彩叶桂新品种‘紫嫣公主’遗传多样性的AFLP和SSR分析

以长叶木犀为对照,采用AFLP和SSR方法,研究了彩叶桂花(Osmanthus fragrans)新品种‘紫嫣公主’与其他木犀的遗传关系。筛选出55对AFLP引物和17个SSR,分别产生了1103个和45个扩增产物,其中多态性占AFLP的92.29%,占SSR的62.2%。在群体水平上,有效等位基因的数量从0.76到1.11不等,Shannon指数从0到0.11不等,表明桂花品种的遗传基础较窄。‘紫嫣公主’与其他桂花品种的遗传相似性在0.58～0.80。UPGMA聚类分析结果表明,‘紫嫣公主’属于银桂品种群。本研究结果可为桂花种质资源的保护和新品种选育提供新的分子依据。     

基于AFLP和SSR分子标记的两个优良彩叶桂品种遗传多样性分析（英文）

两种彩叶桂新品种"紫嫣公主"和"虔南桂妃"其叶片颜色渐变,观赏期较长,可在我国多地作园林观赏栽培。该文利用AFLP和SSR分子标记,以长叶木犀为对照品种,研究了"紫嫣公主"、"虔南桂妃"与其他桂花品种之间的亲缘关系。共筛选出55对AFLP引物和17对SSR引物,分别获得了1 103个扩增片段和45个扩增片段,其中AFLP的多态性比率为92.29%,SSR的多态性比率为62.20%。在群体水平上,有效等位基因数变化范围为0.76~1.11,Shannon信息指数变化范围为0~0.11,揭示桂花品种的遗传基础较窄。遗传相似性分析表明"紫嫣公主"与其他桂花品种的相似性系数在0.61~0.80之间,"虔南桂妃"与其他桂花品种的相似性系数在0.57~0.67之间。UPGMA聚类结果表明,"紫嫣公主"可能属于银桂品种群;但"虔南桂妃"单独聚为一类,遗传变异较大。研究结果为种质资源保护和新品种选育提供了新的分子依据。     

两种彩叶桂花新品种光合特性的比较研究

为了探讨2个彩叶桂花(Osmanthus fragrans L.)新品种(虔南桂妃、紫嫣公主)需光特性,测定4个不同桂花品种生长高峰期的光响应曲线。通过相关分析,探讨4种桂花净光合速率(Pn)。结果表明,各桂花品种净光合速率随光合有效辐射(PAR)的增加而迅速增加,在PAR200μmol/(m~2·s)时逐渐稳定。净光合速率日变化的影响因子存在显著差异。两个彩叶桂花新品种的光饱和点(LSP)、光补偿点(LCP)与其他2个桂花品种的相比较低,弱光利用效率也较强,具有较好的耐阴性。     

模拟酸雨胁迫对彩叶桂花新品种紫嫣公主和虔南桂妃生长的影响

为了解酸雨对彩叶桂花新品种紫嫣公主和虔南桂妃的胁迫特征,用模拟酸雨胁迫处理其植株。结果表明:在酸雨pH值4.0～6.0处理胁迫下紫嫣公主和虔南桂妃幼苗高生长受到的影响不显著,而pH值3.0酸雨胁迫下其幼苗的生长受到抑制,与对照存在显著性差异;酸雨胁迫对紫嫣公主和虔南桂妃的新生叶伤害与酸雨的pH值密切相关,不同浓度的模拟酸雨对植株的伤害程度表现不同,pH=5酸雨处理下紫嫣公主和虔南桂妃的伤斑不明显,pH≤4.0的酸雨胁迫下,给紫嫣公主和虔南桂妃的新生叶造成不同程度伤害,随着酸雨胁迫浓度增加(pH值越低),植株酸害指数增大,叶片酸害等级升高。紫嫣公主和虔南桂妃应避免在pH≤4.0的重度酸雨地区栽培。     

冀花系列高油酸花生新品种(系)遗传差异分析

为解析冀花系列高油酸花生新品种(系)的遗传构成并分析其遗传差异,对4个高油酸姊妹系及其亲本进行了农艺性状的调查、品质检测和SSR标记检测。结果表明:高油酸品种(系)在荚果产量、籽仁产量、百果重和百仁重等产量相关性状均与母本‘冀花6号’相当并优于父本‘开选01-6’,姊妹系获得了来源于‘开选01-6’的高油酸优良基因片段。其中,‘冀花13号’单株结果数最多,荚果较小,出仁率高。‘冀0607-5’植株相对矮小。SSR标记分析表明,双亲对4个高油酸姊妹系的遗传贡献为46.15%~53.84%。6个多态性标记中,分别有1~5个标记可用来进行两两品种(系)的区分。seq5D05-340和seq15C12-500为‘冀花13号’特异遗传位点;AS1RN9C02-c-386和IPAHM103-190分别为‘冀花16号’和‘冀0607-5’特异遗传位点。遗传距离分析表明,‘冀花19号’和‘冀0607-5’具有较近的亲缘关系,‘冀花13号’与‘冀0607-5’遗传差异最大。以上结果为分析花生高油酸品种(系)的遗传构成及鉴别品种的真实性奠定基础。     

12个北美冬青品种的ISSR亲缘关系分析

北美冬青Ilex verticillata作为切枝观赏和景观美化植物在中国花卉市场受到越来越多的关注。为给北美冬青新品种选育提供保障,采用简单重复序列间扩增多态性（ISSR）分子标记分析了北美冬青品种间的亲缘关系,从12个ISSR引物中筛选出4个多态性引物;对12个北美冬青品种进行了扩增,共获得63个条带,其中多态性条带占90.48%,所选引物的多态性较高,可用于鉴定北美冬青品种间的相对亲缘关系;12个北美冬青品种间的遗传相似系数为0.54~0.87,亲缘关系相对较近;品种间的遗传相似系数聚类结果表明,各品种间存在不同程度的亲缘关系,其中I. verticillata ‘Jim Dandy’和I. verticillata ‘Cacapon’间亲缘关系最近。研究结果为北美冬青品种的选育奠定了理论和实践基础。     

模拟酸雨胁迫对彩叶桂花新品种紫嫣公主和虔南桂妃生长的影响

为了解酸雨对彩叶桂花新品种紫嫣公主和虔南桂妃的胁迫特征,用模拟酸雨胁迫处理其植株。结果表明:在酸雨pH值4.0～6.0处理胁迫下紫嫣公主和虔南桂妃幼苗高生长受到的影响不显著,而pH值3.0酸雨胁迫下其幼苗的生长受到抑制,与对照存在显著性差异;酸雨胁迫对紫嫣公主和虔南桂妃的新生叶伤害与酸雨的pH值密切相关,不同浓度的模拟酸雨对植株的伤害程度表现不同,pH=5酸雨处理下紫嫣公主和虔南桂妃的伤斑不明显,pH≤4.0的酸雨胁迫下,给紫嫣公主和虔南桂妃的新生叶造成不同程度伤害,随着酸雨胁迫浓度增加(pH值越低),植株酸害指数增大,叶片酸害等级升高。紫嫣公主和虔南桂妃应避免在pH≤4.0的重度酸雨地区栽培。     

梨极早熟芽变品种‘六月酥’的AFLP分析

【目的】从DNA分子水平研究‘早酥梨’及其极早熟芽变品种‘六月酥’的遗传差异,为极早熟梨的分子育种提供理论依据。【方法】以‘早酥梨’和‘六月酥’梨的幼叶为试材,采用改良CTAB法提取梨叶片基因组DNA,应用AFLP技术对‘早酥梨’和‘六月酥’进行遗传差异分析。【结果】DNA完整性较好,纯度高。64对AFLP引物组合中有47对检测出DNA分子多态性,产生了1 931条清晰谱带,其中多态性位点有95个,多态性条带比例为9.38%,遗传相似系数为95.24%,差异片段主要集中在200~900 bp;47对不同引物组合均能在‘早酥梨’和‘六月酥’梨间检测到AFLP扩增差异位点。【结论】‘六月酥’和‘早酥梨’之间的差异与遗传物质的改变相关,其中一些差异可能与决定梨极早熟性状的基因有关。     

9个白杨品种SSR指纹图谱构建及遗传关系的研究

利用SSR分子标记,对4个白杨杂交新品种及父母本和3个近缘品种进行了指纹图谱构建和遗传关系分析。结果表明:筛选出的9对引物共扩增出106条清晰条带,平均每对引物扩增条带为11.7条,其中,多态性条带89条,多态性比率为83.1%,说明这些品种间具有较高的遗传多样性。9个品种间的遗传相似系数在0.41~0.75之间;通过系统聚类分析发现,4个杂交新品种与父本截叶毛白杨遗传相似度较高。选用扩增效果好,重复性高的3对引物构建了DNA指纹图谱,为这些品种的商业化生产应用提供了技术依据。     

甘蓝型油菜EMS突变后代材料的分子遗传多样性分析

旨在利用SSR和SRAP标记从分子水平上分析甘蓝型油菜EMS突变后代材料的遗传差异。选取138个‘中双9号’油菜的EMS突变M_3株系(以‘中双9号’为参照),这些材料的叶、花、角果等存在丰富的形态学变异,选用24对扩增条带清晰、多态性高的SRAP引物和20对SSR引物对参试的139个材料进行分析。结果显示,24对SRAP引物共检测到360个位点,其中102个为多态性位点,平均多态性比率为28.33%,平均多态性信息含量PIC为0.60;20对SSR引物共检测到196个位点,其中91个为多态性位点,平均多态性比率为46.43%,PIC为0.59。参试材料之间的遗传相似系数为0.62~0.91,聚类分析和群体结构分析结果显示,参试EMS突变M_3株系没有完全按表型突变聚在一起。研究表明,EMS诱导‘中双9号’产生了分子水平上可检测的突变且诱变后代材料之间存在广泛的遗传差异。     

分子标记技术及其在大豆疫霉根腐病研究中的应用

随着遗传学的不断发展,遗传标记的种类和数量也不断增加。与其他标记技术相比,分子标记技术具有许多明显的优越性,因而应用也日趋广泛。综述了RFLP、RAPD、SSR、AFLP、SCAR、SNP、SRAP等几种主要DNA分子标记技术原理和方法及其在大豆疫霉根腐病研究中的应用。     

利用InDel标记构建番茄新品种指纹图谱

利用优化的InDel技术体系对19份上海地区主栽番茄新品种进行遗传多样性分析和指纹图谱构建。结果表明,19份番茄品种在遗传相似性系数为0.38时被分为2个主簇,供试品种遗传相似性系数在0.38到0.86之间,说明这些品种具有丰富的遗传多样性,聚类分析结果为番茄亲本选择选配提供了理论依据。利用5对InDel引物组合构建的指纹图谱将19份供试品种区分开,其中引物sli555可直接鉴定出品种‘浦珍’,引物sli608可直接鉴定出品种‘宇宙3号’和‘浦粉1号’,引物Indel F331可直接鉴定出品种‘凯旋’和‘改良粉妃’,表明InDel标记是一种构建番茄品种指纹图谱的理想标记,研究结果为番茄新品种的审认定、新品种保护权申请等工作提供了参考。     

蓝莓基因组SSR分子标记开发

基于蓝莓(Vaccinium spp.)基因组DNA开发简单重复序列(simple sequence repeats, SSR)分子标记25对，并采用17份蓝莓试材评价其多态性，结果表明，上述SSR位点的等位基因数量介于3～9个，平均等位基因数约为4.96个，信息指数平均值为1.055 2。此外，遗传多样性分析结果表明，17份蓝莓试材被分为4个组；其中，A组包含12份蓝莓试材，为最大分支；而C组和D组分别仅包含1份蓝莓试材，其遗传亲缘关系与其他试材相距较远。本研究开发的SSR引物能为蓝莓遗传多样性研究、新品种鉴定提供借鉴。     

水稻6个异交相关性状的SSR关联分析

从水稻核心种质和栽培品种中选取95个品种构成品种总群体,调查该群体6个异交相关性状。选用分布在水稻12条染色体上的93个SSR标记对这95个品种进行基因型鉴定。采用TASSEL软件中一般线性模型对标记与性状间的关联进行分析,发掘有利等位变异和相应载体品种。结果表明:品种总群体中6个异交性状的变异系数为9.9%～62.9%。共检测到22个与异交性状相关联的SSR分子标记,其中8个与剑叶角度相关联,2个与花丝长度相关联,4个与花药长度相关联,1个与柱头长度相关联,3个与柱头外露率相关联,9个与开颖角度相关联。发掘了一批携有优良等位变异且效应值较大的载体品种。携有RM480-197 bp和RM535-170 bp条带的‘无芒早稻’分别对增加剑叶角度和花丝长度效应最大。携有RM311-162bp条带的‘敲冰黄’对增加花药长度效应最大。携有RM498-187 bp条带的‘滇屯502选早’对增加柱头长度效应最大。携有RM206-150 bp条带的‘徐稻5号’对提高柱头外露率效应最大。携有RM311-159 bp条带的‘小白野稻’对增加开颖角度效应最大。这些有利等位变异及其载体品种可用作水稻异交性状遗传改良的亲本。     

山东主栽杏品种分子遗传多样性研究

利用荧光AFLP标记技术,对26个山东省主栽杏品种的遗传多样性进行研究。结果表明：8对AFLP引物平均扩增出103.25条多态性带,多态性百分比为87.37%。所有检出位点的平均Nei’s基因多样度为0.1935,平均香农信息指数为0.3100,说明山东杏遗传多样性较为丰富。在相似系数58.58%处将山东主要栽培杏分为四大类,四大类中都有山东本地杏的分布。其中玉巴旦、大麦黄和杨继元品种同山东其它杏品种及美洲杏遗传距离较远,因此这3个品种对于扩大山东栽培杏遗传多样性,进行新品种培育和种质创新具有重要意义。     

中国古老月季‘月月粉’叶绿体基因组特征

‘月月粉’月季是蔷薇科蔷薇属植物,是中国古老月季品种之一,是现代月季的重要祖先.本研究基于‘月月粉’月季叶绿体基因组图谱,对其序列特征、SSR分子标记、核苷酸多态性及其在蔷薇属中的系统发育位置进行了分析.结果表明：‘月月粉’月季叶绿体基因组序列全长156 591 bp,具有非常典型的四分体结构,共有130个基因,包含86个蛋白编码基因、37个tRNA基因和8个rRNA基因,总GC含量为37.00%;‘月月粉’月季叶绿体基因组保守度极高,与其他4个近缘种‘大花香水’月季、单瓣月季、‘粉红香水’月季、‘亮叶’月季的序列有很好的共线性关系,且蛋白编码区域的保守度和相似度最高;‘月月粉’月季叶绿体基因组共有57个简单重复序列(SSR),且绝大多数是单核苷酸重复序列;‘月月粉’月季与单瓣月季的亲缘关系密切.本研究结果为后续蔷薇属的遗传多样性、遗传结构及系统发育研究提供了科学依据.     

分子标记在作物遗传育种中的应用

分子标记已被广泛用于作物分子连锁遗传图谱的构建、遗传多样性、基因定位、外源导入基因的检测等研究。以RFLP、RAPD、AFLP和SSR为主的分子标记各具特色,克服了传统遗传标记的缺陷,在分子标记辅助育种中已得到广泛的应用。     

基于SSR分子标记的福建百香果品种（系）鉴定及指纹图谱构建

【目的】基于SSR分子标记鉴别福建百香果品种的遗传多样性,构建福建百香果品种的分子指纹图谱。【方法】基于转录组测序,开发西番莲SSR分析标记,并筛选出15个重复性好、多态性高的分子标记用于17个福建百香果品种（系）鉴定及遗传多态性分析,构建百香果品种（系）的SSR分子指纹图谱。【结果】利用MISA软件对1 kb以上的24 319条西番莲（Passiflora caerulea L.） Unigene进行搜索,于8 742条Unigene上检测出11 385个SSR位点,出现频率为46.82%,平均分布距离为7.15 kb。单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸分别占总SSR的63.72%、20.40%和14.28%,为数量较大的优势重复基序,其优势重复基元分别为A/T、 AG/CT和AAG/CTT。通过Primer 3.0共获得出28 257对SSR引物。从26对有效扩增引物中选择重复性好的15对引物,对17份百香果品种（系）进行多态性验证分析。15对SSR引物共产生235条多态性条带,PIC平均值为0.95。利用UPGMA进行聚类分析并作图,在遗传距离0.765处,可将17个品种（系）分为7个...     

分子标记辅助选择改良'黄华占'的褐飞虱抗性与抗旱性

以携带抗褐飞虱基因和抗旱性好的节水抗旱稻M535为供体材料,以优质高产常规水稻‘黄华占’为受体材料,采用杂交、回交的方法,在分离群体中利用与Bph15基因紧密连锁的Ms5标记进行分子标记辅助选择,经抗旱性筛选与农艺性状选择,选育出3个抗旱且携带Bph15基因的纯合株系W1、W2、W3。利用全基因组56K水稻SNP芯片分析3个改良株系的背景回复率,分别为92.01%、88.18%和84.26%。抗性鉴定表明:3个株系苗期对褐飞虱抗性为"抗虫",W1、W2、W3的抗旱性级别分别为2级、3级、2级,优于‘黄华占’。田间主要农艺性状考察表明:3个株系的株高均比‘黄华占’显著增加;株系W2的穗长显著长于‘黄华占’;株系W3的千粒重显著大于‘黄华占’;在其他性状上,3个株系与‘黄华占’均没有显著差异。     

DNA分子标记及其在番茄遗传育种中的应用

介绍了RFLP,RAPD,SPAR,SSR—锚定PCR,AFLP,STS,CAP和SNP等DNA分子标记的概况,以及它们应用于番茄基因组作图及遗传育种研究的最新进展,包括：遗传多样性研究、品种指纹图谱及杂种纯度鉴定、基因定位、标记辅助选择、比较基因组研究、基因克隆等,并就今后番茄分子育种主要研究方向进行了讨论。