微卫星分子标记分析四川绵羊群体遗传多样性

为探究四川省6个绵羊群体的遗传多样性,实验应用12个微卫星标记计算基因频率、有效等位基因数、杂合度及多态信息含量来评估群体内遗传多样度,通过遗传距离聚类图、群体结构推测图、主成分分析及群体间分子方差分析来评估群体间遗传关系。结果表明:6个绵羊群体在12个微卫星位点的平均有效等位基因数为3.006~3.176,平均多态信息含量变化为0.559~0.612,平均期望遗传杂合度为0.610~0.670;6个绵羊群体间的遗传关系与地理分布情况及育成史实不完全一致,但遗传距离聚类图、群体结构推测图和主成分分析结果均显示,6个绵羊群体中布拖黑绵羊类群与贾洛绵羊类群遗传关系更近;6个绵羊群体间方差组分F统计量结果为0.112 39,处于中度分化水平。     

丝羽乌骨鸡群体遗传结构的微卫星标记分析

用9对微卫星引物对170只丝羽乌骨鸡的基因组DNA进行扩增,结果表明,9个微卫星标记在该品系中都表现出了丰富的多态性,所有扩增结果都能重复.微卫星标记平均每个座位检测到4.56个等位基因(3-7个).9对微卫星引物平均多态信息含量为0.6072,标记平均杂合度为0.7423.本研究的结果可以为进一步利用微卫星进行丝羽乌骨鸡种质特性等研究提供一定的参考.     

四川地方乌骨鸡种群遗传变异的微卫星DNA分析

利用10个微卫星标记，对四川不同地区5个乌骨鸡种群的等位基因频率、各群体的遗传杂合度、群体间的遗传距离等进行了分析，并根据遗传距离对这几个乌骨鸡种群进行了聚类分析。结果表明，各乌骨鸡群体的遗传多样性较为丰富，并具有较高的选择潜力。各乌骨鸡种群间有一定的遗传距离，UPGMA聚类分析表明，四川山地乌骨鸡黑羽系与川南山地乌骨鸡被聚为一类，草科鸡与旧院黑鸡被聚为一类。     

应用微卫星标记对12个中国地方乌骨鸡品种遗传多样性的研究

利用27个微卫星DNA标记对12个地方乌骨鸡品种进行遗传多样性分析，通过计算等位基因频率、多态信息含量、杂合度、有效等位基因数和遗传距离，评估各品种内遗传变异和各品种间遗传相关，并根据遗传距离对12个鸡品种进行了聚类分析。结果表明，各乌骨鸡群体的遗传多样性较为丰富，并具有较高的选择潜力。平均杂合度最高的是竹乡鸡，为0．670；最低的是江山乌骨鸡，为0．581。27个微卫星标记中4个为中度多态座位，1个低度多态座位，22个为高度多态座位；LEI0234与LEI0192分别检测到了10．3与12．2个等位基因。以标准遗传距离为准，遗传距离最近的为沐川乌骨鸡与略阳鸡，为0．1002，而乌蒙乌骨鸡与略阳鸡最远，为0．2546。通过UPG—MA法聚类后，略阳鸡、沐川乌骨鸡、兴文乌骨鸡、盐津乌骨鸡、竹乡鸡首先聚为1类，江山乌骨鸡、郧阳白羽乌鸡、余干乌骨鸡聚为1类；金湖乌凤鸡、丝绒乌骨鸡和丝毛乌骨鸡聚为第3类；乌蒙乌骨鸡独为一类。     

丝羽乌骨鸡群体遗传结构的微卫星标记分析

用 9对微卫星引物对 170只丝羽乌骨鸡的基因组DNA进行扩增 ,结果表明 ,9个微卫星标记在该品系中都表现出了丰富的多态性 ,所有扩增结果都能重复。微卫星标记平均每个座位检测到 4 .5 6个等位基因 (3～ 7个 )。 9对微卫星引物平均多态信息含量为 0 .6 0 72 ,标记平均杂合度为 0 .74 2 3。本研究的结果可以为进一步利用微卫星进行丝羽乌骨鸡种质特性等研究提供一定的参考     

乌骨鸡的遗传多样性研究现状

本文从形态、细胞、生化以及DNA水平对乌骨鸡的遗传多样性作了较系统的阐述 ,进一步提出了未来的发展方向。     

不同地方乌骨鸡种群遗传多样性的微卫星DNA分析

利用家禽基因组中的10个微卫星标记，对位于不同地区6个乌骨鸡种群的等位基因频率、各群体的遗传杂合度、群体间的遗传距离等进行了分析，并根据遗传距离对这几个乌骨鸡种群进行了聚类分析。结果表明，各乌骨鸡群体的遗传多样性较为丰富，并具有较高的选择潜力。各乌骨鸡种群间有一定的遗传距离，UPGMA聚类分析表明，黑凤乌骨鸡与白凤乌骨鸡最先被聚在一起，四川山地乌骨鸡黑羽系与川南山地乌骨鸡被聚为一类，草科鸡与旧院黑鸡被聚为一类。     

中国6个双峰驼群体微卫星遗传多样性分析

为了解中国双峰驼群体的遗传多样性及不同种群间的遗传进化关系,本研究采用微卫星标记技术,对中国阿拉善驼、青海驼、南疆驼、北疆驼、肃北驼、苏尼特驼6个双峰驼群体进行了遗传多样性分析。通过计算杂合度（H）、多态信息含量（PIC）、有效等位基因（Ne）、Shannon信息指数等分析群体内遗传变异,通过计算F-统计量、基因流、遗传分化系数、遗传距离等分析群体间遗传进化关系。结果显示,10个微卫星位点共检测到了89个等位基因,平均每个位点检测到8.9个等位基因;所有位点均属中高度多态位点（YWLL08除外）,平均PIC值在0.488~0.752之间;6个群体观测杂合度值（0.355~0.448）都低于期望杂合度值（0.643~0.703）;几乎所有位点的Shannon指数都>1,且处于哈代-温伯格不平衡状态（P< 0.05）。群体间遗传分化系数Fst值为0.059,处于较低程度的中等分化状态; 6个双峰驼群体的平均Fis值均为正值,说明6个双峰驼群体都存在不同程度的近交。基于标准遗传距离D_S和遗传距离D_A进行聚类分析,南疆驼和北疆驼聚为一支,阿拉善驼、青海驼、肃北驼、苏尼特驼4个群体聚为一支。研究表明,中国双峰驼遗传多样性丰富,群体内遗传变异较大,存在一定近交现象;群体间存在着一定的基因流动,群体间的分化主要由群体内的遗传变异造成;6个群体分为2个类群。     

利用微卫星分析云南武农绿壳蛋乌骨鸡的遗传多样性

应用微卫星分析技术，以6对引物对云南武农绿壳蛋乌骨鸡进行遗传多样性分析，结果表明该鸡种具有丰富的遗传多样性，具有保存和开发的潜力。     

四川三个藏猪群体的微卫星遗传多样性分析

本研究利用已开发的18对微卫星引物,分析了四川境内阿坝、稻城和德格三个藏猪群体共143个个体18条常染色体上的微卫星遗传多样性。结果表明:阿坝藏猪群体多态信息含量和观测杂合度比其他两群低,群体遗传变异较小;三个群体Nei氏标准遗传距离均在0.6以上,平均基因流值大于1,表明三个群体各有特点,群内基因交流频繁。     

Genetic diversity of Forest and Savannah chicken populations of Ghana as estimated by microsatellite markers

The characterization of indigenous animal genetic resources is a requisite step in providing needed information for the conservation of useful genotypes against future needs. Thus, in this study, 22 microsatellite markers were used to genotype 114 local chickens from the Forest (n = 59) and Savannah (n = 55) eco‐zones of Ghana and the results compared to those of the ancestral red junglefowl (n = 15) and two European commercial chicken populations – a broiler (n = 25) and white leghorn (n = 25). A total of 171 alleles were observed, with an average of 7.8 alleles per locus. The local Ghanaian chickens showed higher diversity in terms of the observed number of alleles per locus (6.6) and observed heterozygosity (0.568) compared with the combined control populations (6.0 and 0.458, respectively). However, Wright's F‐statistics revealed negligible genetic differentiation (F_ST) in local Ghanaian chicken populations. In addition, 65% of the Savannah chickens were inferred to be more likely from the Forest, suggesting a south‐north dispersal of chickens from their probable original location in the Forest zone to the Savannah areas. It is concluded that the Forest and Savannah chickens of Ghana are a single, randomly mating unselected population, characterized by high genetic diversity and constitute a valuable resource for conservation and improvement.     

利用微卫星标记分析乌骨大骨鸡的遗传多样性

利用微卫星标记分析了乌骨大骨鸡的遗传多样性和遗传结构,筛选了鸡基因组7条染色体上的7个微卫星标记位点,随机选取24羽乌骨大骨鸡个体,进行多态性检测,共检测到23个等位基因,每个座位等位基因数目从2个到5个不等,平均等位基因数为3.3个。该群体平均多态信息含量和平均杂合度分别为0.660 3和0.717 6。结果表明乌骨大骨鸡属多态性较丰富的群体。     

利用微卫星标记分析5个家兔品种内的遗传多样性

本研究利用微卫星标记分析了我国5个家兔品种内的遗传多样性。结果表明:在5个品种中,新西兰兔有效等位基因数最多,为6.545 5;加利福尼亚兔有效等位基因数最少,为3.000。比利时兔平均多态信息含量和平均杂合度最大,分别为0.570 4和0.823 3;加利福尼亚兔平均多态信息含量和平均杂合度最小,分别为0.499 7和0.589 7。     

应用微卫星DNA标记对BWEL-SPF鸡种群的群体遗传学分析

本研究利用14个鸡微卫星DNA标记位点,采用DNA测序仪和荧光素标记分子内标,建立了鸡分子遗传学的检测方法,对F15世代BWEL-SPF鸡种群8个家系群体内和群体间的遗传结构进行了分析。结果表明,被检位点35.7%(5/14)的基因型趋于纯合,家系内等位基因的变异程度显著降低。F-统计量检验结果表明,家系间的遗传分化均达到了极显著水平(P0.001),群体间的变异占到了总遗传变异的12.9%。     

东方白鹳微卫星遗传标记的筛选及其在种群遗传分析中的应用

东方白鹳(Ciconia boyciana)是分布于东亚的大型濒危涉禽,亟待深入开展其种群的保护遗传学研究.本研究采用微卫星标记技术筛选东方白鹤的微卫星位点,并进行种群的遗传多样性分析.所用的36对微卫星引物7对来自白鹳(Ciconia ciconia),12对来自朱鹮(Nipponia nippon),17对来自大蓝...     

济宁百日鸡群体遗传多样性的微卫星标记分析

采用微卫星标记技术,在分布于家鸡的22条染色体的25对微卫星引物中,筛选出10对多态性丰富的微卫星位点,对60个个体的DNA多样性进行了检测。结果共检测到29个等位基因,每个微卫星座位的等位基因数目为2~5个,平均等位基因数为2.90,该鸡群的平均基因杂合度(H)为0.348,多态性信息含量(PIC)为0.511。表明所检测的济宁百日鸡群体的遗传多样性较丰富,具有一定的选择潜力,可以做进一步的选择利用。     

新疆地方斗鸡遗传多样性的微卫星分析

本试验利用8个微卫星座位分析了新疆3个地方（吐鲁番、喀什和伊犁）斗鸡群体的等位基因频率、多态信息含量、基因杂合度和有效等位基因数等群体遗传变异参数。结果表明,3个地方斗鸡的8个微卫星座位共检测到77个等位基因,多态信息含量（除伊犁斗鸡ADL0298位点外）均大于0.5,表现高度多态信息,群体间平均遗传距离为0.2866。因此,所选取的微卫星位点可用于新疆3个地方斗鸡的群体遗传多样性分析。     

我国6个绵(山)羊群体遗传分化的微卫星分析

为进一步了解我国绵(山)羊群体的品种特性及其遗传分化,本文利用微卫星标记对我国6个绵(山)羊群体遗传分化进行了分析。采用中心产区典型群随机抽样方法用聚丙烯酰胺凝胶电泳检测乌珠穆沁羊7个微卫星位点,并引用同实验室小尾寒羊、滩羊、湖羊、同羊、长江三角洲白山羊(参照群体)的相关资料进行群体遗传分化水平分析。研究表明:7个微卫星位点在乌珠穆沁羊、小尾寒羊、滩羊、湖羊、同羊、山羊这6个品种中均存在遗传多态性,各座位等位基因均较丰富。根据标准遗传距离、DA遗传距离以及模糊相容关系进行聚类分析,湖羊与同羊首先聚为一类,乌珠穆沁羊和小尾寒羊聚为一类,然后与滩羊聚为一类,5个绵羊品种最后与山羊相聚。     

Genetic diversity and structure of the West Balkan Pramenka sheep types as revealed by microsatellite and mitochondrial DNA analysis

Several different phenotypes of the native Pramenka sheep have been developed in the Balkan region for different environmental and socio‐cultural conditions. Animals from seven West Balkan Pramenka sheep types were analysed for 15 microsatellite markers and for mitochondrial DNA (mtDNA) and the results were used to assess genetic variation within and among the types and to infer the genetic population structure of the Pramenka sheep. Mean expected heterozygosity and allelic richness over the microsatellite loci and sheep types were 0.78 and 7.9, respectively. A Bayesian statistical method for estimating hidden genetic structure suggested that a core of the largest panmictic population was formed by Serbian, Kosovan, Bosnian, Montenegrin and Albanian types, while Croatian and Macedonian types comprised two other main populations, respectively. Mitochondrial DNA analysis revealed two mtDNA haplogroups in the Pramenka sheep, B and A, with a frequency of 93.7% and 6.3%, respectively. A total of 60 mtDNA haplotypes were found in 64 animals sequenced, and the mean nucleotide and haplotypic diversities over the types were 0.013 and 0.945, respectively. Molecular analysis suggests that the West Balkan Pramenka sheep types have their origins in two distinct maternal lineages of domestic sheep and different Pramenka phenotypes tend to form few panmictic populations. The Pramenka sheep represents a valuable resource of genetic diversity in sheep.