桃分子标记研究进展

桃属于蔷薇科(Ra.saceae)桃属(Prunus),起源于我国最古老的果树之一,栽培历史悠久,分布十分广泛,是我国重要的果树种类.它的染色体数目少(2n=16),基因组小,含有0.30±0.02PgDNA,大约有3.0×108bp,只有拟南芥基因组的两倍,是最适合进行遗传学研究的多年生果树种类,也是目前研究较为深入和广泛的果树种类.分子标记是继形态标记、细胞标记和生化标记之后发展起来的一种较理想的遗传标记形式.     

桃种间亲缘关系的SSR鉴定

通过正交试验,建立了桃SSR反应体系,对桃的6个种和扁桃进行了鉴定;对谱带进行数字化转换,用SPSS11.5中的Jaccard聚类方法对结果进行了聚类,发现桃亚属间普通桃与新疆桃的亲缘关系最近,陕甘山桃与甘肃桃间也有较近的亲缘关系,在相似系数小于0.589时,普通桃、新疆桃、陕甘山桃、甘肃桃4个种被聚为一类,与这4个种相近的为光核桃,其次为山桃,最远的为扁桃。     

基于SSR标记的观赏桃亲缘关系分析

观赏桃种质资源丰富,遗传背景复杂,使用SSR标记进行鉴定评价,以期为观赏桃亲缘关系研究提供借鉴。以34份观赏桃品种、7份桃的近缘种和1份毛桃共42份种质为试材,利用16对位于李属植物参考图谱上的SSR标记进行观赏桃亲缘关系研究。结果表明,筛选出的16对SSR引物共扩增出124个清晰条带,多态性条带百分率为87.99%;...     

基于SSR标记的黄桃种质资源亲缘关系分析

利用SSR标记技术对12个黄桃品种（系）进行遗传多样性检测.结果发现,SSR标记能够揭示材料间的遗传多样性,从蔷薇科苹果属35对SSR引物中筛选出8对扩增稳定的特异性引物,构建其指纹图谱.8对SSR引物共扩增出78条DNA片段,其中44条具有多态性,多态性比率为54.6％,材料间的遗传相似系数在0.64 ～0.88之间,平均为0.759.通过聚类,从分子水平对黄桃品种（系）的遗传关系进行分析,并对12份黄桃种质材料进行了SSR标记分类,为黄桃种质资源的研究利用提供参考.     

桃野生种和地方品种种质资源亲缘关系的AFLP分析

利用AFLP技术对94份野生桃种质资源进行了DNA多态性分析,从64对E+2/M+3引物组合中筛选出9对引物用于扩增基因组DNA,共获得清晰可辨的236个标记,其中多态性标记为141个,多态性检出率为59.9%。UPGMA聚类结果显示,在遗传距离约为0.3267时,普通桃、陕甘山桃、光核桃3个种被聚为一类,与这3个种相近的为新疆桃,其次为甘肃桃,最远为山桃(白花山桃、红花山桃)。在遗传距离0.2178处,五月鲜扁干、白黏胡桃和珲春桃3份材料各自聚为一类。在遗传距离约0.1997处,普通桃又可明显分为4个组:组I包括原产于南方和西北地区的地方品种,且大部分南方蟠桃主要聚在此类;组II仅有油桃(甘肃酒泉)一个野生材料;组III包括野生毛桃和大部分原产于北方的地方品种,北方硬肉桃主要聚在这一类;组IV由白碧桃和白花山碧桃2个观赏桃品种组成。     

应用SSR标记进行部分黄肉桃种质鉴定和亲缘关系分析

以116份黄肉桃种质和19份其它桃或桃近缘种种质为试材,利用定位于李属参考图谱上的SSR标记,进行遗传多样性评价及亲缘关系分析。SSR扩增结果表明,筛选出的28对SSR引物共扩增出206个等位基因,其中多态性等位基因159个（占76.56%）。聚类结果表明,在相似系数为0.82时,黄肉桃资源在聚类图上呈两组：美洲、欧洲和亚洲育成黄桃品种聚为一组（Ⅰ）,中国地方黄桃品种中唯‘西安杏瓤桃’和‘天津黄肉’出现在这一组;来源于云南、华北、西北地区的中国地方黄桃品种聚为另一组（Ⅱ）。在相似系数为0.87时,育成黄桃品种（Ⅰ）分为8个亚组,美洲育成品种分布在所有8个亚组中,欧洲育成品种分布在Ⅰ-2、Ⅰ-3和Ⅰ-4亚组,而亚洲育成品种仅分布在Ⅰ-3和Ⅰ-4亚组;亲本相同的育成品种在聚类图中临接或出现在较近的位置,育成品种的聚类结果与品种的系谱关系基本吻合。在相似系数为0.87时,中国地方黄桃品种分为7个亚组,西南黄桃和西北黄桃存在一定的组群界限,来自西南的黄桃地方资源主要分布在Ⅱ-1和Ⅱ-5亚组,而来自西北的黄桃地方品种主要出现在Ⅱ-2、Ⅱ-4和Ⅱ-7亚组。品种群的聚类结果表明,亚洲育成品种与美洲育成品种间亲缘关系最近,其次为欧洲育成品种;中国地方黄桃品种与育成品种间亲缘关系较远。     

桃遗传图谱的构建及两个花性状的分子标记

 以桃‘红垂枝’与其近缘种山桃‘白花山碧桃’杂交的52株F1群体为试材,采用SSR、AFLP和SRAP分子标记进行遗传分析。筛选扩增稳定且多态性丰富的38对SSR引物、61对AFLP引物和38对SRAP引物进行群体分离分析,获得符合1:1分离的标记441个,亲本为双杂合位点的标记52个。应用Mapmaker分析软件将符合1:1分离的标记和雌蕊发育性状一起构建了包含11个连锁群的遗传图谱,该图谱共206个标记（18个 SSR,126个 AFLP、61个SRAP和1个形态学标记）,全长1193.2 cM。每个连锁群的平均长度为108.5 cM,标记间平均图距为5.8 cM。根据18个SSR标记与T×E参考图谱比对,本试验中的11个连锁群对应于参考图谱的G1至G8,标记的线性符合度较好。雌蕊发育性状标记定位在第1连锁群,对应于1号染色体。应用Mapmaker分析软件将亲本为双杂合位点标记和花单瓣/重瓣性状一起分析,获得1个新单瓣/重瓣基因的2个AFLP标记。     

桃主要性状的分子标记与功能基因定位研究进展

综述了桃果实、花、树体及抗根结线虫等主要性状的功能基因定位和分子标记开发的最新研究成果,阐述了决定果皮茸毛有无、果肉颜色(黄/白)、果肉质地与核黏离性、短枝型矮化和柱型等质量性状的功能基因定位,分析了1个与成熟期主效位点相关的重要候选基因,同时对决定果实糖、酸含量变化的QTL以及根结线虫(Meloidogyne incognita)、蚜虫(Myzus persicae Sulzer.)抗性相关位点的研究进展进行总结,为桃性状定位和整个发育期调控糖、酸含量的基因及其作用模式研究提供参考。在此基础上,对功能基因和分子标记在辅助选择育种和种质资源鉴定中的应用及发展方向进行展望。     

草莓品种亲缘关系的AFLP分子标记分析

 利用AFLP技术对我国国家草莓资源圃内保存的107个草莓品种进行了DNA多态性分析。从64对“2 + 2”引物中筛选出10对引物应用于扩增基因组DNA, 共获得清晰可辨的581条带, 其中412条为多态性带。UPGMA方法聚类分析结果显示, AFLP分子鉴定结果与其系谱关系非常一致, 表明AFLP指纹图谱分析能很好地鉴别草莓品种之间的遗传关系。     

蟠桃种质SSR标记的遗传多样性分析

以38个蟠桃品种和9个其他类型桃品种为试材,利用24对位于桃参考图谱上8个连锁群的SSR引物进行了蟠桃种质资源遗传多样性研究。24对SSR引物共获得179个扩增位点,其中多态性位点171个,多态率达95.53%。蟠桃资源平均Nei’s基因多样性指数(He)为0.242 5,平均Shannon信息指数(I)为0.379 8;南方蟠桃品种群多态性位点百分率为74.30%,Nei’s遗传多样性指数为0.203 8,Shannon信息指数为0.316 3;北方蟠桃品种群的遗传多样性相对较高,多态性位点百分率为91.06%,Nei’s遗传多样性为0.244 9,Shannon信息指数为0.382 4。群体间存在较小的基因分化系数(Gst=0.065 9),遗传变异有很大一部分是来自群体内,可能与其较大的基因流Nm=7.086 1有关。UPGMA聚类分析结果表明,相似系数为0.66～0.95,在相似系数为0.67时,所有南方品种聚于同一类群,北方品种除新疆蟠桃、黄肉蟠桃及香金蟠外也聚于同一类群,聚类结果支持蟠桃多起源假说。     

分子标记技市在桃基因定位中的应用

从质量性状和数量性状的基因定位二大方面,介绍分子标记技术在桃基因定位中的应用研究进展,并对分子标记技术在果树种质资源与育种应用的前景进行了展望.     

利用AFLP和RAPD标记构建桃的遗传连锁图谱

为了给进一步研究桃的遗传标记的定位打下基础,以毛桃北京2—7[Prunus persica(L．)Batsch．Beijing2-7]、山桃白花山碧桃[Prunus davidiana(Carr．)Franch．Baihuashanbitao]以及2者的F1代为试材,用RAPD、AFLP标记构建了北京2—7和白花山碧桃的遗传连锁图,分别覆盖221．7 cM(7个连锁群)、1238．8 cM(12个连锁群)。其中北京2—7的连锁图包含19个标记,标记间平均距离为11．7 cM;白花山碧桃的连锁图包含103个标记,标记间平均距离为12．0 cM。     

Prognosis and correction of iron chlorosis in peach trees and relationship between iron concentration and Brown Rot

This study investigates the possible correlations between bark, floral, and leaf iron (Fe) concentrations and SPAD measures to be used as early methods for prognosis of iron chlorosis in peach trees. The results showed that there were significant correlations between bark, floral and leaf Fe concentrations and SPAD measurements. This study shows for the first time the possibility of using bark analysis as an early predictive method of iron chlorosis in peach trees.Differences in mineral composition of leaves of peach trees, in relation to rootstocks were also found.This study also investigated the distribution of mineral elements in different parts of peach leaves. Tissue analysis of different leaf parts showed that the peripheral and petiole of leaves had the highest P, Ca, Mg, Zn, Fe, B and Cu concentrations. In contrast, the highest K concentration was found in the internal parts of leaves. High Mn concentration was found in the laminar of leaves, but was lower in the petioles.In other experiments, the effect of different sources of Fe application on the leaf Fe concentrations and development of Brown Rot in the year of application and one and 2 years later was also examined. No application increased significantly the leaf Fe concentrations in the year of application and 1 year later. Leaf Fe concentrations were significant higher in trees treated with FeSO₄·7H₂O + S 2 years after application.The possible effect of flesh Fe concentration to susceptibility of peach (cv. Sun Crest) to Monilinia laxa was also evaluated. The results showed no correlation between flesh Fe concentration and susceptibility of peach to M. laxa. Besides, no statistical difference was found in the susceptibility of peach to M. laxa collected from the cultivar Sun Crest grafted on different rootstocks.     

菠萝蜜遗传多样性的ISSR分析

用ISSR标记方法对76份菠萝蜜(Artocarpus heterophyllus Lam.)种质资源DNA的遗传多样性进行了检测,24个引物共检测到477条带,其中427条具多态性(占89.52%),平均PIC为0.23,24个引物能把76份种质完全区分开来。遗传距离分析结果显示供试种质的遗传多样性较低,在DNA水平上的遗传相似系数为0.626～0.945,平均为0.775。聚类分析表明,76份菠萝蜜材料在遗传距离系数为0.752处可分为4大类,其中热带植物园的种质WJ2和GSYWJ1与其他种质的遗传距离相对较大,干胞和湿类型不能独立聚类。另外各地区的种质与雷州半岛种质明显分开聚类,而雷州半岛各地区的种质混杂聚类在一起,不能按地区单独聚类。     

杨梅雌、雄种质遗传关系的RAPD和ISSR分析

为获得与主栽的杨梅品种遗传基础相近的杨梅雄株,文章采用了22个多态的RAPD引物和7个多态的ISSR引物,对浙江杨梅的栽培品种东魁、荸荠种、晚稻杨梅、丁岙梅和早色等10个雌株与17个雄株种质资源间的遗传关系进行了研究。结果表明,不同杨梅产地收集的这17个杨梅雄株种质资源中,雄株与品种间的遗传关系呈规律性,即同一产区的地方品种与当地的雄株间遗传相似程度最高,而同一地区不同雄株与当地主栽品种间的遗传相似程度也有不同。通过UPGMA法进行聚类分析,上述5个杨梅主栽品种分别获得了与其亲缘关系相对接近的雄株,成对遗传相似系数最高为0.958,最低为0.878。     

Phenology and drought affects the relationship between daily trunk shrinkage and midday stem water potential of peach trees

Summary

The relationship between maximum daily shrinkage in trunks (MDS), daily trunk growth (DTG), predawn water potential (Ψ_pd) and midday stem water potential (Ψ_stem) were studied in an irrigation experiment in peach trees. Control trees were irrigated to replace evapotranspiration, with trees receiving regulated deficit irrigation (RDI) watered at 35% of this rate during Stage II of fruit development and after harvest. The RDI trees were watered as controls during Stage III of fruit development. Minimum (Ψ_pd and Ψ_stem fell to –0.6.MPa and –1.2 MPa, respectively in RDI plots compared with –0.2 and –0.6 MPa in the controls. Trunk growth was less in the RDI plots than in the controls during drought. In contrast, MDS was higher when deficit irrigation was applied in the RDI trees. When site differences were considered the correlation between (Ψ_pd and accumulated trunk growth over an ample period was loose, while maximum daily shrinkage and midday stem water potential remarkably improved such a correlation. However, pooling all available data, the correlation between Ψ_stem and MDS was very poor (R²=0.44) and it substantially improved only when using data from specific phenological periods (i.e. R²=0.75). A seasonal drift in MDS values was observed and it was related to the seasonal changes in trunk growth rates, (i.e. highest shrinkage was found when growth rates were lowest). We concluded that phenology in combination with drought reduce the reliability of the water status information obtained from MDS.     

桃砧木筑波4号和筑波5号抗根癌病鉴定评价

以当年实生筑波4号(Prunus persica‘tsukuba-4’)和筑波5号(Prunus persica‘tsuku-ba-5’)的新梢为材料,采用人工接种发根土壤杆菌(Agrobacterium rhizogenes)的方法研究了其对根癌病的抗性及其分离情况。结果表明,筑波4号实生群体中免疫、高度抗病、中度抗病、中度感病和高度感病类型分别占0.90%、1.80%、9.01%、18.92%和69.37%。筑波5号实生群体中免疫、高度抗病、中度抗病、中度感病和高度感病类型分别占1.01%、3.03%、8.08%、38.38%和49.49%。筑波4号和筑波5号对发根土壤杆菌的抗性存在显著分离现象,可从中筛选出抗性极强的植株。