撒坝猪SLA-DQA基因多态性与生长性状的相关性分析

应用PCR-RFLPs方法检测撒坝猪SLA-DQA基因突变位点多态性,通过最小二乘分析进行基因型与生长性状表型值的相关分析,结果表明SLA-DQA基因3种基因型在所分析的几个阶段体重和6月龄体尺性状上差异均未达到显著水平,且而在0⁴5日龄日增重和70日龄45日龄日增重和70日龄⁴月龄日增重上AA基因型与AB基因型间的差异达到显著水平,大多数生长性状都以BB型的较高。     

畜禽胰岛素样生长因子-Ⅰ基因的研究进展

综述了畜禽胰岛素样生长因子-Ⅰ(insulin-like growth factor-Ⅰ,IGF-Ⅰ)基因在位置、结构及多态性上的研究进展,并初步探讨了IGF-Ⅰ基因与经济性状的关系.     

牦牛MDHⅠ基因多态性及其与生长性状的关联分析

本研究旨在探讨牦牛细胞质苹果酸脱氢酶（cytoplasmic malate dehydrogenase,MDHⅠ）基因的遗传多态性及其与生长性状的关联性,以期为牦牛优良性状选育提供参考依据。选取5个牦牛类群（共178头）,采集耳组织样提取DNA并构建DNA池,对MDHⅠ基因所有外显子设计特异性引物进行扩增测序,用Mega 5.2筛查SNPs位点,直接测序法鉴定其基因型,利用PopGene 32进行χ²独立性检测、基因纯合度（Ho）、基因杂合度（He）、有效等位基因频率（Ne）和多态信息含量（PIC）分析,利用SPSS 24.0分析MDHⅠ基因与牦牛生长性状间的关联性。结果表明,申扎牦牛、类乌齐牦牛、斯布牦牛、帕里牦牛和麦洼牦牛均在外显子8区域发现1个突变位点（G23093C）,属同义突变,有3种基因型：GC、CC和GG,5个牦牛类群中,GC基因型为优势基因型（类乌齐牦牛中GG为优势基因型）,G为优势等位基因（斯布牦牛除外）,在斯布牦牛中,G和C基因频率相等。χ²适应性检验表明,申扎牦牛、类乌齐牦牛、斯布牦牛、帕里牦牛和麦洼牦牛均符合Hardy-Weinberg平衡（P>0.05）。MDHⅠ基因在申扎牦牛、帕里牦牛和斯布牦牛中属于高度多态（PIC>0.5）,在麦洼牦牛和类乌齐牦牛中属于中度多态（0.25 < PIC < 0.5）;纯合度最高的是申扎牦牛和类乌齐牦牛。关联性分析结果表明,MDHⅠ基因不同基因型对类乌齐牦牛、帕里牦牛和麦洼牦牛体重有显著性影响（P<0.05）;且种间分析发现,MDHⅠ基因不同基因型对牦牛体重有显著性影响（P<0.05）,说明该基因可作为人工选育的分子标记。     

撒坝猪部分生长发育性状的典型相关分析

采用SAS统计分析系统对577头撒坝猪的3个体重性状和5个体尺性状进行了典型相关分析。结果表明,体重与体尺性状的第一、第二典型相关系数达到了显著水平(P<0.01),分别为0.9532和0.3044,占总相关的99.97%。体重性状与体尺性状间的相关主要是由于4月龄体重、6月龄体重与6月龄胸围、6月龄腿围的相关引起的。在达到显著水平的两对典型变量中,体重性状的两个典型变量对6月龄体长、胸围和腿围的预测能力较强,体尺性状的两个典型变量对4月龄体重和6月龄体重的预测能力较强,在实际育种中,选择体尺性状可同时达到提高体重性状之目的。     

撒坝猪部分生长发育性状的典型相关分析

采用SAS统计分析系统对577头撒坝猪的3个体重性状和5个体尺性状进行了典型相关分析.结果表明,体重与体尺性状的第一、第二典型相关系数达到了显著水平(P＜0.01),分别为0.9532和0.3044,占总相关的99.97%.体重性状与体尺性状间的相关主要是由于4月龄体重、6月龄体重与6月龄胸围、6月龄腿围的相关引起的.在达到显著水平的两对典型变量中,体重性状的两个典型变量对6月龄体长、胸围和腿围的预测能力较强,体尺性状的两个典型变量对4月龄体重和6月龄体重的预测能力较强,在实际育种中,选择体尺性状可同时达到提高体重性状之目的.     

云南撒坝猪H-FABP基因多态性及与部分生产性能的关系

采用PCR-RFLP技术检测H-FABP基因5′上游区1125~1817区段HinfⅠ酶切位点在撒坝猪群体中的多态性分布,并采用最小二乘分析模型初步统计分析检测位点多态性与部分生产性能的相关性。结果表明,H-FABP基因等位基因H及基因型Hh在群体中占优势,频率分别为0.6022和0.4194;H-FABP基因在群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态;H-FABP基因检测位点基因型间在生长和繁殖性状上不存在不利影响。     

撒坝猪及长撒二元杂猪SLA-DQB基因PCR-RFLP多态性分析

采用限制性内切酶RsaⅠ对云南地方品种撒坝猪及其长撒二元杂猪SLA-DQB基因外显子2的273bp扩增产物进行多态性分析,结果在2种猪中均发现B、C、G3种等位基因,在撒坝猪中发现6种基因型:132bp/84bp/30bp/27bp(BB)、246bp/27bp(CC)、132bp/114bp/27bp(GG)、246bp/132bp/84bp/30bp/27bp(BC)、132bp/114bp/84bp/30bp/27bp(BG)、246bp/132bp/114bp/27bp(CG);长撒二元杂猪中发现5种基因型:BB、CC、BC、BG、CG。经χ2适合性检验,撒坝猪和长撒二元杂猪SLA-DQB基因外显子2在RsaⅠ酶切位点处于Hardy-Weinberg遗传不平衡状态。     

猪IGF-Ⅱ基因SNPs及其与部分生产性状的关联分析

以46头健康松辽黑猪为实验材料,对猪IGF-Ⅱ基因进行PCR扩增,采用PCR-SSCP技术结合测序分析了猪IGF-Ⅱ基因在松辽黑猪中的多态性。结果表明:松辽黑猪第9外显子存在第29507位C→A、第29729位A→T、第29731位T→C突变。χ2检验表明,本实验中发现的多态位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态。最小二乘分析结果显示,exon9突变位点不同基因型个体平均背膘厚、日增重存在显著差异,由此推测,IGF-Ⅱ基因可能对于猪生产性能具有较大影响或与控制生产性能的主基因连锁,可以尝试将其作为重要的一个分子标记用于猪的育种实践。     

云南撒坝猪H—FABP基因多态性及与部分生产性能的关系

采用PCR-RFLP技术检测H-FABP基因5′上游区1125～1817区段Hinf Ⅰ酶切位点在撒坝猪群体中的多态性分布,并采用最小二乘分析模型初步统计分析检测位点多态性与部分生产性能的相关性.结果表明,H-FABP基因等位基因H及基因型Hh在群体中占优势,频率分别为0.6022和0.4194;H-FABP基因在群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态;H-FABP基因检测位点基因型间在生长和繁殖性状上不存在不利影响.     

撒坝猪及其配套系氟烷基因检测与遗传效应分析

利用PCR -RFLP技术对云南省楚雄州种猪场 1 0 4头种猪 (包括撒坝纯种 71头 ,加系大约克 1 0头 ,丹系长白 8头 ,美系杜洛克 9头及三元杂大长撒 6头 )进行了氟烷基因检测。发现杂合子猪(Nn) 4头 ,包括 2头大约克 ,2头大长撒 ,未发现阳性猪 (nn) ,其余皆为阴性 (NN)。对大长撒氟烷基因杂合子与同群阴性猪作生长和肉质性状比较 ,显示其杂合子在瘦肉率、日增重和料重比等有优势 ,而肉质性状无明显差异。本文还就氟烷基因对地方母系及其配套系建设的影响作了初步分析     

猪MSTN基因的多态性和生长性状关联分析

基于肌肉生长抑制素(Myostatin,MSTN)基因结构及功能研究报道,将其作为猪生长发育性状的候选基因进行多态性检测与关联分析,旨在为猪分子遗传标记提供依据。本研究以长白猪、大白猪、杜长大、通城猪、莱芜猪、五指山猪6个不同猪种基因组DNA为模板,通过克隆测序鉴定MSTN基因启动子区、第1内含子区、第2内含子区、第1外显子区、第2外显子区及3′UTR区SNPs位点;以长白猪和杜长大2个试验猪群为材料,利用基质辅助激光解吸飞行时间质谱法对MSTN基因进行SNP分型。建立最小二乘法分析模型,利用SAS软件分析数据。结果表明:在6个猪种76个个体中,共筛选出16个SNPs,其中有4个位于启动子区,5个位于第1内含子,7个位于第2内含子,在外显子1、外显子2和3′UTR区域并未检测到SNP位点。对MSTN基因的4个SNPs位点(P1、P3、P4、P5;其中P1、P3、P4位于启动子区,P5位于内含子1区)的生长性状关联分析显示,P4和P5 2个位点的多态性与猪生长性状显著相关(P<0.05)。P4和P5 2个位点具有作为分子标记辅助猪育种的潜在应用价值。     

胰岛素样生长因子-1基因多态性与猪部分生产性能的关系

采用PCR－RFLP对南昌白猪（92头）和大约克夏猪（170头）的IGF－1基因的179bp片段进行了扩增，并用HhaI酶切，产生两个等位基因A（151＋28bp)和等位基因B（116＋35＋28bp)。分析了不同基因型对个体初生重、2月龄重、4月龄重、6月龄重、料重比、背膘厚和瘦肉率等生产性能的影响。结果表明，在南昌白猪中，AA型猪比AB型猪初生重大，差异显著（P＜0.05)；在大约克夏猪中，BB型猪比AB型猪的6月龄体重大，差异显著（P＜0.05)；AA型猪比AB型和BB型猪瘦肉率低，差异极差著（P＜0.01)。     

撒坝猪配套系生长胴体性能杂种优势分析

对以云南地方良种撒坝猪为母本的6个杂交组合的生长胴体性能的杂种优势进行分析。结果表明：杂种优势在各组合各性状间普遍存在，各性状间的超高亲优势存在显著性差异，各组合间的超高亲优势差异不显著，超中亲优势在各组合各性状间的差异显著。6个杂交组合中，值得推广应用的组合为杜撒和杜约撒。     

撒坝猪胴体瘦内活体性状间的灰色关联度分析

应用灰色磁联度分析法对撒坝猪胴体瘦内民几个活体性状间的关系进行了分析。结果表明：瘦内民各性状间的关联度大小顺序为：胸围〉活膘〉体长〉体重≥体高〉腹围〉管围。根据关联度分析原则，以胸围、活膘、体长人率关系较为密切，在猪瘦肉型品系选筛应予以足够重视。并担子同该法在种猪个体的综合评比、新品系鉴定和杂交组合的筛选上运用的可能性。     

撒坝猪体尺性状的聚类与主成分分析

本文应用聚类与主成分分析,对４８８头撒坝猪的六月龄体尺性状进行了研究。结果表明,撒坝猪的体尺性状可分为体重、体型、特征三大类,体重与体长、体高、胸围、腹围、活膘等性状间呈显著相关,管围与体高、腿围与活膘呈强正相关,在撒坝猪品系选育中应予以重视。     

奶山羊GHRHR基因遗传多态性及其与生长性状的关联分析

利用PCR-SSCP、PCR-RFLP技术检测668只关中和萨能奶山羊GHRHR基因遗传多态性及其与生长性状的关联分析,结果表明GHRHR基因存在4个SNP多态.关联分析表明:P3位点的基因型与2个奶山羊品种的部分生长性状(体高、体长、胸围)存在显著差异(P<0.05).     

松辽黑猪胰岛素样生长因子Ⅱ基因PCR-SSCP多态性分析

采用PCR-SSCP技术检测胰岛素样生长因子Ⅱ(IGF-Ⅱ)基因外显子3和外显子4在松辽黑猪中的单核苷酸多态性,同时研究该基因对松辽黑猪部分重要生长、胴体性状的影响。结果表明:3对引物中,只有p3的扩增片段存在多态性。p3的扩增片段在松辽黑猪中检测到AA、AB和BB 3种基因型;测序分析发现BB型与AA型相比在IGF-Ⅱ基因(AY044828)第21585 bp处有G→C突变,松辽黑猪AA、AB和BB基因型频率分别为0.6956、0.2609和0.0435。AA基因型对瘦肉率(P<0.05)、日增重(P<0.05),BB基因型对平均背膘厚(P<0.01)有正遗传效应,对其他性状差异不明显。     

大白猪FST基因多态性与生长和繁殖性状的关联分析

本实验旨在研究卵泡抑素（FST）基因多态性与猪生长、繁殖性状的关系,为母猪生长、繁殖性能提供新的遗传标记。选用大白猪为实验对象,采用DNA混池测序对猪FST基因多态位点进行筛选,利用GenoPlexs?基于多重PCR的靶向测序基因型分型技术对候选单核苷酸多态性（SNP）进行分型,并与大白母猪出生重、达100 kg时的生长性能（日增重、背膘厚、体重日龄、眼肌面积和眼肌厚）、母系指数、父系指数、繁殖指数、出生乳头数、终身繁殖性能（总产仔数、产活仔数、死胎数、产仔窝重、仔猪21日龄窝重和妊娠期）进行关联分析。结果显示,在FST基因中筛到3个单碱基突变,分别为g.32808636G>A、g.32809116A>G、g.32809757T>A。其中g.32809116A>G为同义突变,突变后未改变FST基因mRNA二级结构。FST基因的g.32808636G>A、g.32809116A>G、g.32809757T>A 3个位点完全连锁遗传（D’=1,R2=1）,且表型值完全相同,对父系指数、出生乳头数、终身产仔窝重、死胎数、100 kg眼肌面积和眼肌厚有...     

以催乳素受体基因作为撒坝猪部分生产性能候选基因的研究

此文运用PCR-RFLP技术检测催乳素受体(PRLR)基因在撒坝猪群体中的多态性分布,并采用最小二乘分析模型初步统计分析基因多态性与部分生产性能的相关性。结果表明,PRLR基因等位基因B及其基因型BB在群体中占优势,频率分别为0.6594和0.4438;PRLR基因在群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态;头胎繁殖性状有利等位基因B对生长性状无不利影响。     

撒坝猪及长撒二元杂交猪SLA-DQA基因PCR-RFLP多态性分析

根据SLA-DQA基因cDNA序列和已报道的引物序列,在猪中成功扩增了一个731bp的片段,该片段包括猪SLA-DQA基因的大部分第2外显子、完整第2内含子和少部分第3外显子.采用限制性内切酶EcoR1对撒坝猪和长撒二元杂猪SLA-DQA基因的扩增产物进行多态性分析,结果2个猪种在酶切后出现2个等位基因,3种基因型:654 bp/77 bp(AA)、731 bp(BB)和731 bp/654 bp/77 bp (AB).分析发现,A等位基因在群体中占优势,经X2适合性检验,撒坝猪和长撒二元杂交猪SLA-DQA基因在EcoR1酶切位点处于Hardy-Weinberg遗传平衡状态.