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[目的]利用ISSR分子标记技术对选择的富士芽变优系和12个苹果品种为材料进行分子鉴定,构建指纹图谱,并且根据聚类分析的结果确定这13个苹果品种的亲缘关系.[方法]从100条ISSR引物中对供试样品进行PCR扩增筛选,采用NTSYSpc2.10t软件根据Nei's遗传相似系数采用UPGMA法进行聚类,此分析亲缘关系,并采用POPGENE1.32软件计算多态性位点数、多态性点百分率,最终筛选出条带清晰、多态性较高、稳定且重复性好的引物.[结果]从100个ISSR引物中筛选出3个多态性高、重复性好的引物,分别为UBC846、UBC881和UBC899,共在57个位点扩增出条带,其中50个为多态性位点,平均多态性位点百分率为86.11;.利用3条多态性ISSR引物构建的数字化指纹能够有效地区分出所有供试材料,且建立了13个苹果品种的亲缘关系聚类图,这13个品种的相似系数的变化范围在0.67 ~0.82,表现出较高的遗传多样性.[结论]ISSR分子标记技术可以有效地用于苹果种质资源评价、指纹图谱的构建和苹果芽变品种的鉴定,为苹果的种质资源鉴定、遗传多样性检测和栽培育种提供了分子生物学依据. 相似文献
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[目的]利用ISSR分子标记构建盾叶薯蓣品种鉴定的DNA指纹图谱,为盾叶薯蓣药材鉴定和良种选育提供技术支持。[方法]筛选ISSR引物,对10个盾叶薯蓣品种进行PCR扩增和电泳检测,统计条带并进行遗传多样性分析、聚类分析等;选择核心引物,建立DNA指纹图谱鉴定体系。[结果]从50条ISSR引物中筛选出9条,对10个品种扩增共得到86条谱带,多态性条带72条,多态性条带比率为83.72%;选出3条ISSR核心引物建立了10个薯蓣品种的ISSR指纹鉴定图谱。[结论]盾叶薯蓣品种遗传多样性丰富;3条核心引物所构建的植物图谱中,每个品种均有各自特异的共有谱带、特有谱带、缺失谱带,这些谱带的组合可用于盾叶薯蓣品种鉴定。 相似文献
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贵州苹果砧木资源亲缘关系的ISSR分析 总被引:1,自引:0,他引:1
利用ISSR标记,对原产于贵州的10份苹果砧木种质及5份外来资源进行亲缘关系分析。结果表明:采用筛选出的10条引物,共扩增出75条重复性好的谱带,其中67条(占89.3%)具有多态性;应用引物827、M05、M08可以有效区分出15份种质资源,构建其DNA的ISSR指纹图谱;聚类分析表明,供试种质间的遗传相似系数在0.49~0.93之间,贵州威宁苹果砧木资源遗传多样性较为丰富,ISSR分析结果与已知苹果砧木间的谱系较为一致。 相似文献
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为鉴定和保存不结球白菜品种资源,利用基因组 DNA 的 SRAP、RAPD 和 SSR-PCR 技术,筛选具有稳定多态性位点的引物,对新培育的耐热1号和苏州地区11个不结球白菜耐热主栽品种构建品种DNA 指纹,并转化为数字指纹图谱。结果表明:筛选出22个 SRAP 引物、16个 RAPD 引物和32个 SSR 引物,通过 PCR 扩增在12个白菜品种中获得了143个多态性位点标记,12个栽培品种间的遗传距离较小,相似系数范围为0.55~0.76。利用筛选出的3对 SRAP 引物组合成功绘制出不结球白菜主栽品种鉴定图,能将供试品种完全区分开。 相似文献
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越橘品种的ISSR鉴定及其亲缘关系分析 总被引:2,自引:0,他引:2
利用ISSR分子标记对由北美引种到南京的7个南高丛越橘品种(Vaccinium darrowi×V.corymbosum)、9个南高丛越橘实生选择系和12个兔眼越橘(V.ashei)品种共28份材料进行分子鉴别和亲缘关系分析.10个引物共扩增出98条谱带,其中37条为多态性条带,多态率为37.8%.利用其中8个引物扩增的17条多态带可以区分19个品种和9个实生选择系.利用POPGENE1.31软件进行了Nei's遗传距离计算,利用UPGMA法构建了聚类树状图.聚类结果将各类群单独聚成一大类,证实了它们的亲缘关系.同时显示实生选择系间的遗传差异相对较大,其中7个与南高丛越橘品种聚为一类,而其余2个与兔眼越橘品种聚为另一大类.但是在同一类群内各品种间的遗传关系与谱系数据不完全相吻合,表明本试验所用的ISSR引物不足以用来估算兔眼越橘品种间的遗传关系. 相似文献
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新疆梨种质资源亲缘关系的ISSR和RAPD分析 总被引:3,自引:0,他引:3
[目的]探讨新疆梨种质资源亲缘关系以及遗传多样性,旨在为供试梨资源的分类提供科学依据.[方法]采用ISSR和RAPD分子标记对48份梨种质资源进行聚类分析和遗传关系研究.[结果]14条ISSR引物共扩增出113条清晰的谱带,其中101条显示多态性,平均每个引物扩增出7.2条多态性谱带.19条RAPD引物共扩增出163条清晰的谱带,其中多态性谱带138条,平均每个引物扩增出7.2条多态性谱带.基于ISSR和RAPD两种标记,利用UPGMA分别构建了48份梨资源的聚类树状图.ISSR和RAPD分别聚类以及两种标记混合聚类均将48份梨种质分为3类:第Ⅰ类群中包括1份种质;第Ⅱ类群中包括23份种质;第Ⅲ类群中包括24份种质.[结论]两种标记适合于梨种质资源亲缘关系和遗传多样性分析,可为梨资源的开发利用及新品种的选育提供科学依据. 相似文献
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23个水稻品种(系)的ISSR指纹图谱及其亲缘关系 总被引:3,自引:0,他引:3
为开展水稻新品种亲缘关系鉴定,拓展水稻种质资源创新与利用途径,以筛选出的12条IS-SR引物对23个水稻品种(系)进行PCR扩增。结果表明,共扩增出清晰、重复性好的谱带155个,其中,特异带121条,多态性比例为78.06%;应用引物881、888及其组合获得了每个品种的ISSR特征带,可以有效区分出所有供试材料,建立了23份水稻品种(系)的ISSR指纹图谱;经聚类分析,在相似性系数为0.678处,可将所有材料严格地按粳、籼稻分为2类。 相似文献
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长春花种质资源遗传多样性的ISSR分析 总被引:1,自引:0,他引:1
本研究利用ISSR分子标记技术对40个长春花种质资源进行了遗传关系分析,多态性PCR扩增结果表明:在115个位点,其中多态位点78个,多态位点百分率为67.8%,多态性较高;POPGENE32软件计算结果表明,40个长春花品种平均有效等位基因数为1.6384,Nei遗传多样性指数平均为0.3735,平均Shannon信息指数为0.5546;应用NCSYS软件计算得到品种间的遗传相似系数介于0.150~0.900,平均为0.584.通过聚类分析将这40个长春花种质分成7组,该聚类结果与以前根据形态进行的分类结果有极大的相似性. 相似文献
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8个云南主要栽培梨品种亲缘关系的ISSR分析 总被引:3,自引:0,他引:3
[目的]探索利用简单序列重复间区(ISSR)分子标记研究供试栽培梨品种的分类和系统发育。[方法]利用ISSR分子标记技术对8种云南主要栽培梨品种的亲缘关系进行分析。[结果]ISSR—PCR反应体系优化结果表明,20μl ISSR.PCR反应体系中各因素的最佳浓度分别为:1×PCR buffer、100μmol/L dNTP、0.3μmol/L引物、20ng的模板DNA和1.5U Taq DNA聚合酶,并在此基础上建立了梨ISSR—PCR反应体系。从24个引物中筛选出9个能扩增出清晰带并具多态性的引物,共扩增出了135条DNA片段,其中102个DNA片段呈现多态性,占总扩增片段的75.5%。利用NTSYS—pc2.10t软件计算8种梨品种间的Jaccard遗传相似系数。结果显示梨品种间的相似性系数为0.186~0.750,平均遗传相似性系数为0.476。UPGMA聚类分析表明,8种梨品种可以聚为2类:第一类群包括日本水晶梨、早95-2、四川火把和西子绿;第二类群由早酥、金花、旱黄酥和砀山梨4个品种组成,这与传统分类结果一致。[结论]该研究为梨资源的开发利用及新品种的选育提供科学依据。 相似文献
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14份杏种质的ISSR分析 总被引:11,自引:0,他引:11
以冀光为试材,研究了PCR反应体系的主要成分及退火温度对杏ISSR扩增结果的影响。同时,从42对ISSR引物中筛选出12对扩增条带清晰、多态性好的引物进行扩增,并运用UPGMA聚类分析法,分析了12份杏种质的亲缘关系及多样性。结果表明:在20μL的反应体系中,模板DNA含量在10~80 ng均能得到较好的扩增;dNTP用量对扩增无明显影响;而引物、Mg2+的最适浓度分别为0.25μmol/L、0.25 mmol/L;Taq酶在0.5~4 U均能得到好的扩增条带;退火温度在50~52.1℃范围内均能得到清晰的条带;并在此基础上建立了杏ISSR反应体系。当相似系数在0.444~0.452之间时,将12份杏材料划分为3类:①普通杏(Amentacavulgaris),西伯利亚杏(A.sibirica),辽杏(A.mandshurica),藏杏(A.holosericea)类型;②仁用杏品种一窝蜂;③紫杏(A.dasycarpa)。 相似文献
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应用ISSR分子标记和表型性状评价孔雀草自交系的遗传关系 总被引:5,自引:2,他引:5
【目的】对亲本遗传距离的评估是保证F1代种子杂种优势的基础工作,本研究的目的是为科学的选择孔雀草杂交育种亲本奠定基础。【方法】对12份孔雀草自交系和4份孔雀草F1代及两份万寿菊材料分别用ISSR分子标记和形态学特征进行了遗传分析。【结果】用10个引物共得到145个位点,其中138个为多态性位点;对ISSR标记和10个表型性状分别进行分析的结果表明,当优先考虑花型和材料来源两个表型性状时,两种分类方法得到的结果基本一致。【结论】在孔雀草分类中以花型和材料来源为重要依据时,能够比较客观地反映其遗传基础上的差异。在孔雀草利用杂种优势育种中,选择花型差异大,来源不同的亲本,如孔雀草nana和孔雀草黄色小英雄,孔雀草nana Petite Gold和孔雀草21605,有可能得到性状优良的杂交后代。 相似文献
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新疆核桃亲缘关系的ISSR分析 总被引:2,自引:1,他引:1
[目的]采用ISSR技术从DNA水平探讨核桃材料亲缘关系,为核桃资源的保护、开发利用及新品种选育等提供理论依据.[方法]以核桃叶片为材料,利用ISSR标记技术,筛选出8条引物对24份DNA进行PCR扩增.以NTSYSpc2.1软件计算样品的遗传相似系数(GS),并进行UPGMA聚类分析.[结果]共扩增位点86个,其中多态位点60个,多态位点百分率70.00;;样品间的GS在0.29~0.93,在GS=0.37处将栽培核桃与野生核桃分成2组.[结论]供试核桃具有较高的多态性,样品间有明显的基因分化,其亲缘关系也较远,并且具有明显的地域性. 相似文献