四川黑熊(Ursus thibetanus mupinensis)线粒体NADH脱氢酶亚基1基因(ND1)的序列分析

以四川境内的四川黑熊（Ursus thibetanus mupinensis）为研究对象,根据已报道的若干物种的NADH脱氢酶亚基1基因（ND1）序列信息设计引物．运用PCR技术从四川黑熊毛囊组织的总DNA中扩增出ND1基因序列．采用GenScan、Blast2.1、ORF finder和Clustal W等软件分别对DNA序列进行预测、相似性比较、ORF查找以及多序列比对,并利用PredictProtein软件对蛋白质进行预测和结构分析．结果表明;PCR扩增所得DNA序列长度为957bp,包含了ND1基因,其ORF为957bp,编码317个氨基酸,编码蛋白的分子量为35.6×10^3Da,pI为7.83．四川黑熊的ND1基因序列及其所编码的氨基酸序列与其它熊、浣熊和小熊猫等动物的ND1基因序列和对应的氨基酸序列具有较高的相似性．     

亚洲黑熊四川亚种线粒体NADH脱氢酶亚基5和亚基6基因的克隆与初步分析

[目的]克隆与分析亚洲黑熊四川亚种线粒体NADH的脱氢酶亚基5和亚基6基因（ND5和ND6）。[方法]根据已报道的部分熊科动物ND5和ND6基因序列的相关信息设计引物,运用PCR技术,首次从亚洲黑熊四川亚种的肌肉组织总DNA中成功克隆了ND5和ND6基因的编码序列,分析了其序列特征,并与已报道的9种熊科动物进行比较分析。[结果]该克隆片段包括ND5和ND6两个基因共2456bp,共编码781个氨基酸,与9种熊科动物的ND5和ND6具有很高的同源性;该克隆片段ND5和ND6的蛋白分子量分别为68.2621和19.0386kDa,等电点分别为9.19和4.25,与9种熊科动物的均十分接近。[结论]四川黑熊与9种熊科动物的ND5和ND6基因及其编码蛋白具有很高的相似性,在功能上具有一致性,尤其与东北黑熊在功能上具有高度一致性。     

弓形虫GJS株表面抗原1基因的克隆及真核表达质粒的构建

根据GenBank数据库中的RH株弓形虫表面抗原1(SAG1)基因序列设计1对引物,应用PCR技术从弓形虫GJS株速殖子基因组DNA中扩增编码SAG1的基因片段.PCR产物经纯化、酶切后定向插入pcDNA3.1(+)真核表达载体,转化至大肠杆菌DH5α,经酶切及PCR鉴定后测序,并进行序列分析.结果表明:从弓形虫GJS株基因组DNA中扩增出1 008 bp的特异SAG1片段,大小与预测值相符,与已知的SAG1基因核苷酸序列(GenBank登录号:S76248)的ORF和氨基酸序列的同源性均为99%.     

纤维素酶系基因的克隆与序列分析

根据Gen Bank已报道的枯草芽孢杆菌的基因序列,设计特异性引物,经PCR分别从B.subtilis L、B.subtilis K基因组中扩增得到3个纤维素酶基因序列,基因片段分别长约700、1 500、1 700 bp。连接到T载体上进行测序,获得该3个纤维素酶基因片段的DNA序列,在线比对分析表明3个基因的部分碱基序列与已报道的纤维素酶基因的序列同源性达99%。这3个基因的全序列在Gen Bank中未见报道,且通过软件对比,三者没有任何相似性。根据3个纤维素酶基因的来源分别命名为Lcen、Ken、Kkg。借助软件分析确定Lcen基因全长699 bp,基因序列为1个完整的阅读框,连续编码232个氨基酸。Ken基因全长1 500 bp,连续编码499个氨基酸。Kkg基因全长1 686 bp,基因序列为1个完整的阅读框,连续编码561个氨基酸。3个基因均属于纤维素酶家族大类。     

石蒜捕光叶绿素a/b结合蛋白基因的克隆和序列分析

根据捕光叶绿素a/b结合蛋白基因(Cab)家族中的保守序列设计PCR引物,扩增出的约350bp cDNA小片段为分子杂交探针,对构建的石蒜全长cDNA文库进行杂交筛选,并结合PCR分析对阳性克隆进行测序分析验证,克隆了石蒜中1个Cab基因全长cDNA,命名为LrCab(GenBank 登记号:GU362887).LrCab长为1073 bp,从第50 bp开始至847bp含有1个开放阅读框和1个终止密码子,编码 265个氨基酸.LrCab编码的蛋白质预测的等电点和分子量分别为5.14和28 010.00 u.通过比较分析,LrCab DNA序列(GU362887)和编码的氨基酸序列与其他种属的Cab基因编码氨基酸序列相似性很高,表明Cab家族基因在进化过程中保守性高.     

加工番茄无离层突变及离区JOINTLESS基因序列分析

以加工番茄有离层品种09872和无离层品种08003为试验材料,分别提取基因组DNA及有离层品种09872的花梗离区总RNA,设计引物扩增并测序,得到JOINTLESS基因序列(1 286 bp)、jointless(j)突变序列(347 bp)及JOINTLESS基因表达序列(797 bp)。采用生物学软件对序列进行生物信息学分析,结果表明,加工番茄的JOINTLESS基因编码序列与普通栽培番茄品种相比,有2个碱基发生突变;jointless(j)突变是由JOINTLESS基因第1个外显子的部分序列连同起始密码子上游共939 bp的碱基缺失所引起;JOINTLESS基因共编码265个氨基酸,预测所得的蛋白质整体表现为亲水性。经系统发育分析得出,加工番茄JOINTLESS基因序列与矮牵牛中该基因序列相似性最高,与葡萄物种的相似性最低。     

珠颈斑鸠线粒体ND1和ND2基因序列测定与特征分析

根据其他物种的线粒体基因序列设计引物,采用PCR方法扩增珠颈斑鸠（Streptopelia chinensis）线粒体基因组中编码NADH亚基基团的ND1、ND2基因片段,测序后获得了NDl和ND2基因的全序列。结果表明,NDl基因序列长度为966bp,编码321个氨基酸的多肽,A、G、C、T碱基组成分别为27．0％、12．7％、33．9％、26．4％;ND2基因序列长度为1041bp,编码346个氨基酸的多肽,A、G、C、T碱基组成分别为32．5％、9．7％、33．8％、24．0％。NDl、ND2基因的起始密码子均为ATG,但终止密码子分别为AGA、‘rAG。将珠颈斑鸠NDl、ND2基因核苷酸序列及氨基酸序列与其他11种鸟类进行比对,结果表明,珠颈斑鸠与原鸽的亲缘关系最近,与形态学分类一致。根据12种鸟类NDl和ND2氨基酸序列。采用NJ法构建了12种鸟类系统进化树。     

猪输血传播病毒2型福建株ORF1基因特征

参照GenBank中登录的猪输血传播病毒2型(Torque Teno Virus genogroup 2,TTV2) ORF1基因序列特征设计特异性引物,采用PCR方法对从福建省某猪场采集的血液基因组DNA中扩增到猪输血传播病毒2型ORF1基因,并对目的片段进行克隆测序.结果表明,所扩增的目的片段编码有TTV2完整的ORF1基因开放阅读框,全长为1 875 bp,编码有624个氨基酸.运用生物信息学软件,将获得猪TTV2福建株ORF1基因序列和GenBank中登录的猪TTV2进行分析比较,其和FJ/China/2010/TTV2/2(GenBank登录号JF937656)的同源性高达98.8％,和四川株(GenBank登录号HQ204188)核苷酸同源性最低,仅为83.5％.从遗传进化上看,猪输血传播病毒2型可以分为3个明显的分支亚群,福建分离株在基因1群和基因2群均有分布,推测福建省存在多亚群猪TTV2流行.     

普通荞麦种内丝裂原活化蛋白激酶序列分析

【目的】比较普通荞麦Fagopyrum esculentum种内丝裂原活化蛋白激酶基因(MAPK)序列的差异,研究MAPK基因序列在普通荞麦栽培进化过程中的变化。【方法】以普通荞麦的9个栽培品种和3个落花落果野生种质为材料,PCR特异性扩增获得MAPK基因的保守片段,对基因片段序列进行差异分析和蛋白结构预测。【结果】荞麦MAPK基因cDNA全长为2 835 bp,开放阅读框1 827 bp,编码609个氨基酸,含有TDY的三肽模块,为植物D组MAPK蛋白。PCR扩增获得12个供试材料的MAPK序列,其单型不变位点为723个,多态位点为70个。9个栽培品种间开放阅读框(ORF)区域无序列差异,3个野生种质间ORF区域也无序列差异。栽培品种与野生品种的ORF区域序列含有8个差异位点,编码3个差异氨基酸。其中,ORF区域第13位点组氨酸(H)→酪氨酸(Y)发生置换,导致1个α-螺旋构象发生变化。【结论】普通荞麦MAPK基因序列高度保守,栽培驯化对ORF区域第13位点差异氨基酸的选择具有高度一致性。     

鳗鲡疱疹病毒FJ株ORF51基因的克隆及生物信息学分析

为了解本课题组分离的鳗鲡疱疹病毒福建株（AngHV-FJ） ORF51的结构特征,扩繁了 AngHV-FJ ,提取其基因组DNA ,经PCR扩增,获得ORF51基因,将其克隆至pMD19-T载体中,进行DNA测序,用生物信息学方法分析AngHV-FJ ORF51基因及其编码蛋白的结构和功能。结果显示,扩增到长约720 bp的ORF51基因序列,其与GeneBank上鳗鲡疱疹病毒欧洲株（AngHV-1） ORF51基因的序列完全一致。该基因编码239个氨基酸;预测ORF51基因编码蛋白的分子量为26107.1 Da ,等电点为7.66,是疏水性蛋白且偏碱性;有4个跨膜域;抗原表位预测显示抗原性较好;结构预测显示,存在1个N-糖基化位点、1个O-糖基化位点、10个磷酸化位点;亚细胞定位预测显示其主要存在于内质网。本研究为解析ORF51的功能及开展AngHV的基因工程疫苗研究奠定了基础。     

金翅雀（1）

金翅雀[Carduelis sinica（Linnaeus）]别名有金翅、绿雀、谷雀、铜铃、黄豆雀、菜子雀、黄楠鸟、金翅儿、芦花雀、黄弹鸟、小碛鹆、芦花黄雀。英文名Greenfinch;Grey-capped Greenfinch;Chinesen Greenfinch;Oriental Greenfinch。属鸟纲（Aves）雀形目（Passerifomes）雀科（Fringillidae）金翅（雀）属（Carduelis）。     

1-(1H-1,2,4-三唑基)-1-环(氧)烷基-取代苯甲醇的合成

用α-(1H-1,2,4-三唑-1-基)取代苯乙酮与二卤化物进行取代关环反应,合成了8个新型三唑类化合物,其化学结构经IR、^1H NMR、MS和元素分析确证,讨论了化合物的反应性质及波谱性质,化合物的生测数据表明,化合物对小麦锈病有良好抑制作用。     

Eta-1 (osteopontin): an early component of type-1 (cell-mediated) immunity

Cell-mediated (type-1) immunity is necessary for immune protection against most intracellular pathogens and, when excessive, can mediate organ-specific autoimmune destruction. Mice deficient in Eta-1 (also called osteopontin) gene expression have severely impaired type-1 immunity to viral infection [herpes simplex virus-type 1 (KOS strain)] and bacterial infection (Listeria monocytogenes) and do not develop sarcoid-type granulomas. Interleukin-12 (IL-12) and interferon-gamma production is diminished, and IL-10 production is increased. A phosphorylation-dependent interaction between the amino-terminal portion of Eta-1 and its integrin receptor stimulated IL-12 expression, whereas a phosphorylation-independent interaction with CD44 inhibited IL-10 expression. These findings identify Eta-1 as a key cytokine that sets the stage for efficient type-1 immune responses through differential regulation of macrophage IL-12 and IL-10 cytokine expression.     

中英文对照专业时文数据库的新视野(1)

现代数据库始于1970年,当时E.F.Codd出版了题为"大型共享数据库的数据关系模型"的论文.他的思想实现了数据的逻辑管理独立于物理位置,大大简化了应用程序开发人员的工作.     

南阳牛HCRTR1基因编码区单核苷酸多态性分析

 【目的】研究南阳牛HCRTR1基因编码区单核苷酸多态性,为利用遗传标记进行肉牛选育奠定基础。【方法】以122头南阳牛为试验动物,利用PCR-SSCP及测序方法研究了HCRTR1基因全部编码区序列的多态性,并对发现的SNP位点进行了遗传特性及单倍型分析。【结果】在该基因的编码区首次发现11个SNP位点,分别为G322A、G384C、T420C、C423T、T481A、C510A、T627C、C631T、G690A、G714A和C736T,其中在322、481、631和736bp处的突变都导致了氨基酸的改变,而其余7处均为同义突变。在322、510和736 bp处的SNP表现为中度多态,PIC分别为0.3731、0.3190和0.2851,其余8处的SNP位点均呈现低度多态。对多态位点进行单倍型分析,发现在南阳牛122个个体中共检测到29种单倍型, 其中有2种单倍型的频率超过了10%;7种单倍型的频率小于1%;其余20种单倍型的频率均在1%～10%。【结论】本研究测定了南阳牛122个个体的HCRTR1基因的多态性,在全部编码区检测到11个多态性单核酸变异,构成了29种单倍型。     

2-(4-氯苯基)-1-(1H-1,2,4-三唑-1-基)-2-丁醇的合成研究

唑醇类杀菌剂对植物的常见致病菌如鞭毛菌、担子菌、半知菌等均有很好的预防和治疗作用,在农药领域应用十分广泛。以对氯苯丙酮为原料,经Corey-Chaykovsky环氧化,再与1H-1,2,4-三氮唑缩合,合成了唑醇化合物2-(4-氯苯基)-1-(1H-1,2,4-三唑-1-基)-2-丁醇。探讨了环氧化反应的关键因素,收率可达97.9%。对缩合反应条件进行了正交优化：以碳酸氢钠为碱催化剂,环氧化物、1H-1,2,4-三氮唑、碳酸氢钠的摩尔比为1.0∶1.5∶2.1,反应温度130℃,反应5 h,缩合收率可稳定在82.0%以上。     

贵草1号多花黑麦草的选育

贵草1号多花黑麦草是贵州牧草种籽繁殖场和贵州省草业研究所以美国引进的阿倍德多花黑麦草为基础,从种子繁殖群体中选择典型的、优良的植株.混合播种,反复选择、改良而成的高产优质新品系,全生育期235d左右,品比试验鲜草产量迭6710.29kg/667m2.贵州省区域试验平均鲜草产量达4 963.6kg/667m2,初花期株高130～150 cm,孕穗期株高80～120 cm,分蘖能力强,生长速度和再生速度快,叶量大,叶片长25～37 cm,叶宽1～1.5 cm;抗病性强、草质柔嫩、牲畜适口性好、利用价值高、经济效益好,特别适宜黔中地区种植,是发展种草养畜业的优质牧草品种.