农作物SNP芯片技术及其在分子育种中的应用

分子育种是世界农作物育种的发展方向。综述了利用第3代新型分子标记研制的SNP芯片所具有的高集成、高通量、微型化和自动化等优点,介绍了基于Illumina公司的BeadArray技术和Affymetrix公司的Axiom技术开发的相应芯片鉴定平台及其在水稻、小麦、玉米等粮食作物和棉花、花生、向日葵等经济作物育种过程中的应用情况,讨论了SNP芯片技术在应用中存在的问题,并对其前景进行了展望。     

SNP在动植物遗传育种中的应用

单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)作为第三代分子标记,具有数量多、分布广、代表性强和遗传稳定性好等特点.目前已经在人、家畜、作物和蔬菜的遗传多样性分析、基因作图、分子标记辅助育种和功能基因组学的研究中得到了广泛的应用.基于PCR技术为基础,结合电泳技术、荧光、质谱等方...     

SNP标记在小麦遗传育种中的应用研究进展

小麦遗传育种对于小麦产量的提高意义重大。高密度单核苷酸多态性(SNPs)广泛应用于小麦数量性状位点(QTL)定位和标记性状关联分析,这极大推动了小麦遗传学和基因组学领域的发展,并有助于阐明表型和基因型之间的复杂关系,提高了小麦的育种效率。通过综述SNP在小麦遗传育种中的研究进展,为小麦育种提供进一步理论指导。     

SNP及其在分子植物育种中的应用

对于多基因控制的数量性状而言,分子标记的数量影响基因的精细定位。在全基因组内进行性状分析的关键是获得大量高通量基于标记的序列。SNP(单核苷酸多态性)是基因组中分布最广的序列变异。本文综述了QTL鉴定的必需元件和基于SNP基因分型的5个中心生化反应原理。     

STR分型技术在牛亲子鉴定中的应用实例

分别以争议小牛和嫌疑母牛的基因组总DNA为模板,运用STR复合扩增技术对TGLA227、BM2113、TGLA53、ETH10、SPS115、TGLA126、TGLA122、INRA23、ETH3、ETH225、BM1824共11个STR(短串联重复序列)基因座进行扩增,扩增产物经遗传分析仪检测,检测结果通过GeneM...     

SNP技术在预防奶牛乳房炎中的应用

奶牛养殖业的发展是衡量一个国家畜牧业及农业发展水平的重要指标，而奶牛乳房炎是制约奶业发展的一种重要疾病，因此，找到一种较为有效且能彻底解决乳房炎的方法至关重要。近年来，随着分子生物学技术和统计分析方法的发展，动物学家们提出了动物育种新的策略，即动物分子育种，其中SNP技术作为分子育种技术中的一种，本文主要介绍了SNP技术在预防乳房炎中的应用。     

应用基因分型技术研究牛结核分枝杆菌分子流行病学

牛分枝杆菌是引起牛结核病(bTB)的病原体,侵染宿主广泛,可感染多种家畜和野生动物,对人类和动物健康构成巨大危害。随着多年不懈的研究,有关分枝杆菌分子流行病学的知识积累不断增加。作者对近年来应用新的基因分型技术研究牛结核分枝杆菌分子流行病学方面的一些研究进展。这些技术包限制性片段长度多态性分析(RFLP)、PCR介导的间隔区寡核苷酸分析(spoligotyping)、数目可变串联重复位点(VNTR)等。主要用于对人、牛、家畜以及野生动物的结核病分子流行病学进行分析和监测。另外,还利用一系列敏感的基于PCR的技术从分枝杆菌杆菌复合体(NTM)中对菌型进行鉴别。对分枝杆菌感染分子流行病学的全面了解,有助于对本病扩散传播机制的深入研究。可为制定科学防治结核病的措施做出贡献。     

水稻抗稻瘟病基因Pi2的KASP标记开发与应用

【目的】水稻稻瘟病抗性基因Pi2对稻瘟病生理小种具有广谱抗性,开发Pi2的KASP分子标记并对其评价,为抗稻瘟病水稻品种分子育种提供简便、可靠的基因分型检测方法。【方法】利用593份自然群体中筛选出的不同抗性和亲缘关系的2份材料H-74和H-78,针对Pi2基因核心区域的SNP位点开发成KASP标记Pi2-C3。【结果】利用标记Pi2-C3对自然群体中的84份材料进行KASP基因分型,结果表明,该标记可以准确地将不同水稻材料的Pi2位点分为抗病基因型、杂合基因型和感病基因型,是一种高效鉴定抗稻瘟病基因Pi2的方法。利用标记Pi2-C3对阳江市病圃材料进行检测,结合表型调查结果发现,检测到含有Pi2基因的46份材料均表现出不同程度的稻瘟病抗性,表明该标记可以用于检测材料在病圃的发病情况。【结论】本研究采用KASP技术,开发了能准确检测Pi2基因的特异性分子标记Pi2-C3,并建立一套水稻Pi2基因的KASP基因分型体系,对提高抗性育种效率,改良抗稻瘟病水稻品种具有重要应用价值。     

转基因技术在中国蔬菜育种中的应用研究进展

就转基因技术在蔬菜抗病(毒)、抗虫、抗除草剂和抗逆性育种以及人为创造雄性不育和提高耐贮性、提高产量、延迟成熟、品质改良等方面的研究进展进行了综述,并展望转基因技术在中国蔬菜育种中应用的广阔前景。     

SNP芯片在油菜分子育种的应用

油菜是我国最主要的油料作物之一, 肩负着国内植物油供给的重任,所产菜油占国产油料作物产油的57%以上。近年来,中国面临严重的食用油供给安全问题,国产植物油短缺,进口依赖度达60%以上。我国的油菜产量低、生产成本高、市场竞争力相对较弱是制约我国油菜生产的主要原因之一。努力提高我国油菜育种水平是促进油菜产业发展、保障我国食用油供给安全的有效途径。新型高通量分子育种技术-SNP育种芯片的开发与利用为快速高效油菜育种带来了生机。在油菜及其基本种的基因组测序、SNP分子标记的开发等方面我国已具有良好的研究基础。我国油菜科技工作者正在致力于引进和建立国内自己的油菜育种SNP芯片,为提高油菜育种效率提供技术支撑。     

SNPs分析技术及其在小麦遗传育种中的应用

综述了单核苷酸序列多态性的特点,并对其在小麦基因组中的搜寻与检测技术以及在小麦遗传育种中的应用做了介绍。     

RAPD技术在产气荚膜杆菌基因分型中的应用研究

采用随机扩增多态性ＤＮＡ技术对产气荚膜杆菌进行ＰＣＲ扩增。结果产气荚膜杆菌Ａ，Ｂ，Ｃ，Ｄ４个型均可扩增出约４３０ｂｐ的条带，Ｂ，Ｃ型还扩增出约２１０ｂｐ条带，Ｂ，Ｄ型还扩增出约１２１０ｂｐ条带，Ａ型还扩增出约２４０ｂｐ和６９０ｂｐ条带，各型之间的条带差别明显，从而为产气荚膜杆菌的基因分型、ＰＣＲ快速诊断提供可靠的依据。     

四引物扩增受阻突变体系PCR及其在水稻遗传育种研究中的应用

介绍了四引物扩增受阻突变体系PCR技术,阐述了该SNP基因分型技术的引物设计和反应体系优化方法,综述了该技术在水稻遗传育种研究中的应用,旨在推广这一简单、高效SNP基因分型技术。     

SNP标记技术及其在农作物育种中的应用

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是指DNA序列上的单个碱基变异,它具有分布广、多态信息量大和易于检测等优点,被称为继RFLP和微卫星标记后的第三代基因遗传标记。本文就SNP标记方法的结构特征、特点、识别与检测技术和应用等几个方面对其进行了简要介绍。     

One tube nested-PCR在SNP基因型分型中的应用

nested–PCR是一种在普通PCR基础上发展起来的专门用于检测单核苷酸多态性(SNP)的技术。结合nested–PCR技术在水稻中检测SNP的研究,以1个水稻香味基因Fgr和3个稻瘟病基因Pi–ta、Pi9、Pigm为例,把nested–PCR的4条引物同时加在一管PCR反应中进行扩增,在其序列内针对SNP位点设计功能标记,用来扩增含有突变位点的DNA片段。通过优化引物浓度梯度和改良反应程序,达到了一步快速检测SNP基因型的目的。     

94份小麦育种亲本的功能基因分子检测

为了掌握小麦育种亲本重要性状功能基因的等位基因变异情况,利用42个功能基因KASP标记对94份育种亲本进行了分子检测。结果表明,1B/1R易位系占比30%;Rht-D1是主要的矮秆基因,占比80%;与产量相关的TaCwi-A1-1、GW2-6B、TaSus1-7B优异等位变异占比均大于85%,TaGS2-B1、TaGS5-A1、TaGW2-6A、TEF-7A在30%左右,TaGASR7-A1和TaMoc-A1小于10%;与品质相关的Glu-A1、Lox-B1、Pinb-D1优异等位变异占比70%左右,而Zds-D1高达99%,Glu-D1、Zds-A1、TaPds-B1在25%左右;与抗性相关的Lr46优异等位变异占比93%,1-feh-w3为66%,Vp1B1和Lr14a在50%左右,TaSdr-B1为21%,Lr68为15%,而Fhb1、Sbm1、Lr34、Sr2、Pm21在5%以下;光周期、春化和开花期相关基因的优异等位变异占比均较高。本研究明确了优异等位变异占比均较低的功能基因,为下一步育种亲本的有效利用奠定了基础,也为利用KASP标记开展分子标记辅助选择提供了参考。     

稻米品质性状研究进展与应用

水稻作为我国重要的粮食作物之一,改善其稻米品质是每位育种工作者所追求的夙愿。人们对米质的要求随着生活及消费水平的增加而有所提高,目前改良稻米品质已成为育种家开展水稻品质育种的重要目标。对稻米品质性状的构成、影响米质的因素及稻米品质性状的分析技术进行了系统性的概述,将调控米质的外观品质、加工品质(粒型、垩白)、蒸煮食味品质(直链淀粉含量、糊化温度及香味)、营养品质(蛋白质)等性状相关基因的克隆、功能研究以及重要稻米品质基因在常规育种和现代育种技术上的应用进行了综述,并对稻米品质分析技术、稻米品质性状相关基因在育种上的应用进行了展望,以期为稻米品质分析技术、稻米品质的改良及品质育种提供参考,提高水稻品种的多样性,丰富水稻的种质资源。     

定时输精技术在牛品种改良中的应用

定时输精技术是一种能使多头母畜在短时间内集中发情、配种,且能提升母畜配种受胎率、良种化率的人工授精技术,该项技术主要被用于牛养殖业中,能促进母牛集中发情、配种、产犊,从而能促进牛品种改良,推动牛产业化发展,但当前有不少牛养殖技术人员及养殖户并未掌握这一技术的操作规范,难以采用该项技术进行牛品种改良,基于此,本文先简述了定时输精技术方法,总结该项技术在牛品种改良中的应用方法及效果,以期能为后续牛品种改良工作提供有效参考。