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柑桔黄龙病病原16S rDNA克隆、测序及实时荧光PCR检测方法的建立 总被引:22,自引:0,他引:22
克隆并测定了中国柑桔黄龙病病原16SrDNA基因序列,经同源性比较,表明属于柑桔黄龙病菌(Liberobacter asiaticum)亚洲种中一个新株系(中国厦门株系)。依据获得的16SrDNA特异序列,建立了柑桔黄龙病病菌检测的实时荧光PCR方法,并应用此方法对柑桔样品进行了检测。结果显示,该检测方法具有快速、特异、敏感、重复性好等优点。该方法为柑桔黄龙病的检测,特别是早期诊断、检疫和病害的综合治理奠定了基础。 相似文献
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柑桔黄龙病近红外光谱无损检测 总被引:3,自引:1,他引:2
为探讨快速无损检测柑桔黄龙病的可行性,应用近红外光谱技术结合机器学习方法进行研究。在4000~9000cm-1光谱范围内,采集黄龙病、缺素和健康3类叶片样本的近红外光谱。采用一阶导数、平滑和多元散色校正组合的光谱预处理方法,消除光谱的基线漂移和散射效应。分别对偏最小二乘判别模型(PLS-DA)的主成分因子数和最小二乘支持向量机(LS-SVM)的输入变量数量、核函数类型及其参数进行了优化,建立了PLS-DA和LS-SVM模型。采用预测集样本,评价模型的预测能力,经比较,采用11个主成分得分向量为输入、线性核函数和惩罚因子为2.25的LS-SVM模型预测效果最佳,模型误判率为0。结果表明采用近红外光谱技术结合最小二乘支持向量机进行柑桔黄龙病无损检测是可行的。 相似文献
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柑桔叶片黄龙病光谱特征选择及检测模型 总被引:6,自引:4,他引:2
为探索高光谱技术诊断黄龙病及分类的可行性,通过变量筛选方法组合为高维数据实用化提供参考。采集柑桔叶片高光谱图像并进行普通(polymerase chain reaction,PCR)鉴别分为轻度、中度、重度、缺锌和正常5类样品。用无信息变量消除算法(uninformative variable elimination,UVE)剔除无关信息,组合遗传算法(genetic algorithm,GA)和连续投影算法(successive projections algorithm,SPA)筛选变量,对数据进行降维。结合极限学习机(extreme learning machine,ELM)和最小二乘支持向量机(least squares support vector machine,LS-SVM)构建柑桔黄龙病判别模型。对预测样品进行诊断分类,来评价模型判别能力。经对比发现,UVE组合SPA筛选变量后的LS-SVM模型效果最好,该模型以Link_kernel函数为核函数,惩罚因子(γ)最小为1.07,误判率最低为0。用全谱作输入变量时LS-SVM模型复杂程度最高且预测能力最差,误判率最高为11.9%,可能是包含无用信息和冗余信息变量造成的。研究显示,UVE组合SPA筛选变量,结合LS-SVM对柑桔黄龙病诊断并分类具有一定可行性,为高维度数据实用化提供一定参考价值。 相似文献
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柑桔是江西省南丰县生物资源中十分有特色的种质资源。本研究利用ISSR分子标记对南丰柑桔品种的遗传多样性进行研究。从100个ISSR引物中筛选出17个多态引物,对14份柑桔样品进行ISSR-PCR分析。结果显示,共扩增出162条DNA条带,其中多态性条带为134条,占82.71%,其片段大小在200~2000bp之间。UPGMA聚类分析结果表明,以遗传相似系数为0.67为分界线,可以将14份供试柑桔样品分成三类:第一类包含以ss-28为代表的7个柑桔品种;第二类包含以杨小2,6为代表的3个柑桔品种第三类包括以早系97-1为代表的4个柑桔品种。本研究结果对于南丰蜜桔的辅助育种或品种(株系)苗木鉴别具有重要的参考价值。 相似文献
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柑橘黄龙病综合防控技术探讨 总被引:1,自引:0,他引:1
《南方农业》2020,(3)
在柑橘种植过程中,黄龙病是为害最为严重的一种病害,一旦暴发,会导致柑橘树大量黄化死亡,给种植户造成严重的经济损失。一直以来,黄龙病都是国内外植物检疫的重点对象。黄龙病是由韧皮部杆菌引起的细菌性病害,通常情况下是通过柑橘木虱或者苗木嫁接传播的,在预防控制柑橘黄龙病的过程中,种植人员要采取综合防控技术措施,才能确保有效控制柑橘黄龙病。基于此,探讨柑橘黄龙病综合防控技术。 相似文献
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沙田柚黄龙病病原16S rDNA片段的克隆与序列分析 总被引:4,自引:0,他引:4
采集田间表现斑驳症状的沙田柚叶脉,用CTAB法提取总DNA。根据柑橘黄龙病病原16S rDNA的核苷酸序列设计引物P1/P2,进行PCR扩增,获得1条大小为1 167 bp的片段。酶切分析显示,该片段可被切成大小分别约为640 bp和520 bp的2个片段。扩增产物经纯化,与pM D 18-T V ector连接,转化大肠杆菌(E scherich ia coli)DH 5α,筛选克隆重组子。对PCR产物进行测序及序列分析,结果表明,与柑橘黄龙病病原亚洲种16S rDNA的同源性为99%,与非洲种的同源性为97%,与美洲种的同源性为96%。认为,沙田柚的斑驳症状是由黄龙病病原引致的,称之为沙田柚黄龙病。该沙田柚黄龙病病原属于柑橘黄龙病病原亚洲种(L iberobacter as iaticus)中的一个成员。系统进化树分析显示,沙田柚黄龙病病原与中国柑橘黄龙病病原亲缘关系最近,推测是直接来自中国柑橘黄龙病病原。 相似文献
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我国是柑橘生产大国,柑橘种植面积和产量都位居世界前列,然而在发展的过程中受黄龙病等柑橘病害的影响大,从而会带来严重的损失。基于此,分析了柑橘黄龙病的为害以及发病特征,并以广西桂林平乐地区为例,探讨发病条件及原因,提出了一系列柑橘黄龙病的防治措施,旨在保障柑橘安全生产,实现可持续发展。 相似文献
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柑橘黄龙病的识别与防控 总被引:1,自引:0,他引:1
《南方农业》2016,(6)
柑橘黄龙病又称黄梢病、黄枯病或青果病,是危害柑橘生产的最危险的一种传染病。近年来,柑橘黄龙病蔓延趋势大增,危害愈发严重。如若任其蔓延,将会给我国柑橘业造成沉重的经济损失。通过对柑橘黄龙病的病因进行分析,症状进行识别,提出相对的防控措施。 相似文献
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目前,我国很多省份都在种植柑橘,且有的省份种植面积很大,而柑橘黄龙病是威胁柑橘生产的重要病害之一,俗称柑橘"癌症",会给柑橘生产带来毁灭性的影响。基于此,根据对柑橘黄龙病的多年实践调查研究,就柑橘黄龙病的发病规律及防控关键技术进行了相关探讨,希望能够为防治黄龙病提供借鉴。 相似文献
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富川县柑橘黄龙病防控措施探讨 总被引:1,自引:0,他引:1
《南方农业》2016,(36)
通过阐述柑橘黄龙病的危害、分析富川县柑橘黄龙病防控工作现状、指出其中存在的问题,从推广优质抗病品种、调整果品种植结构、加强种植栽培管理、完善病情监测机制和实行挖控并举策略等方面探讨了富川县防控柑橘黄龙病丰产栽培技术,希望对提升富川县柑橘栽培种植效益有所裨益。 相似文献
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柑橘黄龙病被称为柑橘的"癌症",具有极强的传染性,造成柑橘产业巨大的经济损失。为探究病原菌对宿主光合作用进程中对光能吸收、分配和利用的影响,并实现柑橘黄龙病的快速诊断,该研究利用叶绿素荧光成像技术对感染黄龙病不同程度柑橘叶片的叶绿素荧光特性和相应淀粉、蔗糖、葡萄糖和果糖含量进行研究,分析了叶片的叶绿素荧光图像与淀粉、蔗糖、葡萄糖和果糖含量之间的关系,并构建了柑橘黄龙病快速诊断模型。结果表明,染病叶片中的淀粉、蔗糖、葡萄糖和果糖出现异常累积,糖代谢异常与病原菌的侵染有关;宿主的叶绿体光系统Ⅱ(Photosystem Ⅱ, PSⅡ)反应中心遭受破坏,导致最小荧光产量上升,PSⅡ的最大光量子效率下降及PSⅡ中有活性的光反应中心数量减少,染病叶片的光化学反应的能力降低,激发能被转换成不可调制荧光淬灭的比例上升;叶绿素荧光参数能够精确地反演出叶片的淀粉、蔗糖、葡萄糖和果糖含量,两者具有很强的相关性。利用叶绿素荧光参数构建的随机森林模型对柑橘黄龙病诊断的总体识别正确率为97.50%。采用叶绿素荧光成像技术能够实现柑橘黄龙病快速无损检测,可为柑橘黄龙病的早期预警提供新方法。 相似文献