水稻遗传育种相关生物信息数据库和工具的研究进展

水稻Oryza sativa L.是主要的粮食作物，也是单子叶植物研究的模式植物。面对日益严峻的环境和人口压力，培育高产、优质、环境适性强的水稻品种是解决当前粮食安全问题的有效途径。随着多组学技术的快速发展，积累了海量的水稻遗传育种相关的数据。生物信息数据库和在线分析工具是存储这些数据的载体，用以整合、可视化和共享数据，并为数据的深入挖掘和利用提供工具，从而为育种决策提供数据支撑。本综述系统梳理了近20年来开发的水稻生物信息数据库和在线分析工具，并基于内置数据集和功能对它们进行了分类和总结。最后，讨论了现有的水稻生物信息数据库和在线分析工具的问题与不足，并对它们在大数据和人工智能时代的发展方向进行了展望。     

基于网格的海量农业信息管理技术研究

在海量农业信息共享中的一个核心问题就是如何管理农业信息共享系统的信息资源。本文提出了一种基于网格的海量农业信息管理框架,对海量农业信息的接入、处理、存储和管理进行了讨论。     

基于中间库与WebService农业信息共享模式的设计

随着农业信息化的迅速发展,我国不断兴起各类农业产业专业信息平台和产品,从而为农业从业人员提供了海量的农业资讯、政策新闻、种养殖管理技术及市场行情等农业信息,然而由于目前各类农业产业专业信息平台和产品存在风格各异、内容参差不齐等问题,难以对此类信息进行整合和共享,造成了资源浪费.因此通过研究分析现有信息共享模式,提出了基于中间库和WebService农业信息共享模式,并以农业供求信息类平台为例进行了设计与实现,为我国农业信息共享提供了参考.     

本体论及农业本体构建

对本体论的定义、构造方法进行了介绍,并利用农业信息本体构造工具来构建农业本体,使农业信息得到更好的利用、共享和处理。     

基因芯片数据分析中的基因集合分析技术

基因芯片是一种高通量研究生命规律的技术,但是如何从海量的基因芯片数据中获得生物信息依旧是一个难题。基因集合分析技术可以从这些海量的生物数据中揭示出潜在的被影响的生物过程。     

生物信息数据库简介及在农业上的应用

随着生物技术与生物信息学的不断发展，生物信息数据库中信息呈指数增长，理解其中所包含的生物学知识、揭示生物内在规律将成为今后自然科学研究中的重要课题。本文介绍了近几年来世界生物信息数据库发展的状况，并筒述生物信息数据库在农业上的应用。     

世界农业信息与技术发展及其对策——参加世界农世界农业信息与技术大会的若干思考

本文简要介绍了在日本东京农业大学召开的世界农业信息与技术会议的情况,通过与来自世界各国的专家、学者的充分交流与热烈讨论,在信息数据采集、决策支持系统、知识管理,本体论、图书馆信息服务和数据库建设、食品安全,以及信息通信技术的应用等领域有了基本的了解,并结合国际农业信息管理与技术发展经验与问题,提出了我国在该领域值得重视和借鉴的若干思考与建议.     

FLP/FRT位点特异性重组系统在高等真核生物中的研究进展

 来源于酵母2 μm质粒的FLP/FRT位点特异性重组系统已经被广泛应用于拟南芥、水稻、小鼠、果蝇、线虫等高等真核模式生物,正逐渐成为转基因动植物研究领域进行基因操作的强有力工具。笔者综述了FLP/FRT系统的重组原理及其在高等真核生物中的应用,系统地概述了该系统在转基因植物、哺乳动物、昆虫以及其它相关高等真核模式生物中的研究现状,讨论了FLP/FRT系统在研究中存在的主要问题、应用前景和发展方向。     

生物信息学在药用植物研究中的应用

生物信息学是应用计算机技术将生物化学和分子生物学试验的海量信息转换为数字信息的一门科学,其重点是DNA和蛋白质序列的比对和分析.本文阐述生物信息学的方法学,包括功能基因组、蛋白质组、基因表达谱、生物芯片、靶基因研究等相关技术在药用植物研究上的应用前景.     

基于XML技术的生物标本信息共享规范数字化表达技术

为实现网络环境下生物标本资源的信息共享,国家制定了自然科技资源平台生物标本资源描述规范.实现标本信息的计算机自动处理与信息交换,需要按照标准规范制定适合标本信息检索、交换、共享的数字化规范描述体系.该文主要研究生物标本信息共享规范数字化表达技术,并给出了基于XML技术的初步解决方案,将共享规范映射成为计算机可自动识别的规则文档,实现标本信息的计算机自动处理与信息交换.