转座子在基因组和基因进化方面的研究进展

从转座子插入对基因组产生的重组、异位、倒位以及对基因产生的沉默、表达等方面阐述了转座子对基因组和基因进化的重要作用,从转座子在基因中插入位置的不同对基因表达和功能产生的影响进行了综述。     

淅川乌骨鸡全基因组转座子的鉴定与分析

【目的】通过分析淅川乌骨鸡全基因组重测序数据,获取淅川乌骨鸡转座子的基本信息和特征分布,探究转座子相关基因参与的通路。不仅对研究淅川乌骨鸡转座子的生物学功能具有重要的意义,而且为探索基因组扩增、基因组功能及进化研究提供重要基础数据。【方法】对淅川乌骨鸡血液DNA进行全基因组重测序,采用双末端短序列比对基因组,运用RepeatModeler、TEclass、RepeatMasker等使用流程对转座子进行鉴定、构建、校正、分类和注释,获得淅川乌骨鸡整个基因组所有的转座子,对转座子的特征、分布及和基因的关系等方面进行分析。并对转座子插入的所有基因进行GO和KEGG数据库富集,分别结合GO和KEGG注释结果对功能进行描述。【结果】经鉴定、分类和注释,淅川乌骨鸡共鉴定到370 252个转座子序列,分为19个超家族,主要为CR1、TcMar-Mariner、ERVL、ERV1等超家族,进一步说明淅川乌骨鸡转座子类型主要是逆转录转座子;转座子的数目和染色体长度有关,染色体越长,转座子数目越多。在基因组中转座子和基因的密度成反比,基因密集的区域中转座子密度较低;基因组内转座子的插入并非随机的,LTR/...     

鄱阳湖湿地区土地利用变化分析与预测

本文在遥感与地理信息系统支持下,建立了鄱阳湖湿地区新建县1996-2000年土地利用数据库,结合统计数据,运用马尔科夫与GM(1,1)2种预测方法对研究区未来的土地利用变化趋势进行了预测.结果表明2种预测方法的预测结果吻合度较高,研究区土地利用变化的总趋势为耕地持续减少,林地持续增加;建设用地面积加速增长,江滩湖滩减少速度放慢;湿地区域相对较稳定.结合研究区社会经济数据,文中还进一步分析了人口因素、经济发展水平、工业化与城镇化和地理位置与土地政策对土地变化趋势的影响.研究结果可为土地利用规划管理及政策的制定提供科学依据,为鄱阳湖湿地的管理提供背景资料和依据.     

新建县土地利用变化预测与驱动因素分析

在遥感与地理信息系统支持下,建立了新建县1998年和2002年土地利用数据库,结合统计数据,运用马尔科夫与GM(1,1)两种预测方法对研究区未来的土地利用变化趋势进行了预测。结果表明,两种预测方法的预测结果吻合度较高,研究区土地利用变化的总趋势为耕地持续减少,林地持续增加;建设用地面积加速增长,未利用地减少速度放慢;草地和水域相对较稳定。结合研究区社会经济数据,进一步分析了土地变化的驱动因素,研究结果可为土地利用规划管理及政策的制定提供科学依据。     

燕麦C基因组反转录转座子分离与特异性标记的建立

燕麦属是禾本科中重要的属,其中,栽培燕麦是一种营养价值很高的粮、经、饲、药多用途作物,而野生物种中则含有多种优良农艺性状基因,是遗传改良的重要资源。基因组和染色体特异性的分子标记是分子育种工作的重要工具,以燕麦属不同倍性和基因组物种为材料,利用300条随机引物(random amplified polymorphic DNA,RAPD),从燕麦C基因组中筛选到一条基因组特异性序列OPR51655;比对和原位杂交发现,OPR51655为一Ty1-copia型反转录转座子重复序列,其同源序列分布于除端部和着丝粒外的整个染色体臂上;根据OPR51655建立了燕麦C基因组特异性(sequence-characterized amplified region,SCAR)标记,利用该标记能有效地检测燕麦栽培种和野生种中的C基因组染色质。     

河南省农村劳动力转移速度预测方法的探讨

通过对河南省巩县七村一百个农户进行调查,探讨了劳动力分布现状和转移的趋势,并用马尔柯夫链对转移速度作了预测。     

森林景观组成结构动态模拟及预测方法研究

以关帝林区 4个时期的航空像片和地形图为基础资料 ,通过地形斑块图层和植被斑块图层叠加建立景观要素斑块图层及相应数据库 ,在ARC/INFO支持下采用加密的公里网格样点取样的方法 ,成功地确立了森林景观转移概率矩阵 ,并应用马尔可夫模型对研究地区森林景观格局的变化趋势进行了分析、模拟和动态预测。结果表明该地区森林景现在现有经营方针和干扰状况下 ,将在 2 0 2 4年左右达到一个稳定状态。景观总体质量提高 ,有林地面积增加 ,其中寒温性针叶林和温性针叶林面积增大 ,落叶阔叶林面积略有减少。预示着关帝林区最终将趋于一种经济发展与森林资源管理、生态环境保护相协调的森林景观格局。     

广西农产品模型预警系统的构建与应用

从农产品预警系统总体设计及其指标体系构建出发,组建了广西农产品趋势预测模型,在此基础上,采用波动系数和系统化方法划分农产品预警警度与警限,应用马尔柯夫链和多级模糊综合评估法进行农产品预测及其综合评判,从而建立了一套完整的农产品模型预警系统。应用结果表明,平均预警有效率为75.6%,预警有效率在67%以上的年份占全部年份的86.4%。     

茶树炭疽菌N425全基因组测序与基因功能注释

【目的】对茶树炭疽菌N425进行全基因组测序和基因功能注释并从中初筛出致病相关基因。【方法】通过Illumina HiSeq2500 PE150平台对N425菌株进行全基因组测序和组装,并利用NR、KEGG、KOG等功能基因数据库进行基因预测和功能注释。【结果】茶树炭疽菌N425基因组全长约56.3 Mbp,G+C含量为53.2%,共预测出10 157个蛋白编码基因和若干各类非蛋白编码序列。其中,1 356个基因在病原与宿主互作数据库（PHI）中得到注释,包括140个注释为致病力丧失的基因;720个基因在碳水化合物酶数据库（CAZy）中得到注释;302个基因被预测为次生代谢物相关基因。这些基因中有涉及cAMP-PKA、MAPK等信号通路以及降解宿主细胞壁等致病相关过程,是潜在的致病相关基因。【结论】本研究成功获得茶树炭疽菌N425全基因组序列和基因功能注释,并从中挖掘出潜在致病相关基因,为后续展开对茶树炭疽菌侵染茶树的致病分子机制研究奠定基础。     

转座子应用的研究进展

转座子是存在于DNA上可自主复制和移位的基本单位,它存在于生物界的各个领域,转座子及其相关技术是后基因组时代用于研究基因组功能的生物技术。综述了转座子的分类、转座子的转座机制以及转座子的应用与发展前景。     

贝母鉴别方法研究进展

就鉴别贝母的几种常用方法,包括性状鉴别法、显微鉴别法、光谱鉴别法等进行了概述。     

piggyBac转座子及其转基因昆虫的应用

综述了piggyBac转座子的结构、转座机制及其在获得转基因动物方面的应用成果,介绍了利用该转座子获得的转基因昆虫在功能基因研究、生物反应器、昆虫改良和害虫防治等方面的应用。     

白蚁群体融合性及识别因素研究进展

总结了台湾乳白蚁(Coptotermes formosanus)、黑翅土白蚁(Odontotermes formosanus)、大锯白蚁(Microcerotermes crassus)、黄翅土白蚁(Macrotermes barneyi)和尖唇散白蚁(Heterotermes aculabialis)等不同白蚁群体间的融合性,对影响白蚁群体融合的表皮碳氢化合物、肠道菌、季节和巢源地理位置、环境等因素进行了阐述,以期加深对白蚁群体融合性的研究,了解不同种类白蚁群体的融合性,并加以充分利用.     

蚕丝的性质·特点及鉴别方法

介绍了蚕丝的分类、性质特点及鉴别方法等。利用光学显微镜研究了蚕丝的显微结构,结果表明,显微镜下的蚕丝有其独特的显微结构,这为蚕丝区别于其他动物皮毛提供了依据。     

牛流行热病毒山东地方株的分离与鉴定

利用BHK-21细胞,接种山东济南地区疑似牛流行热病牛高热期的抗凝血,经盲传3代,分离到1株病毒,经RT-PCR鉴定为牛流行热病毒,命名为BEFV-SD。理化特性试验表明:BEFV-SD对热敏感,56℃10 min、37℃18 h可被灭活,对乙醚、氯仿等敏感;BEFV-SD可被BEFV阳性血清中和,中和效价为1∶408;将BEFV-SD的G基因与GenBank中公布的BEFV进行同源性比较,同源性达到96.3%以上。     

转基因棉花中Bt蛋白鉴定方法的研究现状

转基因棉花是推进中国棉花产业发展,造福广大棉农的必然举措,然而,如何确定和建立一种简单、快速、方便的转Bt基因棉花检测、鉴定方法成为制约其推广、应用的关键。文章对生物测定法、酶联免疫法(EL1SA法)和SDS-PAGE电泳法等三种当前常用的Bt基因棉花鉴定方法进行了归纳、分析与讨论,并指出了各方法存在的问题及不足,同时,还对已有研究报道的Dot-ELISA法、协同凝集反应、抗生素抗性鉴定法等进行了简单阐述,为进一步推动转Bt基因棉花鉴定方法的研究奠定基础。     

我国水稻抗旱性主要指标及抗旱性鉴定方法研究进展

介绍水稻(Orazy sativa L.)在干旱胁迫下的农艺性状和生理生化指标变化,并对目前我国学者研究中常采用的各种鉴定方法和分析方法进行综述,以期为水稻抗旱育种和鉴定提供参考。     

1株高效聚磷节杆菌的分离鉴定及其聚磷特性研究

[目的]为降低水中磷含量以控制水体富营养化,从自然界筛选高活性的聚磷菌,用于生物除磷。[方法]以聚磷效果为主要指标,通过富集分离筛选细菌,并对其培养条件优化,提高其聚磷能力。根据生理生化反应特点以及分子生物学分析,对分离到的高效聚磷菌进行鉴定。[结果]从污水和污泥中分离到9株有效聚磷菌,其中菌株J-12的聚磷能力最强。16S rDNA序列分析显示,J-12与节杆菌属的同源性达99%,结合生长特性、生理生化特性,初步确定该菌株属于节杆菌属的一个种（Arthrobacter sp.）,尚未见到具有高效聚磷作用的节杆菌的报道。研究表明,J-12在生长温度32℃,pH值7.0,微量元素液添加量为4ml的条件下,培养10h,可使合成废水中总磷由20.0mg/L降至0.1mg/L,聚磷率达95%以上。[结论]筛选到1株具有高效聚磷菌能力的节杆菌,在污水治理和水产养殖业中有着潜在的应用前景。     

桔小实蝇及其复合种研究进展

从桔小实蝇的分类、起源、传播、分布、寄主、生物学特性及对环境的适应性等方面,综述了国外和我国台湾地区桔小实蝇及其复合种的研究进展,以期为我国桔小实蝇及其复合种的研究提供参考。