真核生物核糖体RNA基因的转录调控

综述了真核生物核糖体RNA串联基因调控机制、转录预起始复合物的形成及核糖体RNA基因转录起始调控机制。     

动物脂肪酶基因超家族分子进化和系统发育关系研究

研究对动物脂肪酶基因超家族的5个成员蛋白家族43条mRNA序列做进化分析,利用MEGA4.0计算5个成员蛋白家族的组间和组内遗传距离,在脂肪酶超家族之间,LPL蛋白家族与EL、HL蛋白家族之间是有差别不大的遗传间隔,是为0.3867和0.5243。LPL蛋白宗族与PL、PLA1蛋白宗族之间是有很大的遗传间隔,是为0.9786和0.8791。     

海洋双RNA病毒VP2e基因的克隆和表达

从海洋双RNA病毒(MABV)Y-6毒株基因组中克隆到VP2 e基因,将其连接到GST融合表达载体pGEX-6P-1,在大肠杆菌中表达,并对其表达条件进行了优化。通过温度和诱导物浓度优化试验,经SDS-PAGE和Western-Blot检测表明,在温度为37℃、IPTG浓度为0.1mmol/L时,表达的融合蛋白含量最高,占细菌总蛋白的28.6%。     

偶蹄动物朊蛋白基因变异性和其系统发生关系分析

【目的】为明了偶蹄动物PrP基因的结构特征及其变异与结构、功能和朊粒病传染种间屏障的关系以及系统发生关系;【方法】利用DNAstar和Clustalx程序及treev32软件进行了22种偶蹄动物的43个完整PrP基因序列的同源性分析、多重排比和进化树构建;【结果】不同种属偶蹄动物的PrP基因完整ORF大小有所差异,范围为768～795 bp,可编码255～264个氨基酸的朊蛋白。核苷酸和氨基酸序列的同源性,偶蹄动物间≥88.6%和≥93.3%,反刍动物间≥95.4%和≥96.5%。共发现40个点突变和2个突变区。在N-端柔韧无序"尾"区(25～135)以八肽重复缺失为主,球形结构域区(136～241)以点突变为主,点突变主要簇聚在S1 -折叠前的柔韧无规卷曲区的C-端部分和HC -螺旋内。氨基酸104～135区和球形结构域区存在有8个高突变位点。已知PrP肽基元和功能位点如芳烃回文序列基元、2个N-连接糖基化位点、2个苏氨酸磷酸化位点、1个酪氨酸硫化位点、形成二硫键的2个半胱氨酸以及GPI锚锚着点丝氨酸为偶蹄动物所共有,各种间变异体的各结构模式非常一致。进化关系分析,可将偶蹄动物PrP基因区分为3大类,反刍动物PrP基因分为3小类。令人意外的是,2个双峰驼PrP基因的进化关系与牛属动物基因同源。【结论】偶蹄动物的PrP基因是一个保守基因,氨基酸104～135区和球形结构域区内的8个高突变位点可能是影响分子间相互作用、形成朊粒病传染种间屏障的主要位点,物种间各氨基酸变异并不影响PrP的主要结构和功能。     

动物GH基因和前GH一级结构的比较研究

本文依据大量文献资源较系统的综合分析了动物ＧＨ基因和前ＧＨ的一级结构及其物种间存在的保守性和变异性。结果表明：ＧＨ基因有５或６个外显子，其ｃＤＮＡ长度一般为８００－１２００ｂｐ；前ＧＨ的信号肽和成熟肽分别为１６－２７和１８６－１９１个氨基酸。外显子的数目和大小在不同纲动物间存在较强的保守性。哺乳纲动物间和鸟纲动物间在基因长度、外显子数目和大小、内含子大小、碱基组成、５’端和３’端非编码序列、局部碱     

柞蚕微孢子核糖体基因和转录间隔区的序列及系统进化分析

【目的】研究柞蚕微孢子（Nosema antheraeae）的核糖体基因，转录间隔区（ITS）以及它们的排列顺序，为柞蚕微孢子的分类和系统进化分析提供分子生物学方面的依据。【方法】采用特异引物进行PCR扩增，克隆和测序。用DNAStar软件，用Clustal W 的比对方法得到遗传距离和系统进化树。【结果】得到柞蚕微孢子的核糖体小亚基rRNA（SSU rRNA），转录间隔区（ITS），5S rRNA的全长，得到核糖体大亚基rRNA（LSU rRNA）的部分序列。【结论】柞蚕微孢子的核糖体基因排列顺序为LSU－ITS1－SSU－ITS2－5S与Nosema bombycis 相同，是一种比较特殊的排列方式。将微孢子SSU rRNA基因和ITS结合起来分析微孢子的亲缘关系是一个新的尝试。     

从植物抗病基因的克隆看其基因结构、功能和进化

对植物抗病基因的克隆技术及已克隆的一些抗病基因作了概述,归纳了抗病基因的类型、产物结构和功能,对抗病基因进化的可能分子机制也作了讨论.     

酯酶功能和编码基因的多样性

酯酶(esterase)是催化酯键水解的一大类酶的总称,广泛存在于动物、植物和微生物中.它种类繁多,功能和所催化的底物多样.酯酶通过催化蛋白质的去磷酸化来调节酶、转运蛋白、转运因子和细胞信号转导通路中的蛋白活性参与生物体内的物质代谢和能量代谢,酯酶还直接催化细胞信号物质的合成和转化.酯酶大多由多基因家族编码,同一家族成员在不同种生物和同一生物不同亚种中存在差异,因此是进化关系分析和品种鉴定的重要靶酶.酯酶自身活性受酶蛋白的磷酸化和糖基化的调节.本研究扼要综述酯酶种类、功能、编码基因、基因进化和功能调节多样性方面的研究进展.     

海洋双RNA病毒(MABV)VP3基因的克隆与表达

海洋双RNA病毒(MABV)可引起多种海洋生物的腹水病等病症.从MABV基因组中克隆到VP3基因,将其连接到GST融合表达载体pGEX-4T-2上,在大肠杆菌中表达,并对其表达条件进行了优化.结果表明,在温度为30℃、IPTG浓度为0.8mmol·L-1时.表达的融合蛋白相对最高,占细菌总蛋白的20.7%.试验结果为该病毒结构蛋白和MABV病毒疫苗研究提供了基础.     

海洋双RNA病毒(MABV)VP5基因的克隆与表达

从海洋双RNA病毒(MABV)基因组中克隆到VP5基因,将其连接到6×His融合表达载体pET-28a(+)上,在大肠杆菌中表达,并对其表达条件进行了优化.研究结果表明,在温度为28℃、IPTG浓度为0.1 mmol·L-1时,表达的融合蛋白相对最高,占细菌总蛋白的7.3%.     

部分水产动物性别决定基因的研究进展

继在哺乳动物中发现了性别决定基因SRY后,相关学者还发现了诸如性别连锁基因、芳香化酶基因、锌指结构基因、H—Y抗原、Sox、DMRTl、DMy等许多与性别控制和性腺发育相关的基因,为进一步阐明鱼类性别决定机制提供了基础和手段,但仍存在一些问题有待探索。本文概述了近年来部分水产动物性别决定基因方面的研究动态和进展,并对其应用前景做了简述,以期为系统研究鱼类性别决定机制提供参考。     

海洋动物抗菌肽的研究进展

随着人们对食品安全的要求越来越高,抗菌肽因相对于抗生素而言具有不产生抗药性的主要特点而越来越引起人们的关注.本文论述了海洋动物抗菌肽的研究进展、作用机理以及对其在水产养殖中应用前景.     

结构面粗糙度对其剪切过程中变形特征与强度特征的影晌

采用相同材料制作不同粗糙度试样进行法向应力下的直剪试验,深入研究结构面在剪切应力下的变形特征和强度特征,并进行数值模拟,得出结构面受到剪切作用时变形特征及强度特征与结构面粗糙度的关系,结果表明：在结构面受到剪切作用时,随着结构面粗糙度的增大,结构面的抗剪强度相应增大,但是在不同的粗糙度下,增大的幅度不同;受到剪切作用后,结构面的表面积出现不同程度的减小,随着粗糙度的增大,减小的程度变大．     

珠颈斑鸠线粒体12S rRNA基因的克隆·测序和分子进化分析

[目的]获得殊颈斑鸠（Streptopelia chinensis）线粒体12SrRNA基因序列,并以此分析不同鸟类的分子进化关系。[方法]根据其他鸟类线粒体12SrRNA基因及侧翼序列设计引物,采用PcR的方法获得珠颈斑鸠线粒体12SrRNA基因片段,克隆后进行序列测定,利用Mega4．0软件Neighbor—Joining法分析不同鸟类的进化关系。[结果]获得珠颈斑鸠线粒体12SrRNA基因序列长度为970bp,碱基组成为：A=31．6％、C=28．9％、G=19．8％、T=19．7％,其中A＋T含量高于G＋C含量。通过与GenBank中环颈斑鸠（Streptopelia capicola）等其他8种鸟类12SrRNA基因序列比较发现,珠颈斑鸠与环颈斑鸩的同源性最高。为94．4％,与家鸭（Arias platyrhynchos）的同源性最低,为78．4％。并根据这9种鸟类序列用NJ法构建进化树,结果表明,珠颈斑鸠和其他8种鸟类在分子水平上反映的进化关系与在形态学上的进化关系基本吻合。[结论]首次得到珠颈斑鸠12SrRNA基因全长序列,并确定了珠颈斑鸠与其他8种鸟类的分子进化关系。     

NO系统及其在海洋动物病害防御中的研究进展

NO分子是一种非常规的神经递质和神经调节分子,它首次被发现是由硝酸甘油在体内分解而得到的。低浓度的NO能起到扩张血管、改善心脏供血等作用,高浓度的NO具有抵抗病原体和肿瘤的作用。近年来,一氧化氮合成酶(NOS)被应用于海洋动物抵御外界病原体的研究,肯定了它在免疫防御方面的重要性。     

六个癌基因碱基序列的结构特点与聚类分析

提取6个癌基因(BAK1、ccnd1、A DA MTS1、ADAM17、A DA MTS8、A GER)的碱基序列,借助MATLAB软件编写程序代码,检索6个癌基因碱基序列的4种单一碱基(A、T、C、C)的概率和64种三碱基组(AAA、AAT、AAC、……、GGG)的概率；对6个癌基因碱基序列的各种分布进行相空间聚类.结果表明,所在染色体不同、所在细胞不同、序列长度不同的6个癌基因碱基序列的结构特点与其生物学功能之间存在着明确的相空间关联.对生物学功能未知的基因和生物学功能已知的基因进行碱基序列结构特点分析和相空间聚类,可以由聚类结果预测功能未知基因是否具有与功能已知基因相似的生物学功能,这为寻找具有某种生物学功能的基因和预测基因是否具有某种生物学功能提供了一个有效途径.     

选择与适应:兰科植物查尔酮合酶基因家族成员的分子进化和功能趋异

回顾了近十五年来国内外对各科植物查尔酮合酶基因CHS分子进化的研究成果,并结合作者近年来对兰科植物CHS基因分子进化的研究结果,对兰科植物CHS基因分子进化和功能趋异的机制展开综述,揭示了植物中普遍存在的CHS基因分子进化以及伴随的功能趋异的现象和机制,初步探讨了CHS基因分子进化与生物进化和自然选择的关系。     

甜菜碱在动植物中的应用研究进展

甜菜碱是广泛存在于生物体内的一种季铵型生物碱。不仅对高等植物的渗透调节起重要作用,也可以提高动物肉质和饲料的转化效率。综述甜菜碱的功能及其在实际生活中的应用,为进一步研究其作用效果提供基础依据。     

Cloning and Characterization of Genes Coding for Fructan Biosynthesis Enzymes （FBEs）in Triticeae Plants

Fructan is not only a carbon source for storage but also plays an important role as anti-stress agents in many plant species. Complex fructans having both β-（2,1）- and β-（2,6）-linked fructosyl units accumulate in Triticeae plants commonly. Three enzymes （sucrose： sucrose 1-fructosyltransferase, 1-SST, EC： 2.4.1.99; sucrose： fructan 6-fructosyltransferase, 6- SFT, EC： 2.4.1.10; and fructan： fructan 1-fructosyltransferase, 1-FFT, EC： 2.4.1.100） were involved in fructan biosynthesis in Triticeae plant species. We successfully isolated these genes from tetraploid wheat （Triticum turgidum, genotype： AABB）, common wheat （Triticum aestivum L., genotype： AABBDD） and three wild relatives of common wheat, Triticum urartu Thum. （the origin of the AA genome）, Aegilops speltoides （Tausch） Gren. （the putative source of the SS genome） and Aegilops tauschii Coss. （the source of the DD genome）. Sequence analysis revealed that all the FBEs （fructan biosynthetic enzymes） had three highly conserved functional motifs except 1-SST （EU981912） from tetraploid wheat species only with conserved DPNG. Low pI （isoelectric point） and potential N-glycosylation sites were predicted, which were crucial for protein compartmentation and post-translational process. Analysis on subcelluar localization signals showed that only 6-SFT had vacuolar-directed signal. Sequences alignment result showed that 1-SST and 1-FFT were more conservative and had closer relationship each other, while 6-SFT was more active during the evolution processing. According to the syntenic relationship between wheat and rice genome, FBEs were predicated to be located on the homeologous group 6 and group 2 chromosomes. Expression profile confirmed that expression of all the three FBEs were drought-stress induced. This study can assist to establish a useful theoretical platform for cold- or drought-tolerant improvement of wheat by modulating FBEs expression.     

豫北泥鳅线粒体DNA 16S rRNA和12S rRNA基因序列的遗传多样性分析

为了评价豫北地区泥鳅种质资源的多样性,以采自新乡地区泥鳅种群中的11个个体为材料,利用PCR技术扩增其线粒体16S rRNA和12S rRNA基因的部分序列,利用 Clustalw 2．0和DNAsp 4．10软件分析了不同个体间的差异和遗传多样性。结果表明：16S rRNA和12S rRNA基因种内个体间的差异分别为0．25％和0．97％,二者的分化程度较低;16S rRNA的进化速度约为12S rRNA基因的4倍。16S rRNA和12S rRNA种群群体的单倍型间平均遗传距离分别为0.0027、0.0016,单倍型多样度指数分别为0.873、0.327,核苷酸多样性指数分别为0.00265和0.00081,平均核苷酸差异数分别为1.636和0.327。可见,豫北泥鳅种群具有较低的遗传多样性。