贵州威宁黄牛线粒体DNA D-loop区全序列分析

为了解贵州威宁黄牛的遗传多样性及遗传背景，我们分析测定了19个个体线粒体DNA D-loop区序列。结果检测到8种单倍型，7种为普通牛血统的单倍型，1种为瘤牛血统的单倍型，表明威宁黄牛同时受普通牛和瘤牛的影响。本研究同时构建了19个威宁黄牛个体的系统发生树，结果发现它们明显分为普通牛血统单倍型组和瘤牛血统单倍型组两组。     

贵州威宁黄牛线粒体DNA D-loop区全序列分析

为了解贵州威宁黄牛的遗传多样性及遗传背景,测定了19个个体的线粒体DNAD-loop区全序列。威宁黄牛D-loop区全序列中,A＋T平均含量为61．4％,G＋C含量为38．6％。经比对,共检测到威宁黄牛D-loop区8种单倍型,核苷酸多态位点45个,其中7种为普通牛血统的单倍型,1种为瘤牛血统的单倍型,表明威宁黄牛同时受到普通牛和瘤牛的影响。在威宁黄牛19个个体中,其单倍型多样度为0．715,核苷酸歧异度（π值）为2．415％,表明威宁黄牛品种的遗传多样性丰富。     

广西乌鸡线粒体DNA D-loop区序列遗传多样性分析

采用PCR和直接测序的方法测定广西东兰乌鸡线粒体DNA(mt DNA)D-loop第一高变区序列,比较分析东兰乌鸡(片羽、丝羽)的遗传变异。结果表明:在东兰乌鸡mt DNA D-loop区中,共发现27个变异位点,46种单倍型,其变异方式主要是转换和缺失;检测片段的G+C含量(60.59%)明显高于A+T含量(39.41%),具有偏倚性(P0.05);单倍型多样度和核苷酸多样度分别为(0.890±0.020)、(0.01653±0.02483),表明东兰乌鸡的遗传多样性较丰富,其中丝羽乌鸡的变异位点、单倍型数量、单倍型多样度和核苷酸多样度等均比片羽乌鸡高。在NJ系统发生树上,东兰乌鸡分为3大支,说明具有3个血统来源,起源于中国红色原鸡。     

中国部分山羊品种线粒体DNA D-loop序列遗传多样性分析

分析了中国部分本地山羊品种(18个品种200个体)以及在中国饲养的引入品种(4个品种25个体)线粒体DNA控制区(D-loop)的全序列,结合已报道的世界其它地方的山羊(15个品种77个体)以及2只野山羊的线粒体DNA控制区(D-loop)全序列共304个体,研究结果表明:山羊线粒体DNA控制区约为1 212 bp,检测到228个变异位点,203种单倍型,单倍型多样度为0.993±0.001;核苷酸多样度0.018±0.001。中国部分山羊的变异类型主要为类型A和B,而在巴基斯坦山羊中还检测到类型C和D。比较分析结果表明中国山羊遗传多样性和基因交流比中国黄牛品种要高。     

贵州黎平黄牛杂交改良初步研究

对农户饲养的黎平黄牛及其与西门塔尔牛、安格斯牛、利木赞牛的杂交F_1代的初生、6月龄、12月龄、18月龄、24月龄的体重、体尺进行了测定,结果表明;(1)黎平黄牛经杂交改良后,各年龄阶段各主要体尺都有极显著提高(P＜0．01),初生重和各月龄体重均有显著提高(P＜0．05);(2)初生至24月龄平均日增重,西×黎F_1、安×黎F_1、利×黎F_1公(母)牛分别为395g(366g)、364g(332g)、391g(360g),比黎平黄牛公(母)牛的192g(175g)分别提高了105。7%(109．1%)、89．6%(89．7%)、103．6%和105．7%)。     

基于线粒体DNA D-loop区全序列分析儋州鸡遗传多样性及其起源进化关系

为了研究儋州鸡的遗传多样性及其起源进化关系,本研究对36只儋州鸡样品的线粒体DNA(mtDNA) D-loop区全序列进行PCR扩增和测序,结合GenBank中公布的部分品种鸡的mtDNA D-loop区全序列,利用生物信息学方法进行数据处理,分析儋州鸡的遗传多样性及其起源进化关系。结果显示,儋州鸡mtDNA D-loop区扩增片段长度为1 210 bp,A+T含量为59.9%,C+G含量为40.1%,变异区在167～1 215 bp之间,高变区主要集中在167～367 bp之间,存在6种单倍型,共有20个变异位点,单倍型变异度(Hd)为0.571,平均核苷酸差异(k)为6.449,核苷酸多样度(Pi)为0.00537,中性检验的Tajima’s D值为1.61643,6种单倍型可分为A、B、C 3个世系,以B世系为主。研究结果表明,儋州鸡群体遗传多样性和单倍型多样性相对偏低,结合群体构建的系统进化树发现,儋州鸡的遗传组成来自3个母系祖先,缅甸红原鸡、爪哇红原鸡及红原鸡海南亚种均是其潜在的祖先,受外来鸡种影响较小,是一个较为封闭的原始鸡种。     

山羊线粒体DNA D-loop区遗传多样性研究

本研究利用PCR-SSCP技术对8个山羊品种分析了线粒体DNA D-loop区5′端部分序列的遗传多样性。378个个体共检测到A、B、C、D、E、F、G 7种单倍型,平均的单倍型比例为1.9%。单倍型多样度以太行黑山羊最高,为0.8003;洪洞奶山羊最低,为0.5772,但也属于较高的遗传多样性。结果表明,8个山羊品种均有较高的遗传多样性。     

4种鼢鼠线粒体DNA D-loop区全序列分析

采用PCR测序技术对采自甘肃境内的4种鼢鼠22个个体的线粒体DAND-loop区全序列进行了测定。结果表明：鼢鼠线粒体DNAD-loop序列长度为893、894、895、896或899bp,核苷酸位点突变类型有5种,即转换、颠换、插入、缺失及转换与颠换共存。碱基转换以T〈=〉C形式为主。其中T、C、A、G4种核苷酸的平均比例分别为34．1％、24．3％、30．1％、11．5％,A＋T含量（64．2％）明显高于G＋C含量（35．8％）。这4种鼢鼠22条线粒体DNAD-loop区发现20种单倍型,单倍型比例为81．82％,说明中国鼢鼠mtDNA遗传多态性很丰富。从系统发育树分析,4种鼢鼠明显聚为两类,推测鼢鼠可能有两个起源。     

黎平黄牛体重估测公式探讨

随机实测２６１头黎平黄牛的胸围,体斜长和体重,根据体重等于体积乘以密度（比重）的原则,采用回则分析方法进行了黎平黄牛体重估测公式的推导与验证。结果表明,黎平黄牛的性别对体尺与体重回归关系的影响差异不显著（Ｐ〉０．０５）,合并公母牛的体尺体重数据。得出该品种总的体重估测公式;体重（ｋｇ）＝胸围＾２（ｍ）×体斜长（ｍ）×８８－８（ｒ＝０．９９７１,Ｓｙ／ｘ＝４．７０１）胸围,体斜长对体重的回归关系极显     

张掖肉牛线粒体DNA D-loop区遗传多样性研究

为研究张掖肉牛的遗传多样性及母系起源,利用特异性引物扩增mtDNA D-loop区全序列,采用最大似然法构建了张掖肉牛mtDNA D-loop区分子系统树,对核苷酸多态性和遗传距离进行了分析。结果表明,构建的166头张掖肉牛mtDNA D-loop区全序列分子系统树分为3组（普通牛、瘤牛、牦牛）,其中,普通牛血统基因型组占比80.7%,有93种单倍型（Hd=0.988),核苷酸变异度π=0.005 79;瘤牛血统基因型组占比13.2%,有6种单倍型（Hd=0.476）,核苷酸变异度π=0.001 19;牦牛血统基因型组占比6.1%,有5种单倍型（Hd=0.867）,核苷酸变异度π=0.009 65。张掖肉牛与中国北方牛的遗传距离比较近（Fst=0.01）。综上所述,张掖肉牛具有混合母系起源的特点,但受普通牛的影响较大,亲缘关系明显表现出了中国北方黄牛的地理生态分布特征,该研究结果可为张掖肉牛生态区的分布提供理论依据,也可为遗传育种提供参考。     

甘南州蕨麻猪mtDNA D-环序列的起源及遗传多样性分析

为了研究甘南州蕨麻猪mtDNA D-环序列起源与遗传多样性,利用文献报道的1对引物对蕨麻猪mtDNA D-环序列进行PCR扩增及测序,对所得数据进行单倍型、遗传多样性、系统发育树和网络关系分析.分析结果显示,135头蕨麻猪mtDNA D-环序列表现出3种长度变异,其中4个序列长度为1 199 bp,3个序列长度是1 319 bp,127个序列长度为1 219 bp.对127个长度为1 219 bp的序列进行分析,发现83个单倍型.单倍型比例、单倍型多样度、核苷酸多样度和平均核苷酸差异数在卡加曼蕨麻猪最高,而在夏河蕨麻猪为最低.系统发育树和网络关系分析均将83个单倍型分为2个分支,说明蕨麻猪具有2个母系起源.与其他猪种mtDNA D-环序列比较,蕨麻猪与东南沿海野猪有较近的亲缘关系,没有发现东亚与东南亚野猪对蕨麻猪的起源有贡献的证据.     

新批准的西南地区5个山羊遗传资源mtDNA D-loop遗传多样性与亲缘关系研究

为了研究新批准的西南地区5个山羊遗传资源的遗传多样性及其与其他羊种的亲缘关系,试验利用设计的引物对山羊的mtDNA D-loop序列进行了PCR扩增和测序,对序列数据进行了核苷酸多样性、单倍型和亲缘关系分析。结果表明:在西南地区新批准的5个山羊遗传资源中,大足黑山羊、黔北麻羊和酉州乌羊平均多态位点数比较接近,均高于渝东黑山羊和贵州黑山羊;大足黑山羊、黔北麻羊和酉州乌羊遗传多样性高于贵州黑山羊和渝东黑山羊;从亲缘关系来看,渝东黑山羊与板角山羊和南江黄羊亲缘关系较近,酉州乌羊与板角山羊亲缘关系最近,贵州3个羊种(贵州白山羊、贵州黑山羊和黔北麻羊)遗传距离近,大足黑山羊与乐至黑山羊遗传距离较近。说明渝东黑山羊和贵州黑山羊遗传多样性较低,需要加强遗传资源的保护和提纯;新批准的5个山羊遗传资源的遗传距离和亲缘关系与其所处的地理位置存在密切关系。     

Phylogenetic relationships of German heavy draught horse breeds inferred from mitochondrial DNA D-loop variation

Summary We analysed a 610-bp mitochondrial (mt)DNA D-loop fragment in a sample of German draught horse breeds and compared the polymorphic sites with sequences from Arabian, Hanoverian, Exmoor, Icelandic, Sorraia and Przewalski's Horses as well as with Suffolk, Shire and Belgian horses. In a total of 65 horses, 70 polymorphic sites representing 47 haplotypes were observed. The average percentage of polymorphic sites was 11.5% for the mtDNA fragment analysed. In the nine different draught horse breeds including South German, Mecklenburg, Saxon Thuringa coldblood, Rhenisch German, Schleswig Draught Horse, Black Forest Horse, Shire, Suffolk and Belgian, 61 polymorphic sites and 24 haplotypes were found. The phylogenetic analysis failed to show monophyletic groups for the draught horses. The analysis indicated that the draught horse populations investigated consist of diverse genetic groups with respect to their maternal lineage.     

Genetic diversity of Jiangsu native chicken breeds assessed with the mitochondrial DNA D-loop region

1. The objective of this study was to determine the origin and evolution of chickens from 5 native breeds that are traditionally raised in Jiangsu Province.

2. To address this question, the complete mitochondrial DNA D-loop sequence of 149 chickens from 5 native breeds of Jiangsu Province was analysed.

3. Sequence read lengths of the native breeds were 1231 to 1232 bp, with a single-base deletion from the 859 bp site in the 1231 bp haplotype. A total of 33 variable sites that defined 19 haplotypes were identified. The average haplotype diversity and nucleotide diversity were 0.862 ± 0.017 and 0.00591 ± 0.00135.

4. Phylogenetic analysis showed that genetic structure of the mtDNA haplotypes of Jiangsu chickens are distributed across 5 clades (haplogroups): Clades A, B, C, D, and E. However, most of the individuals characterised in this study belonged to clades A and B.

5. The results of this study indicate that Jiangsu chicken populations have relatively low nucleotide and haplotype diversity and likely share 5 common maternal lineages.     

黎平黄牛肉质营养特性研究

为了研究黎平黄牛肉质营养成份选用5头黎平黄牛青年公牛屠宰,对肉质常规成分、氨基酸、脂肪酸进行全面分析测定,结果表明:鲜肉的蛋白质含量为23.08%,脂肪含量为4.08%;必需氨基酸与氨基酸总量(EAA/TAA)的比值为40.08%(未计色氨酸);不饱和脂肪酸(UFA)与总脂肪酸(TFA)的比例为45.78%.黎平黄牛肉富含蛋白质、风味氨基酸和脂肪酸,肉质柔软而不油腻,口感好,易消化,营养价值高,是优质的膳食肉资源.     

陇东地方牛种遗传多样性研究

对陇东地方牛种及其与秦川牛和南德温牛杂交群体共计113个个体线粒体D-loop区461 bp序列进行多态性分析,结果表明,3个群体该区域A+T含量(64.2%)明显高于G+C含量(35.8%),表现出明显的碱基偏倚;3个群体核苷酸变异率介于0.42%和3.27%之间,陇东牛和南德温牛杂交群体核苷酸变异率最高;核苷酸变异类型以转换为主,转换占核苷酸多态位点的90.94%,其次为颠换,占4.59%,同样表现出明显的碱基替换偏倚;3个群体核苷酸岐异度介于0.008 95和0.029 06之间,遗传距离介于0.000 15和0.008 36之间,陇东地方牛及其与秦川牛的杂交群体核苷酸歧异度和遗传距离最小。     

广西3个地方黄牛品种mtDNA D-loop区序列多态性及起源分析

【目的】探究广西3个地方黄牛品种线粒体DNA控制区（mtDNA D-loop区）序列的多态性及其母系起源,为广西地方黄牛品种的选育、系统分类和开发利用提供科学依据。【方法】利用PCR扩增、测序和生物信息学方法对广西3个地方黄牛品种（南丹黄牛、隆林黄牛和涠洲黄牛）mtDNA D-loop序列进行多态性分析与系统发育进化树构建。【结果】从广西3个地方黄牛品种127个个体mtDNA D-loop区序列中检测到27种单倍型,其核苷酸多态位点65个,多态位点占所测核苷酸总长（908~912 bp）的7.143%,其中有61个转换、3个颠换和1个转换/颠换共存。广西3个地方黄牛品种mtDNA D-loop区单倍型多样度（H）为0.339~0.795,核苷酸多样度（π）为 0.31%~2.54%,表明广西3个地方黄牛品种mtDNA D-loop区的遗传多样性存在较大差异,其中,南丹黄牛具有更丰富的遗传多样性,隆林黄牛次之,涠洲黄牛的遗传多样性较贫乏。聚类分析结果表明,广西3个地方黄牛品种具有普通牛和瘤牛2大母系起源,受瘤牛起源影响更明显。【结论】广西3个地方黄牛品种具有瘤牛和普通牛两大母系起源,但受瘤牛影响更明显。隆林黄牛与南丹黄牛为瘤牛和普通牛的混合母系起源,而涠洲黄牛为纯正的瘤牛母系起源,因此,应加强对广西地方黄牛品种资源,尤其是对涠洲黄牛品种资源的保护力度。     

温州水牛线粒体DNA D-loop遗传多态性分析

以30头温州水牛为研究对象,对每个个体的线粒体DNA(mtDNA)D-loop区915bp全序列进行了分析研究,结果共检测到14种单倍型,50个核苷酸多态位点,其中出现核苷酸转换48个,颠换2个.温州水牛mtDNAD-loop区核苷酸多样度(π值)为0.0184,单倍型多样度(H)为0.8575,表明温州水牛线粒体DNA遗传多样性丰富.NJ聚类分析表明,温州水牛有2个母系起源.     

蒙古牛mtDNA D-loop高变区序列分析

本文对蒙古牛线粒体DNAD-loop高变区的核苷酸序列进行了分析。结果发现,蒙古牛D-loop高变区的核苷酸变异率约为0.40%,其核苷酸变异类型只有转换1种形式。