早熟禾属植物种间关系的RAPD分析

利用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术对10种早熟禾植物进行了基因组DNA多态性分析，对30个OPRON公司十聚体随机引物进行多态性筛选，28个可产生多态性，18个引物产生的250个DNA片段，用于计算种间的欧氏遗传相似性系数分析，在Statistic统计软件按非加权算术平均数（UPGMA）进行聚类并构建系统发育树状图，结果，10种早熟禾植物种间的亲缘关系，其变幅主要在6．7－8．5之间；其中P.botryoides与P.psilolepis之间的遗传距离最小，为6．7，其次是P.sinattenuata与P.sphondylodes遗传距离较近，为6．8，而P．sikkimensis与P.pratensis,P.sikkimensis与P.psilolepis之间的距离最远，均为10．5，这与形态学分类结果基本一致，说明RAPD分析方法可从分子生物学角度为早熟禾属植物的系统学分类提供更为有利和可靠的证据。     

鹅观草属三个物种及其居群间核型变异研究

报道了鹅观草属3个物种,毛叶鹅观草、竖立鹅观草和纤毛鹅观草及其居群间的核型,其中R. amurensis的核型2n=4x=28=24m(2SAT) 4sm为首次报道.结果表明,3个物种绝大多数由中部和近中部着丝点染色体组成,具1对随体,几乎都位于第14对染色体上.核型类型为2A.但在核型公式、平均臂比、臂比大于1.7的染色体比率等方面,不仅3个物种的种间存在一定的差异,而且R. ciliaris和R. japonensis的种内不同居群间也存在差异,表明R. ciliaris和R. japonensis种内具有较大的遗传多样性.     

利用RAPD标记分析狼尾草属牧草品种间的遗传关系

采用RAPD分子标记技术对狼尾草属8个品种(品系)间的遗传关系进行了分析,结果发现,19个引物共扩增出169条带,其中111条带为多态性带,占总带数的65.7%,表明在这8个品种(品系)间具有较高的遗传多样性,存在有一定的遗传分化.从UPGMA聚类分析的结果来看,象草、象草新品系、矮象草、N51、王草和桂牧1号作为一个谱系群的bootstrap值为73%,反映了它们之间较为密切的亲缘关系;同时发现,杂交狼尾草与其他7个草种间存在有较明显的遗传分化,表明Pennisetum americanum遗传成分的多少及有无在这8个品种(品系)间遗传关系的调节中起着重要的作用.另外,相对于其他6个草种,象草新品系与矮象草具有最小的遗传距离(0.130),从而为象草新品系与矮象草之间亲缘关系的确定提供了重要证据.     

鹅观草属与披碱草属分类学的历史与现状

鹅观草属与披碱草属间亲缘关系密切 ,性状交叉 ,界限不易分清 ,不同分类学者对两个属的概念也不同。本文概要介绍了不同分类学者对两个属分类的看法 ,为今后我们对两个属的植物进行研究提供一个清楚的认识和依据。     

用RAPD标记研究7个猪种间的亲缘关系

试验利用随机扩增多态ＤＮＡ技术对互助猪、荣昌猪、甘肃白猪、长白猪、约克夏猪、杜洛克猪、汉普猪共７个品种的ＤＮＡ池进行了多态型研究,分析了各品种间的亲缘关系。结果显示：甘肃白猪虽然是由国外品种和地方品种培育而成,但其亲缘关系更接近于中国猪品种;约克夏猪与其它欧洲猪种亲缘关系较远,这可能与约克夏猪在培养过程中亲本遗传背景较为复杂有关。     

玉蜀黍属物种间遗传关系的RAPD分析

用136个RAPD引物对玉蜀黍属大刍草和玉米种质基因组DNA的多态性进行检测,共得到5 303条条带,其中多态性带4 500条。遗传相似系数分析结果表明,玉米与大刍草种质遗传相似性系数变幅为0.585～0.809,相同种遗传相似性系数为0.767～0.809,而种间或亚种间的相似性系数为0.585～0.745,表明利用RAPD技术能准确地揭示出玉米与大刍草种间的遗传关系。聚类结果表明,玉蜀黍属内所有大刍草和玉米可分类为繁茂亚属和玉蜀黍亚属,繁茂亚属包括四倍体多年生类玉米种、二倍体多年生类玉米种、繁茂类玉米种和尼加拉瓜类玉米种;玉蜀黍亚属包括小颖类玉米亚种、墨西哥类玉米亚种、委委特南戈类玉米亚种和玉米。运用RAPD技术证实在玉蜀黍属中尼加拉瓜类玉米种与繁茂类玉米种亲缘关系最近。     

内蒙古驼蹄瓣属植物亲缘关系的RAPD分析

应用RAPD技术对七种驼蹄瓣属植物及其近缘种霸王的亲缘关系进行了研究,16个引物共扩增出125条带,其中99条表现出多态性,占79.2%,表现出丰富的RAPD多态性;利用UPGMA构建了分子系统树,结果表明RAPD分析的亲缘关系聚类基本上与经典分类相一致,表明RAPD技术适用于驼蹄瓣属植物亲缘关系的研究.     

7种鹅观草属植物苗期干旱胁迫的生理评价

利用盆栽模拟土壤干旱法,对鹅观草属7种植物幼苗在连续干旱胁迫下的生理生化特征进行研究,综合评价7种植物的抗旱性,筛选抗旱品种。结果表明:随干旱胁迫天数的增加,土壤相对体积含水量、叶片相对含水量和叶绿素含量显著降低(P<0.05),脯氨酸含量、相对电导率、丙二醛(MDA)含量都显著增加(P<0.05);过氧化物酶(POD)和超氧化物歧化酶(SOD)活性先上升,后不同材料变化各异。相关分析表明,除了SOD活性,其他指标之间都存在显著或极显著相关。运用隶属函数法进行综合评价,7种植物的抗旱性顺序为:黑药鹅观草>垂穗鹅观草>肃草>纤毛鹅观草>多变鹅观草>岷山鹅观草>直穗鹅观草。     

鹅观草属野生牧草资源的搜集与评价

在14个省区搜集的386份野生鹅观草属材料中,西藏地区搜集到115份,占30%,确认青藏高原存在着丰富的鹅观草属野生资源;搜集到一批优良鹅观草属饲用牧草。通过对4个不同地区鹅观草属材料适应性评价,表明它们的抗逆性很强,适应性比较广。     

应用RAPD标记对高粱属两物种之间遗传差异的研究(简报)

本研究选用了32个栽培高粱品种、10个苏丹草品种及2个高粱近缘种进行了RAPD分析。结果表明,1)12对引物产生的68条DNA扩增片段中,52条(76.5%)具有多态性。2)高粱之间的相似系数从55%到95%;苏丹草之间的相似系数从52%到84%,因此选择的品种之间的多态性高,具有代表意义。高粱不育系和保持系之间的相似度很大,为89%以上,但通过RAPD标记能够将其区分。3)以0.66为阈值将44个品种分为10个类群。第1类群中全部为苏丹草;在2,3,4群中既有苏丹草也有高粱;5,6,7,8群中则全部为高粱。因此,使用RAPD分子标记进行聚类不能将高粱和苏丹草区分开来。     

用RAPD标记分析高羊茅的遗传多样性

采用RAPD分子标记技术对从国外引进的15个高羊茅品种的遗传多样性进行了研究。从60个随机引物中筛选出12个有效引物,它们共扩增出85条DNA带,其中59条为多态性带,占69.41%,平均每个引物扩增出多态性带4.92条;利用NTSYS-PC软件计算出的不同品种间Jaccard遗传相似系数(GS)变化范围较大,为0.373~0.932;根据得到的遗传相似性矩阵进行非加权组法(UPGMA)聚类分析,建立高羊茅品种的分子系统树状图;以相似系数0.68为标准,可将所有品种分为3类,品种翠丽和贝克各自聚为一类,其余13个品种聚成一类。     

苦豆子种质资源遗传多样性的RAPD分析

为深入研究并充分利用野生苦豆子（Sophora alopecuroides）资源,本研究利用RAPD技术对22个苦豆子居群进行研究,从DNA水平探讨苦豆子种质资源的遗传多样性。结果表明,筛选得到的31条RAPD随机引物共检测出314条扩增DNA片段,其中多态性条带285条,多态性比率为90.76%。Nei’s遗传多样性指数（H）为0.301 5,Shannon信息指数（I）为0.453 1,遗传距离变化范围为0.114～0.709,所研究的苦豆子居群间具有丰富的遗传多样性。UPGMA聚类分析和主成分分析(PCA)结果显示,22个苦豆子居群聚为6类,不同居群间出现了一定的遗传分化。     

Typing Listeria monocytogenes by random amplified polymorphic DNA (RAPD) fingerprinting.

Twenty epidemiologically unrelated Listeria monocytogenes strains isolated from different animals, locations and on different dates in Japan were classified into 18 types by the random amplified polymorphic DNA (RAPD) fingerprinting technique with four primers. Further, seven epidemiologically related L. monocytogenes strains isolated from raw milk and a bulk tank on a dairy farm represented the same RAPD type suggesting that they were all of the same origin. Therefore, RAPD-polymerase chain reaction (PCR) analysis, which is rapid, simple and inexpensive to perform, can be used in surveys as a convenient epidemiological technique.     

Random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis of Mycobacterium tuberculosis strains in India

The usefulness of random amplification of polymorphic DNA (RAPD) analysis for typing Indian strains of M. tuberculosis was investigated. M. tuberculosis H37Rv, M. tuberculosis DT and 42 clinical isolates of M. tuberculosis were subjected to RAPD-PCR using 7 random decamer primers. All 7 primers were found to be differentiated and produced specific RAPD profiles. The polymorphic amplicons served as RAPD markers for M. tuberculosis. The dendrograms, obtained by different primers, showed the discriminatory ability of the primers. RAPD analysis provided a rapid and easy means of identifying polymorphism in M. tuberculosis isolates, and it was found to be a valuable alternative epidemiological tool. In addition, the results of the present study showed heterogeneity in the M. tuberculosis strains in the population studied.     

绵羊、山羊、岩羊和非洲羚羊RAPD的研究

作者用39个10碱基随机引物对绵羊、山羊、岩羊和非洲羚羊4个物种的池DNA进行了RAPD分析，共检出347条清晰条带，309条表现多态性，多态频率为89．05％。种属间的遗传距离指数和分子聚类关系表明，山羊和绵羊遗传亲缘关系最近，非洲羚羊表现出与山羊特别与绵羊较近的遗传亲缘关系，而岩羊则表现出与绵羊特别与山羊较远的遗传亲缘关系。     

藏系绵羊随机扩增多态性DNA最佳反应体系的研究

以高原型藏羊的基因组DNA为模板，通过对RAPD反应体系中的各种参数进行优化试验，建立了适宜于藏系绵羊RAPD分析的最佳反应体系：在PE2400型DNA扩增仪的25μL反应体系中，模板DNA的量为60－120ng，引物量为4－8pmol，Mg^2 浓度为2.0mM，Taq DNA聚合酶为1－2.5U,dNTP浓度为150－200μM;94℃预变性3分钟后35次循环的参数设定为：94℃1分钟，36℃1分钟，72℃2.5分钟，最后72℃延伸10分钟，利用这些条件对藏系绵羊的基因组DNA进行RAPD分析，其结果的重复性和可靠性大为提高。     

Differentiation of avian pathogenic Escherichia coli (APEC) strains by random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis

Here we describe the application of a random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis for molecular genetic typing avian pathogenic Escherichia coli (APEC) strains. The RAPD technique was shown to be highly reproducible. Stable banding patterns with a high discriminatory capacity were obtained using two different primers. Overall, 55 E. coli strains were analyzed with a RAPD technique. The RAPD analysis showed that the E. coli strains isolated from poultry in Thailand and Sweden could be grouped into 50 of RAPD types by using these two different primer sets. Most of these different E. coli RAPD types were not geographically restricted. There was, as expected, a tendency of higher genetic relationship among E. coli strains isolated from the same farm. It is suggested that the RAPD technique may provide a rapid, low cost, simple and powerful tool to study the clonal epidemiology of avian E. coli infections.     

浅述RAPD分子标记技术在家禽遗传育种中的应用

１９５３年，Waston和Crick提出了DNA分子结构双螺旋模型。１９８０年Botsten等采用DNA限制性片段多态性（RFLP）作为一种遗传标记技术。８０年代中后期PCR（聚合酶链式反应）技术的诞生和９０年代初人类基因组研究，分子标记技术研究和应用得到迅速发展。拾多年来，相继出现了RAPD（随机扩增多态性DNA）标记、SSR（简单序列重复也称为微卫星标记）、AFLP等十几种DNA标记技术。现代分子标记技术已广泛应用于生物基因组研究、生物遗传育种、起源进化、分类鉴定以及疾病诊断等方面。本文着重介绍目前常用的RAPD分子标记技术及…     

Phenotypic characterization and random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis of Pasteurella multocida isolated from Korean pigs

Pasteurella multocida causes various respiratory disease symptoms in pigs, including atrophic rhinitis and pneumonia. In the present study, 69 strains of P. multocida were isolated from 443 pigs with respiratory clinical symptoms at 182 farms located throughout South Korea from 2009 to 2010. A multiplex capsular PCR typing assay revealed that 69 strains of P. multocida isolated in this study had the biosynthetic locus of the capsules of either serogroup A (47 strains, 68.1%) or serogroup D (22 strains, 31.9%). The 22 strains positive for serogroup D-specific primers were divided into four clusters and the 47 strains positive for serogroup A-specific primers were divided into 12 clusters according to the results of Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) analysis. P. multocida strains in the present study were susceptible to most of the antimicrobial agents used. An analysis of antimicrobial resistance and virulence gene pattern combined with RAPD indicated that a certain P. multocida strain appeared to be genetically identical, implying the persistence of the strain within a single farm.     

中国高羊茅种质资源遗传多样性的RAPD分析

高羊茅是广泛应用的冷季型草坪草,但有关我国高羊茅种质资源遗传多样性的研究十分匮乏。本研究利用RAPD分子标记技术,对采自我国云南、贵州、青海、湖北等地的26份逸生高羊茅种质资源进行了遗传多样性分析。试验筛选出引物20条,共扩增出179个条带,其中177个为多态性带,平均每个引物扩增出多态性带8.85条,多态性条带比率(PPB)为98.88%。材料间遗传相似系数为0.419~0.966,说明我国逸生高羊茅种质资源具有丰富的遗传多样性。根据聚类分析结果,可将26份中国本土高羊茅材料分为三大类,其中来自云南省的高羊茅基本聚在同一类,来自其余省份的高羊茅种质资源的聚类结果与其地域分布没有明显联系。