芥菜种质资源的RAPD和ISSR分析

利用RAPD和ISSR标记对28份芥菜种质资源进行遗传多样性分析,20个RAPD引物共扩增出162条清晰的谱带,其中140条显示多态性,平均每个引物扩增出7.0条多态性谱带.18个ISSR引物共扩增出143条清晰的谱带,其中多态性谱带124条,平均每个引物扩增出6.9条多态性谱带.基于RAPD和ISSR两种标记,利用UPGMA分别构建了28份芥菜资源的聚类树状图.结果表明,RAPD和ISSR分别聚类以及两种标记混合聚类均将28份芥菜种质分为3类:第Ⅰ类群中包括了15份种质;第Ⅱ类群中包括了9份种质;第Ⅲ类群中包括了4份种质.     

利用RAPD标记对桃品种特殊种质分析

采用RAPD技术，用从200 个随机引物筛选的22 个10碱基随机引物对148个桃品种进行DNA扩增。根据各品种扩增的RAPD带和聚类结果，分析具特殊位点，并在聚类图中聚在外围、相似系数较低的品种有玉露蟠桃、秋蜜、爱保太、佛尔蒂尼莫蒂尼和金皇后等特殊品种种质。从分子生物学角度，为种质保存和育种提供理论依据。     

石斛属植物遗传多样性RAPD分析

应用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,对石斛属植物16个种进行了基因组DNA多态性分析.从82个随机引物中筛选出20个多态性好的引物进行RAPD扩增,扩增DNA片段数据用UPGMA聚类法构建系统发育树.20条引物共扩增出142条带,多态性带118条,约占总数的83.1%.聚类结果显示RAPD分子标记构建的系统发育树与经典分类系统一致.RAPD标记可为石斛属植物的系统分类研究提供分子生物学依据.     

豆瓣菜种质资源遗传多样性的RAPD和ISSR分析

以8个豆瓣菜的品种为试材，用筛选出的79个RAPD引物和34个ISSR引物对这8个品种的基因组DNA进行扩增，分别扩增出361条和179条谱带，每个引物扩增出的带在3～10条之间，平均每个引物扩增出约5条带。根据所得的条带进行聚类分析，两种标记产生的聚类图存在一些差异，但它们都可以较好地将8个品种按亲缘关系的远近划分为3个不同的类群。Mantel测试得出相关系数r=0．58155，表明RAPD和ISSR两种分子标记技术的相关度很低。     

中国部分兰花品种RAPD分析

用随机引物扩增多态DNA（RAPD）分析技术，对中国兰花迸行品种鉴定和分类研究。使用10种20个碱基的引物，对19个中国兰花品种的基因组DNA进行扩增，其产生83条扩增带，其中80条大多态性带。每个兰花品种都有其特有的扩增带可与其它品种区别开来。这种特异的条带可作为一个品种的分子标记应用于品种鉴定和分类RAPD对基因组的分析结果与传统分类学的结果基本相符。各个种内的不同品种问亲缘关系接近，而不同种间差异较丸RAPD技术为中国兰花品种的鉴定和分类提供了新的途径     

不同产地人参种质资源RAPD和SSR分析

以15个产地人参种质资源为试材,采用RAPD和SSR分子标记技术对其遗传多样性进行分析。结果表明:2种分子标记均能揭示不同地区人参种质间的遗传多样性。共筛选出11条RAPD随机引物,平均每条引物可扩增出3~17条DNA片段,共扩增出104条清晰条带,多态性条带100条,多态性百分率为96.15%,揭示供试材料间遗传相似系数(GS)为0.505 3~0.989 5,平均值为0.760 4。筛选出5对SSR引物,平均每对引物可扩增出1~8条DNA片段,共扩增出38条清晰条带,多态性条带35条,多态性百分率为92.11%,揭示供试材料间遗传相似系数(GS)为0.400 0~0.960 0,平均值为0.742 1。RAPD和SSR标记的聚类分析在分类上稍有差异,但总体趋势一致,RAPD、SSR及RAPD+SSR均将样品聚为三大类,均能揭示它们之间的亲缘关系,为人参种质资源的收集与利用奠定了基础。     

甘肃42份枣种质资源遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR分子标记技术对甘肃省42份枣种质资源的遗传多样性进行分析。结果表明:筛选出8条引物共扩增出76条DNA谱带,其中多态性谱带70条,多态性位点比率92.0%;按照42份枣种质间的遗传距离构建UPGMA聚类图,42份枣种质被划分为4个大类、10个亚类,遗传多样性处于较高水平;从聚类结果看,原产自甘肃省的枣品种遗传背景相似,主要根据原产地进行聚类,目的性品种交换现象较少。另外,对6个未知身份的枣品种进行了初步鉴定。     

24个大果沙棘品种的RAPD分析

为了解沙棘种质资源的遗传多样性和品种间的亲缘关系,以24个大果沙棘品种为材料,利用随机扩增多态性DNA(RAPD)方法进行沙棘的遗传多样性分析。从120个随机引物中筛选出多态性丰富的18个引物用于扩增反应,在24个大果沙棘品种中检测到171个RAPD位点,其中多态性DNA带112条,多态位点百分比为65.5%,表明大果沙棘品种具有丰富的遗传多样性;在RAPD分析的基础上,对大果沙棘品种进行了聚类分析,结果表明,以相似系数0.58处作为分界,可将供试的24份大果沙棘种质分为4类。     

ISSR．PCR技术在桂花品种分类研究中的应用

 利用ISSR．PCR方法对桂花的19个品种进行了基因组多态性分析，从74个ISSR引物中筛选出13个多态性引物用于正式扩增，共扩增出9o条DNA片段，其中多态性DNA条带79条，占总扩增片段的87．8％ ，平均每个引物扩增的DNA带的数目为6．92条。根据ISSR扩增结果，应用RAPDistance软件进行Nei相似性系数和遗传距离计算，利用UPGMA法构建聚类树状图。聚类分析的结果把供试桂花的l9个品种分为8个大类，并对4个品种群的遗传关系和种下分类系统进行了探讨。     

香石竹品种的RAPD 标记

 用随机扩增多态DNA (RAPD) 技术, 选用4 个随机引物, 对87 个大花型香石竹品种总DNA进行随机扩增。4 个引物均得到了稳定的RAPD 图谱。扩增出的片段分子量在500～4300 bp 之间, 每个随机引物扩增出的条带数在8～12 条之间, 共扩增出2113 个条带, 平均每个引物扩增的DNA 条带数为915 条。根据DNA 谱带计算品种间遗传距离, 对87 个品种进行了聚类分析, 分为10 个组群, 组群间差异较大, 组群内差异较小。     

云南芋种质资源遗传多样性的AFLP分析

 采用荧光标记引物的AFLP分子标记技术, 用筛选出的“3 + 2”引物组合, 对48份云南芋种进行遗传多样性分析, 3对引物共扩增出184个DNA位点, 平均每对引物可检测出56.3个多态性位点,多态性位点高达91.8% , 云南芋种质资源在DNA分子水平上表现出极为丰富的遗传多样性。聚类分析表明: 野生种质和栽培种质的亲缘关系较远, 栽培种质基于AFLP标记的分类结果与形态性状基本一致, 少数材料差异较大。     

茄子耐盐种质亲缘关系的RAPD分析

利用RAPD标记对14份耐盐茄子种质资源进行遗传多样性分析。结果表明：从100个引物中筛选出10个多态性较好的引物,共扩增出102条带,多态性条带所占的比例为77.45%。聚类分析结果显示：14份耐盐茄子材料的遗传相似系数在0.316～0.975之间|在遗传相似系数0.47处可将14份耐盐茄子材料分为3大类,大部分种质资源（85.71%）都聚在第3类（栽培种）,表明收集到的茄子耐盐种质亲缘关系较近。     

Characterization of white sapote (Casimiroa edulis Llave & Lex.) germplasm using floral morphology,RAPD and AFLP markers

Floral morphology, random amplified polymorphic DNA (RAPD), and amplified fragment length polymorphism (AFLP) were used to characterize and verify genetic diversity within a white sapote cultivar collection and to develop molecular markers for germplasm identification. On the basis of floral morphology, the cultivars were classified into three types: type I included 23 cultivars with large ovaries and small anthers; type II included 13 cultivars with small ovaries and large anthers; and type III included one cultivar, named ‘Maltby’, with a large ovary and large anthers. DNA was isolated from 39 cultivars of white sapote and subjected to RAPD and AFLP analysis using 24 and 7 primers, respectively. One hundred and sixty-eight RAPD and 286 AFLP bands were used to assess genetic characterization among white sapote. Sixty percent of the RAPD and 77% of the AFLP amplification products were polymorphic among accessions. RAPD or AFLP markers differentiated all white sapote cultivars effectively. Moreover, each flower type was characterized as specially associated with two RAPD bands. UPGMA dendrograms based on RAPD and AFLP data, showed the majority of the cultivars from flower type I and flower type II clustering together. Finally 101 RAPD markers and 220 AFLP markers were used to construct a neighbor-joining dendrogram. This showed that the 37 cultivars could be classified into six distinct clusters, between which the similarity coefficient was as low as 0.00–0.55, even though the cultivars were morphologically very similar. The remaining two cultivars namely ‘Smathers’ and ‘Maltby’ were found genetically very distant from the other cultivars in RAPD, AFLP or combined RAPD and AFLP based dendrograms. The results suggested that the level of genetic variation among white sapote cultivars is diverse and the morphological and molecular data may lead to representation of the cultivar relationships as well as flower type discrimination.     

四川主栽茶品种亲缘关系的RAPD分析

利用RAPD标记对四川主要产茶区具代表性的36份茶树栽培品种的亲缘关系进行分析。从50条引物中筛选出扩增效果良好的16条, 共扩增出167条谱带, 其中, 多态性带为158条(占94.61% ) ,遗传距离的变异范围在0.149～0.679之间。UPGMA聚类结果将36份茶树栽培品种分为3个复合组和2个独立组, 聚类结果与茶树品种的来源有关。     

云南25份石榴资源的RAPD分析

用RAPD标记技术分析了25份云南地方石榴材料(品种或类型)的亲缘关系,从128个随机引物中筛选出12个重复性好、条带清晰的多态性引物,并用这些引物对25份云南石榴材料进行RAPD扩增,共扩增出110条谱带,平均每个引物9.17条。多态性程度达到71.8%。用Statistic分析软件计算出的遗传距离为0.027～0.342,对25份材料进行了UPGA法聚类,亲缘关系树状图显示,25份云南石榴材料的遗传背景较复杂,难以划分类群。研究结果与生产上根据风味、花色、皮色、子粒颜色、核软硬程度等某一性状及栽培目的的分类方法不一致。     

中国野生葡萄副梢长度的RAPD标记

为培育短副梢葡萄品种,对中国野生葡萄副梢长度性状进行调查,以葡萄短梢×长梢的葡萄种间杂交组合(燕山-1×河岸葡萄)F183个单株为试材,采用BSA法和RAPD技术,通过369个随机引物的筛选,获得了1个与中国野生葡萄副梢长度基因连锁的RAPD标记OPB07-2000,并在中国野生葡萄17个种46个株系中得到验证。这就为葡萄短副梢分子辅助育种提供了科学依据,进而从根本上解决葡萄生产上夏季副梢生长过旺的问题。     

黄瓜栽培种、近缘野生种、种间杂种及其回交后代的RAPD 分析

 黄瓜栽培种、黄瓜野生变种、近缘野生种、种间杂交种及其与黄瓜回交自交的后代以及甜瓜为试材, 采用RAPD 方法探讨其亲缘关系。对23 份试材进行扩增, 筛选出31 条随机引物的扩增产物进行结果分析, 共产生375 个位点, 具多态性位点占90. 0 % , 平均每条扩增出6. 3 条。通过UPGMA 聚类分析,以遗传距离0. 37 为阀值, 可将23 份试材归为黄瓜、近缘野生种、种间杂交种及甜瓜亚属种4 类。     

几种玉兰亚属植物的RAPD亲缘关系分析

 以玉兰亚属的20个材料(含种和品种)为研究对象，用RAPD技术对其亲缘关系进行分析。从55个随机引物中筛选出15个，对所有供试材料进行扩增，共获得274条DNA谱带，其中262条为多态性带。建立的基于RAPD结果的亲缘关系树形图显示玉兰亚属的基因背景非常复杂，类群划分较为困难，说明中国的玉兰亚属种质资源非常丰富。