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1.
利用RAPD技术对蜜桃种质资源的分析 总被引:2,自引:2,他引:2
程中平 《南京农业大学学报》2003,26(1):10-13
利用RAPD技术,采用从200个10碱基随机引物筛选的22个引物对14个蜜桃品种的基因组DNA进行扩增,通过扩增180个位点的谱带的聚类,分析供试蜜桃的系统发育,将供试的蜜桃品种分为3组;并运用特殊谱带,建立了蜜桃的分子检索表,提出了特殊保存的蜜桃种质有秋蜜,太原水蜜,深州红蜜和温州水蜜。 相似文献
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大字杜鹃种质资源遗传多样性与亲缘关系的RAPD分析 总被引:1,自引:0,他引:1
采用RAPD分子标记技术对6份大字杜鹃种质进行遗传多样性与亲缘关系分析。结果表明,160个RAPD引物筛选出7个多态性引物,进行PCR扩增,共获得176条稳定条带,其中多态性条带为153条(占86.93%),大字杜鹃不同群体间存在较丰富的遗传多样性。应用NeiLi相似系数法对6份材料间的遗传相似系数(GS)进行估算,平均GS值为0.45,其GS值在0.2816~0.7020之间,即遗传差异较大。聚类分析结果表明,以0.56为GS截值,6份大字杜鹃种质可分为两类;以0.64为GS截值,6份供试大字杜鹃种质可分为三类;初步鉴定了6份大字杜鹃种质间的亲缘关系。 相似文献
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采用RAPD分子标记技术对贵州省22份玉米地方种质资源材料进行遗传多样性分析。结果表明,从90个引物中共筛选出18个能够稳定扩增的多态性引物,共产生123条多态性带,平均每个引物6.83条,聚类分析表明,以相似系数0.670为标准,22份贵州省玉米地方种质可以划分为四大类群。其中以赫498-1为代表的第四大类群中的自交系,与其它3个类群中的自交系间遗传基础较远,可能会形成具有较大潜力的杂种优势模式。用RAPD分子标记揭示的贵州省玉米地方种质具有较为广泛的遗传基础。 相似文献
4.
利用RAPD技术对64个三叶青种质资源样本进行遗传多样性分析,从40对引物中筛选出10对引物进行批量PCR实验。结果表明:64个三叶青样本的观测等位基因数(Na)为1.666 7~2.000 0,有效等位基因数(Ne)为1.247 9~1.701 3,Nei's基因多样性指数为0.167 0~0.398 4,Shannon多样性指数(I)为0.262 8~0.583 0,平均多态位点为7.5,平均多态百分数为93.145%;在遗传相似系数0.720 56处,可以将64个三叶青样本分成11大类;在遗传相似系数0.697 04处,则可将64个三叶青样本分成4大类;聚类分析的结果与种源的地理距离存在不一致性,这可能与种质资源库的地形、气候等自然因素有关。表明所测三叶青种质资源遗传多样性丰富,具有一定的开发利用价值,可为合理保护三叶青的基因资源及其遗传改良提供科学依据。 相似文献
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利用RAPD技术进行辣椒杂种纯度鉴定的研究 总被引:2,自引:0,他引:2
为了建立一套快速、受外界环境影响少、结果准确可靠的辣椒杂种纯度鉴定技术,以湘研5号、湘研10号2个辣椒杂种及其父母本为材料,使用MJ/PTC-200型PCR仪及GDS-8000型凝胶成像分析系统,建立了适合辣椒Randomly Amplified Polymorphic DNA(RAPD)分析的PCR扩增反应的实验体系,从39个随机引物中找到了2个可用于鉴定湘研5号、4个可用于鉴定湘研10号杂种纯度的引物. 相似文献
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辣椒胞质雄性不育恢复基因的RAPD标记 总被引:9,自引:0,他引:9
为定位和克隆辣椒8001恢复系中恢复基因提供基础,用9704A8001 F2代群体开展了辣椒胞质雄性不育恢复基因分子标记研究.通过RAPD-BSA分析法,找到了一个与辣椒细胞质雄性不育恢复系8001中的恢复基因紧密连锁的RAPD标记OPL09-763,测定了该标记带的序列,并进行了同源性比较.该标记带与恢复基因之间的交换值为4.17%,遗传距离为4.18 cM. 相似文献
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用21个引物不同籼、粳、野生稻进行了RAPD分析,聚类结果表明,籼、粳、野栽都可以清楚分组,不同稻种都有特异性带,通过RAPD分析制作的DNA指纹可用于种质鉴定和利用。还对不同稻种的多态性分析及其用途,稻种类型划分的标准化、科学化等问题进行了讨论。 相似文献
9.
我国油松主要分布区种质资源遗传多样性 总被引:6,自引:0,他引:6
利用随机微卫星扩增多态性DNA(RMAPD)分子标记技术,对全国范围内的12个天然居群245个个体进行遗传多样性分析,用筛选出的18对引物组合共扩增出303个条带,其中多态性条带229个,多态条带百分率为77.58%.用NTSYS-PC软件中的SIMQUAL程序计算Jaccard遗传相似性系数(genetic similarity,S_G)并聚类.结果表明:245份油松材料间的S_G值变化范围为0.5238~0.9682,平均为0.8141.采用UPGMA法在0.68水平上可将供试材料聚为4类.内蒙古宁城油松、山西地区油松各自聚为一类外,甘肃小陇山地区油松分别于陕西的洋县、留坝、周至、洛南、柞水的油松聚为一类,黄龙、黄陵、府谷的油松聚为一类.表明各居群间存在较高遗传多样性. 相似文献
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利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,对几份柑橘资源及其芽变系共计25份材料进行了鉴定和遗传多样性分析,从70个引物中筛选出多态性好的10个引物组成单引物和双引物对基因组进行扩增,共扩增出142条谱带,其中多态带72条,共同带70条,平均每个单引物出现多态带6.8条,每对双引物出现多态带1.3条。利用UPGMA法分析发现,这些基因型间的遗传相似系数在0.834~0.966之间,在此基础上,构建了各基因型的遗传关系树状图。结果表明RAPD标记可以准确鉴定出各柑橘资源及其芽变系,这25份柑橘资源代表了25个基因型。较高的遗传相似系数揭示了柑橘资源间狭窄的遗传背景。 相似文献
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Two hybrid hot pepper varieties Xiangyan 5 and Xiangyan 10, and their parents were analyzed the polymerase chain reaction with MJ/PT 200 Pehrier Themal Cycler and DS 800 White-ultravilot Transilluminator to set up a RAPD system adaptable to the purity determination of the hy-brid seeds. Among the 39 random primers, 2 and 4 primers were found to be used effectively in Xiangyan 5 and Xiangyan 10 respectively. 相似文献
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辣椒细胞质雄性不育系与其保持系线粒体DNA的RAPD分析 总被引:3,自引:0,他引:3
以辣椒细胞质雄性不育系21A及其相应的保持系21B为试材,从苗龄10~15 d的黄化苗中分离纯化线粒体并提取线粒体DNA。线粒体负染后电镜观察发现,分离纯化的线粒体形态完整,呈椭球形,杂质较少。电泳检测提取的线粒体DNA的琼脂糖,结果表明,线粒体DNA纯度较高,无降解现象,浓度为20~50 ng/μl,可用作RAPD分析。经初步筛选,100个RAPD随机引物中有8个引物表现出多态性,经再次重复筛选,获得了辣椒细胞质雄性不育系21A线粒体DNA与雄性不育性相关的RAPD标记CMSAG3430。 相似文献
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应用RAPD分析小豆种质资源遗传多样性及遗传演化趋势 总被引:11,自引:1,他引:11
用RAPD标记方法对来自中国、日本、韩国、不丹、尼泊尔、越南6国163份小豆种质资源DNA的遗传多样性进行检测。从27个引物共检测到285条带,有261条具多态性(占92.98%),其中野生型多态性带谱占85.82%,栽培型次之为83.52%,半野生型为80.46%,三类型小豆都有其自身特征带;遗传离散度大小顺序是:野生型>半野生型>栽培型,其遗传分化系数大小顺序为:野生型<半野生型<栽培型;从分化系数差异看,半野生型小豆更接近野生型小豆;从相似系数平均值来看,半野生型小豆材料之间亲缘关系较近,而处在进化两极的野生型材料之间、栽培型材料之间亲缘关系都较远;来自我国西南以及日本南部两地区的小豆材料遗传离散度较大,遗传分化系数、相似系数平均值较低。聚类分析结果表明,163个小豆材料以遗传相似系数0.32为截值,可分为8大类,归类有较明显的地理相关性及遗传类型的趋同性。 相似文献
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花椒种质资源的RAPD分析 总被引:1,自引:0,他引:1
利用30条RAPD引物对21份花椒种质资源的DNA进行了扩增,计算了样品间的遗传距离并进行了聚类分析。共扩增出257条谱带,其中多态性谱带186条(占72.37%),平均每条引物扩增多态位点6.2个。21份种质材料间均存在遗传差异,其中韩城红葡萄椒和韩城大红袍遗传距离最近,平均遗传距离为0.290 4;凤县野生构椒和韩城白葡萄椒的遗传距离最远,平均遗传距离为0.833 6;同一种质资源内个体间存在不同程度的差异,其中山东大红袍个体间差异最大,个体间平均遗传距离为0.087 2,但临夏一号和凤县大红袍2份种质内个体间均未检测到差异。当遗传距离取0.529 7~0.576 3时,21份花椒种质资源可以聚类为3组,当遗传距离取0.496 3~0.503 7时,可聚类为7组。RAPD多态性分析从分子水平上反映出了花椒种质资源复杂的遗传背景;为花椒品种的鉴定与分类研究提供了依据。 相似文献
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桃品种种质资源的RAPD分析 总被引:9,自引:0,他引:9
用筛选的20个随机引物对42个桃品种(种)进行RAPD扩增,用扩增产生的107条多态性带计算样品间的遗传距离,UPGMA法聚类分析,在遗传距离0.14处可将供试样品划分为四类,认为RAPD标记可用于分析桃种质资源间亲缘关系。在遗传距离0.11处可将水蜜桃、黄肉桃、油桃明显区分开,但存在一定交叉现象,若以肉质类型划分桃品种,还应考虑桃品种的遗传背景。供试样品中珲春桃是优先保存的种质,其次是Fireprince、上海水蜜桃等。根据聚类分析结果和遗传距离,认为珲春桃不是桃和山桃的杂交后代,应为桃的一个变种。 相似文献