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板栗PAPD影响因素的研究 总被引:5,自引:3,他引:2
稳定的RAPD反应体系是进行RAPD分析的关键,分别测试了模板DNA、dNTP、Mg^2 、引物、TaqDNA聚合酶浓度和变性时间、退火温度及时间、延伸时间、延伸时间、循伸时间、循环次数等对反应结果的影响。通过实验确定了板栗最佳的RAPD反应条件。在50ul反应体系中含有50ng模板、0.74umol/L随机引物、180umol/LdNTP、3UTaqDNA聚合酶、2.0mmol/LMgCl2。反应扩增程序为:94C预变性5min.40次热循环,每个循环包括:94C变性30sec,36C退火45sec,72C延伸90sec,最后72C终延伸7min。按照优化的RAPD条件进行的重复实验,重现性良好。 相似文献
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在提取高质量八角基因组DNA的基础上,通过对其RAPD反应体系的Taq DNA聚合酶、dNTPs浓度、Mg2+浓度、引物浓度等因子的优化,建立了稳定、重复性高的八角RAPD-PCR反应体系.研究结果表明,在25 μL PCR反应体系中,含1.0 UTaq DNA聚合酶,0.15 mmol·L-1 dNTPs,2.0mmol·L-1 Mg2+,2.0 μmol·L-1引物,20~ 80 ng模板.最佳反应程序为,94℃预变性5 min,扩增后94℃变性30 s,31 ~37℃退火30 s,72℃延伸30 s,35个循环;72℃完全延伸7 min,4℃保存.在建立RAPD-PCR反应体系的基础上,从240条RAPD引物中筛选出15条扩增条带清晰、稳定性好的引物,并通过各引物的退火温度梯度实验,确定了各引物的最适退火温度. 相似文献
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油茶随机扩增多态DNA条件的研究 总被引:10,自引:0,他引:10
以改进的CTAB法提取油茶嫩叶总DNA,进行随机扩增多态DNA(RAPD)分析,分别测试了Mg2+浓度、引物浓度、dNTP浓度、模板DNA浓度和TaqDNA聚合酶用量对反应结果的影响,确定了油茶RAPD分析的最适反应体系:在25μlPCR反应体积中,含20ng模板DNA,2 5mmol·L-1MgCl2,0 2mmol·L-1dNTP,0 3μmol·L-1引物,1UTaqDNA聚合酶。扩增程序为:94℃预变性180s;94℃变性60s,37℃退火90s,72℃延伸120s,反应40个循环;最后在72℃延伸5min。 相似文献
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适于草果遗传多样性分析的RAPD引物筛选 总被引:1,自引:0,他引:1
以云南省文山州西畴县和德宏州陇川县的12株草果优良无性系为材料,利用RAPD标记技术,选用192个RAPD随机引物,对草果进行PCR扩增,并用UPGMA法对RAPD引物扩增条带进行聚类分析,计算其遗传相似系数,以期筛选出适用于草果遗传多样性分析的RAPD有效引物。实验共筛选出21个条带清晰、多态性丰富并具有可重复性特点的有效引物。21个引物在实验选用的12份样品中共扩增出177条DNA带,其中多态性带数为119条,占扩增总带数的67.2%,每个引物平均扩增出8.4条带。结果表明,12份草果样品聚为A组和B组,其中A组又分为两个亚组,聚类结果与所选用材料的地理来源基本一致,这也说明该研究所筛选得到的21个RAPD引物适用于草果的遗传多样性分析。该研究为应用RAPD标记技术对草果进行遗传多样性分析等研究奠定了基础。 相似文献
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对核桃RAPD分析中Mgh、引物、dNTPs、TaqDNA聚合酶浓度及复性温度等因素进行了比较影响分析。建立了适合核桃DNA多态性分析的RAPD反应体系:25μL反应液中,3.5mM Mg^2+、0.2mM dNTPs、0.2μM随机引物、1.0UT aq酶、50ng~100ng模板DNA;反应过程为45个循环,94℃变性60s,36℃退火60s,72℃延伸120s。 相似文献
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运用改良SDS(十二烷基硫酸钠)法,从马尾松、黄山松、黑松等松树种子胚乳中提取到较高纯度的DNA,并对其纯度、浓度及产率进行了分析.经RAPD检测表明,DNA扩增效果良好,完全能满足常规DNA实验的要求,为针叶树种等其它小粒种子DNA的提取提供了经济、快速、可靠的实验方法. 相似文献
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