波尔山羊10个微卫星标记多态性分析

为了解波尔山羊群体的遗传多样性,选择了位于不同染色体上、具有较高多态性的10个微卫星标记对波尔山羊群体进行研究。结果表明:在BM1329等10个微卫星标记上共检测到145个等位基因,每个标记都检测到至少10个等位基因(平均每个标记检测出14.5个),有效等位基因数为6.4～14.9个,基因频率最高的是OarAE101标记的95 bp片段(0.239 1);10个微卫星标记的多态信息含量都在0.95以上,均为高度多态标记,遗传多样性丰富,其中BMS1591标记的多态信息含量最高,为0.995 5;各标记的观测杂合度在0.616 7～0.984 4之间,期望杂合度在0.8441～0.932 8之间,平均期望杂合度为0.894 0,属于高度杂合标记和高度杂合品种,遗传变异较大。     

4个微卫星标记在波尔山羊中的遗传多态性研究

根据比较基因组学方法,利用绵羊6号染色体上与主效多胎基因(FecB)紧密连锁的4个微卫星标记OarAE101、OarHH55、BM1329和BMS2508,对波尔山羊进行了等位基因频率、多态信息含量、有效等位基因数和杂合度的遗传检测。结果表明,4个微卫星位点在波尔山羊上多态性丰富;OarAE101基因座的多态信息含量(PIC)、有效等位基因数(Ne)、平均杂合度(He)分别为0.847 4,6.553 1和0.862 8;OarHH55基因座分别为0.767 6,4.302 9和0.796 8;BM1329基因座分别为0.841 4,6.305 2和0.857 6;BMS2508基因座分别为0.783 1,4.6104和0.8096。4个微卫星位点均为高度多态位点,可用于波尔山羊遗传多态性评估和多胎性状研究。     

微卫星标记MCM38在波尔山羊及其级进杂交后代中的遗传多态性的研究

利用经筛选的与产肉性能相关的微卫星引物MCM38,对波尔山羊及其与关中奶山羊级进杂交后代的MCM38基因座进行了多态性分析,分析检测了纯种和F1-F3代中该位点的等位基因频率、杂合度、多态信息含量和有效等位基因数。结果表明,微卫星标记MCM38在波尔山羊及其级进杂交后代中都存在丰富的多态性,其中以F1代多态性最丰富(PIC=0.8441)。本研究表明微卫星标记MCM38可作为肉用山羊生长发育性状候选基因的标记辅助选择,也可为波尔山羊的杂交改良、杂种优势利用、后代标记辅助选择(MAS)提供试验依据。     

微卫星标记多态性与番鸭体尺性状的关系

采用16个鸭特异性的微卫星标记对该番鸭30个个体进行PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳分析,检测其等位基因,并分析其与番鸭体尺性状的相关性。结果表明,共检测到72个等位基因,16个座位都呈现出多态性,16个微卫星座位的等位基因数2~7个,平均等位基因数为4-5个。群体平均杂合度和平均多态信息含量分别为0.681和0.644。微卫星座位基因型间方差分析结果表明,微卫星AY493314与胫围呈极显著相关（P<0.01）,微卫星AJ272582与胫围和龙骨长呈显著相关（P<0.05）;微卫星AY493282,APL515883与胫长呈显著相关;AY493255,AY493342与半潜水长呈显著相关;AY493322与胸宽呈显著相关,其余微卫星未达到显著水平。     

鲁山牛腿山羊体尺性状与微卫星标记的相关分析

根据比较基因组学和相关文献资料,选择与山羊和牛生长性状相关的6个微卫星基因座(BM6444,MAF70,BM315,BMS1678,BM1818和BMC1206)作为分子标记,研究了牛腿山羊的群体遗传变异,并分析了体尺性状与6个微卫星标记之间的关系.结果表明:6个微卫星标记在牛腿山羊群体中的多态信息含量(PIC)分别为0.887,0.863,0.773,0.840,0.888和0.791,遗传杂合度(He)分别为0.904,0.883,0.808,0.864,0.904和0.824,有效等位基因数(Ne)分别为9.62,8.05,5.02,6.96,9.68和5.46.6个微卫星标记与体尺性状的最小二乘分析结果表明:BM6444基因座165bp和145bp等位基因对体质量、体高、体长、胸围和胸深有正效应,而154bp和137bp等位基因对体高、胸围和胸深性状有负效应;MAF70基因座180bp和159bp等位基因对体质量性状有正效应,159bp和144bp等位基因对体高、胸围和胸深有负效应;BM315基因座140bp等位基因对体高有正效应,而136bp等位基因对胸深有负效应;BM1818基因座298bp和27...     

微卫星标记BMS2508和Bulge5在河南淮山羊中的遗传多样性研究

用2个微卫星标记,通过PCR扩增,利用12％非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染显色等方法对河南淮山羊进行微卫星DNA遗传多态性进行研究.结果显示:在Bulge5基因座上检测出6个等位基因,其片段大小在105～140 bp之间,其多态信息含量(PIC)、有效等位基因数(Ne)、平均杂合度(He)分别为0.7340、3.182 0、0.8325;BMS2508位点有6个等位基因,其片段大小在100～150 bp之间,其多态信息含量、有效等位基因数、平均杂合度分别为0.843 0、3.706 0、0.8446.说明BMS2508和Bulge5等2个微卫星位点在河南淮山羊上均为高度多态位点,利用微卫星DNA多态性预测山羊的生产性能是可行的,本研究为山羊的选育、保种和开发利用提供了理论依据.     

微卫星标记BMSS2508在4个山羊品种中的DNA多态性

为寻找山羊繁殖性能的多胎性分子标记,根据比较基因组学方法,选用位于绵羊6号染色体上与多胎基因(FEC^B)紧密连锁的微卫星标记BMS2508,分别检测了湘东黑山羊、南江黄羊、贵州黑山羊、波尔山羊该微卫星位点的等位基因频率、多态信息含量、有效等位基因数和杂合度．研究结果表明：BMS2508位点的多态信息含量／有效等位基因数／平均杂合度在湘东黑山羊、南江黄羊、贵州黑山羊、波尔山羊中分别为0．5927／2．6822／0．6272,0．7002／3．5366／0．7172,0．5765／2．3653／0．5772,0．7506／4．3295／0．7690．故该微卫星位点在4个山羊品种中具有比较丰富的遗传多态性,可用于山羊遗传多态性评估,也为研究该微卫星位点的DNA多态性与山羊繁殖性能的相关打下了基础．     

9个猪微卫星标记在资源家系群体中的多态性检测

自 1 992年第 1届国际猪基因作图专题讨论会及 2 3届国际动物遗传学会召开以来 ,国际上先后成立了三个主要的猪遗传作图研究组[1 ] ,从而使猪的图谱构建及数量性状 (或经济重要性状 )位点定位工作加速前进 ,并取得了卓越成果[2 ] 。在这些研究工作中 ,微卫星成为应用最普遍的遗传标记。然而令人遗憾的是 ,国内在这方面的研究一直处于空白状态。为此 ,我们在国内率先选用遗传距离较远、性状差异显著的中国梅山猪 (以产仔数多著名 ,但瘦肉率低、生长速度慢 )和大白猪 (瘦肉率高、生长快 ,但产仔数不及梅山猪 )杂交 ,采用Ｆ2 代设计建立资源家…     

伏牛白山羊6个微卫星标记的遗传多样性分析

选取位于绵羊第6号染色体上与牛多胎基因FecB紧密连锁的2个微卫星基因座OarAE1 01、BM1329,牛第3号染色体上的微卫星基因座BMS1248,绵羊第4号染色体上的2个微卫星基因座MAF70、OarHH35及牛第8号染色体上的微卫星基因座BM1227,对伏牛白山羊遗传多样性进行检测。结果表明,6个微卫星基因座在伏牛白山羊中共检测到50个等位基因,其中平均多态信息含量(PIC)为0.789,且每个微卫星基因座的PIC>0.5,平均有效等位基因数(Ne)、平均杂合度(H)分别为5.165、0.903。由此表明,6个微卫星标记均具有高度多态性,可用于伏牛白山羊遗传多样性的分析。     

2个山羊品种的10个微卫星标记多态性及其与杂种优势关系研究(英文)

[目的]了解麻城黑山羊的遗传多样性及其与杂种优势的相关性。[方法]试验选择10个微卫星标记对波尔山羊和麻城黑山羊群体进行标记多态性研究,并对结果进行统计分析。[结果]BM1329等10个微卫星标记共检测到175个等位基因,等位基因数最多的是23个,最少的是10个,有效等位基因数6.4~18.1个,与等位基因观察数的绝对相差值在1.6~8.1之间,基因频率最高为0.239 1,最低为0.002 7。10个微卫星标记多态信息含量都在0.95以上,各标记的观察杂合度在0.616 7~0.984 4之间,期望杂合度在0.844 1~0.944 6之间,波尔山羊和麻城黑山羊品种的平均期望杂合度分别为0.894 0和0.906 7。波麻杂交羊的各项体重体尺指标比麻城黑山羊均有不同程度的提高(增加范围为0.32%~30.06%),体高和胸围的平均杂种优势率较高,体重的平均杂种优势率较低。[结论]波尔山羊和麻城黑山羊之间的遗传距离为0.379 5,与两者的地理分布相吻合,也与杂交后代表现出的杂种优势充分相关,说明了微卫星标记分析是预测品种间杂种优势的方法之一。     

新疆南疆绒山羊与新疆山羊主要经济性状的差异分析

[目的]对比分析新疆南疆绒山羊和新疆山羊在抓绒后体重、产绒量、绒层厚度、绒纤维直径四项指标上的差异,进一步阐明两个品种所具有的品种优势,为绒山羊育种工作提供一定理论依据.[方法]实验随机选取264只新疆南疆绒山羊成年母羊和158只新疆山羊成年母羊,分别测定其抓绒后体重、产绒量、绒层厚度、绒纤维直径四项指标,并对其主要绒性状进行相关分析.[结果]新疆南疆绒山羊抓绒后体重、产绒量、绒层厚度均极显著高于新疆山羊(P＜0.01),绒纤维直径上,两品种差异不显著(P＞0.05).两品种绒纤维直径与绒层厚度、产绒量呈正相关关系,且相关关系显著(P＜0.05).[结论]南疆绒山羊品种优势明显,具有较高的推广价值;利用各品种其绒纤维直径与绒层厚度、产绒量的相关关系,一定水平可以用于绒山羊绒纤维直径的预测.     

哲罗鲑微卫星标记与重要生长性状的相关性分析

采用10对微卫星荧光标记分析哲罗鲑Hucho taimen同池养殖群体的遗传多样性,通过SPSS13.0的GLM模型筛选出与生长性状(体质量、体长、体高和体宽)相关的微卫星标记。结果显示,10个微卫星位点的平均有效等位基因个数为2.301 4;多态信息含量0.366 6~0.557 6;观测杂合度范围0.652 2~0.989 1,均大于期望杂合度;Fis值为负数,存在杂合子过剩现象。基因座BJT4、BJT6、BJT8、BJT12、BJT18、BJT19、BJTH4和BJTH19均与体质量和体长性状极显著相关(P0.01),BJT6、BJTH6和BJTH17均与体高和体宽性状极显著相关(P0.01),发现存在"一因多效"和"多因一效"现象。不同基因型的多重比较表明,BJT12、BJT18和BJTH4基因座的AA基因型、BJT4基因座的BB基因型、BJT6基因座的AB基因型与体质量、体长呈正相关,BJTH6和BJTH17基因座的AB基因型与体高、体宽呈正相关。研究结果为哲罗鲑的分子标记辅助育种提供依据,同时也为下一步构建哲罗鲑的遗传连锁图谱提供基础数据。     

虾夷马粪海胆群体的遗传多样性及微卫星标记与生长性状的相关性分析

为了明确性腺性状和分子标记之间的关系,在海胆选育工作中提高性腺性状,利用微卫星标记对海胆各生长性状及性腺颜色进行相关分析。选用28个虾夷马粪海胆多态性微卫星分子标记对虾夷马粪海胆自交F1代家系群体的进行了检测分析,结果表明:共检测到80个等位基因,平均等位基因数为2.857 1个;平均有效等位基因数为0.827 0个; 观测杂合度平均值0.515 0,期望杂合度平均值为0.530 4;平均多态信息含量（PIC）为0.402 6,卡方检验显示其中有9个位点发生了偏离(P<0.01)。采用一般线性模型(GLM)进行连锁显著性检验,发现与壳高、体重和体积显著相关（P<0.05）的微卫星标记各1个,分别为TS131、TS38和TS105;与海胆颜色L*值（暗-亮）显著和极显著相关的微卫星标记分别为4个 (TS38、TS85、TS105、TS108)和1个(TS41);与海胆颜色a*值（绿-红）显著和极显著相关的微卫星标记各1个(TS101 TS41);与海胆颜色b*值（蓝-黄）显著相关的微卫星标记3个(TS41、TS114和TS128);与海胆口器重显著和极显著相关的微卫星标记各1个(TS114和TS46)。该研究结果可以为虾夷马粪海胆的相关性状进一步QTL定位提供参考数据,并为虾夷马粪海胆的养殖和选育提供理论指导。     

鸡微卫星DNA标记与屠宰性状的关系

利用25个微卫星标记,对以隐性白羽鸡和仙居鸡为亲本建立的F2群体500只鸡进行遗传检测,并测定各个体的活重、屠体重、屠体率、胸肌率、腿肌率和腹脂率,采用方差分析法对微卫星DNA标记与屠宰性状进行相关性分析。研究结果表明,各位点平均等位基因数为5,平均杂合度为0.701 2,平均多态信息含量为0.646 8。方差分析结果显示:MCW 0095、ABR0322、ADL289、MCW 4、ADL166、MCW 104和MCW 67对活重、屠体重有显著或极显著影响(P<0.05或P<0.01);MCW 104对屠体率有极显著影响(P<0.01);ABR0322、ADL166和MCW 67对胸肌率差异显著或极显著(P<0.05或P<0.01);MCW 0223和ADL166对腿肌率有显著或极显著影响(P<0.05或P<0.01);ADL136和MCW 67对腹脂率有显著影响(P<0.05)。其他标记对性状的影响未达到显著水平。     

Mapping QTLs Affecting Economic Traits on BTA3 in Chinese Holstein with Microsatellite Markers

It had been demonstrated that the strong and highly significant quantitative trait locus（QTL） can affect protein percentage on Bos Taurus Autosome 3（BTA3） at the position 52 cM, near the microsatellite DIK4353, with the 95% confidence interval spanning from 25 to 57 cM in Chinese Holstein population using QTL-express, MQREML, and GRIDQTL softwares. This study herein focused on such region of fine mapping QTLs for milk production and functional traits with 16 microsatellite markers with coverage of 33 cM between the markers BMS2904 and MB099 on BTA3 in a daughter-designed Chinese Holstein population. A total of 1 298 Holstein cows and 7 sires were genotyped for 16 microsatellites with ABI 3700 DNA sequencer. The variance components QTL linkage analysis（LA） and linkage-disequilibrium（LD） analysis（LA/LD） was performed to map QTLs for 7 traits, i.e., 305-d milk yield, fat yield, protein yield, fat percentage, protein percentage, somatic cell score and persistency of milk yield. Four strong and highly significant QTLs were detected for fat yield, fat percentage, protein percentage and somatic cell score at the position 40, 30, 27 and 26 cM, respectively. Two minor QTLs for milk yield and persistency of milk yield were identified at 42 and 46 cM, respectively. These findings provided a general idea for the fine mapping of the causal mutation for milk production and functional traits on BTA3 in the future.     

和丰县新疆山羊主要经济性状的相关性分析

[目的]研究和丰县新疆山羊主要经济性状的相关性,为育种场的种羊培育及新疆地方品种资源的保护提供依据.[方法]通过对新疆山羊的细度、含绒率、平均长度、抓绒量的测定,利用SPSS软件分析绒山羊不同年龄、不同生理阶段的主要经济性状之间的相关性.[结果]周岁公羊的细度与含绒率呈负相关,差异极显著(P＜0.01);周岁母羊的含绒率与平均长度呈正相关,差异显著(P＜0.05),细度与平均长度呈正相关,差异极显著(P＜0.01);成年母羊的细度与平均长度呈正相关,差异极显著(P＜0.01).[结论]和丰县绒山羊在不同生理阶段的主要经济性状存在较大差异.     

崂山奶山羊微卫星标记与泌乳性状的相关分析

 【目的】探讨微卫星DNA作为崂山奶山羊泌乳性状遗传标记的可行性。【方法】根据比较基因组遗传图谱,选择奶牛6、14、15号染色体上与泌乳性状相关联的微卫星座位（BM1329、BM143、BM302、CSSM66和BMS0812）,对175只崂山奶山羊泌乳母羊进行多态性检测,采用最小二乘方法分析微卫星座位与泌乳性状之间的关联效应。【结果】所选微卫星座位在崂山奶山羊群体中均表现出丰富的遗传多态性,有效等位基因、观察杂合度、多态信息含量和近交系数的平均值分别为3.9924、0.4667、0.6748 和0.347。基因座CSSM66对乳脂率和300 d泌乳量均有显著效应（P＜0.05）,最有利的基因型分别为210/210和194/194,具有正效应的等位基因分别为210和194;BM302对300 d泌乳量有极显著效应(P＜0.01),最有利的基因型为156/150,具有正效应的等位基因为156和150;基因座BM143对乳脂率有显著效应(P＜0.05), 对乳蛋白率有极显著效应(P＜0.01),最有利基因型分别为114/100和100/100,等位基因114和100对乳脂、乳蛋白均有正效应;基因座BM1329对乳脂率有显著效应(P＜0.05),最有利的基因型为182/180。【结论】发现了对崂山奶山羊泌乳性状有显著效应、多态性较高的微卫星基因座,为开展崂山奶山羊的标记辅助选择提供了有价值的遗传标记。     

草原红牛及其杂种牛群体微卫星DNA遗传多态性研究

运用分子生物学技术,分析了草原红牛、草原红牛与利木赞杂交后代群体在8个微卫星座位的遗传多态性。结果表明：在草原红牛中,ETH225,IDVGA2,IDVGA46,IDVGA44多态信息含量分别为0.5420,0.6736,0.5218,0.5750,这4个座位为高度变异座位。另4个座位BM2113,BM1824,IDVGA55,TGLA44多态信息含量分别为0.3698,0.3604,0.3538,0.4708,属于中度多态性座位。在杂种牛中,这8个座位的多态信息含量（PIC）均大于0.5000,属于高度多态性座位。