溶血性葡萄球菌来源的细胞外囊泡对小鼠生长性能、免疫力、肠道形态与微生物区系的影响

本试验旨在研究溶血性葡萄球菌来源的细胞外囊泡(SH-EVs)对小鼠生长性能、免疫力、肠道形态与微生物区系的影响。选用体重、日龄接近的20只健康雄性离乳C57BL/6小鼠,采用完全随机试验设计分为2个组,每组10个重复,每个重复1只小鼠。每隔1 d给对照组小鼠灌服150μL磷酸盐缓冲液(PBS),给试验组小鼠灌服150μL SH-EVs悬液(含500μg SH-EVs)。试验期为5 d。结果显示:1)与对照组相比,灌服SH-EVs显著降低了小鼠的平均日采食量和平均日增重(P0.05),并有提高料重比的趋势(P=0.052)。2)与对照组相比,灌服SH-EVs显著提高了小鼠血清肿瘤坏死因子-α(TNF-α)和白细胞介素-10(IL-10)含量(P 0.05),显著降低了血清免疫球蛋白A(IgA)含量(P0.05),有降低血清免疫球蛋白G(IgG)含量的趋势(P=0.067)。3)灌服SH-EVs导致小鼠回肠绒毛损伤,肠绒毛稀疏。4)与对照组相比,灌服SH-EVs在门水平上显著降低了小鼠肠道拟杆菌门(Bacteroidetes)的相对丰度(P 0.05),显著提高了酸杆菌门(Acidobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、变形菌门(Proteobacteria)、浮霉菌门(Planctomycetes)的相对丰度(P0.05);在属水平上显著降低了小鼠肠道普雷沃氏菌科UCG-001(Prevotellaceae_UCG-001)、拟杆菌属(Bacteroides)、拟普雷沃菌属(Alloprevotella)的相对丰度(P0.05);在种水平上显著降低了小鼠肠道产酸拟杆菌(Bacteroides acidifaciens)的相对丰度(P0.05),显著提高了毛螺菌科细菌COE1(Lachnospiraceae_bacterium_COE1)的相对丰度(P0.05)。由此可见,灌服SH-EVs降低了小鼠的生长性能、免疫力,一定程度上损伤了肠道形态发育并扰乱了肠道菌群结构,对小鼠健康产生了不利影响。     

饲粮中添加复合植物精油对58周龄海兰褐壳蛋鸡生产性能、蛋品质和肠道菌群结构的影响

本试验旨在探讨饲粮中添加复合植物精油(八角茴香精油和百里香精油)对58周龄海兰褐壳蛋鸡生产性能、蛋品质和肠道菌群结构的影响。选用产蛋率和体重相近的58周龄海兰褐壳蛋鸡360只,随机分为对照组和试验组2个组,每组6个重复,每个重复30只鸡。对照组饲喂基础饲粮,试验组饲喂基础饲粮+150 mg/kg复合植物精油。试验期49 d。结果表明:1)与对照组相比,试验组蛋鸡的产蛋率显著升高(P0.05),料蛋比和破蛋率显著降低(P0.05),平均日采食量和死淘率无显著差异(P0.05)。2)与对照组相比,试验组蛋鸡的蛋黄色泽、蛋白重量显著升高(P0.05),其他蛋品质指标差异无显著差异(P0.05)。3)与对照组相比,试验组的Shannon指数显著降低(P0.05),Chao1指数、ACE指数和Simpson指数无显著差异(P0.05)。4)在门水平上,2组盲肠菌群主要为厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、梭杆菌门(Fusobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)。与对照组相比,试验组拟杆菌门的相对丰度显著升高(P0.05),厚壁菌门和梭杆菌门的相对丰度显著降低(P0.05)。5)在属水平上,与对照组相比,试验组的拟杆菌属(Bacteroides)和unidentified_Ruminococcaceae的相对丰度显著升高(P0.05),梭形杆菌属(Fusobacterium)、瘤胃球菌科_UCG-005属(Ruminococcaceae_UCG-005)、厌氧球菌属(Anaerotruncus)的相对丰度显著降低(P0.05),瘤胃球菌科_UCG-014属(Ruminococcaceae_UCG-014)和克里斯滕森菌科_R-7族群(Christensenellaceae_R-7_group)的相对丰度有降低趋势(P=0. 060)。由此可见,在本试验条件下,饲粮中添加150 mg/kg复合植物精油能够改善58周龄海兰褐蛋鸡的生产性能,加深蛋黄颜色,提高盲肠拟杆菌门的相对丰度,降低盲肠厚壁菌门和梭杆菌门的相对丰度,改善盲肠肠道菌群结构。     

酶解青蒿联合地衣芽孢杆菌对肉仔鸡生长性能和盲肠菌群的影响

本试验旨在研究酶解青蒿联合地衣芽孢杆菌饲喂肉仔鸡对其生长性能和盲肠菌群的影响。选取1日龄科宝(Cobb)肉仔鸡480只,随机分为4组(每组6个重复,每个重复20只):对照组饲喂基础饲粮,抗生素组、试验Ⅰ组和试验Ⅱ组分别在基础饲粮中添加20 mg/kg抗生素(主要成分为维吉尼霉素)、1 g/kg酶解青蒿以及1 g/kg酶解青蒿+200 mg/kg地衣芽孢杆菌。试验期42 d。结果表明:1)与对照组相比,试验Ⅱ组肉仔鸡平均日增重显著提高(P0.05),抗生素组和试验Ⅰ组平均日增重分别提高5.18%和7.49%(P0.05);试验Ⅱ组肉仔鸡终末体重显著提高(P0.05),抗生素组和试验Ⅰ组分别提高6.94%和6.94%(P0.05)。各组肉仔鸡平均日采食量和料重比差异不显著(P0.05)。2)对肉仔鸡盲肠菌群进行alpha多样性分析发现,抗生素组和各试验组盲肠菌群多样性均有所提高(P0.05)。对4组肉仔鸡盲肠菌群组成进行分析显示,在门水平上,优势菌门主要为厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和软壁菌门(Tenericutes)。与对照组相比,抗生素组和各试验组厚壁菌门相对丰度显著提高(P0.05),试验Ⅰ组和试验Ⅱ组拟杆菌门相对丰度显著降低(P0.05)。在属水平上,与对照组相比,抗生素组和各试验组拟杆菌属相对丰度显著降低(P0.05),试验Ⅰ组和试验Ⅱ组粪杆菌属相对丰度显著提高(P0.05),试验Ⅱ组瘤胃球菌科UCG-014菌属相对丰度显著提高(P0.05)。由此得出,酶解青蒿用于肉仔鸡饲粮具有替代抗生素的潜质。饲粮单独添加酶解青蒿具有改善肉仔鸡生长性能的趋势,酶解青蒿和地衣芽孢杆菌联用可通过改善盲肠菌群结构,提高肠道菌群多样性,以及提高厚壁菌门与拟杆菌门相对丰度的比例来提高肉鸡生长性能。     

饲粮添加凹凸棒石负载植物精油复合物对蛋鸡生产性能和肠道微生物的影响

本试验旨在研究饲粮添加凹凸棒石负载植物精油复合物(EO-PGS)对蛋鸡生产性能和肠道微生物的影响。选取480只65周龄健康的罗曼粉壳蛋鸡,随机分成4组,每组6个重复,每个重复20只。对照组蛋鸡饲喂基础饲粮,试验组蛋鸡分别饲喂在基础饲粮中添加0.50、0.75和1.00 g/kg EO-PGS的试验饲粮。预试期7 d,正试期56 d。结果表明:1)与对照组相比,0.75和1.00 g/kg EO-PGS组的产蛋率显著提高(P0.05)。2)β多样性分析显示,与对照组相比,0.75和1.00 g/kg EO-PGS组盲肠菌群结构分布相对零散,相似度较低。3)在门水平上,与对照组相比,试验组盲肠软壁菌门相对丰度有提高的趋势(P=0.071),0.50和0.75 g/kg EO-PGS组盲肠迷踪菌门相对丰度显著提高(P0.05)。在属水平上,与对照组相比,0.50和0.75 g/kg EO-PGS组盲肠Elusimicrobium相对丰度显著提高(P0.05),0.50 g/kg EO-PGS组盲肠优杆菌属相对丰度显著提高(P0.05)。4)与对照组相比,试验组盲肠双歧杆菌相对丰度显著提高(P0.05),盲肠沙门氏菌相对丰度显著降低(P0.05);0.50和1.00 g/kg EO-PGS组盲肠大肠杆菌相对丰度显著降低(P0.05);0.50 g/kg EO-PGS组十二指肠和盲肠乳酸杆菌相对丰度显著提高(P 0.05)。由此可见,饲粮添加0.50和1.00 g/kg EO-PGS能够改善蛋鸡生产性能,在一定程度上提高微生物多样性,优化肠道菌群结构。     

日粮纤维对竹鼠生长及肠道菌群组成的影响

试验旨在研究日粮中纤维对竹鼠生长及肠道菌群组成的影响。选取健康状态良好、体重相近的6只竹鼠,随机分为2组,每组3只。试验组添加含0%竹茎,对照组投喂40%竹茎,试验期为45 d。结果显示,与对照组相比,在门水平上,试验组竹鼠肠道蓝藻菌门(Cyanobacteria)丰度极显著降低(P0.01),而互养菌门(Synergistetes)丰度极显著升高(P0.01);在属水平上,试验组的norank_f_Muribaculaceae丰度极显著低于对照组(P0.01),而Cloacibacillus极显著高于对照组(P0.01),优势菌属发生明显的改变。研究表明,日粮中缺乏竹茎成分使竹鼠肠道菌群多样性降低,破坏竹鼠肠道菌群的平衡,影响营养物质的吸收。     

补喂鞣花酸对哺乳中后期纯血马马驹粪便菌群多样性的影响

【目的】试验旨在研究补喂不同水平的鞣花酸对马驹粪便细菌多样性的影响,通过探究粪便菌群的变化,以期为哺乳马驹胃肠道菌群多样性和肠道健康等提供参考依据。【方法】选择出生日期相近、体重为(143.33±16.10)kg的3月龄纯血马马驹15匹,随机分为3组,每组5匹,分别为对照组、试验Ⅰ组、试验Ⅱ组。在相同的饲养条件下,对照组马驹不做任何处理,试验Ⅰ和Ⅱ组马驹每天分别补喂15和30 mg/kg BW鞣花酸,进行为期60 d的饲养试验。试验第60天晨饲前于直肠采集马驹粪便样品,测定粪便菌群多样性。【结果】OTUs结果显示,试验各组共有OTUs 789个,试验Ⅰ组特有的OTUs为182个;各试验组与对照组之间Alpha多样性差异不显著(P>0.05),但试验Ⅰ组Shannon、Chao1及ACE指数有提高的趋势;菌群丰度结果表明,各试验组与对照组前十的优势菌种类相同,以厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门和疣微菌门为主,且丰度占总数92.94%以上,各组之间门、科和属水平菌群丰度差异均不显著(P>0.05);LefSe分析结果表明,试验Ⅰ组有差异菌9种,试验Ⅱ组有2种;预测前十的功能有全局与...     

菌群移植对三穗鸭生长性能、屠宰性能和肠道菌群的影响

试验旨在探究菌群移植早期干预对三穗鸭的生长性能、屠宰性能和肠道菌群的影响。选择120只1日龄的健康三穗鸭，随机分为2组，每组6个重复，每个重复10只鸭，菌群供体选择42日龄的三穗鸭。试验前3 d，对照组鸭饲喂基础日粮，移植组鸭饲喂基础日粮，灌喂0.5 mL菌群液，试验期42 d。结果显示，15～42 d时，移植组鸭的成活率显著高于对照组（P<0.05）；料重比显著低于对照组（P<0.05）。移植组鸭的屠宰率、全净膛率、半净膛率、腿肌率和胸肌率较对照组有所提高，但差异不显著（P>0.05）。在盲肠菌群门水平丰度方面，移植组鸭的拟杆菌门、变形菌门丰度较对照组分别降低了8.7%(P>0.05)、24.4%(P>0.05)，厚壁菌门、梭杆菌门、放线菌门较对照组提高了11.2%(P>0.05)、26.1%(P>0.05)、55.5%(P<0.05)。研究表明，菌群移植能够提高三穗鸭的生长性能及改变盲肠菌群的丰度水平。     

壳聚糖螯合锌对大肠杆菌攻毒断奶大鼠回肠菌群结构及代谢产物的影响

本试验旨在研究日粮中添加壳聚糖螯合锌(chitosan-chelated zinc, CS-Zn)对大肠杆菌攻毒断奶大鼠回肠微生物及代谢产物的影响。试验选用24只断奶SD大鼠,随机分为对照组和试验组,对照组饲喂基础日粮,试验组饲喂基础日粮+640 mg/kg壳聚糖螯合锌(含锌50 mg/kg)。试验期为14 d,试验第10～12 d,所有大鼠每天灌胃总菌数为10~(10) CFU/只的大肠杆菌菌液,连续灌胃3 d。试验结束采集回肠食糜进行16S rRNA高通量测序分析结果显示,与对照组相比,试验组大鼠回肠微生物α多样性Shannon和Simposon指数显著降低(P0.05);厚壁菌门相对丰度显著增加(P0.05),拟杆菌门、变形菌门、放线菌门和疣微菌门的丰度显著降低(P0.05);Romboutsia属和苏黎世杆菌属(Turicibacter)丰度显著增加(P0.05),脱硫弧菌属(Desulfovibrio)和狭义梭菌属(Clostridium sensu stricto)丰度显著降低(P0.05);同时,试验组丙酸、丁酸和乳酸的浓度显著上升(P0.05)。研究表明,壳聚糖螯合锌主要通过上调有益菌的丰度,下调促炎菌脱硫弧菌属的丰度来调节肠道菌群结构,进而促进微生物代谢产物短链脂肪酸和乳酸的生成。     

复合中草药添加剂对芦花雏鸡生产性能、肠道菌群及脾脏IL-2 mRNA表达量的影响

试验旨在探究复合中草药添加剂对芦花雏鸡生产性能、肠道菌群及免疫功能的影响。选取1日龄健康、体重相近的芦花鸡600只(公母各半),随机分为2组,每组4个重复。对照组饲喂基础日粮,试验组在基础日粮中添加0.3%复合中草药添加剂,预饲期7 d,试验期为35 d。结果表明:(1)试验组平均日增重比对照组显著提高,料重比显著降低(P<0.05);(2)试验组血清IgA和IgM水平极显著升高(P<0.01),IL-2水平无显著变化(P>0.05);(3)试验组14、28、42 d脾脏指数和胸腺指数均提高(P>0.05);(4)试验组变形菌门丰度显著低于对照组(P<0.05),厚壁菌门、拟杆菌门和软壁菌门丰度均提高(P>0.05);试验组拟杆菌属和别样杆菌属丰度提高,Butyricimonas属和螺旋杆菌属丰度降低(P>0.05);(5)脾脏IL-2 mRNA表达量无显著变化(P>0.05)。综上可见,该复合中草药添加剂不仅促进了芦花雏鸡免疫器官发育,改善了肠道菌群组成,增强机体免疫功能,且提高了生产性能。     

复合酶制剂对新疆伊犁鹅产蛋性能和盲肠微生物菌群的影响

试验旨在研究饲粮中添加复合酶制剂对伊犁鹅产蛋性能和盲肠微生物菌群的影响。选取健康状况良好、体重相近的4岁伊犁鹅200只,随机分为4组,每组10个重复,每个重复5只伊犁鹅。对照组和试验Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ组分别添加0、0.2、0.3 g/kg和0.4 g/kg的复合酶制剂。预试期7 d,正试期35 d。随机选取对照组和试验Ⅱ组(产蛋性能最佳组)伊犁鹅各8只采集盲肠内容物,提取其DNA,用特异性引物扩增细菌16S rRNA基因V3～V4区,使用基于NovaSeq测序平台对细菌16S rRNA基因进行测序分析。结果表明:(1)在试验的第4周,试验Ⅱ组的产蛋率极显著或显著高于对照组(P0.01)、试验Ⅰ组(P0.05)及试验Ⅲ组(P0.05),试验Ⅱ组的料蛋比显著低于对照组(P0.05);综合全期,试验Ⅱ组的产蛋率较对照组显著提高(P0.05),料蛋比显著降低(P0.05)。(2)与对照组相比,试验Ⅱ组的盲肠微生物在门水平上,拟杆菌门相对丰度极显著升高(P0.01),梭杆菌门相对丰度极显著降低(P0.01);在属水平上,拟杆菌属相对丰度极显著升高(P0.01),脱硫弧菌属相对丰度显著增加(P0.05),梭杆菌属相对丰度极显著降低(P0.01)。综上所述,在饲粮中添加0.3 g/kg复合酶制剂可显著提高伊犁鹅产蛋率,显著降低料蛋比,显著或极显著增加盲肠有益菌(拟杆菌门、拟杆菌属、脱硫弧菌属)的相对丰度,极显著减少有害菌(梭杆菌门、梭杆菌属)的相对丰度,利于提高伊犁鹅肠道的消化吸收功能和预防肠道疾病,从而提高伊犁鹅的产蛋性能。     

复合益生菌对早期断奶仔猪肠道抗炎作用及菌群结构的影响

益生菌在临床上防治动物腹泻有显著效果,为探讨其作用机制,将早期断奶仔猪分为2组,每组10头,对照组饲喂基础日粮,试验组在基础日粮中添加1‰复合益生菌,试验期60 d,期间观察各实验动物腹泻情况并记录腹泻指数,试验结束时每组随机选4头取盲肠食糜及结肠组织,利用Illumina MiSeq高通量测序分析盲肠内容物微生物结构,并用荧光定量PCR方法检测结肠组织TLR/MyD88/NF-κB信号通路相关基因转录水平。结果显示,试验组肠道菌群丰度与对照组比较有很大变化:在门水平上,试验组拟杆菌门(Bacteroidetes)平均丰度显著降低了7.05%(P0.05),变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)平均丰度提高了4.28%,1.73%,1.50%;在属水平上,试验组乳杆菌属(Lactobacillus)的平均丰度显著降低了18.85%(P0.05),而瘤胃球菌属(Ruminococcaceae)的平均丰度显著提高了8.79%(P0.05),肠杆菌属(Enterobacteriaceae)、梭菌属(Clostridiales)、毛螺菌科(Lachnospiraceae)、链球菌属(Streptococcus)的平均丰度也分别上升了4.02%,3.94%,3.39%,3.01%。同时,试验组IL-10的表达量显著高于对照组(P0.05),而MyD88、TLR4、NF-κB、IL-6、IL-8、TNF-α表达量均显著低于对照组(P0.05)。试验组腹泻指数较对照组均有所下降,其中试验15,45 d差异显著(P0.05)。可见复合益生菌增加了肠道微生物的丰度及有益菌的含量,并通过下调TLR/MyD88/NF-κB信号通路的转录抑制肠道炎症的发生,可有效防治动物腹泻。     

凝结芽孢杆菌对产蛋后期蛋鸡生产性能、肠道免疫因子及肠道菌群的影响

试验旨在研究产蛋后期蛋鸡饲粮中添加凝结芽孢杆菌对其生产性能、肠道免疫因子和肠道菌群的影响。选取840只63周龄海兰褐蛋鸡,分为2组,每组10个重复,每个重复42只。对照组饲喂基础饲粮,试验组在基础饲粮中添加0.05%凝结芽孢杆菌粉,试验期45 d。结果表明：与对照组相比,试验组料蛋比、破蛋率均有所降低,但差异不显著;试验组蛋鸡的蛋形指数及蛋壳厚度均无显著差异;试验组IFN-γ、IL-8和TNF-α基因表达量显著降低;门水平上,对照组拟杆菌门丰度高于试验组(P<0.05),厚壁菌门丰度低于试验组(P<0.05);属水平上,试验组拟杆菌属丰度低于对照组(P<0.05),栖粪杆菌属丰度高于试验组(P<0.05);普雷沃氏菌、脱硫弧菌属、另枝菌属指标均无显著差异。本试验条件下,饲粮中添加0.05%凝结芽孢杆菌对产蛋后期蛋鸡的生产性能改善作用不显著,但可以通过降低促炎因子的表达来改善机体炎症反应,同时降低致病菌的相对丰度,调节肠道菌群平衡。     

免疫增强剂党参对仿刺参肠道菌群结构的影响

采用平板计数法和聚合酶链式反应( PCR)-变性梯度凝胶电泳( DGGE)技术分析免疫增强剂党参对仿刺参( Apostichopus japonicas)肠道菌群结构的影响。将初始体重为(18.00±2.00) g的仿刺参随机分为2组(对照组、试验组),每组6个重复,每个重复12只。对照组投喂海泥、鼠尾藻粉按照1∶1的质量比配制的饵料,试验组饵料中以鼠尾藻粉质量的2%添加党参,连续投喂28 d。结果表明：应用免疫增强剂党参不仅能够显著提高仿刺参的特定生长率( P<0.05),降低其饵料系数(P<0.05),而且能够显著增加仿刺参肠道内容物中异养菌的数量(P<0.05);序列统计分析显示投喂党参后仿刺参肠道细菌优质序列比例显著增加( P<0.05),试验组达97.57%,对照组仅为80.22%;Beta多样性分析反映投喂党参后仿刺参肠道微生态环境发生了变化,其多样性系数范围在14.91%~15.47%、15.47%~16.21%、14.91%~16.21%;丰度分析显示投喂党参后仿刺参肠道内容物中变形菌门( Proteobacteria)和拟杆菌门( Bacteroidetes)丰度提高,疣微菌门( Verrucomicrobia)、放线菌门( Actinobacteria)和厚壁菌门( Firmiaites)丰度降低;聚类分析显示试验组与对照组肠道菌群结构相似性系数为0.97。由此可见,免疫增强剂党参可提高仿刺参的特定生长率,降低饵料系数,增加肠道异养菌数量和优势菌群丰度,优化肠道微生态环境。     

中草药泰山磐石散加减方对小鼠肠道微生物菌群的影响

为了解中草药泰山磐石散加减方对小鼠肠道微生物菌群的影响,本试验选取45只SPF级昆明小鼠,分为对照A组、试验B组和试验C组。试验B组和C组小鼠分别用0.86 g/mL的中草药泰山磐石散方灌胃0.3和0.4 mL,对照A组灌胃蒸馏水0.4 mL,每天灌胃2次,间隔8 h,连续7 d。第8天采集对照组和试验组小鼠直肠部位粪便样品,从每份样品中提取微生物基因组总DNA,采用Illumina HiSeq测序技术检测样品微生物群落多样性。结果显示,中草药泰山磐石散对小鼠粪便中微生物α多样性指数(Chao1和Shannon)呈波动性变化,试验B和C组与对照A组的Chao1指数差异极显著(P0.01);通过检测小鼠对照组与试验组粪便中的微生物,在门水平上,有9大优势菌门,其中与对照A组相比,试验组肠道微生物Proteobacteria、Verrucomicrobia丰度显著降低(P0.05);而Saccharibacteria、Tenericutes丰度显著或极显著增加(P0.05;P0.01);在科水平上,有19大优势菌科,其中与对照组相比,试验组肠道微生物Lactobacillaceae、Desulfovibrionaceae、Coriobacteriaceae、Porphyromonadaceae、Family_XIII和Bifidobacteriaceae丰度显著降低(P0.05);在属水平上,有18大优势菌属,其中与对照A组相比,试验B、C组肠道微生物Lactobacillus、Desulfovibrio和Enterorhabdus丰度显著降低(P0.05),而试验C组的肠道微生物Alloprevotella、Bacteroides、Lachnospiraceae_UCG-006和Faecalibaculum丰度显著增加(P0.05)。本试验中草药泰山磐石散加减方能够有选择性的促进小鼠肠道内Bacteroidetes的生长,从而抑制Proteobacteria有害菌的生长,增强糖和脂肪代谢,最终通过改善肠道微生物多样性的结构,使整个肠道微生物多样性达到一个新的平衡。     

应用Illumina-MiSeq高通量测序技术分析脱氧雪腐镰刀菌烯醇对小鼠肠道菌群的影响

本试验旨在研究脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)对小鼠肠道微生物多样性、物种丰度的影响。选用平均体重为20 g的BALB/c小鼠40只,随机分成对照组(灌胃灭菌生理盐水)和DON组(灌胃1.8 mg/kg BW DON),每组20个重复,每个重复1只小鼠,连续灌服28 d。试验结束后,收集新鲜粪便,每组随机选取3份,用Illumina-Mi Seq高通量测序技术分析微生物群落结构和组成的变化。结果表明,1)与对照组相比,DON组测序数量减少(P0.05)。2)DON组降低了Alpha、Beta多样性,Shannon指数较对照组显著降低(P0.05)。3)在门水平,与对照组相比,DON组显著降低了拟杆菌门(Bacteroidetes)和脱铁杆菌门(Deferribacteres)的物种丰度(P0.05),显著提高了变形菌门(Proteobacteria)的物种丰度(P0.05)。在属水平,与对照组相比,DON组显著降低了副类杆菌属(Parabacteroides)、理研菌属(Rikenella)、Algoriphagus、Mucispirillum、嗜甲基菌属(Methylophilus)、Francisella的物种丰度(P0.05),显著提高了梭菌属(Clostridium)、Robinsoniella、A llobaculum、A kkermansia的物种丰度(P0.05)。4)聚类分析显示,DON组与对照组的肠道微生物相似性降低。由此可见,DON能显著影响小鼠肠道微生物菌群多样性及物种丰度,提示DON致肠道损伤与这些肠道菌群的变化密切相关。     

基于16S rDNA测序分析柔嫩艾美耳球虫感染对鸡盲肠菌群的影响

为探究柔嫩艾美耳球虫感染对鸡盲肠菌群的影响,采集对照组和球虫感染组雏鸡盲肠内容物,提取DNA,16S rDNA测序分析鸡盲肠菌群丰度、多样性的变化,采用粪菌移植验证正常鸡肠道菌群对柔嫩艾美耳球虫感染的保护作用。16S rDNA测序结果显示,柔嫩艾美耳球虫感染后盲肠内菌群丰度、多样性显著降低。在门水平上,感染前,两组雏鸡盲肠的优势菌门均为厚壁菌、变形菌、放线菌;感染后厚壁菌门丰度下降,变形菌门、放线菌门的丰度上升,差异显著(P<0.05),感染组出现了拟杆菌门。在属水平上,与对照组相比,感染组鸡盲肠微生物菌群中乳杆菌属、埃希菌-志贺菌属、拟杆菌属、罗姆布茨菌属、棒状杆菌属、肠球菌属、变形杆菌属丰度增加但差异不显著(P>0.05),毛螺菌科未定属、瘤胃球菌属、梭菌UCG-014、瘤胃球菌科未定属丰度显著下降(P<0.05),GCA-900066575丰度降低但差异不显著(P>0.05)。粪菌移植结果显示,与生理盐水移植组相比,盲肠内容物移植组和粪便菌移植组能显著减轻柔嫩艾美耳球虫感染后鸡增重降低的影响,减轻盲肠损伤,卵囊产量显著下降(P<0.05)。盲肠内容物...     

饲粮中添加苹果渣对伊拉肉兔盲肠微生物多样性的影响

为研究饲粮中添加苹果渣对伊拉肉兔盲肠微生物多样性的影响,选取32日龄断奶肉兔100只,按照体重和性别,随机分为5组,每组20只兔。各组分别饲喂含0、6%、12%、18%和24%苹果渣的饲粮。试验期为30 d。饲养试验结束后,采用高通量测序技术对盲肠微生物多样性进行分析。结果表明:与对照组相比,添加苹果渣对门、科水平上菌群相对丰度影响不显著(P0.05);在属水平上,与对照组相比,试验Ⅱ组、Ⅳ组UCG-010属的比例极显著增加(P0.01);厚壁菌门一种未定义菌属的比例显著高于对照组及其他试验组(P0.05),添加苹果渣对其他菌属相对丰度没有显著影响(P0.05)。由此可见,饲粮中添加苹果渣可以改变生长肉兔盲肠微生物的丰度和多样性。     

应用Illumina MiSeq高通量测序技术分析饲粮添加丁酸钠对蛋雏鸡盲肠微生物的影响

为研究饲粮中添加丁酸钠对蛋雏鸡盲肠微生物的影响,选取1日龄健康、体重相近的罗曼褐蛋公雏120只,随机分成2个处理组,每组6个重复,每个重复10只鸡。对照组饲喂基础饲粮,试验组饲喂添加0.1%丁酸钠的饲粮,试验期42 d。试验结束后,每处理组随机选取6只鸡,测定其生长性能,再从中选出体重相近且状态良好的3只作为测序样本,收集盲肠食糜样,并应用Illumina MiSeq高通量测序技术分析盲肠微生物。结果表明:(1)丁酸钠组雏鸡体重、平均日增重(ADG)、料肉比等指标均优于对照组,丁酸钠组平均日采食量(ADFI)较对照组显著降低1.52%(P 0.05);(2)两组间优势菌门均为拟杆菌门、厚壁菌门和变形菌门。丁酸钠组变形菌门含量较对照组极显著降低44.8%(P 0.01);(3)与对照组相比,丁酸钠组拟杆菌属、梭菌XⅣa类群、梭菌XⅧa类群等含量显著提高(P 0.05);丁酸钠组乳酸杆菌属含量显著提高38.6%(P 0.05),埃希氏菌属/志贺氏菌属含量极显著降低71.4%(P 0.01);(4)丁酸钠组盲肠菌群丰度,Shannon和Simpson指数显著提高(P 0.05)。综上说明,饲粮中添加丁酸钠有利于促进雏鸡生长,且能平衡肠道菌群,提高菌群丰度和多样性,使微生物种类更多,均匀性更好。     

枸芪多糖对育肥猪肠道菌群多样性及组成的影响北大核心CSCD

本试验旨在研究枸芪多糖对育肥猪肠道菌群多样性及组成的影响。选用180头80日龄的健康育肥猪,随机分为2组,每组6个重复,每个重复15头猪。对照组饲喂基础饲粮,试验组在基础饲粮中添加1‰的枸芪多糖,试验期为3个月。采集育肥猪盲肠内容物,提取样本中细菌基因组DNA,进行16S rDNA基因高通量测序。结果显示:1)试验组肠道菌群的Ace指数、Chao指数和Shannon指数均显著高于对照组(P<0.05)。2)在门水平上2组的两大优势菌均为拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes),对照组梭杆菌门(Fusobacteria)及梭杆菌属(Fusobacterium)的相对丰度显著高于试验组(P<0.05),互养菌门(Synergistetes)及互养菌属(Synergistes)的相对丰度显著低于试验组(P<0.05)。3) 2组在属水平上的优势菌均为拟杆菌属(Bacteroides),试验组巨单胞菌属(Megamonas)和螺杆菌属(Helicobacter)的相对丰度显著低于对照组(P<0.05)。由此得出,饲粮中添加枸芪多糖可提高育肥猪肠道菌群的丰富度和多样性,通过促进有益菌厚壁菌门、互养菌门与抑制有害菌变形菌门、梭杆菌属和螺杆菌属的增殖优化肠道菌群平衡,建立更健康的肠道菌群结构。     

复方中草药添加剂对AA+肉鸡生产性能及肠道菌群结构的影响

为了探究复方中草药添加剂对AA⁺肉鸡生产性能、血清免疫指标及肠道菌群结构的影响,试验选取1日龄健康AA⁺肉鸡1 600只(公母各半),随机分为2组,每组4个重复。对照组饲喂基础日粮,试验组在基础日粮中添加0.3%复方中草药添加剂,预试期为7 d,正试期为35 d,测定各组试验鸡7日龄体重与42日龄体重,42日龄测血清免疫球蛋白(IgA、IgG、IgM)、γ干扰素(IFN-γ)和白细胞介素2(IL-2)含量及肠道菌群丰度。结果表明：与对照组比较,试验组平均日增重无显著差异(P>0.05);料肉比显著降低(P<0.05);试验组血清免疫球蛋白IgA、IgG、IgM及IFN-γ和IL-2水平均极显著升高(P<0.01)。试验组厚壁菌门相对丰度降低(P>0.05),拟杆菌门、变形杆菌门和Epsilonbacteraeota相对丰度均提高(P>0.05);试验组粪杆菌属相对丰度极显著升高(P<0.01),拟杆菌属相对丰度无显著变化(P>0.05),丁酸梭菌属相对丰度显著降低(P<0.05),瘤胃球菌属、毛...