家兔肠道微生物ERIC-PCR指纹图谱构建及分析

[目的]构建不同周龄健康家兔及腹泻家兔肠道微生物的ERIC-PCR指纹图谱,分析二者肠道菌群结构的多样性及其差异性,为优化家兔饲养和疾病防治打下基础.[方法]收集l~8周龄健康家兔与腹泻家兔粪便样本,分离肠道微生物并提取其基因组DNA,PCR扩增其16S rDNA与ERIC,构建ERIC-PCR指纹图谱,对不同同龄健康家兔及腹泻家兔肠道菌群结构进行分析.[结果]肠道微生物迅速在1周龄仔兔肠道中定植且总量达最高值,其后不断减少,5周龄后总量趋于稳定,且l周龄仔兔与5周龄后(断奶后)家兔的肠道微生物总量间均存在显著差异(P<0.05).随着周龄的增加,肠道微生物ERIC条带特征发生明显变化,各周龄出现了不同的特征性ERIC条带.与同一周龄健康家兔相比,腹泻家兔肠道微生物ERIC条带明显减少,条带特征存在明显差异,菌群多样性低于健康家兔.[结论]随着周龄的增加,健康家兔的肠道微生物菌群结构和多样性发生明显变化.与同一周龄健康家兔相比,腹泻家兔肠道微生物菌群结构明显改变,多样性明显降低,且出现健康家兔中未出现过的优势菌群,进一步证明肠道微生物菌群结构与家兔生长发育和腹泻存在关联性.     

EM有效微生物群制剂简介

EM是有益微生物菌群的简称。它包括光合菌群、乳酸菌群、酵母菌群、草兰氏阳性放线菌群、发酵系的丝状菌群，核心为光合菌群。在动物或植物体内，这些有益菌多了，生长旺盛，那么就会抑制有害菌的生长。动、植物的病就会减轻，甚至消失了。EM就是利用这种原理来增强动、植物的抗病力，改善品质，提高产量的。现将其主要使用的方法介绍如下：     

患兔流行性腹胀病家兔肠道菌群结构的ERIC-PCR指纹图谱分析

[目的]建立患兔流行性腹胀病家兔肠道细菌的DNA指纹图谱,并分析其肠道菌群结构特征的整体差异。[方法]提取流行性腹胀病兔及健康兔肠道内容物细菌总DNA,应用肠杆菌基因间重复共有序列基因扩增技术(ERIC-PCR)建立肠道菌群的DNA指纹图谱,并分析其整体差异。[结果]病兔大肠样本DNA条带明显少于健康兔对照,而小肠样本在二者间无明显差异,说明病兔与健康兔大肠肠道菌群存在整体差异。病兔大肠样本DNA在约350 bp处出现1条主带,同时伴有若干较弱的带,而健康兔对照大肠样本DNA条带均无明显规律。病兔大肠肠道的微生物群落多样性指数为(2.03±0.49),健康兔大肠肠道的微生物群落多样性指数为(3.30±0.31),差异极显著(P0.01)。[结论]兔流行性腹胀病发病兔大肠中肠道菌群结构多样性降低,可能存在单一或几种特定的肠道优势菌群。     

畜禽粪便好氧发酵优势菌群的分离及微生物菌群变化研究

利用新鲜畜禽粪便,模拟好氧发酵过程,通过多次富集培养和驯化,获得了含有除臭和有机物快速降解的优势菌群,同时对发酵过程中微生物菌群的变化情况进行了分析。结果显示,利用驯化后的优势菌群对畜禽粪便进行好氧发酵,4天后可达到除臭效果,6天后驯化样重量减少13.16%。通过对微生物菌群变化情况研究,发现细菌是整个发酵过程的优势菌群,是中温阶段的主要作用菌群,对发酵升温起主要作用,放线菌是高温阶段的主要作用菌群。     

益肽安多效益生菌实用说明

益肽安多效益生菌主要是由EM菌（乳酸菌群、酵母菌群、光合菌群、革兰氏阳性放线菌群、发酵系的丝状菌群和芽孢杆菌群等）6科18属80多种微生物培养而成。是由日本琉球大学比嘉照夫教授经过50多年研究取得的科技成果。     

温度及碳源对纤维素分解菌群分解活性与稳定性的影响

为探索秸秆纤维素分解菌群筛选过程中,温度及碱处理小麦秸秆对菌群纤维素分解活性及菌群结构的影响,利用高温秸秆堆肥为筛选菌源,以碱处理小麦秸秆和未经碱处理小麦秸秆为碳源,分别在50和60℃条件下进行限制性筛选,最终获得18组具有纤维素分解活性的菌群。选择其中4组代表性菌群进行连续继代培养,监测相关性质,并利用PCR-DGGE技术结合主成分分析(PCA)方法对菌群结构进行分析。结果表明,从高温堆肥环境筛选秸秆纤维素分解菌群,培养温度及秸秆碳源均影响菌群的筛选效果。以碱处理小麦秸秆为碳源的菌群在分解秸秆过程中能够保持较好的菌群结构稳定性;60℃的温度条件和碱处理小麦秸秆的碳源条件更有利于获得高活性的纤维素分解菌群,并在此条件下成功筛选到菌群WDC2。该菌群分解碱处理小麦秸秆的纤维素内切酶活性(CMCase)达到1.01 U/mL,分解率最高为60.8%。     

猪胃肠道微生物菌群的研究现状浅析

动物胃肠道微生物菌群与宿主胃肠道环境和宿主所处的外界环境密切相关,形成统一的整体.本文对猪胃肠道微生物菌群的组成和分布、菌群的作用、影响菌群的因素以及菌群的研究手段和调控等进行了浅析,为猪胃肠道微生态区系的研究和调控提供参考.     

3种DNA提取方法对养殖池塘不同生境菌群PCR-DGGE分析的影响

比较3种DNA提取方法(溶菌酶法、CTAB法及珠磨法)对养殖池塘几种生境(底泥、饲料、草鱼肠道内容物及肠道壁)菌群PCR-DGGE分析的影响。结果表明,以3种提取方法获得的DNA为模板均能进行16S rDNA V3区特异性片段扩增;但不同DNA提取方法对池塘不同生境菌群DGGE指纹图谱存在显著影响。DGGE指纹图谱显示草鱼肠道内容物菌群(溶菌酶法)与肠道壁菌群(溶菌酶法)存在较高一致性,底泥菌群(CTAB法)及饲料菌群(溶菌酶法)与鱼体肠道菌群(包括内容物菌群和肠道壁菌群)则存在明显差异,但肠道菌群与底泥菌群的相似度相对更高。研究提示采用微生物分子生态学工具对养殖池塘不同生境进行菌群结构分析时,需提前优化DNA提取方法;在以投饲为主的养殖鱼塘中,草鱼肠道菌群更多源自于池塘底泥。     

利用有效微生物菌群进行鸡粪处理的研究

在实验室和生产场地进行了有效微生物菌群处理鸡粪的试验研究，结果表明，有效微生物菌群能大幅度减少鸡粪臭味、氨味，使鸡粪保存较多有效养分和具有较高生物活性，肥效好。有效微生物菌群处理鸡粪的适宜发酵条件为：采用自研有效微生物菌群，发酵鸡粪含水量 50％，有效微生物菌群的发酵浓度 3.5％— 5.0％ ，发酵温度 25℃以上，发酵时间3—7d。     

滩涂养殖青蛤体内细菌菌群的初步分析

检测了收获季节盐城滩涂养殖青蛤体内菌群总数,并对菌群进行初步鉴定。结果表明,不同养殖地的青蛤体内细菌总数和大肠菌群数存在差异,从中分离获得55株细菌,归属于6个菌属,其中弧菌属为优势菌群,对青蛤可能构成潜在的危险,并且影响食品卫生安全。     

土壤中石油烃降解菌群的构建及其在降解过程的特征分析

[目的]构建土壤中石油污染物的优势降解菌群,并对该菌群的降解性能进行研究,为生物修复技术提供帮助。[方法]构建石油污染物的优势降解菌群,对所构建菌群除油时的最适污染度进行确定,并监测该菌群群在石油烃降解过程中的动力学特征。[结果]各组菌群中ACD为最优菌群,3d内原油的降解率达39.67%;所构建的菌群在污染度为3%时除油效果最好;混合菌群ACD降解石油污染物的反应初期符合1级动力学方程,后期符合0级动力学方程,总体反应趋向于1级反应。[结论]复合菌群对石油污染物的降解性能明显高于单菌,且在其适宜的污染度条件下,菌群的降解性能也有明显提高。     

小型犬蓄脓子宫摘除对其阴道和粪便菌群结构的影响

选取4只子宫蓄脓的小型犬,分别取其阴道样品和粪便样品,采用聚合酶链式反应–变性梯度凝胶电泳(PCR–DGGE)技术,回收共性及特异性条带进行克隆测序,分析小型犬蓄脓子宫摘除对其阴道及粪便菌群结构的影响。结果显示:在摘除患犬子宫的前1天、摘除子宫后治疗第1天和第2天,患犬阴道菌群的多样性指数分别为3.22、3.35、3.05,均匀度分别为0.88、0.92、0.83,丰富度分别为25.0、28.50、21.25,均呈先增加后降低的趋势,而粪便菌群只有丰富度呈先增加后降低的趋势;大肠杆菌、假单胞菌是阴道和粪便的共同优势菌群,红球菌是共有的特异性细菌,而葡萄球菌、嗜水气单胞菌是阴道的特有细菌,不动杆菌是粪便的特有细菌。结果表明,小型犬蓄脓子宫摘除对阴道菌群结构影响较大,阴道内的大肠杆菌及假单胞菌可能源于粪便。     

纤维素降解菌群构建及其降解能力的初步研究

通过对堆肥材料内微生物菌群的连续筛选与驯化,获得高效、稳定纤维素降解菌群,并对其生长特性和降解能力进行了研究,结果表明:降解菌群生长迅速,培养第7天即可达到生长平台期;菌群纤维素酶活性在1～7 d内逐步增加,第7天的酶活性最高;降解菌群对不同纤维素材料的纤维素酶活性差异较大,初始pH值低有利于降解菌群酶活性的提高,其中初始pH值为4.0时的纤维素酶活性最高,为86.54 U。     

浅析鸡群肠道菌群失调的原因

健康的鸡群肠道菌群使动物与菌群保持动态的微生态平衡。本文从疾病、饲料和抗生素三个方面分析了鸡群肠道菌群失调的原因,旨在预防和治疗该类型疾病的发生。     

肠道菌群与仔猪腹泻的相互关系

综述了仔猪肠道菌群的分布、肠道菌群的作用、其与动物的生产性能、仔猪的腹泻关系及调控措施等。     

家禽肠道菌群多样性及其与宿主的相互关系

概述主要品种家禽肠道菌群结构多样性,分析肠道菌群与宿主的营养互作关系;多角度诠释肠道菌群对肠道黏膜免疫系统的健康影响,以期实现家禽肠道菌群发展和形成过程的可控,益生菌的合理应用,保证家禽肠道菌群与宿主两者良性互作,实现家禽的健康高效生产。     

不同生长速度的大黄鱼肠道菌群结构的差异

为分析肠道菌群结构变化对大黄鱼Pseudosciaena crocea生长速度的影响,采用高通量测序的方法,对生长条件相同、生长速度不同的两组大黄鱼肠道菌群结构进行了研究。结果表明:生长缓慢组鱼肠道内菌群OTUs和菌群多样性指数Chao1显著高于生长正常组(P0.05),但两组间Shannon指数差异不显著(P0.05);变形菌门Proteobacteria、厚壁菌门Firmicutes、梭杆菌门Fusobacteria和拟杆菌门Bacteroidetes为大黄鱼肠道内的优势菌群,其中变形菌门在两组鱼肠道内的相对丰度超过50%;两组大黄鱼肠道菌群结构变化主要集中在变形菌门、放线菌门Actinobacteria和蓝细菌门Cyanobacteria;科水平上的细菌相对丰度比较结果显示,变形菌门内的鞘脂单胞菌科Sphingomonadaceae、柄杆菌科Caulobacteraceae、丛毛单胞菌科Comamonadaceae、假单胞菌科Pseudomonadaceae和莫拉氏菌科Moraxellaceae在两组鱼肠道内的相对丰度差异显著(P0.05),其中莫拉氏菌科在生长缓慢组鱼肠道内的含量显著高于生长正常组(P0.05)。研究表明,不同生长速度的大黄鱼肠道菌群结构存在差异,生长缓慢组鱼肠道内菌群种类多于生长正常组;变形菌门内菌群变化与大黄鱼生长密切相关,莫拉氏菌科在鱼肠道内含量的变化可能是引起大黄鱼生长变慢的主要原因。     

高温菌群接种生活垃圾好氧堆肥的实验

利用从垃圾中分离、筛选、驯化的高温菌群对生活垃圾进行接种好氧堆肥实验,通过堆肥过程中微生物数量、温度的变化等来研究接种高温菌群在生活垃圾好氧堆肥过程中的作用,以及接种高温菌群与不接种高温菌群好氧堆肥效果的差异。结果表明,接种高温菌群后,好氧堆肥高温阶段持续时间增长,加快了有机物的降解速度,从而缩短了堆肥周期。     

EM有效微生物群制剂简介

EM是有益微生物菌群的简称。它包括光合菌群、乳酸菌群、酵母菌群、草兰氏阳性放线菌群、发酵系的丝状菌群，核心为光合菌群。在动物或植物体内，这些有益菌多了，生长旺盛，那么就会抑制有害菌的生长。动、植物的病就会减轻，甚至消失了。EM就是利用这种原理来增强动、植物的抗病力，改善品质，提高产量的。现将其主要使用的方法介绍如下：     

高通量测序分析鞣花酸对大鼠肠道菌群的影响

[目的]采用高通量测序技术分析鞣花酸对大鼠肠道菌群组成和多样性的影响。[方法]采集持续灌胃鞣花酸SD大鼠的粪便,运用高通量测序技术对粪便肠道菌群进行分析,通过生物信息学方法分析大鼠肠道菌群的多样性和结构组成。[结果]通过高通量测序发现灌胃鞣花酸使SD大鼠肠道菌群的多样性增加(P<0.05),灌胃期间菌群的组成也发生了明显的波动,在门水平菌群变化中,拟杆菌门丰度增高(P<0.05),变形菌门丰度则降低到较低水平(P<0.01);在属水平菌群变化中,Bacteroidales S24-7 group、Lachnospiraceae NK4A136 group和拟杆菌属所占比例显著升高(P<0.05、0.01)。[结论]鞣花酸对大鼠肠道菌群具有调节作用。