茶花鸡PRLR基因多态性与产蛋性状的相关性研究

为探究茶花鸡PRLR基因多态性与茶花鸡产蛋性状的相关性,挖掘影响茶花鸡产蛋性状的分子遗传标记,研究以300只300日龄的茶花鸡为研究对象,通过测序检测PRLR基因是否存在SNPs位点,并与茶花鸡产蛋性状进行关联分析,再通过实时荧光定量PCR验证PRLR基因在不同组织中的表达情况。研究结果显示:在茶花鸡PRLR基因中发现两个SNPs位点(C-40T和A+47G),在C-40T的位点中,优势等位基因为T,属于低度多态;关联分析显示该位点与300日龄产蛋数显著相关(P0.05)。在A+47G位点中,优势等位基因为G,属于中度多态;关联分析显示该位点与开产日龄显著相关(P0.05)。两个位点均显著偏离哈迪-温伯格平衡(P0.05)。PRLR在茶花鸡高产组卵巢中的表达显著高于低产组(P0.05),在高产组卵巢中的表达显著高于垂体(P0.05)。综上所述,茶花鸡PRLR基因位点C-40T和A+47G可能分别是茶花鸡43周龄产蛋数和开产日龄的分子标记,为茶花鸡产蛋性能的选育提供参考依据。     

NPY和PRL基因SNP位点对如皋黄鸡产蛋性能的组合效应研究

本研究旨在分析鸡神经肽Y(NPY)和催乳素(PRL)基因的SNP位点对产蛋性能的组合效应。实验采用飞行质谱技术对如皋黄鸡NPY基因内含子2的A+1259G(P7位点)突变和PRL基因内含子1的C+79T(P8位点)突变进行单基因和多基因组合效应分析。结果表明:P7位点GG基因型是多态位点上开产日龄和40周龄总产蛋数的优势基因型,5个测定的产蛋性状在P8位点3种基因型间差异均不显著;在9个组合中,GGTT和GGCT组合基因型为优势组合基因型,其中GGCT型个体的开产日龄和开产体重比组合前P7位点GG基因型和P8位点CT基因型个体的均值分别减少了3.7 d、52.6 g,组合效应显著(P0.05),40周龄总产蛋数比组合前增加了9.9枚(P0.05);2个位点间不存在显著的互作效应(P0.05)。     

峪口褐壳蛋鸡B系开产日龄对其体重、生产和蛋品性状的影响

为了探究峪口褐壳蛋鸡B系开产日龄与体重、生产和蛋品性状的关系,指导蛋鸡纯系选育,试验以峪口褐壳蛋鸡B系11世代第二批次1 502只母鸡为研究对象,记录蛋鸡的开产日龄,根据蛋鸡开产日龄划分为1,2,3,4,5,6,7,8组,测定各组蛋鸡开产体重和蛋重;28,36,56周龄体重和蛋重;38,56周龄产蛋数和39～56周龄产蛋数;36,56周龄蛋壳厚度和蛋壳强度,分析各组鸡开产日龄对开产体重、开产～56周龄体重、蛋重、产蛋数、蛋壳强度、蛋壳强度等指标的影响及相关关系研究。结果表明:不同开产日龄组别之间的开产体重存在极显著正相关(P0.05),随着开产日龄的增大,开产体重呈增加趋势;不同开产日龄组别之间的开产蛋重、28周龄至56周龄蛋重存在极显著正相关(P0.01),随着开产日龄的增大,蛋重呈增加趋势;不同开产日龄组别之间的38周龄和56周龄产蛋数存在极显著负相关(P0.01),随着开产日龄的增大,产蛋数呈降低趋势;不同开产日龄组别之间的56周龄蛋壳厚度存在显著正相关(P0.05),但相关系数小。说明峪口褐壳蛋鸡开产日龄在127～154日龄之间的鸡只其开产体重、生产和蛋品质等性状指标比较理想。     

肌肉生长抑制素基因5′调控区的多态性对边鸡生长和繁殖性状的遗传效应

本研究采用PCR-SSCP技术检测边鸡肌肉生长抑制素(Myostatin,MSTN)基因5′调控区的单核苷酸多态性,并与边鸡的生长和繁殖性状进行关联分析。结果表明:在MSTN基因5′调控区检测到2个突变(A326G、C334G);6～8周龄,KK型的体重显著高于JJ和JL型(P<0.05);14周龄,KK和LL型的体重显著高于JL型(P<0.05);16周龄,KK型的体重显著高于JJ、JK和JL型(P<0.05);18周龄,KK型的体重极显著高于JL型(P<0.01),显著高于JJ和JK型(P<0.05),LL型的体重显著高于JL型(P<0.05),KK型的开产体重显著高于JJ和JL型(P<0.05);不同基因型对其余4个繁殖性状(开产日龄、开产蛋重、300日龄产蛋数以及300日龄蛋重)均无显著影响。结果提示,MSTN基因可能是影响边鸡生长性状的一个主要候选基因。     

淮南麻黄鸡CRBP4基因多态性与早期产蛋性状和蛋品质的相关性

旨在探索CRBP4基因与淮南麻黄鸡产蛋性状和蛋品质的相关性,寻找可作为淮南麻黄鸡产蛋性状的重要分子标记.本研究利用PCR-SSCP技术和DNA测序技术对308只淮南麻黄鸡CRBP4基因遗传多态性进行检测及基因型分析,并对CRBP4基因的多态位点与早期产蛋性状和30周龄蛋品质进行相关分析.结果表明,在CRBP4基因exon2和exon3上存在3个突变位点,即C826T、C1240T和A1241G,其中C826T和A1241G导致了49 Se→4 9Leu和97 Ile→97Val突变,这3个突变位点都属于中度多态,基因型分布都处于Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05).C826T位点与母鸡的开产蛋重呈显著相关,CC基因型有利于提高开产蛋重;构建的单倍型对开产蛋重的影响达到显著水平(P＜0.05).结果提示,CRBP4基因不同基因型和单倍型组合与淮南麻黄鸡开产蛋重存在相关性.     

DRD2基因14个多态位点与鸡产蛋性状的相关性

本研究旨在分析DRD2基因与鸡产蛋性状的相关性,寻找可作为鸡产蛋性状的重要标记。在该基因上选取了14个多态位点,采用PCR-RFLP及PCR测序等方法在宁都三黄鸡母系644个个体中进行了鸡产蛋性状的关联分析。结果表明:位于该基因5′调控区的4个突变位点G-38560C、T-38326G、T-32751C和A-16105G与鸡的开产日龄显著或极显著(P0.05或P0.01)相关,位点A-16105G还与300日龄总产蛋数显著相关(P0.05);由G-38560C、G-38544A、I-38463D与T-38326G这4个位点组成的单倍型块与开产日龄呈极显著相关(P=0.006 50.01)。研究结果提示:G-38560C、T-38326G、T-32751C和A-16105G这4个突变位点以及由G-38560C、G-38544A、I-38463D与T-38326G组成的单倍型块可作为产蛋性状标记辅助选择的有效分子标记。     

太行鸡INHA基因多态性与产蛋性状相关性研究

研究旨在探究抑制素A(Inhibin A,INHA)基因多态性与太行鸡产蛋性状的相关性，挖掘影响太行鸡产蛋性状的分子遗传标记。通过对125只麻羽太行母鸡INHA基因进行测序，检测其多态性并分析其与产蛋性状的相关性。结果显示：在太行鸡INHA基因上共存在7个SNPs位点（C187T、T248C、G410A、A680G、T1040C、T1037C、T324C）。在C187T位点中，优势等位基因为C，与500日龄产蛋数关联分析中显示该位点的TT基因型比CC基因型产蛋数显著增高（P<0.05）。在A680G位点中，优势等位基因为A，与开产日龄、300日龄产蛋数和500日龄产蛋数关联分析显示该位点的AG基因型开产日龄显著早于AA基因型（P<0.05），且产蛋数极显著增高（P<0.01）。两位点基因型分布均处于Hardy-Weinberg平衡状态。其余位点未发现显著关联。结果表明：INHA基因多态性对太行鸡的产蛋性状存在一定的影响，推测C187T和A680G可能是太行鸡产蛋性状的重要SNPs位点。     

如皋黄鸡产蛋性能与遗传参数分析

研究以如皋黄鸡第4世代的15个家系351只母鸡为实验素材,测定开产日龄、开产体重、开产蛋重和40周龄产蛋数,统计各周龄群体产蛋率,估算开产性状和40周龄产蛋数的遗传参数。结果表明:如皋黄鸡开产日龄为(153.9±13.13)d,开产体重为(1 366.5±135.51)g,开产蛋重为(32.8±3.17)g,40周龄产蛋数为(101.0±8.94)个;高峰产蛋率为82.1%,70%以上产蛋率维持16周;开产日龄、开产体重、开产蛋重和40周龄产蛋数均为中等遗传力0.177~0.320;开产日龄、开产体重和开产蛋重间两两呈遗传正相关0.736~0.971,40周龄产蛋数与开产日龄、开产体重、开产蛋重间均呈遗传负相关-0.832~-0.639;性状间的表型相关性质和遗传相关一致,且均达到极显著的程度。     

如皋黄鸡连产性状及其遗传参数分析

本文通过对如皋黄鸡两个世代(9世代866只,10世代423只)常规选育性状(开产日龄、开产体重、开产蛋重及40周龄产蛋数)和连产性状(连产周期、平均连产长度、最长连产长度、平均间歇天数、最长间歇长度及连产强度)进行统计分析,估计各性状的遗传力及之间的遗传相关并分析表型相关。结果表明:与常规选育性状相比连产性状的变异系数较大;9世代连产周期遗传力最高为0.523,开产体重和平均连产长度为中等遗传力性状(0.417和0.310),开产日龄、开产蛋重、40周龄产蛋数、最大连产长度、平均连产间歇天数、最长间歇天数及连产强度为低遗传力性状(0.068~0.244);40周龄产蛋数与平均连产长度、连产强度呈正遗传相关和极显著表型相关,与连产周期、最长连产间歇呈负的遗传相关和极显著表型负相关。以40周龄产蛋数为主选目标间接使10世代连产周期数下降,连产长度延长,而连产周期数的遗传力下降。综上,与40周龄产蛋数相比,连产性状中的连产周期和平均连产长度的遗传力估计值较高,与其遗传相关和表型相关均较高,可将连产性状作为选育指标对如皋黄鸡进行进一步选择。     

蛋种鸡育成前期体重对产蛋性能的影响

试验旨在探究蛋种鸡育成前期体重对其产蛋性能的影响，为该品系蛋种鸡的体重管理及选育分析提供科学数据和管理思路。本试验将10周龄京红1号蛋种鸡按体重分为4组，并记录和分析产蛋鸡的开产日龄及不同周龄下的体重、产蛋数以及蛋重指标。结果表明：10周龄不同体重对蛋种鸡的开产日龄、产蛋期体重、产蛋数、蛋重均产生一定的影响。体重越大开产日龄越小，A组开产日龄最大（P<0.05）,D组最小（P<0.05）,B组与C组的开产日龄处于A组与D组之间，且二者之间差异不显著；除56周龄各组间体重差异不显著外，28周龄和36周龄各组体重随10周龄体重增大而增大（P<0.05）；产蛋后期（48周龄和56周龄），B组和C组的产蛋数显著高于A组和D组；A组的36周龄蛋重显著小于B、C、D组，而B组和C组间差异不显著。本试验结果提示，10周龄体重处于平均体重的90%～110%范围内，京红1号蛋种鸡后期的综合产蛋性能更佳。     

欣华鸡DRD2基因多态性及其与蛋用性状的关联分析

试验旨在研究多巴胺受体D2(dopamine receptor D2,DRD2)基因多态性及其与欣华鸡蛋用性状的相关性,寻找可用于欣华鸡蛋用性状选育的分子遗传标记。应用Primer Premier 5.0软件设计4对引物,利用PCR-RFLP技术对欣华E系鸡群的473个个体进行基因型鉴定,使用SPSS 19.0软件将欣华鸡的蛋用性状与DRD2基因多态性进行关联分析。群体多态性分析结果表明,存在4个SNPs位点:A-16105G(SNP1)、G-12510T(SNP2)、G+3360A(SNP3)和T+5042C(SNP4),其中SNP1和SNP2位点符合哈代-温伯格平衡(P>0.05),且杂合度较低,但SNP3和SNP4位点显著偏离哈代-温伯格平衡(P<0.05)。关联分析表明,DRD2基因4个SNPs位点与欣华E系鸡群体蛋用性状存在关联,其中与产蛋性状关联结果:SNP1与开产日龄显著关联(P<0.05),SNP2与33周龄产蛋数、300日龄产蛋总数极显著关联(P<0.01),SNP3与开产体重(P<0.05)、300日龄产蛋总数(P<0.01)、平均连产(P<0.01)和最长连产(P<0.05)关联,SNP4与开产日龄极显著关联(P<0.01);与蛋品质关联结果:SNP1与蛋形指数(P<0.01)、蛋黄颜色(P<0.01)和哈氏单位(P<0.05)关联,SNP2与蛋黄重显著关联(P<0.05),SNP3与蛋壳强度极显著关联(P<0.01),SNP4与蛋黄重、蛋清重和哈氏单位显著关联(P<0.05)。单倍型分析发现,DRD2基因4个SNPs位点的不同单倍型组合与欣华鸡的最长连产长度呈极显著相关(P<0.01),与哈氏单位呈显著相关(P<0.05)。组织表达谱分析发现,DRD2基因主要在欣华E系鸡垂体中表达,在58周龄鸡胸肌中有较高表达,在36周龄鸡脑中有少量表达。结果表明,DRD2基因可作为候选基因辅助用于欣华E系鸡群体蛋用性状的遗传改良。     

鸡VLDLR基因多态性与蛋黄性状的关联分析

本研究采用PCR-RFLP方法,检测VLDLR基因在山东地方鸡种汶上芦花鸡、济宁百日鸡和莱芜黑鸡中的多态性,并分析各多态位点不同基因型与4个蛋黄性状的相关性。结果表明,在3个供试群体中共检测到2个具有生物学意义的SNPs位点,即第6外显子8 467nt处的G→A突变(V8467)和第17内含子13 876nt处的A→G突变(V13876)。最小二乘分析结果表明,V8467对蛋黄质量有极显著影响(P<0.01),对蛋黄高度有显著影响(P<0.05);V13876对蛋黄质量有极显著影响(P<0.01),对蛋黄比率和蛋黄高度有显著影响(P<0.05);而双倍型对蛋黄质量、蛋黄比率的影响均达到极显著水平(P<0.01),对蛋黄高度的影响达到显著水平(P<0.05)。结果提示:本研究检测到的VLDLR基因的V8467和V13876多态性位点可以作为蛋黄性状的候选分子标记。     

肌细胞生成素基因多态性对京海黄鸡繁殖性状的遗传效应研究

本研究旨在探讨肌细胞生成素(myogenin,MyoG)基因多态性与鸡繁殖性状间的相关性。以378只京海黄鸡为研究对象,采用PCR-SSCP技术研究MyoG基因外显子的多态性。运用最小二乘法分析这些突变位点形成的基因型与京海黄鸡繁殖性状间的相关性。结果表明,MyoG基因外显子1上存在1个G102A突变,外显子3上存在1个T36C突变,分别形成基因型AA、AB、BB和CC、CD、DD。关联分析结果显示,基因型AA、AB和BB在京海黄鸡繁殖性状上无显著差异（P＞0.05）;基因型CC和DD在京海黄鸡开产体重上存在显著差异（P＜0.05）,在其余性状上各基因型差异均不显著（P＞0.05）。因此,推测MyoG基因对京海黄鸡的繁殖性状无显著影响,为探索鸡育种过程中的标记辅助选择提供参考资料。     

边鸡胰岛素生长因子结合蛋白-3基因外显子2MspⅠ位点对繁殖性状的遗传效应分析

本研究采用PCR-RFLP技术检测边鸡类胰岛素生长因子结合蛋白-3(insulin-like growth factor binding proteins-3,IGFBP-3)基因外显子2 MspⅠ位点的单核苷酸多态性,并与边鸡的繁殖性状进行相关分析。结果表明,在边鸡IGFBP-3基因的1087 bp处检测到1个C→T的突变,显示3种基因型(CC、CT和TT),C等位基因为优势等位基因。最小二乘分析结果表明,CT基因型的开产体重显著高于CC基因型(P<0.05)。不同基因型对其余4个繁殖性状(开产日龄、开产蛋重、300日龄产蛋数及300日龄蛋重)均无显著影响(P>0.05)。     

STAT5b基因2个SNPs位点与京海黄鸡生长和繁殖性状的关联分析

采用PCR-SSCP方法检测京海黄鸡、AA鸡、尤溪麻鸡、边鸡4个鸡品种STAT5b基因5′调控区部分序列的多态性,并分析其对京海黄鸡生长和繁殖性状的遗传效应,利用PHASE软件对2个多态位点进行单倍型分析。在5′调控区检测到C-1591T、G-250A 2个SNPs;单倍型分析产生4种单倍型H1(CG)、H2(TG)、H3(CA)、H4(TA),单倍型组合H1H4对初生重有极显著影响(P0.01);单倍型组合H3H4与8、16周龄体重存在正相关(P0.05),单倍型组合H1H2对开产蛋重有极显著影响(P0.01);单倍型组合H3H4的开产体重极显著高于其他单倍型组合(P0.01);在300日龄体重上,单倍型组合H1H1和H1H3显著高于H4H4(P0.05)。京海黄鸡STAT5b基因5′调控区的多态性对其生长和繁殖性状有一定影响,但是否可以作为影响京海黄鸡生产性状的遗传标记需进一步研究。     

Genetic Effects of IGF-Ⅰ Gene on the Growth and Reproductive Traits in Jinghai Yellow Chicken

The aim of this study was to analyze the association of SNPs in insulin like factor-Ⅰ（IGF-Ⅰ） gene with chicken growth and reproductive traits. PCR-SSCP approach was applied to assess the single nucleotide polymorphisms(SNPs) and the general linear model was used to analyze genetic effects between genotypes and growth traits of the Jinghai Yellow chicken. For the IGF-Ⅰ gene, three genotypes(AA, AB and BB) were detected in Jinghai Yellow chicken population, the frequency of A and B alleles were 0.613 and 0.387. Sequencing revealed one mutation(A60G) of IGF-Ⅰ gene in BB genotype in comparison to AA genotype. The results showed that BB genotype of the IGF-Ⅰ gene had higher bodyweight at 4 weeks compared to AA and AB genotypes(P<0.05);AA genotype of the IGF-Ⅰ gene had significantly higher bodyweight at 300 day-age-weight compared to BB genotype(P<0.05). Polymorphisms in exon 3 of IGF-Ⅰ gene had certain effect on growth and reproductive traits in Jinghai Yellow chicken. However, whether these polymorphisms were important genetic markers, which related with IGF-Ⅰ gene and reproduction traits in Jinghai Yellow chicken, were needed to be further studied.     

Genetic parameters for egg production traits in purebred and hybrid chicken in a tropical environment

1. Genetic parameters were estimated for 5 economically important egg production traits using records collected over 9 years in chickens reared under tropical conditions in Thailand. The data were from two purebred lines and two hybrid lines of layer parent stocks.

2. The two purebred lines were Rhode Island Red (RIR) and White Plymouth Rock (WPR) and the hybrid lines were formed by crossing a commercial brown egg laying strain to Rhode Island Red (RC) and White Plymouth Rock (WC), respectively.

3. Five egg production traits were analysed, including age at first egg (AFE), body weight at first egg (BWT), egg weight at first egg (EWFE), number of eggs from the first 17 weeks of lay (EN) and average egg weight over the 17th week of lay (EW).

4. Fixed effects of year and hatch within year were significant for all 5 traits and were included in the model.

5. Maternal genetic and permanent environmental effects of the dam were not significant, except for EN and EW in RIR and BWT and EW in WPR.

6. Estimated heritability of AFE, BWT, EWFE, EN and EW were 0.45, 0.50, 0.29, 0.19 and 0.43 in RIR; 0.44, 0.38, 0.33, 0.20 and 0.38 in WPR; 0.37, 0.41, 0.38, 0.18 and 0.36 in RC; and 0.46, 0.53, 0.36, 0.38 and 0.45 in WC lines, respectively.

7. The EN was negatively correlated with other traits, except for BWT in RC and AFE and BWT in WC.

8. It was concluded that selection for increased EN will reduce other egg production traits in purebred and hybrid chicken and therefore EN needs to be combined with other egg production traits in a multi-trait selection index to improve all traits optimally according to a defined breeding objective.

     

Study on the Polymorphisms of IGF-ⅠR Gene Alu Ⅰ Locus and Genetic Effect on Growth and Reproduction Traits in Bian Chicken

Single nucleotide polymorphisms (SNPs) in exon 2 of insulin-like growth factor Ⅰ receptor (IGF-ⅠR) gene were detected by PCR-RFLP in Bian chicken,which was to find the correlation markers of growth and reproduction traits in Bian chicken.The results showed that AluⅠsite displayed polymorphic, and a G→A mutation at the position of the 376 bp in exon 2 was occurred. There were three genotypes (GG, GA and AA), the genotypes frequencies were 0.687, 0.296 and 0.017, respectively, GG genotype was the dominant genotype, the frequency of G allele was 0.835, which was the dominant allele. This site was in Hardy-Weinberg equilibrium (P>0.05).Correlation analysis showed that GG genotype had significantly higher body weight than those of GA genotype at the age of 8, 14, 16 and 18 weeks (P<0.05);The GG geno type had extremely significantly higher body weight at first egg than those of GA genotype (P<0.01),but it didn't mean that this locus could be used as a genetic marker for reproduction traits in Bian chicken. This results suggested that the AluⅠsite (G→A) in exon 2 of IGF-ⅠR gene could be used as a genetic marker for growth traits in Bian chicken.