猪THRSP基因5'侧翼区序列转录调控活性的鉴定

本研究旨在对猪THRSP基因5′调控区TP526序列进行转录调控活性的鉴定,以鉴别THRSP基因调控区的功能。提取猪耳组织基因组,利用PCR技术克隆THRSP基因5′调控区TP526序列,将其插入荧光素酶报告载体中(pGL3-Basic),构建猪THRSP基因5′调控区TP526序列调控的荧光素酶报告载体(pGL3-TP526/promot-er),经PCR鉴定后,转染293T细胞,利用双报告基因检测TP526序列的启动子活性。结果显示,pGL3-TP526/promoter调控的表达载体,其萤火虫与海肾荧光素酶荧光强度之比(1.816 2±0.253 3)显著高于pGL3-Basic(0.126 7±0.020 3),呈高效表达(P<0.01)。THRSP基因5′调控区TP526序列具有启动子调控活性。     

猪乳糖酶基因5’非编码区多态性分析

研究检测国内外猪种乳糖酶基因5’非编码区多态性位点。采用PCR、TA克隆和直接测序的方法,分析大白猪、长白猪、杜洛克、荷包猪、民猪乳糖酶基因5’非编码区多态性。结果表明,在猪乳糖酶基因5’非编码区-630 bp处及增强子区-797 bp处出现G/A两种不同的等位基因,在-539 bp处出现C/T两种不同的等位基因,在-442 bp处出现C/A两种不同的等位基因。     

牛Ankrd2基因启动子遗传多态性及启动效率分析

采用限制性片段长度多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)技术,检测462头中国西门塔尔牛Ankrd2基因启动子区域的单核苷酸多态(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点,分析了SNP位点与牛肉质和胴体性状的关联性,利用生物信息学网站和软件对启动子序列进行预测分析;另一方面,采用点突变构建含有SNP位点不同基因型的双荧光素酶报告基因载体,分别瞬时转染293T细胞和牛胎儿成纤维细胞,测定荧光素酶的相对活性并进行统计学分析。结果显示:牛Ankrd2基因启动子区域(-2101～+436 bp)中存在1个SNP位点:g.-171G>T,该位点在检测的牛群体中仅存在2种基因型:GG和GT,其中G为优势基因,且该位点对牛肺和气管重影响达到显著水平(P<0.05),当G突变为T时,启动子序列减少2个ZF5转录因子结合位点,增加了1个FACB转录因子结合位点,pGL4-Ankrd2-TT启动子启动效率极显著低于野生型载体pGL4-Ankrd2-GG(P<0.01)。结果表明,在中国西门塔尔牛群体Ankrd2基因启动子区存在g.-171G>T,位点与牛胴体性状存在相关性,且该位点可能通过改变转录因子结合位点,从而影响基因的启动子转录活性。     

鸭CD8α基因启动子区的克隆及荧光素酶报告基因重组体的构建

旨在了解分化群α基因可能的调控序列及其转录调控机制。本研究利用基因组步移技术扩增鸭CD8α基因的启动子区序列,使用在线软件进行序列分析;分别将鸭肝炎易感组和抗性组的CD8α基因启动子区定向亚克隆至荧光素酶表达载体pGL3-Basic中,利用酶切与测序技术进行鉴定;并瞬时转染细胞,采用荧光素酶报告基因系统检测启动子载体的活性。结果,扩增出一条长度为2 480bp的片段(包含第一外显子56bp,启动子区2 424bp)。经序列分析,鸭CD8α基因启动子区具有典型的TATA-box、GC-box和CAAT-box,其转录起始位点位于翻译起始密码子ATG上游-406bp处,且发现了CdxA、Nkx-2、GATA-1、SRY等41个潜在转录因子结合位点。经酶切与测序鉴定,成功构建了鸭CD8α基因荧光素酶报告基因重组体。荧光素酶报告基因检测系统显示,构建的鸭肝炎易感组和抗性组的报告基因启动子载体具有相当的活性。研究结果为进一步探讨CD8α基因的转录调控奠定了基础。     

HGTP基因与羊毛细度的相关性分析及其启动子活性研究

本研究旨在构建高甘氨酸－酪氨酸蛋白（HGTP）启动子荧光素酶报告基因载体并验证其活性,阐明HGTP基因在萨福克羊和中国美利奴羊皮肤毛囊组织中的表达差异与羊毛经济性状的关系。运用PCR方法扩增HGTP基因启动子序列片段,克隆至pGL3-Basic载体中构建重组质粒,并通过双酶切验证和测定核酸序列鉴定;转染皮肤成纤维细胞并检测报告基因的活性;测定羊毛的纤维直径、长度的数据,利用实时荧光定量PCR分析HGTP基因在不同品种绵羊的皮肤毛囊组织中的表达情况。结果显示,萨福克羊与中国美利奴羊的羊毛纤维直径及自然长度差异极显著（P<0.01）,HGTP基因表达水平与羊毛纤维直径存在极显著的高度正相关（P<0.01）,与羊毛自然长度呈现显著的中等负相关（P<0.05）,而羊毛直径与自然长度之间存在极显著的高度负相关（P<0.01）。HGTP基因在萨福克羊和中国美利奴羊皮肤组织中的表达水平差异极显著（P<0.01）。启动子活性荧光素酶检测结果显示,KAP6.1、KAP7和KAP8.1启动子元件在绵羊皮肤成纤维细胞和3T3细胞中均有表达,且在绵羊成纤维细胞中的活性极显著高于在3T3细胞中的活性（P<0.01）。HGTP基因可以作为研究羊毛纤维直径、自然长度的候选基因。构建不同长度的表达载体,转染皮肤成纤维细胞,获得的2个启动子元件都能驱动外源基因在体外细胞水平表达。绵羊HGTP基因启动子的功能研究为调控羊毛发育提供了理论依据。     

猪PLEl基因启动子克隆及序列分析

通过巢式PCR方法获得猪PI。E1基因5’端上游启动子序列,通过T／A克隆法对PI。E1基因的启动子进行克隆,并对PCR鉴定为阳性的克隆子进行测序,参考人、啮齿类的羧酸酯酶家族的启动子结构,并利用启动子在线分析软件对其进行生物信息学分析。结果成功克隆得到PI。E1基因5’端上游1153bp的调控片段,分析表明该调控区没有CpG岛,也不存在典型的TATA盒结构;有2个转录起始位点分别位于翻译起始密码子ATG上游-39bp和-37bp处,潜在的转录因子结合位点有C／EBP、Spl、USF、CdxA、GATA-X、GATA-1、GATA-2、GATA-3、MZFl、AML-la、SRY、Nkx-2、LyLl、deltaE等。另外还发现了7种基序分别为EGF-1、INTEGRINBETA、CTCKl、ANA—PHYIJATOXIN-1、THIOLASE-3、TUBUI,IN、VWFC-1。研究结果可为进-步揭示PLEl基因转录调控机制提供理论参考。     

猪SelS基因启动子区的克隆及序列分析

本研究旨在克隆和分析猪硒蛋白S基因(Selenoprotein S,SelS)启动子序列,并初步探讨潜在转录因子结合位点对其表达的影响.通过SON-PCR技术克隆猪SelS基因启动子序列,利用PromoterScan、Promoter 2.0等在线工具预测其启动子特征,利用细菌脂多糖(Lipopolysaccharides,LPS)刺激PK15细胞,研究NF-kappaB转录因子对猪SelS基因启动子活性的影响.试验获得了猪SelS基因约3kd的启动子序列,部分序列比对发现猪、人、牛和小鼠物种间相似性仅7%～51%.预测猪SelS基因转录起始位点在-398 bp,猪和人SelS基因启动子存在系列保守的转录因子结合位点,包括NF-kappaB、CCAAT box、SP1、USF等,但均未发现典型的TATA box.细胞试验表明,NF-kappaB转录因子可以上调猪SelS基因的表达.结果提示,物种间SelS基因启动子相似性较低,但猪和人SelS基因的转录因子非常保守,LPS诱导试验提示,猪SelS基因表达可能受NF-kappaB转录因子的调控.     

不同品种猪IGFBP-3启动子区突变位点筛查及分析

以军牧1号白猪、大白猪、东北野猪、巴马香猪和西藏小型猪为研究对象,通过PCR扩增5个品种猪IGFBP-3基因5′调控区序列(约2 000bp)并进行测序分析,来研究不同品种猪IGFBP-3基因启动子区序列的差异。同源性比对分析发现5个品种猪IGFBP-3基因5′调控区存在约50处突变;启动子预测发现在-185bp附近为核心启动子区的几率最大;突变共导致9处转录因子结合位点发生改变,其或可造成不同品种猪IGFBP-3表达量的差异,进而影响不同品种猪的体型大小。     

荣昌猪和长荣猪肌肉生长抑制素基因表达规律的研究

为了研究荣昌猪和长荣猪胴体瘦肉率和骨骼肌肌肉生长抑制素(MSTN)基因表达量的变化规律,试验采用2×2因子试验设计,荣昌猪和长荣猪(两种基因型猪)分别饲喂按中国瘦肉型猪饲养标准和荣昌猪饲养标准配制的日粮,共4个处理,每个处理6个重复,在20 kg、35 kg、50 kg、80 kg和110 kg时每个重复屠宰1头。结果表明:荣昌猪和长荣猪的瘦肉率随体重的增加呈降低的趋势,背最长肌中MSTN基因的表达量呈上升的趋势;在相同体重条件下,荣昌猪的胴体瘦肉率显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)地低于长荣猪,其背最长肌中MSTN基因表达均明显高于长荣猪,而日粮营养水平及品种×营养水平交互作用对猪胴体品质和MSTN基因的表达量没有明显影响(P>0.05)。     

猪CuZnSOD基因片段的克隆及不同生长阶段猪肝脏CuZnSOD基因表达的差异

从体质量1、20、40、60、90kg左右的杜长大猪的肝脏组织中提取基因组RNA，RT—PCR扩增CuZnSOD基因，获得了1务255bp的片段，以pGEM—TEasyVector为载体，将该片段克隆到大肠杆菌（E．coli）中，筛选阳性克隆测定其序列，分析表明该片段与报道的猪CuZnSODcDNA部分序列同源性达到100％，编码85个氨基酸组成的多肽，是成熟肽的一部分。以CuZnSOD基因片段的克隆为基础，构建了优化的半定量RT—PCR法，以18SrRNA为内标，研究不同生长阶段猪肝脏组织中CuZnSOD基因mRNA表达的差异。结果显示，1kg左右猪肝脏组织中CuZn—SODmRNA表达水平较高，体质量1～20kg猪的肝脏组织中CuZnSOD基因表达量呈下降趋势，体质量40kg的猪又显著上升，到生长后期即体质量90kg左右，CuZnSOD基因表达量又急剧下降。     

Platelet-activating factor in Iberian pig spermatozoa: receptor expression and role as enhancer of the calcium-induced acrosome reaction

Platelet-activating factor (PAF) is a phospholipid involved in reproductive physiology. PAF receptor is expressed in some mammalian spermatozoa species where it plays a role in these germ-cell-specific processes. The aim of this study is to identify PAF receptor in Iberian pig spermatozoa and to evaluate PAF's effects on motility, viability and acrosome reaction. Semen samples from Iberian boars were used. PAF receptor identification was performed by Western blotting. Spermatozoa motility was analysed by computer-assisted sperm analysis system, whereas spermatozoa viability and acrosome reaction were evaluated by flow cytometry. Different PAF concentrations added to non-capacitating medium during 60 min have no effect on any spermatozoa motility parameter measured. Acrosome reaction was rapid and potently induced by 1 μm calcium ionophore A23187 showing an effect at 60 min and maximum at 240 min. PAF added to a capacitating medium is not able to induce spermatozoa acrosome reaction at any time studied. However, PAF, in the presence of A23187, significantly accelerates and enhances the calcium-induced acrosome reaction in a concentration-dependent manner in Iberian boar spermatozoa. Exogenous PAF does not affect at all spermatozoa viability, whereas slightly exacerbated the A23187-induced loss in viability. This work demonstrates that PAF receptor is expressed in Iberian pig spermatozoa and that its stimulation by PAF regulates the calcium-induced acrosome reaction. This work contributes to further elucidate the physiological regulation of the most relevant spermatozoa functions for successful fertilization: acrosome reaction.     

Embryo gene expression in pig pregnancy

Pregnancy is a complex process in which significant changes occur continually in both the corpora lutea and in the endometrium of the females and varies depending on the embryonic, pre-implantation or foetal stages. In the embryonic stages, the majority of genes expressed in the pig embryo correspond to the loss of cellular pluripotency. In contrast, the implantation consists of three phases: elongation of the conceptus, adhesion and union of the embryo to the endometrial epithelium. During these phases, many factors are expressed, including growth factors, molecules that facilitate adhesion and cytokines. All these changes are ultimately regulated by different lipid and hormonal substances, specifically by progesterone, oestradiol and prostaglandins, which regulate the expression of many proteins necessary for the development of the embryo, endometrial remodelling and embryo–maternal communication. This paper is a review of primary gene regulatory mechanisms in pigs during different stages of implantation.     

猪TGFBR1基因的克隆与生物信息学分析

TGFBR1是TGF-β/Smad信号通路中的重要成员,在哺乳动物卵泡发育和排卵过程中发挥重要作用。本文通过克隆测序技术分离猪TGFBR1基因编码区序列,采用生物信息学方法对猪TGFBR1序列信息及其与哺乳动物其他物种间的进化和系统发育关系进行分析。结果发现:猪TGFBR1基因编码区序列全长1 512 bp,编码蛋白含有503个氨基酸残基,与哺乳动物其他物种的一致性分别在90%和95%以上;猪TGFBR1蛋白具有跨膜结构、GS区和激酶结构等保守结构域。进化分析显示哺乳动物TGFBR1基因的突变已达饱和状态,在进化过程中受到负选择的影响。基于TGFBR1基因编码区序列的系统发育分析发现,猪与同属偶蹄目的普通牛、绵羊的亲缘关系较近。     

柠条锦鸡儿CkNCED1基因启动子的克隆及表达分析

利用染色体步移(Genome walking)技术,克隆柠条锦鸡儿CkNCED1基因上游启动子序列。经顺式元件预测分析,该序列除基本的启动元件之外,还含有2个脱落酸诱导响应元件ABRE、此外还含有多个逆境相关的元件。将CkNCED1基因启动子区连接到pGWB533植物表达载体上,构建Promoter::GUS载体,GUS组织化学染色结果表明,CkNCED1基因在植物的叶、根、茎、花和角果的维管组织中均有表达,且在叶片中表达强度最高。以上研究确定了柠条锦鸡儿CkNCED1基因的表达部位和强度。进一步说明CkNCED1基因在ABA合成调控中发挥重要作用,为深入研究基因功能奠定基础。