基酸的方法,如同位素标记法、高精氨酸法、肽营养超滤技术、氨基糖测定法以及体内体外结合测定法,但这些方法也存在或多或少的缺陷,还有待于改进。     

狂犬病病毒鹿源野毒株与人疫苗株G基因的分子差异

本文通过反转录—聚合酶链反应 (RT- PCR)扩增并克隆了我国狂犬病病毒 (RV)鹿源野毒株 (82 0 2 )糖蛋白 (G)基因膜外主要功能区的两个片段 ,共 742个 bp(40 5～ 1 1 46) ,含有可以诱导中和抗体的多个抗原决定簇和决定毒力及与神经细胞受体结合部位的基因片段。采用 Sanger双脱氧终止法测定了克隆 c DNA片段的核苷酸序列并推导出了氨基酸序列。将82 0 2株与已发表的人疫苗株 (3a G)的相应序列输入计算机进行比较分析。结果表明两者在这一基因片段核苷酸序列和氨基酸序列分子差异很小 ,同源性极高 ,分别为 97%和 95.5% ,抗原决定簇内的氨基酸均未发生改变 ,只是 82 0 2株在 N2 4 7位缺少一糖基化位点。结合流行病学调查可推断 82 0 2株与中国疫苗株属于同源毒株 ,本研究结果提示应用人狂犬病疫苗预防鹿狂犬病将具有很好效果。     

Purification and comparison of corticosteroid-induced and intestinal isoenzymes of alkaline phosphatase in dogs

Corticosteroid-induced alkaline phosphatase (CALP) and intestinal alkaline phosphatase (IALP) from dogs were purified to homogeneity, as determined by polyacrylamide gel electrophoresis. Purification involved an un-interrupted system using DEAE-cellulose, concanavalin A-agarose, and monoclonal antibody affinity columns. The monoclonal antibody was prepared by use of IALP as the antigen. The 2 isoenzymes were compared, using molecular weight determinations, amino acid analyses, peptide mapping, N-terminal sequencing of the first 10 amino acids, carbohydrate analyses, and recognition by anti-IALP monoclonal antibody. The data indicated that canine IALP and CALP are identical with regard to recognition by monoclonal antibody and N-terminal amino acid sequence, nearly identical in amino acid content and peptide maps, but different in carbohydrate content. It was concluded that CALP is a product of the same gene as IALP and that differences in glycosyl transferase activities between liver and intestines or the presence of glycosidase activities in or around the intestinal mucosae result in the marked difference in carbohydrate content.     

Molecular cloning and structural analysis of the porcine homologue to CD97 antigen

CD97 is a member of a novel subfamily of leukocyte proteins that are characterized by the presence of tandemly repeated extracellular epidermal growth factor (EGF)-like domains and a seven-span transmembrane region, known as EGF-TM7. We here report the cloning of cDNA encoding the pig homologue of CD97. A pig CD97 specific probe was generated by PCR amplification of pig leukocyte cDNA, using primers based on consensus regions among the known sequences of mouse and human CD97. Screening of a pig aorta smooth muscle cDNA library identified one clone containing an open reading frame (ORF) that encoded an 18 amino acid putative signal peptide, a 141 amino acid sequence consisting of three EGF domains, a mucin-like spacer region of 276 amino acid, containing a G-protein coupling motif of 52 amino acids, followed by a 250 amino acid region containing seven membrane spanning domains and a 47 amino acid cytoplasmic tail. The amino acid sequence of the clone was 75, 67 and 59% homologous to cattle, human and mouse CD97 antigen, respectively. Therefore, it was termed pig CD97. Pig CD97 antigen shares many structural features with human, cattle and mouse CD97. RT-PCR analysis of cDNA from different pig cells and tissues showed that CD97 was highly expressed in leukocytes and lymph node cells. This is the first report describing the identification of a member of the EGF-TM7 family in the pig.     

Characteristics of an R antigen common to Streptococcus equi and zooepidemicus

An R antigen of the group C streptococcus S. equi that cross reacts with a similar antigen of S. zooepidemicus has been identified and characterized. It is acid, heat and trypsin resistant, but pepsin sensitive and has an isoelectric point of 4.8. The amino acids in highest concentration are glutamic, aspartic, alanine, leucine, and valine. Bacterial components released in a French Press contain large amounts of R antigen, which is present also in culture supernatants and acid extracts. It has a molecular weight of about 82,000. Trypsin extraction of cells yields molecules of predominantly 56,000 and 25,000 molecular weight that appeared by immunoblotting to be similar to those obtained by trypsinization of purified R protein from preparations derived from the French Press. Although horses naturally infected with S. equi or S. zooepidemicus develop cross reacting R antibodies, the role of the R antigen in pathogenesis is unknown. Purified R protein does not stimulate bactericidal antibody in horses nor is it protective for mice. Its occurrence in antigen preparations in assays for S. equi antibody could be a source of interpretive errors because of the presence in many sera of antibody to the immunologically similar R antigen of S. zooepidemicus, a normal nasopharyngeal commensal of Equidae.     

DNA sequence analysis of glycoprotein G gene of bovine ephemeral fever virus and development of a double oil emulsion vaccine against bovine ephemeral fever

The surface glycoprotein G is considered as the major neutralizing and protective antigen of bovine ephemeral fever virus (BEFV). Comparison of the deduced amino acid sequence of G protein of BEFV isolates during the period 1984-2004 outbreaks in Taiwan showed amino acid substitutions in the neutralizing epitopes. All the isolates differ markedly in the neutralizing epitope at the same amino acid positions compared to the currently available killed vaccine strain (Tn73). Tn88128 strain isolated in 1999 showed the maximum variability of 12 amino acids, 5 amino acid in the neutralization epitope and 7 apart from, respectively. Combinations of both Tn88128 (1999) and commercially available vaccine strain (Tn73) were developed and its safety was evaluated in mice, guinea pigs, calves, and pregnant cows. None of the animals showed any adverse effect or clinical signs. Calves were immunized with commercial vaccine (Tn73) and, combined vaccine (Tn73 and Tn88128), respectively, with adjuvants such as Al-gel and water-in-oil-in-water (w/o/w) oil and PBS alone and challenged with Tn88128 strains. Except PBS administered animals, all the vaccinated animals showed protective immune response. However, animals immunized with combined vaccine plus w/o/w adjuvant elicited stronger neutralization antibodies and long lasting immunity compared to other vaccines.     

评定猪饲料氨基酸生物学效价的方法

回肠末端氨基酸消化率是目前用来表征猪饲料氨基酸生物学效价最适宜的方法。由于后段肠道微生物对蛋白质和氨基酸消化率测值有影响，测定氨基酸的消化率时须从回肠末端取样。为此，学者们先后提出了各种回肠末端取样法，包括屠宰法、瘘管法、回-直肠吻合术等。本文从概念和由来入手，介绍了各种回肠末端取样法，并根据其特点进行了分类说明，比较了各种方法在回肠末端氨基酸表观消化率测定等方面的区别，最后提出了评价各种方法优劣的原则和自己的一些看法，并指出了值得进一步研究的问题。     

北京部分地区猪瘟病毒流行株E2基因序列分析

为了解北京地区猪瘟病毒(CSFV)流行毒株的遗传变异情况,采用套式RT-PCR方法,对从北京部分地区近期分离的7株CSFV流行毒株的E2基因主要抗原编码区进行了扩增、克隆与序列测定,并应用DNA Star分析软件对所测定的7株毒株与国内外参考毒株的相应序列进行了同源性分析及氨基酸序列比对。结果表明,7株CSFV流行毒株之间核苷酸与氨基酸的同源性分别为96.3%～99.3%和95.6%～100%,与CSFV石门毒株(Shimen株)的核苷酸与氨基酸的同源性分别为81.7%～83.5%和82.4%～84.6%,与CSFV兔化弱毒株(HCLV株)的核苷酸与氨基酸的同源性分别为80.6%～81.7%和78.0%～80.2%,7株CSFV流行毒株均属于基因2群,且705、713、729和734位氨基酸发生置换。本研究初步揭示了北京部分地区目前流行的CSFV毒株与Shimen株和HCLV株在E2基因主要抗原区上存在较大差异。     

RHDVCD株VP60主要抗原表位基因的克隆与序列分析

本实验用RHDVCD株人工感染家兔,发病死亡后,取肝脏匀浆,用Trizol试剂从匀浆上清中提取病毒RNA。根据Genbank已发表序列保守区设计并合成引物,采用RT-PCR方法扩增了RHDV衣壳蛋白VP60主要抗原表位基因。PCR产物纯化后,进行序列测定。测序结果表明,VP60主要抗原表位基因长525bp。该序列与已发表的其它13株RHDVVP60同一核苷酸序列及推导的氨基酸序列进行同源性比较。结果显示,CD株核酸序列与WX-84株同源性最高为97．5％,与其它毒株的同源性在92．0％～96．6％之间。氨基酸序列与WX-84株、墨西哥Mexi—co-89株同源性最高为99．4％,与其它毒株的同源性在96．6％N98-3％之间。     

RHDV CD株VP60主要抗原表位基因的克隆与序列分析

本实验用RHDV CD株人工感染家兔,发病死亡后,取肝脏匀浆,用Trizol试剂从匀浆上清中提取病毒RNA。根据Genbank已发表序列保守区设计并合成引物,采用RT-PCR方法扩增了RHDV衣壳蛋白VP60主要抗原表位基因。PCR产物纯化后,进行序列测定。测序结果表明,VP60主要抗原表位基因长525bp。该序列与已发表的其它13株RHDV VP60同一核苷酸序列及推导的氨基酸序列进行同源性比较。结果显示,CD株核酸序列与WX-84株同源性最高为97.5%,与其它毒株的同源性在92.0%～96.6%之间。氨基酸序列与WX-84株、墨西哥Mexi-co-89株同源性最高为99.4%,与其它毒株的同源性在96.6%～98.3%之间。