萧山鸡的OPAY02型标记初步研究

本文以OPAY0 2作为引物 ,在萧山鸡中探索到 16 6 0 .8bp和 2 32 6 .0bp的两条带的 4个组合 ,即A ,B ,C ,D型 ,它们的频率大小依次为A >C >B >D。带型对 4 9日龄体重有显著效应 ,依 4 9～ 75日龄两阶段的体重 ,其效应由大到小依次为A >C >B ,D因频率极低 ,这种效应不同于新扬州鸡 ,初步表明在不同遗传群体中效应不一样     

OPAY02-C型标记与新扬州鸡早期增重关系的研究

随机选择新扬州鸡5个父系半同胞家系后代78只,用于分析RAPD标记与新扬州鸡早期增重的关系。RAPD标记是在21个随机引物中,经反复试验选出的稳定的,具有多态性的3个引物OPAY02,OPAY13,OPAY17扩增产物,统计分析表明:OPAY02引物扩增的1660bp和2326bp两条多态性条带的4种组合中,OPAY02-C型标记具有显著的增效作用(P<0.015),可作为标记进行辅助选择。     

新扬州鸡早期增重的OPAY02-SCAR分子标记研究

OPAY02型2条多态性条带经克隆、测序和引物设计后,转换成SCAR标记,并对86个新扬州鸡随机交配后代基因组DNA进行了PCR扩增.2条带DNA序列与红色原鸡基因组序列比对结果表明,大分子量条带与位于红色原鸡第3号染色体上序列有98%的同源性,共检测到8个SNPS,其中195位的碱基T→G,316位的A→T,538位的G→A,731位的T→A,1 147位的G→A,1 329位的T→C,1 927位的C→T,2 081位的C→T,小分子量条带与红色原鸡没有同源序列,推测新扬州鸡野祖除红色原鸡外,还有其它来源.SCAR标记分析表明,经条件优化随机扩增的OPAY02型标记稳定、可靠,可用于遗传分析.2条带所在座位群体基因型平衡性测验结果表明,所测新扬州鸡群体处于平衡状态,选择可以打破平衡,有利于动物育种.     

EAV/DNA指纹图谱条带J与OPAY02型标记对新扬州鸡体质量和生长影响的联合研究

随机选择新扬州鸡大型系和小型系交后代48只，联合研究EAV／DNA指纹图谱带J与OPAY02型2种分子遗传标记与新扬州鸡体质量和生长的关系，结果表明，8、10、26周龄新扬州鸡体质量在2种分子标记的不同组合间比较均存在极显著的差异，尤其是J^-S1^-S2^＋产条带组合遗传标记，8、10、26周龄新扬州鸡体质量均显著或极显著地高于其他JS1S2组合，根据数量性状多基因假说，可以推测J、S1和S2可能是影响鸡增重的多基因，2种分子遗传标记组合J^-S1^-S2^＋遗传标记有望成为鸡体质量选择的遗传标记。     

两个SCAR标记与京海Ⅰ号黄鸡体重的相关性研究

通过对两个RAPD条带(1660条带和2326条带)的克隆、测序,根据条带序列设计两对SCAR引物,对京海Ⅰ号黄鸡基因组进行扩增。结果表明:S1(1660条带)与S2(2326条带)标记在京海Ⅰ号黄鸡中出现的频率分别为40%和48%。无S1标记个体12周龄、18周龄和43周龄体重显著高于有S1标记个体,有S2标记个体在4周龄、12周龄、18周龄和43周龄体重显著高于无S2标记个体。     

滩羊公羊特异性RAPD标记的研究

利用混合样本分析方法对滩羊进行了RAPD分析 ,筛选了 6 0种随机引物 ,结果发现OPB17 32 0这一扩增片段只出现在公羊的混合样中 ,进一步对 5 0只滩羊进行逐个检测 ,发现 2 1只公羊均出现了OPB17 32 0这一DNA片段 ,而 2 9只母羊无一出现此条片段 ,据此推断OPB17 32 0为滩羊公羊的特异性RAPD标记。这一发现为滩羊胚胎性别鉴定和Y染色体上基因的研究提供了新的方法和标记参考座位。     

鹌鹑高低应激品系系的RAPD标记研究

本研究对美国路易斯安那州立大学家禽系选育的高应激和代应激两个品系鹌鹑进行ＲＡＰＤ分析,评定其遗传多态性。采用两个Ｋｉｔ共４０个引物,至少能得到１个多态性片段的引物有３５个。扩增片段大小范围为２００－２６００ｂｐ。９个引物测得高低应激系中共享条带为１０－１３。     

2种高产燕麦品种DNA分子的RAPD标记分析

为了快捷有效的鉴别2种高产燕麦Avena sativa品种:青永久001(5号)和青永久473号(6号),用40条RAPD引物对2个燕麦品种DNA分子进行了扩增.结果显示,大部分引物不能同时在2个品种间扩增出带,部分引物虽然能在2个品种间都能扩增出带,但扩增带的数目及电泳迁移率不相同.提示青永久001和青永久473亲缘关系较远,应用RAPD可以有效区分和鉴别.     

滩羊体大品系遗传标记的研究

本研究首先采用RAPD(Romdom Amplified Polymorphic DNA)技术,利用混合基因池(DNApool)法,对滩羊体大品系、普通品系进行DNA多态性分析.从100种具有10碱基的随机引物中筛选出84种引物可在滩羊群体基因组中得到扩增,共扩增出358条带,其中22种引物扩增产物表现为多态(占22%),且扩增出32条有差异的条带,占总带数的8,94%(32/358);62种引物的扩增产物表现为单态(占62%);另有16种引物扩增非常微弱,不便分析(占16%).根据Nei氏片段共享度公式计算出滩羊的体大品系和普通品系间的遗传距离为0.14±0.25,表明两品系之间的亲缘关系很近.同时在分析过程中发现滩羊体大品系,普通品系均出现了具有品系特征的特异性条带.滩羊普通品系有7条PS-107-550,PS-510-500,PS-512-450,PS-101-450,PS-512-400,PS-511-400,PS-12-370;体大品系有5条PS-509-875,PS-515-875,PS-106-750,PS-1008-700,PS-1010-370;以上引物可作为区分两品系的标记引物,特征性条带可以作为各自的分子标记来进行品系鉴定.     

中国苜蓿地方品种亲缘关系的研究：Ⅱ RAPD标记

利用ＲＡＰＤ分子标记技术对我国１８个苜蓿地方品种和北美９个苜蓿基本种质来源的代表品种进行了分析,根据分析结果计算了品种间的欧氏遗传距离,并进行聚类分析,结果表明;我国１８个苜蓿地方品种间的平均遗传距离为１．５６,以１．５的遗传距离进行划分可将我国１８个苜蓿地方品种分为７组,品种间的亲缘关系与地理分布有一定的相关性。     

滩羊多羔性能的RAPD标记研究

用RAPD技术和混合分离分析 (BSA)方法对双羔家系的 2 6只滩羊和对照系的 2 5只单羔滩羊进行了RAPD检测。发现 :OPB1 7-530、OPB1 9-92 6和OPB2 0 -1 4 2 6三条DNA片段仅出现在多羔家系的母本及多羔母本与单羔父本杂交产生的部分后代中 ,而在对单羔羊的逐个检测中未出现这三条片段。据此可以推断三个DNA分子标记与多羔性能主基因可能相关。作者系统优化组合出了能使滩羊基因组DNA稳定扩增的RAPD体系     

RAPD标记与四川黑山羊表型性状的相关性研究

利用16个多态性较强、重复性好的随机引物对四川黑山羊多个种群的成年（1.5～2岁）黑山羊96只个体的血样DNA进行扩增,16个引物共扩增出170条多态的RAPD条带.对给定的标记,将“有带（1）”、“无带（0）”两类个体看作独立样本,采用SPSS软件的Compare Means中的Independent-samples T Test来比较两样本各数量性状平均值的差异.并根据两独立样本间个体表型值的分布筛选与性状真实关联的分子标记.结果表明,在黑山羊群体中共筛选到5个分子标记分别与不同性状相关,其遗传基础可能是该标记与控制性状的QTL或主基因连锁.     

荷斯坦奶牛抗热应激SCAR标记的研究与应用

为能利用抗热应激SCAR标记应用于奶牛抗热应激新品种的选育,随机选取52头高产耐热荷斯坦奶牛和41头高产不耐热荷斯坦奶牛,利用RAPD技术对筛选出的耐热分子标记进行序列分析和SCAR转化,并以S441 SCAR标记对种公牛和核心群的母牛进行检测和分析。结果表明,随机引物S441和S463在高产耐热组中分别扩增了581 bp和680 bp的特异性片段,序列比较显示,前者与KCNN2基因的同源性达90%,后者与NW_001024067.1|BtUn_WGA9442_2同源性达99%;S441 SCAR标记在种牛的检出率为:母牛12.7%[27/213],公牛32.6%[15/46];数据统计分析表明:有无S441 SCAR标记的母牛产奶量差异不显著(P>0.05),但在热应激条件下产奶量下降率差异极显著(P<0.01)。研究初步确定S441标记作为荷斯坦奶牛抗热应激分子标记。     

宁夏滩羊体大品系遗传标记的研究

研究首先采用RAPD技术,利用混合基因池(DNA pool)法,对滩羊体大品系、普通品系进行DNA多态性分析。从100种具有10个碱基的随机引物中,筛选出84种引物在滩羊群体基因组中共扩增出358条带,其中22种引物扩增产物表现为多态(占22%),且扩增出32条有差异的条带,占总带数的8．94%(32/358);62种引物的扩增产物表现为单态(占62%)。滩羊体大品系的特异性条带5个,而普通品系的特异性条带7个。这些特异标记可以用来鉴定滩羊的2个品系。滩羊体大品系和普通品系间的遗传距离为0．136±0．087,表明2个品系之间的亲缘关系很近。     

荷斯坦奶牛抗热应激SCAR标记的研究与应用

为能利用抗热应激SCAR标记应用于奶牛抗热应激新品种的选育,随机选取52头高产耐热荷斯坦奶牛和41头高产不耐热荷斯坦奶牛,利用RAPD技术对筛选出的耐热分子标记进行序列分析和SCAR转化,并以S441 SCAR标记对种公牛和核心群的母牛进行检测和分析.结果表明,随机引物S441和S463在高产耐热组中分别扩增了581 bp和680 bp的特异性片段,序列比较显示,前者与KCNN2基因的同源性达90%,后者与NW-001024067.1|BtUn-WGA9442_2同源性达99%;S441 SCAR标记在种牛的检出率为:母牛12.7%[27/213],公牛32.6%[15/46];数据统计分析表明:有无S441 SCAR标记的母牛产奶量差异不显著(P>0.05),但在热应激条件下产奶量下降率差异极显著(P<0.01).研究初步确定S441标记作为荷斯坦奶牛抗热应激分子标记.     

4个牦牛品种的RAPD遗传多样性研究

研究采用RAPD分子标记技术对麦洼、九龙、大通和天祝白牦牛等4个牦牛品种共124头牦牛进行了遗传多样性分析.结果表明:①每个RAPD引物扩增的DNA片段数在18～33个,且所有品种均表现多态,标记多态频率平均为38.63%,检测片断大小在0.25～5 kb之间;②用Shannon多样性指数公式计算牦牛品种的遗传多样性指数(H0),结果显示九龙、麦洼、大通、天祝白牦牛的遗传多样性指数分别为0.311、0.262、0.252和0.216;③采用Rogers遗传距离公式分析4个牦牛品种间的遗传距离(DR)结果:天祝白牦牛与九龙牦牛遗传距离最大(0.0414),与大通牦牛的距离最小(0.0383);④根据DR值,将4个牦牛品种聚为两大类,九龙牦牛聚为一类,其它3个牦牛品种聚为一类.大通牦牛和天祝白牦牛在较近的水平上首先聚为一类,然后与麦洼牦牛聚为一大类.     

荷斯坦牛抗热应激分子标记S463的检测

本试验以S463为奶牛假定抗热应激的RAPD分子标记,在核心母牛场湖南省奶牛原种场测定不同世代的种母牛213头,在核心公牛场湖南省种公牛站,以及北京、上海、南京、安徽等地测定种公牛46头,共检测出具有S463分子标记的母牛26头,检出率为12.2%(26/213),公牛10头,检出率为21.7%(10/46).在湖南省奶牛原种场,有、无抗热应激分子标记的母牛在热应激期间的产奶量分别为1 724.53kg和1 531.62kg,产奶量下降率分别为3.47%和23.18%,产奶量差异不显著(P>0.05),但产奶量下降率差异显著(P<0.05),基本肯定了抗热应激分子标记在不同耐热牛群中的特异性.