大型奶牛养殖环境源大肠埃希菌毒力基因与系统进化分群

对甘肃2个大型奶牛养殖环境的大肠埃希菌(Escherichia coli,E.coli)分离株进行系统进化分群和毒力基因分布情况研究,分析系统群与E.coli主要毒力基因之间的潜在关联,以期为E.coli的研究和防治提供参考。利用PCR方法对281株E.coli分离株进行系统进化分群鉴定和毒力基因检测。281株E.coli分离株被分为8个系统进化群,B1、A、E、F、D、C、B2群和隐支Ⅰ或Ⅱ的占比分别为51.96%,28.47%,11.39%,2.85%,1.78%,1.07%,0.71%,0.36%,有4株为未知系统群。毒力基因检测结果显示,ompA、ibeB、ompT、iroN、traT、iucD、fyuA和irp2的阳性率分别为100%,98.58%,76.16%,71.53%,68.33%,64.06%,30.96%,30.25%。不同年份和养殖环境的部分毒力基因的分布存在明显差异,携带8个所鉴定的毒力基因的菌株在B1、B2群和粪土源中的分布较多;traT在2017年的分布明显低于2018和2019年;traT和iroN在粪土源分离株中的分布高于污水源。系统群与毒力基因的关联...     

华东部分地区禽致病性大肠杆菌系统进化分群及毒力相关基因的检测

采用PCR方法,对华东地区分离的66株禽致病性大肠杆菌(APEC)进行系统进化分群和9个毒力相关基因的检测。APEC分离株在各系统进化群中均有一定比例的分布,其中A群为33.4%(22/66),B1群为31.8%(21/66),B2群为13.6%(9/66),D群为21.2%(14/66)。毒力基因分布检测结果表明:编码自分泌黏附素的aatA和aatB、侵袭素ibeA、空泡形成毒素基因vat、温度敏感性血凝素tsh、摄铁系统的ybtX、耶尔森毒力岛内的ireA、VI型分泌系统的clpV1和vgrG等基因的分布率分别为59.1%、13.6%,7.58%、37.9%、36.4%、25.8%、6.06%、21.2%和42.4%,其中aatA、tsh、vat、ybtX、ireA、clpV1 6个基因在各进化群中分布较为广泛,而个别基因如ibeA仅在B2群中检出,在其他进化群没用检出。本研究有助于进一步了解禽大肠杆菌病的分子流行病学特点,并为该病的防控提供了基础。     

大肠杆菌分子分型方法研究进展

大肠杆菌是一种条件致病性的人畜共患病病原菌,对人和动物健康有着严重的危害.因致病性大肠杆菌造成的动物感染和动物产品污染在动物健康和公共卫生安全上是一个严重的问题.大肠杆菌的分子分型和系统进化分群对于准确、快速地确定大肠杆菌的污染及感染来源,判定不同大肠杆菌致病性之强弱,保障人类和动物健康,改善公共卫生环境具有重大意义....     

江苏省如皋地区母猪子宫内膜炎大肠杆菌的进化分群和耐药特性

为了分析江苏省如皋地区母猪子宫内膜炎大肠杆菌(E.coli)致病性、系统进化分群和耐药情况,本试验于2019—2021年从如皋地区猪场采集疑似患子宫内膜炎母猪的阴道分泌物和脓性分泌物样品204份,采用常规的细菌分离鉴定方法和PCR方法进行E.coli分离鉴定,通过人工感染试验、三重PCR法和K-B药敏纸片法分析其致病性、系统进化分群和耐药性。结果显示,共分离得到108株E.coli,其中87株对小鼠具有致病性,致死率介于40%～100%,87株致病性E.coli中A群有12株(13.8%)、B1群有13株(14.9%)、B2群有32株(36.8%)、D群有30株(34.5%),以B2+D群流行为主(71.3%);87株致病性E.coli对阿莫西林、氨苄西林、链霉素等10种药物耐药率介于51.7%～100%,对其他药物耐药率介于9.2%～28.7%,呈现多重耐药性,以耐10(18.4%)、耐11(16.1%)和耐12(14.9%)种药物菌株为主。结果表明,从该地区分离的87株致母猪子宫内膜炎E.coli以B2+D群流行为主,呈现严重多重耐药性。本试验结果为母猪子宫内膜炎大肠杆菌流行病学调...     

新疆地区腹泻仔猪源大肠杆菌的分群、血清型鉴定及耐药性分析

旨在了解新疆地区腹泻仔猪源大肠杆菌的系统进化分群、血清型及耐药性。本研究对154份腹泻仔猪粪便样品进行大肠杆菌的分离鉴定,采用多重PCR方法对分离株进行系统进化分群和O血清型鉴定,通过K-B纸片法对其进行药物敏感性检测并通过PCR方法进行耐药基因检测。结果显示：共分离到154株大肠杆菌,包括ETEC(n=24)、STEC(n=21)、EPEC(n=1)、EPEC/STEC(n=2)、ETEC/STEC(n=1)和ETEC/EPEC(n=1),其他104株。系统进化分群显示,多数菌株属于B1(37%)和A群(31%)。定型菌株44株,分别属于10种血清型,以O154、O12、O8、O141和O175为主要流行血清型。151株(98%)为多重耐药菌,对复方新诺明、四环素、氨苄西林、链霉素和氯霉素的耐药率为81%～100%,对阿莫西林/克拉维酸、头孢噻肟、庆大霉素、头孢曲松、环丙沙星和阿米卡星的耐药率为31%～66%,对左氧氟沙星、多黏菌素B、头孢他啶、头孢吡肟、氨苄西林-舒巴坦、哌拉西林-他唑巴坦和亚胺培南的耐药率为1%～19%。耐药基因tetA(88%)、tetG(60%)和cmlA(4...     

大型奶牛养殖场粪污处理系统与泌乳牛舍饲养环境控制新技术的应用

现代牧业（集团）股份有限公司目前共建成14个万头牧场。2个2万头牧场。其中6个牧场采用了循环经济模式的新式环保粪污处理系统;2个两万头牧场的泌乳牛舍采用了饲养环境恒定的低断面横向通风牛舍。下面就这两项新技术分别做详细论述。     

规模化奶牛养殖场污染的控制措施

随着奶牛养殖业的不断发展,奶牛养殖场产生的粪便、污水等污染物对人畜健康、畜牧生产、自然环境造成了各种危害。文章综述了当前减少奶牛场污染的控制措施,并简要探讨规模化奶牛场生态养殖模式的建立。     

牧场奶牛的分群管理

奶牛的分群管理是牛场最基本的管理手段之一，但是该项工作的进行的好坏对于牛群的生产性能和整个牛场的盈利能力都有巨大的影响。     

不同系统进化群鸡源大肠杆菌耐药性调查分析

[目的]通过系统进化群和耐药性分析,了解鸡源大肠杆菌致病菌株的分布情况及耐药特征,为有效控制鸡大肠杆菌病提供依据。[方法]采用微量肉汤稀释法测定菌株耐药表型（MIC）,采用PCR法检测耐药基因和系统进化群分群试验,采用SPSS17.0软件进行差异显著性分析。[结果]低致病群B1（38.1%）和非致病群A（34.0%）菌株分布相对较多,其次是高致病群D（21.2%）和B2（6.2%）;分离菌株对氨苄西林（87.2%）、四环素（87.0%）、复方新诺明（87.0%）和磺胺异噁唑（80.0%）耐药严重,多重耐药率高达98.86%,但对多粘菌素E敏感;耐药基因sul1（71.0%）、sul2（44.8%）、sul3（18.7%）、tetA（42.2%）、tetB（15.8%）、tetM（7.3%）均有检出,tetC、tetO、tetK、tetL、tetW均未检出,9.13%菌株同时携带3种sul基因,仅有一株菌同时携带3种tet基因。表型耐药菌株携带耐药基因的能力明显高于非耐药菌株（P<0.05）。高致病群B2、D群耐药程度较B1和A群严重,对氧氟沙星、庆大霉素、大观霉素、头孢噻呋、磺胺异噁唑、复方新诺明、奥格门丁等7种药物差异显著（P<0.05）。[结论]我国鸡源大肠杆菌高致病菌株检出率高,且耐药程度相对严重,在适宜条件下更易导致鸡群发病且难以控制。     

畜禽养殖场环境微生物致病性和耐药性调查研究

为了解掌握养殖场中环境微生物对养殖业和公共卫生造成的影响,初步对我国养殖场环境微生物进行了研究。对吉林、湖北等省份的部分养猪场和养鸡场环境采样,并进行大肠杆菌和沙门氏菌分离鉴定,同时对从鸡舍和猪舍内分离大肠杆菌和沙门氏菌进行动物致病性实验及对13种抗生素的耐药性实验。实验结果表明,所有实验的沙门氏菌和90.7%的大肠杆菌菌株对小白鼠有致病性;所有分离菌株对磺胺类药物的耐药性非常严重,其次是对四环素,对其他药物也有不同程度的耐药性。     

新疆克拉玛依地区奶牛源致病性大肠杆菌的血清型、系统进化群及MLST分析

试验对新疆克拉玛地区106头健康成年荷斯坦奶牛的新鲜粪便进行了致病性大肠杆菌的分离鉴定、分型及遗传进化分析,初步掌握了调查地区奶牛致病性大肠杆菌的流行情况。参考USDA检测法,对106份粪便样品选择性增菌,分别利用麦康凯和伊红美蓝琼脂培养基对大肠杆菌进行分离纯化鉴别,通过PCR方法鉴定,获得55株大肠杆菌分离株,对这些分离株进行致病性大肠杆菌血清型鉴定、系统进化群及多位点序列分型（multilocus sequence typing,MLST）分析,利用goeBURST和Mega 7.0生物学软件进行聚类和进化研究,并进行流行病学分析。结果显示,106头健康荷斯坦奶牛的新鲜粪便中大肠杆菌的检出率为51.89%,55株大肠杆菌分离株共鉴定出9种与致病性相关的血清型,检出率为54.55%,其中肠致病性大肠杆菌（EPEC）、肠侵袭性大肠杆菌（EIEC）和肠产毒性大肠杆菌（ETEC）血清型检出率分别为21.82%、18.81%和14.55%,优势血清型为O142∶K86（B）和O124∶K72（均为10.91%）,前者属于肠致病性大肠杆菌,后者属于肠侵袭性大肠杆菌,而肠出血性大肠杆菌（EHEC）血清型检出率为0;系统发育群结果表明,55株大肠杆菌中B1群所占比例最高,为70.91%,其次为A群,占21.82%,D群所占比例较少,占7.27%,B2群未检测出;MLST分析可知,分离株中存在24个ST型,其中优势ST型为ST154（18.18%）;进化树分析显示有7个进化分支。结果表明,新疆克拉玛依地区健康成年奶牛粪便大肠杆菌多样性丰富,不仅存在多种致病性大肠杆菌,而且大肠杆菌菌株之间还存在一定的进化关系。因此,健康成年奶牛粪便也具有潜在的安全风险,应加强对奶牛粪便致病性大肠杆菌的检测和监控。     

规模化奶牛养殖场对环境污染的影响与防治

奶牛养殖场产生的大量固体废弃物和养殖污水对环境造成了严重污染.建议采用预防为主的措施,从源头控制、运用蚯蚓消解、农牧结合三方面减少其对环境的污染;通过技术手段对奶牛粪便进行有效处理并加以综合利用,这对于减轻粪便污染、减少资源浪费、改善生态环境具有重要意义.     

Study on Drug Resistance of Escherichia coli Isolated from Chicken and Swine in Organic Farm

To determine the drug resistance of E.coli strains from swine and chicken in organic farm,collection of stool specimens was conducted in one organic farm in Conghua city,Guangdong province in 2014,in which 118 E.coli strains were separated,including 55 from chicken and 63 from swine.The sensitivity of the E.coli strains from swine and chicken to 18 kinds of drugs was detected through agar dilution method.Similar properties in drug resistance were observed both in E.coli strains from swine and chicken in the same organic farm.In consideration of the resistance rate,samples were relatively sensitive to ceftazidime,cefquinome,cefoxitin,amikacin,apramycin,gentamicin,neomycin,florfenicol,chloramphenicol,imipenem,ciprofloxacin and olaquindox (chicken 0 to 21.8%;swine 0 to 14.3%).These isolates showed moderate resistance to ampicillin and streptomycin (chicken 29.1% to 38.2%;swine 23.8% to 27.0%).About 56.4% chicken isolates and 47.6% swine isolates showed resistant to more than 3 kinds of drugs.However,severe resistance was observed in trimethoprim-sulphamethoxazole,tetracyclineand and doxycycline (chicken 45.5%,76.4% and 72.7%;swine 50.8%,81.0% and 68.3%).The results also indicated that under organic farming mode,the drug resistance rates of E.coli strains from swine and chicken were relatively low in general.Multi-drug resistance existed but was relatively slight.Although the drug resistance rate to several specific antimicrobials was high,it was still lower than that in conventional farms.Since most studies focused on the drug resistance of the bacteria under conventional farming model,this study filled the blank of the research of drug resistance under organic farming model.     

有机农场鸡、猪源大肠杆菌耐药性研究

为了解有机养殖模式下鸡、猪源大肠杆菌的耐药情况,2014年从广东从化某有机农场鸡、猪粪便中采集并分离出118株大肠杆菌,包括55株鸡源大肠杆菌和63株猪源大肠杆菌,采用琼脂稀释法测定大肠杆菌对18种抗菌药的敏感性。结果发现,同一有机农场中,鸡源大肠杆菌与猪源大肠杆菌在耐药种类及耐药率上均呈现相似规律,对头孢他啶、头孢喹肟、头孢噻肟、头孢西丁、阿米卡星、安普霉素、庆大霉素、新霉素、氟苯尼考、氯霉素、亚胺培南、环丙沙星、喹乙醇等较敏感(鸡0~21.8%,猪0~14.3%),对氨苄西林、链霉素呈现轻度耐药(鸡29.1%~38.2%,猪23.8%~27.0%),对复方新诺明、四环素、多西环素呈现较严重耐药(鸡45.5%、76.4%和72.7%,猪50.8%、81.0%和68.3%)。鸡源大肠杆菌中3耐及3耐以上的菌株占56.4%,猪源大肠杆菌占47.6%。结果表明有机养殖模式下鸡、猪源大肠杆菌耐药率相对较低,多重耐药现象存在但相对轻微,对个别临床常用抗菌药耐药率虽较严重但比常规养殖场低。由于目前国内大部分学者致力于研究常规养殖方式下细菌耐药情况,本研究很好地填补了有机养殖模式下畜禽大肠杆菌耐药性研究的空白。     

新疆伊犁某牛场大肠杆菌耐药性调查

为了调查新疆伊犁某牛场饮水、饲料和粪样中分离的大肠杆菌对临床常用抗菌药物的耐药情况。本试验采用微量肉汤稀释法,对饮水源、饲料源、牛粪源样品中分离出的大肠杆菌进行最小抑菌浓度测定。结果显示,25份牛场饮水源样品,大肠杆菌分离率为100.0%（25/25）,对阿莫西林/克拉维酸（12.0%）、氨苄西林（4.0%）、诺氟沙星（4.0%）、恩诺沙星（8.0%）和安普霉素（8.0%）5种抗菌药物耐药;72份牛场饲料源样品,大肠杆菌分离率为65.3%（47/72）,对阿莫西林/克拉维酸（36.2%）、氨苄西林（19.1%）、诺氟沙星（4.3%）和安普霉素（4.3%）4种抗菌药物耐药;80份牛粪源样品,大肠杆菌分离率为100.0%（80/80）,对阿米卡星（12.5%）、氨苄西林（7.5%）、恩诺沙星（7.5%）、庆大霉素（5.0%）、诺氟沙星（2.5%）、环丙沙星（2.5%）、阿莫西林/克拉维酸（1.3%）和头孢噻呋（1.3%）8种抗菌药物耐药,仅对安普霉素敏感。该牛场分离的大肠杆菌对常用抗菌药物耐药情况一般,但中介率较高,须在临床治疗细菌性疾病中避免使用不敏感和中介率高的抗菌药物,养殖场饮水和饲料有被耐药大肠杆菌污染的风险。     

某肉鸡场鸡源大肠杆菌耐药性跟踪检测与分析

2012~2014年从辽宁某肉鸡养殖场采集300份鸡泄殖腔拭子,分离获得152株鸡源大肠杆菌。采用微量稀释法对152株鸡源大肠杆菌进行了14种兽用和16种人用抗菌药的药物敏感性测定,并参照CLSI肠杆菌判定标准进行判定。结果显示,鸡源大肠杆菌对兽用阿莫西林、氨苄西林、恩诺沙星、复方新诺明、磺胺异噁唑、四环素和人用哌拉西林、替卡西林、环丙沙星均产生明显耐药性,耐药率较高。对所分离的鸡源大肠杆菌耐药性检测结果与EUCAST发布的野生型菌株MIC值分布进行比较分析,耐药结果基本一致,但通过MIC值分布比较,结果显示出分离菌株的大观霉素、氨苄西林、恩诺沙星、复方新诺明、头孢噻吩、头孢呋辛、环丙沙星和妥布霉素药物的MIC值发生了明显右移,表明该肉鸡场大肠杆菌对上述抗菌药的耐药强度呈现逐渐增强的趋势。在养殖过程中应采取科学饲养和严格的生物安全措施防控疾病,科学合理使用抗菌药物,控制肉鸡场细菌耐药性的产生和传播。     

Tracking Detection and Analysis of Drug Resistance of Chicken-derived Escherichia coli in a Broiler Farm

From 2012 to 2014,300 chicken cloacal swab samples were collected from a broiler farm in Liaoning province,152 strains of chicken-derived Escherichia coli were isolated and identified.The 152 strains of chicken-derived Escherichia coli were detected on 14 kinds of veterinary antimicrobial drugs and 16 kinds of antimicrobial drugs for human by using trace dilution method,and reference to CLSI enterobacter decision criteria to determine.The results showed that chicken-derived Escherichia coli had obvious resistance to veterinary antimicrobial drugs (amoxicillin,ampicillin,enrofloxacin,trimethoprim-sulfamethoxazole,sulfafurazole,tetracycline) and antimicrobial drugs for human (piperacillin,ticarcillin,ciprofloxacin),the resistance rates were high.The resistance test results of isolated chicken-derived Escherichia coli comparing with the MIC value distribution of EUCAST wild type strains were same,but through comparing MIC value distribution,the results showed the isolates of spectinomycin,ampicillin,enrofloxacin,trimethoprim-sulfamethoxazole,cefalotin,cefuroxime,ciprofloxacin and tobramycin drugs MIC value moved to the right obviously,indicated that the antibiotic resistant strength of Escherichia coli increased gradually.The process of breeding and strict biosecurity measures should be taken scientifically to control diseases,and the antibacterial agents should be applied reasonably to control broiler farm production and propagation of bacterial drug resistance.     

新疆牛源大肠杆菌O157∶H7的分离鉴定及ERIC-PCR基因分型研究

为了了解牛源大肠杆菌（E.coli）O157∶H7在新疆地区的污染状况以及遗传多样性,探究不同地区分离菌株的遗传关系,为控制牛源E.coli O157∶H7的传播提供试验依据。将采集的样品在EC肉汤中进行增菌（37 ℃、180 r/min）,接着将增菌液划线接种到SMAC平板上,37 ℃培养箱中过夜培养18 h左右。挑取SMAC平板上白色或无色单菌落接种MUG培养基,37 ℃培养18 h左右,将无荧光样品接种到SMAC平板上,37 ℃培养18 h左右,隔天挑取白色或无色单菌落进行PCR鉴定,具有rfbE和fliC基因条带的即为阳性菌株。将阳性菌株进行肠杆菌基因间重复共有序列扩增（ERIC-PCR）指纹图谱聚类分析,分析菌株之间的同源性关系。ERIC-PCR结果显示,相似性100%的菌株有3组。从伊犁地区分离到的菌株差异性最大,具有6种分型;其次是乌鲁木齐,具有4种分型。菌株来源多样性最多的在D簇,由此可见通过ERIC-PCR分型,可以进行溯源观察。ERIC-PCR能够区分特定采样点或物种的分离物,它能够证明从不同来源的菌株之间,存在着某些相似的ERIC特性,并聚集在同一个簇群中。该研究中筛选出的E.coli O157∶H7菌株具有广泛的遗传多样性,该方法对于检测不同物种间的细菌差异非常敏感。由此可见ERIC-PCR可以作为E.coli O157∶H7常规监测和鉴定的一个有效的工具。     

新疆牛、羊和骆驼源产志贺毒素大肠埃希菌的系统进化分群、血清群与毒力基因及耐药性分析

旨在了解新疆牛、羊和骆驼源产志贺毒素大肠埃希菌（Shiga toxin-producing Escherichia coli,STEC）的系统进化分群、血清群、毒力基因、耐药性及其遗传多样性,本研究采用PCR方法对牛、羊和骆驼源STEC进行了系统发育分群、血清群和毒力基因stx₁、stx₂（包括亚型）、eaeA、hlyA检测,通过K-B纸片法对分离株进行药物敏感性检测,并对其进行ERIC-PCR基因分型。结果表明：94株非O157 STEC以B1群为主,含9个血清群,包括O146（n=14）、O22（n=7）、O3（n=4）、O168（n=4）、O8（n=3）、O167（n=2）、O88（n=1）、O112ab （n=1）和O147（n=1）。毒力基因检测显示,46.8%（44/94）仅携带stx₁,6.4%（6/94）仅携带stx₂,46.8%（44/94）同时携带stx₁+stx₂。羊源STEC以携带stx₁+hlyA为主（68.0%）;牛源STEC以携带stx₁+stx₂+hlyA为主（57.9%）;骆驼源STEC以携带stx₁+hlyA为主（25.0%）。stx_1a主要分布于牛源STEC,stx_1c主要分布于羊源STEC。14株（14.9%）为耐药菌,对头孢他啶、四环素、头孢噻肟、氨苄西林和氨曲南的耐药率为3.2%~5.3%,对复方新诺明、头孢吡肟、哌拉西林-他唑巴坦、氨苄西林-舒巴坦、阿莫西林-克拉维酸和多黏菌素B的耐药率为1.1%~2.1%。ERIC-PCR结果显示牛、羊和骆驼源STEC亲缘关系较近。牛、羊和骆驼携带多种已知血清群STEC,贮存丰富的毒力基因,存在感染人类的风险,应在屠宰加工过程中予以预防和控制。