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利用双重抑制PCR技术分离鸭微卫星标记 总被引:4,自引:0,他引:4
用双重抑制PCR技术分离10对鸭的特异微卫星引物,应用于北京鸭、樱桃谷鸭、高邮鸭3个品种的基因组PCR扩增。结果表明:10对引物中有7对引物具有多态,3对呈高度多态,4对呈中度多态。7对引物在上述3个鸭品种中分别扩增出23、22、23个等位基因,其中15个等位基因为3个品种所共有;各位点产生4~7个等位基因,平均杂合度为0.494~0.650,平均多态信息含量为0.414~0.586,平均有效等位基因数为2.001~2.870。3个鸭品种的平均杂合度分别为0.578、0.566、0.594,平均多态信息含量分别为0.496、0.480、0.524;平均有效等位基因数分别为2.441、2.340、2.615,与实测平均等位基因数3.286、3.142、3.286较接近。 相似文献
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双重抑制PCR技术分离鹅微卫星标记 总被引:9,自引:0,他引:9
用双重抑制PCR技术分离11对鹅的特异微卫星引物,应用于浙东白鹅和太湖鹅的基因组PCR扩增。结果表明:11对引物在浙东白鹅和太湖鹅中分别扩增出37和36个清晰条带,20个等位基因为两品种所共有,11对引物中有5对呈中等多态、6对呈高度多态。各位点产生2~6个等位基因,各位点的平均杂合度为0.456~0.772,以G07位点为最高,G06位点为最低;平均多态信息为0.375~0.737,以G07位点为最高,C01、G03和G11位点为最低。浙东白鹅和太湖鹅有效等位基因数分别为2.655和2.558,与实际测得的两品种平均值3.364和3.273较接近。研究结果表明,两品种的等位基因分布较为均匀,与鹅的实际品种特征一致,因此,双重抑制PCR技术适合于鹅的基因组结构研究。 相似文献
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用双重抑制PCR技术分离11对鹅的特异微卫星引物,应用于浙东白鹅和太湖鹅的基因组PCR扩增.结果表明:11对引物在浙东白鹅和太湖鹅中分别扩增出37和36个清晰条带,20个等位基因为两品种所共有,11对引物中有5对呈中等多态、6对呈高度多态.各位点产生2~6个等位基因,各位点的平均杂合度为0.456~0.772,以G07位点为最高,G06位点为最低;平均多态信息为0.375~0.737,以G07位点为最高,G01、G03和G11位点为最低.浙东白鹅和太湖鹅有效等位基因数分别为2.655和2.558,与实际测得的两品种平均值3.364和3.273较接近.研究结果表明,两品种的等位基因分布较为均匀,与鹅的实际品种特征一致,因此,双重抑制PCR技术适合于鹅的基因组结构研究. 相似文献
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本试验将锚定PCR技术用于谷子微卫星富集文库的筛选,结果发现该技术能有效减少假阳性的产生,假阳性率仅为7.7%,该技术还能够最大限度淘汰侧翼无法设计引物的无效微卫星克隆,本研究无效克隆比率仅为3.8%.用锚定PCR技术最终筛选开发出13对多态性微卫星标记,这些标记在4个谷子材料和1个野生种中扩增出等位变异数为2~4.锚定FCR技术与常用的同位素杂交筛选技术及普通PCR技术相比,更能降低假阳性克隆和无效微卫星克隆的产生,是一种理想的微卫星文库筛选技术. 相似文献
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微卫星标记由于具有在基因组中分布广、多态性高及共显性等特点,因而在群体遗传多样性分析中广泛应用。本实验针对绵羊19个微卫星标记位点构建了8个多重PCR扩增体系,其中包括3个三重,5个两重PCR扩增体系。采用建立的多重PCR扩增体系对32只小尾寒羊的多态性进行了检测,结果表明19个微卫星标记的等位基因数在5~17之间,期望杂合度、观测杂合度和多态信息含量分别位于0.423~0.885、0.344~0.875和0.392~0.859之间。本实验所建立的多重PCR扩增体系将为绵羊遗传多样性、亲子鉴定和个别识别提供技术基础。 相似文献
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亲缘较近的羊群中开展亲子鉴定时,利用微卫星标记对羊进行亲子鉴定,清晰地将父母与母本信息显示出来,其遗传多态性较高、检测速度快和准确高效的特点,能有效的预防近亲繁殖,所以,近年来,微卫星标记在羊亲子鉴定中得到了广泛的应用。基于此,主要就如何利用微卫星标记对羊进行亲子鉴定进行探究。 相似文献
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利用微卫星DNA标记进行黄牛的亲子鉴定 总被引:1,自引:0,他引:1
亲子鉴定在畜牧业生产中具有重要实际应用价值,常见其用于建立准确的系谱档案和家畜归属的诉讼案件。其中标准的三联体(即在母子关系是已知的情况下,鉴定假设父亲与子畜是否有亲生关系)和单亲[即父子(女)或母子(女)亲生关系的确定]两种情况下的亲子鉴定在畜牧生产中具有普遍意义。以云南文山黄牛为试验材料,采用10对常染色体微卫星DNA标记对这两种情况下的亲子关系进行了检测分析。结果表明,常染色体微卫星DNA标记在标准的三联体和单亲两种情况下都能用来进行亲子鉴定,结果较准确,但标准三联体情况下的亲子鉴定更准确。确定的不同模式下亲子鉴定的方法,可为家养动物亲子鉴定标准方法和流程的建立提供依据。 相似文献
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利用微卫星分子标记法研究水稻亲缘关系 总被引:2,自引:0,他引:2
为探明水稻品种的亲缘关系,合理利用水稻品种资源,选用55对微卫星标记引物对23个水稻品种的亲缘关系进行了研究,采用UPGMA构建系统树图进行聚类分析和计算遗传距离.结果表明:引物的扩增产物带型清晰,结果稳定;23个品种分为4种类型,其中籼型8个,粳型6个,偏籼型5个,偏粳型4个;籼型品种之间和粳型品种之间的亲缘关系均较近,偏籼型品种之间和偏粳型品种之间的亲缘关系均较远.为了提高籼稻或粳稻品种和杂交种的优势,应注意采用偏籼或偏粳材料作为亲本之一. 相似文献
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[目的]探讨北京油鸡的遗传多样性。[方法]采用29对微卫星标记对北京油鸡保种群的192个个体进行遗传多样性检测,并通过计算等位基因数、等位基因频率、期望杂合度(He)和多态信息含量(PIC)分析群体内的遗传变异情况。[结果]在29个微卫星标记中共检测到171个等位基因,每个微卫星座位的等位基因数在2~14个,平均等位基因数为5.90个;多态信息含量和期望杂合度的平均值分别为0.53和0.59,均大于0.5,表现为高度多态性;除5个位.羔(MCW0069、ADI_0112、MCW0183、LE10234和MCW0016)外,其余24个微卫星位点都处于基因平衡状态。[结论]北京油鸡保种群具有丰富的遗传多样性。北京油鸡在北京市农林科学院榆垡种鸡场得到了较为妥善的保存。 相似文献
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枇杷基因组DNA分离技术及浓度测定 总被引:5,自引:0,他引:5
采用CTAB方法及其改进方法对枇杷对14个品种的基础组DNA进行了分离、提取和琼脂糖凝胶电泳,结果表明,采用两种提取法的14个楷杷品种基因组DNA均有二条清晰泳带,其基因组DNA大小约20kb;将所分离的基因组DNA通过紫外分光光度计进行浓度测定,结果显示,不同枇杷品种DNA含量存在一定差异,浓度介于25.6-396.74ug/ml,其中太城4号最高(为396.74ug/ml),夹脚最低(25.26ug/ml)。实验还表明,改进后的方法,提取基因组DNA纯度高,且A260nm/A280nm的比值均介于1.8-2.0. 相似文献
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随机采取无直接亲缘关系的68只鸵鸟血样,采用微卫星标记技术对鸵鸟20个微卫星座位进行遗传多样性检测。结果表明,有3个座位(CAU13、CAU36、CAU46)没有多态性,其他17个座位(LEI0094、CAU5、CAU7、CAU8、CAU11、CAU14、CAU15、CAU16、CAU17、CAU22、CAU23、CAU24、CAU32、CAU34、CAU42、CAU43、和CAU57)共检测到142个等位基因,平均每个座位上等位基因数为8.3529±1.2803,平均期望杂合度及多态信息含量分别为0.8468±0.1368和0.8213±0.0321。鸵鸟群体内存在丰富的遗传变异,遗传多样性较高。 相似文献
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微卫星标记的基因组学研究进展 总被引:1,自引:0,他引:1
微卫星标记是真核生物基因组中分布均匀、含量高的一类短重复序列。本文从微卫星标记在基因组中的分布、微卫星标记的多态性、微卫星标记的进化、微卫星标记的功能及应用等几个方面对微卫星标记的基因组学研究进展进行综述。 相似文献
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小麦高分子量谷蛋白1Dx5亚基特异PCR标记 总被引:2,自引:0,他引:2
本研究为1Dx5亚基基因(Glu—Dl-1b)设计了一对特异引物,对HMW—GS在Glu—Dx1位点已知的11个小麦品种进行了PCR扩增,以检测PCR标记的准确性。结果表明,凡具有1Dx5亚基的4个品种都能扩增出一条450bp的特异带,而其它品种则不能扩增出这一特异带.与HMW—GS的蛋白质电泳结果一致。用这一特异标记对山东省推广种植面积较大的35个品种进行PCR检测.发现仅有9个品种携带1Dx5基因,占待测材料总数的25.7%,明显低于北美小麦品种。研究发现,与蛋白质的HMW—GS标记相比.PCR标记更快速、简便、准确。 相似文献
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利用20个微卫星标记对8个水貂群体和类型的488个个体进行DNA多态性测定和统计分析,计算遗传杂合度、多态信息含量、奈氏遗传距离,采用NJ法构建聚类分析图。8个群体的平均杂合度为0.4458~0.4915,多态信息含量0.4846~0.8775,平均0.6926。计算所得的Nei遗传距离、Nei标准遗传距离和NJ聚类图显示,银蓝色水貂与珍珠色水貂聚为一类,丹麦红眼白貂与丹麦标准貂聚为一类。这一研究结果表明我国饲养的水貂遗传多样性较丰富,亚群体遗传分化程度较低。 相似文献
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本研究对微卫星标记分析畜禽遗传多样性的方法、步骤、度量指标与影响因素及解决对策进行分析讨论,并对微卫星标记在绵、山羊遗传多样性上的应用与研究进展作了概述,为遗传育种工作提供参考依据。 相似文献
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选用草原红牛30头作为试验牛群体,经过牛血液基因组DNA的提取、8对微卫星引物的PCR扩增、扩增产物的聚丙烯酰胺电泳分型、计算机凝胶成像分析系统分析各位点等位基因及全部个体的标记基因型、PPAP3.0软件计算基因频率、多态信息含量(PIC)和杂合度等步骤从分子水平上分析了草原红牛在8个位点的遗传多态性。结果表明,IDVGA2、IDVGA46、TGLA44、BM1824、ETH225、BM2113、IDVGA44和IDVGA55等位基因数分别为6、6、6、4、4、2、6和4,多态信息含量分别为0.722 3、0.749 3、0.671 3、0.584 9、0.671 5、0.508 9、0.761 2和0.596 5,这8个位点均为高度多态位点。8个位点作为遗传标记应用于草原红牛遗传育种研究是可行的。 相似文献