美国金鳟的同工酶分析

本实验运用聚丙烯酰胺凝胶电泳法对养殖型美国金鳟眼(E)、心(H)、肾(K)、肝(L)、肌肉(M)五种组织的乙醇脱氢酶(ADH)、酯酶(EST)、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G-6- PDH)、谷氨酸脱氢酶(GDH)、乳酸脱氢酶(LDH)、苹果酸脱氢酶(MDH)和过氧化物酶(POD)等7种同工酶进行电泳研究。结果显示：美国金鳟中ADH、EST、G-6-PDH、GDH、LDH、MDH、POD、SOD 7种同工酶都有不同程度的组织特异性；美国金鳟群体同工酶分析共记录18个基因座位,其中有8个基因座位为多态,等位基因总数为26个,从而得出多态座位百分数P为44．44％,位点有效等位基因数Ne=1．4444,表明美国金鳟群体遗传多样性偏高。     

乌苏里白鲑的生化遗传结构

2001年10月于黑龙江中游抚远江段捕获野生乌苏里白鲑(Coregonus ussuriensis Berg)30尾，体长30-45cm。采用淀粉凝胶电泳法对其肝脏、肌肉等组织的LDH、MDH、ME、IDH、G3PDH、ADH、GDH、PGI、CAT、AAT、EST、SOD等同工酶进行电泳，并对其表型进行生化遗传分析。结果表明，LDH同工酶的3个位点上都有基因复制，位点间不杂合；在其他同工酶上未见有位点复制或加倍。在检测到的12种同工酶是由26个基因位点编码；其中G3pdh-1、Pgi—3和Est—1等基因位点呈多态，其多态座位比例为11．5％，平均杂合度为0．043。与大多数其他鱼类相比较，乌苏里白鲑在生化遗传水平上表现出较低的遗传变异。     

星突江鲽同工酶的遗传多样性研究

采用聚丙烯酰胺垂直板不连续凝胶电泳技术对星突江鲽Platichthys stellatus野生亲本繁殖子一代的同工酶进行了检测.分析了44个样本的9种同工酶在肌肉中的表达情况.9种同工酶共记录了20个基因座位,其中Amy-3、Gdh、Ldh、Me和Sdh-1共5个座位呈多态,多态座位百分数是25%.平均每个座位的等位基因有效数值A,为1.204 6,预期杂合度H_e 为0.107 8,实际杂合度H_o为0.182 9.同时还分析了星突江鲽各个多态座位的Hardy-Weinberg遗传偏离指数d.这些数据说明,星突江鲽野生亲本繁殖子一代的养殖群体遗传多样性水平较高,有利于对其资源进行开发以及对其遗传育种工作的开展.     

漠斑牙鲆引进种群同工酶的遗传多态性分析

采用聚丙烯酰胺不连续凝胶垂直板电泳技术对引进种漠斑牙鲆（Paralichthys lethostigma）子一代的同工酶进行检测。分析了48个样本的15种同工酶在漠斑牙鲆肌肉和肝脏两种组织或器官中的表达情况，以期为其种质资源的保护和开发以及遗传育种方面的研究提供基础资料。15种同工酶共记录了33个基因座位，其中Me-1、Adh—1、Sdh—1、Sdh-2、Gdh—1、G6pd-1、Pgm—I1ldh—1、Cat—1、Pod—1和Pgi—1共11个座位呈多态，多态座位百分数是33．3％。平均每个座位的等位基因有效数值Ae为1．2196，预期杂合度He为0．1219，实际杂合度Ho为0．1547。同时还分析了漠斑牙鲆各个多态座位的Hardy-Weinberg遗传偏离指数d。这些数据说明，漠斑牙鲆群体拥有较高的遗传变异水平，还处于种质资源维持较好的状态，有利于对其资源进行开发以及对其遗传育种工作的展开。     

三疣梭子蟹野生群体同工酶的遗传多态性分析

采用聚丙烯酰胺不连续凝胶垂直电泳技术对三疣梭子蟹野生群体的同工酶进行检测.分析了48个样本的11种同工酶在三疣梭子蟹肌肉中的表达情况.11种同工酶(MDH、LDH、ME、SOD、 EST、SDH、IDH、ADH、POD、CAT、AAT)共检测出20个基因座位,其中Me-2、Sod-3、Cat-3、Ldh-2共4个座位呈多态(P0.99),多态座位百分数P为20%.平均每个座位的有效等位基因数目Ae为1.230,预期杂合度He为0.094,实际杂合度Ho为0.175.同时还分析了三疣梭子蟹4个多态座位的Hardy-Weinberg遗传偏离指数d.与日本绒螯蟹、中华绒螯蟹等相比,三疣梭子蟹野生群体的遗传多样性水平较高,种质资源还处于较好的状态.     

网箱养殖大黄鱼遗传多样性的同工酶和RAPD分析

采用垂直聚丙烯酰胺凝胶电泳方法(PAGE)和RAPD技术对象山港网箱养殖大黄鱼群体遗传多样性进行检测。结果表明，所分析的12种同工酶共记录了27个基因座位，其中3个基因座位Est-2、Est-3和m-Adh-2为多态，其多态座位比例为11．111％，平均杂合度为0．0279。16个RAPD随机引物共检测出119个位点，其中多态位点20个(16.81％)，个体间的遗传相似系数为0．844～0．972，遗传变异度为0．0927，Shannon多样性指数为6．326，多样性值为0．0532。不论是同工酶电泳分析结果还是RAPD分析结果，均表明象山港网箱养殖大黄鱼遗传多样性水平较低。     

小刀蛏群体内同工酶的生化遗传分析

采用聚丙烯酰胺凝胶不连续垂直平板电泳技术对采自舟山嵊泗海区的小刀蛏群体不同个体的苹果酸脱氢酶、苹果酸酶、细胞色素氧化酶、酯酶、异柠檬酸脱氢酶、过氧化物酶、超氧化物歧化酶和葡萄糖-6-磷酸脱氢酶8种同工酶进行了生化遗传分析,共记录了21个基因座位,37个等位基因,其中有11个基因座位(Mdh-1、Mdh-2、Me-1、Me-2、Pod-1、Pod-2、Pod-3、Cod-3、Icd-1、Icd-2和Icd-3)为多态,多态座位比例为52.38%.小刀蛏群体内具一定的遗传变异能力.     

三疣梭子蟹野生群体同工酶遗传多态性分析

三疣梭子蟹野生群体同工酶的遗传多态性分析=Isozyme polymorphism in Portunus trituberculatus from wild population ［刊,中］/高保全（中国海洋大学生命科学与技术学部,青岛266003）,刘萍,李健,戴芳钰//水产学报,—2007,31(1).-1～6 采用聚丙烯酰胺不连续凝胶垂直电泳技术对三疣梭子蟹野生群体的同工酶进行检测。分析了48个样本的11种同工酶在三疣梭子蟹肌肉中的表达情况。11种同工酶(MDH、LDH、ME、SOD、 EST、SDH、IDH、ADH、POD、CAT、AAT)共检测出20个基因座位,其中Me-2、Sod-3、Cat-3、Ldh-2共4个座位呈多态(P0.99),多态座位百分数P为20%。平均每个座位的有效等位基因数目Ae为1.230,预期杂合度He为0.094,实际杂合度Ho为0.175。同时还分析了三疣梭子蟹4个多态座位的Hardy-Weinberg遗传偏离指数d。与日本绒螯蟹、中华绒螯蟹等相比,三疣梭子蟹野生群体的遗传多样性水平较高,种质资源还处于较好的状态。图1表3参22 关键词：三疣梭子蟹;野生群体;同工酶;多态性 E-mail：liuping@ysfri.ac.cn     

金乌贼同工酶分析

采用水平淀粉凝胶电泳技术对金乌贼（Sepia esculenta）同工酶的组织特异性及其山东日照近海群体的遗传结构进行研究。对金乌贼眼、鳃、肌肉、口球、肝脏、鳃心6种组织的19种同工酶进行分析，检测出PGDH、GPI、MPI、IDHP、SOD、ME、AAT、DIA、MDH、LDH、G3PDH、PGM共12种同工酶在几种组织中有较稳定而清晰的表达。结果表明，金乌贼同工酶的表达有明显的组织特异性。选择金乌贼3种组织（眼、口球、鳃心）进行同工酶分析，共记录了18个基因座位，其中3个基因座位LDH-2^＊、G3PDH-1^＊、PGM^＊呈多态，其多态座位比例为0．1667（P0．99）和0．0556（P0.95），平均观测杂合度和预期杂合度分别为0．0159和0．0143，平均有效等位基因数为1．0201，表明日照近海金乌贼群体的遗传多样性较低。     

日本蟳4个地理群体遗传变异的同工酶分析

采用聚丙烯酰胺不连续凝胶垂直电泳技术对中国沿海的大连黑石礁、山东莱州湾、江苏海州湾和浙江象山4个日本蟳地理群体的10种同工酶进行检测,并分析了群体间的生化遗传差异。实验共记录了28个座位,其中m-Mdh-1、Sod-3、Cat-3、Est-1、α-Amy-1、α-Amy-4、Ldh-2、Alp-1和Alp-3共9个座位表现为多态,4个群体的多态座位百分数（P0.99）均为32.14%,平均每个座位等位基因有效值Ae为1.283 0～1.297 9,平均预期杂合度He为0.146 2～0.155 6,平均观察杂合度Ho为0.273 8～0.278 3,遗传距离D为0.000 4～0.001 8。4个群体的聚类分析表明,莱州湾和大连群体亲缘关系最近,而象山群体与其他3个群体遗传距离较远。实验结果表明,日本蟳遗传多样性处于较高水平,种质资源维持良好,有利于其种质资源的开发及遗传改良等工作的开展。     

莱州湾三疣梭子蟹的生化遗传分析

采用聚丙烯酰胺不连续凝胶垂直板电泳技术对三疣梭子蟹的同工酶进行检测。分析了13种同工酶在莱州湾三疣梭子蟹肌肉中的表达情况,并对同工酶的表型进行了生化遗传分析。结果表明,13种同工酶有22个基因位点编码,其中Ldh-1,Me-3,Gdh-1,Sdh-1,G6pd-1和Sod-3共6个位点是多态的,多态位点百分数是27.3%。三疣梭子蟹的平均每个位点的等位基因的有效数目Ae为1.2270,平均每个位点的预期杂合度He为0.1170,实际杂合度Ho为0.2159。同时还分析了三疣梭子蟹的各个多态位点的Hardy-Weinberg偏离指数:Ldh-1、Me-3和Sod-3的d值都为1.0000,Gdh-1、Sdh-1和G6pd-1的d值分别为0.5047、0.8726和0.0597。这些数据表明,莱州湾三疣梭子蟹的种质资源还处于较好的状态。     

Microsatellite variation reveals fine-scale genetic structure of masu salmon, Oncorhynchus masou, within the Atsuta River

Abstract –  To describe in detail the population genetic structure of masu salmon Oncorhynchus masou , seven anadromous populations in the Atsuta River were investigated by analysis of eight polymorphic microsatellite loci. Exact test and genetic differentiation ( F _ST) revealed that significant differentiation was observed at the within-river scale. Principal components analysis revealed that the spatial pattern of genetic composition was related to geographical location of each population. Furthermore, a significant correlation was observed between genetic differentiation and geographical distance, indicating that dispersal is less likely to occur between distant populations. The results of this study imply that masu salmon have potential to show clear genetic structure at the microgeographical scale (21 km) due to precise homing behaviour.     

云斑尖塘鳢微卫星分子标记的筛选与检测

用磁珠富集法分离云斑尖塘鳢的微卫星序列,由所获得的1032个克隆中筛选出146个阳性克隆,经测序81个含有微卫星序列,52个为完美型,27个为非完美型,2个为复合型,其中43个微卫星序列重复次数在10以上。所获得的云斑尖塘鳢微卫星序列中除探针中使用的CA重复单元和GA重复单元外,还有TAC等其他类型的重复单元。设计合成38对微卫星引物,其中29对引物可稳定扩增出条带,使用这些引物对云斑尖塘鳢48个个体进行检测显示:观测杂合度平均值为0.63,期望杂合度平均值为0.43。29对引物中1对引物表现为单态,7对表现为高度多态,14对表现为中度多态,7对表现为低度多态,多态性较为丰富,说明本研究开发的绝大部分微卫星分子标记较为理想。     

五个斑点叉尾群体的微卫星遗传多样性分析

用8对微卫星引物对1997-2004年引进的5个斑点叉尾群体进行遗传多样性分析,计算并统计等位基因数、多态信息含量（PIC）、杂合度、遗传相似性系数、遗传距离等参数。实验显示8个微卫星位点在5个斑点叉尾群体中共检测到42个等位基因,平均期望杂合度为0.6338～0.7320,表明其遗传多样性程度处于中等偏上水平。平均多态信息含量为0.5756～0.6869,说明基因座为高度多态基因座（PIC〉0.5）。群体间遗传相似系数为0.7504～0.9203。聚类分析显示,04群体与其他4个群体的亲缘关系较远。结果表明：引进的5个斑点叉尾群体均具有较高的遗传多样性,遗传信息丰富,遗传变异大,为良好的育种材料。     

Mining expressed sequences for single nucleotide polymorphisms in Pacific abalone Haliotis discus hannai

Although single nucleotide polymorphisms (SNPs) are important resources for population genetics, pedigree analysis and genomic mapping, such loci have not been reported in Pacific abalone so far. In this study, a bioinformatics strategy was adopted to discover SNPs within the expressed sequences (ESTs) of Pacific abalone, Haliotis discus hannai , and furthermore, polymerase chain reaction direct sequencing (PCR-DS) and allele-specific PCR (AS-PCR) were used for SNPs detection and genotype scoring respectively. A total of 5893 ESTs were assembled and 302 putative SNPs were identified. The average density of SNPs in ESTs was 1%. Fifty-two sets of sequencing primers were designed from SNPs flanking ESTs to amplify the genomic DNA, and 13 could generate products of expected size. Polymerase chain reaction direct sequencing of the amplification products from pooled DNA samples revealed 40 polymorphic SNP loci. Using a modified tetra-primer AS-PCR, seven mitochondrial and six nuclear SNPs were typed and characterized among 37 wild abalones. In conclusion, it is feasible to discover SNPs from number limited ESTs and the AS-PCR as a simple, robust and reliable assay could be a primary method for small- and medium-scale SNPs detection in abalones as well as other non-model organisms.     

凫溪香鱼群体同工酶的生化遗传分析

香鱼(Pleccoglossusaltivelis)隶属鲑形目,香鱼科,香鱼属,为我国小型名贵经济鱼类,广泛分布在北起鸭绿江南至广西北仑河等涉海溪流江河中,也可生活在大型陆封水库中[1],为一年生洄游鱼类。近年来,由于各地捕捞强度增大、水利设施建设以及环境污染日益严重等原因,各地香鱼资     

雌核发育鲢RAPD指纹和蛋白质电泳研究

用２３个随机引物对雌核发育鲢子一代（普通鲢作对照）进行了ＲＡＰＤ—ＰＣＲ反应,在２３个引物中除一个引物无扩增产物外,其它均可得到１～１０条ＤＮＡ带,平均每个引物产生５３８条带。其中７个引物产生多态现象,占总引物的３１４％。多态座位达１３６８％。用Ｓｈａｎｎｏｎ指数对ＲＡＰＤ数据进行遗传多样性（Ｈｏ）分析,得出所研究样本的Ｈｏ为０１７５。用血清酯酶和血清蛋白电泳作对比时没有发现在蛋白质水平的多态现象,说明ＲＡＰＤ技术是一种比较灵敏实用的ＤＮＡ多态检测方法。以ＲＡＰＤ所得数据进行了雌核发育鲢子代和普通鲢个体间的遗传相似性与遗传距离分析,为鲢选育提供了依据。     

Microsatellite loci in tench: isolation and variability in a test population

Because of their high variability and rapid evolution, microsatellites became increasingly important in genetic research, e.g. population structure and differentiation studies, gene mapping and parentage analysis. However, such loci have not been isolated in tench so far. Applying a PCR based method of generating microsatellite enriched DNA fragment libraries we were able to identify nine loci (MTT-1 to MTT-9). The variability of these microsatellite loci was determined in 50 tench individuals originating from a wild population of Lake Döllnsee, Germany. Three loci were found to be monomorphic. The remaining six loci segregated for two to nine alleles. The observed heterozygosities at polymorphic loci were high (0.500–0.959) with only one exception: locus MTT-8 (0.167). These polymorphic microsatellite loci showed a much higher level of genetic variability than the allozyme loci previously studied in the same individuals. Thus, they seem to be more suitable for genetic studies of tench. On the other hand, it remains to be checked in other populations if the three loci that did not show any variation in this population are generally monomorphic in this species.     

基于新开发微卫星标记评价番红砗磲两个野生群体的遗传多样性及近缘种通用性检测

采用磁珠富集和PCR筛选相结合的方法,得到番红砗磲的19个多态性微卫星标记。利用新开发微卫星标记对西沙群岛2个野生群体的遗传多样性进行比较分析,七连屿海域野生群体和永兴岛海域野生群体的平均观测等位基因数(Na)分别为11.105、11.895,平均有效等位基因数(Ne)分别为6.274、6.173,平均期望杂合度(He)分别为0.776、0.788,平均多态性信息含量分别为0.730、0.744,发现2个野生群体的遗传多样性都处于高度多态水平,说明其有效群体大小仍然保持在较高水平。Bonferroni校正后,在2个群体中各有4个位点偏离Hardy-Weinberg平衡。另外分析了这些引物在近缘种中的通用性情况,发现鳞砗磲中有7对微卫星引物具有通用性,6对具有多态性;无鳞砗磲中有3对微卫星引物具有通用性,1对具有多态性;诺瓦砗磲中有5对微卫星引物具有通用性,5对具有多态性;长砗磲中有9对微卫星引物具有通用性,8对具有多态性;砗蚝中有2对引物具有通用性,2对具有多态性。