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为了寻找操作简便、耗时短、成本低的适用于简单重复序列-聚合酶链式反应(SSR-PCR)试验的水稻基因组DNA提取方法,试验以3种类型的水稻样品(叶片、米粒、米粉)为材料,比较了十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法、试剂盒法、蔗糖法、碱法4种基因组DNA提取方法对水稻基因组DNA提取质量的影响.结果表明,CTAB法提取的叶片、米粒和米粉的基因组DNA含量最高,其次为试剂盒法提取的叶片、米粉和碱法提取的米粉的基因组DNA含量.通过4种方法得到的水稻基因组DNA纯度均不高,但不影响后续的SSR-PCR试验.SSR-PCR结果表明,CTAB法、试剂盒法和碱法提取的3种样品类型的水稻基因组DNA的扩增均表现出了良好的重复性.其中试剂盒法的提取成本最高,CTAB法耗时最长.整体而言,碱法是最适合水稻SSR-PCR试验的基因组DNA提取方法,且以米粉为提取材料时效果最佳. 相似文献
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采用6种方法对太湖底泥基因组DNA进行提取,利用琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度计测定和PCR扩增效果等反映DNA纯度和质量的指标,综合分析不同提取方法的优劣.结果显示,在提取过程中使用溶菌酶优于使用蛋白酶,冻融和TENP前处理过程耗时且效果不佳,二次沉淀在提高DNA纯度中起关键作用.结果表明,溶菌酶-SDS-二次沉淀法是一种适用于太湖底泥基因组DNA的提取方法,提取的DNA质量好、纯度高,更胜于包括土壤DNA快速抽提试剂盒在内的其他5种方法,可直接用于对DNA质量要求较高的后续试验中. 相似文献
3.
板栗基因组DNA几种提取方法比较研究 总被引:19,自引:0,他引:19
通过对板栗基因组DNA几种提取方法获得的DNA质量分析,表明改良SDS法是最为理想的提取方法,能满足RAPD及其他分子生物学研究的需要。 相似文献
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水稻基因组DNA提取方法的研究进展 总被引:3,自引:0,他引:3
水稻基因组DNA的提取方法主要有SDS法和CTAB法。在此基础上又提出了快速制备法、简易提取法、无需液氮研磨提取法、微量提取法等多种方法。从试验提取材料、方法等方面对以上各种方法的优缺点及应用范围进行了综述。 相似文献
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以枳壳(酸橙)叶片为试验材料,采用改良CTAB法、CTAB-硅珠法、SDS法、高盐低pH法和周世良法5种方法提取枳壳基因组DNA,并通过紫外分光光度计、琼脂糖凝胶电泳及SSR-PCR扩增3种检测方法比较DNA的提取效果,以期找到枳壳DNA的最佳提取方法.结果表明,5种方法中SDS法提取的DNA浓度最高(平均为900ng/μl),纯度最好(OD260/OD280平均值为1.90),且以SDS法提取的DNA为模板进行SSR-PCR扩增检测,目的条带清晰、亮度均一、稳定性和重复性好.因此,SDS法是枳壳DNA最佳提取方法,可用于分子检测试验. 相似文献
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天牛基因组DNA的提取方法 总被引:6,自引:0,他引:6
通过试验探索出3种可以快速、简便地从天牛干标本、液浸标本和新鲜标本中提取DNA模板的方法。对所获得的基因组扩增分析表明,经过PCR之后的DNA能呈现明显的多态性,同种天牛用同一引物扩增幼虫和成虫所获得的结果相同,可以认为,RAPD技术可以应用于天牛成虫干标本及幼虫浸渍标本的鉴定及系统发育研究中,也证明了这3种方法用于提取不同保存时间、不同种天牛基因组的DNA是切实可行的。 相似文献
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[目的]比较4种提取橡胶叶基因组DNA方法,为后续研究根据需要采用不同的DNA提取方法提供依据。[方法]分别采用TIANGEN新型植物基因组DNA提取试剂盒提取法、E.Z.N.A.TMHigh Performance(HP)Plant DNA Kit提取法、CTAB法、改良的CTAB法提取橡胶基因组DNA,通过紫外分光光度计测定不同方法所提取DNA的纯度和浓度,并通过电泳和酶切检测。[结果]采用改良的CTAB法提取的橡胶基因组DNA纯度最高,质量最好;采用其他方法所得的基因组DNA均有不同程度的多糖多酚以及蛋白的污染。[结论]采用改良的CTAB法所提取的橡胶基因组DNA因其完整性好、浓度高、纯度高可用于对DNA质量要求高的试验中。若是后续研究对DNA质量要求不高,则可以选择试剂盒,省时省力。 相似文献
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提取大白菜基因组DNA的几种方法比较 总被引:5,自引:0,他引:5
对用SDS法、尿素法、改良SDS法、氯化苄和CTAB法提取的大白菜基因组DNA进行了比较,结果表明,改良SDS法提取的DNA具有典型的天然DNA分子的标准紫外吸收光谱特点,其A20/A280为1.7-1.9,A260/A230为1.8-2.0,叶片的DNA产量为400μg/g。用该法提取的大白菜DNA适于进行RAPD分析。 相似文献
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快速提取籽用南瓜基因组DNA方法的研究 总被引:2,自引:0,他引:2
为快速高效提取作物基因组DNA,以南瓜品种为试材,对籽用南瓜基因组DNA的快速、高效提取方法进行研究,并对产物进行紫外分光光度计和琼脂糖凝胶电泳分析。结果表明:通过对CTAB改良后提取的基因组DNA结构较完整,杂质较少,浓度较高,可经纯化直接用于进一步的PCR等分子生物学研究。 相似文献
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猕猴桃基因组DNA不同提取方法的研究 总被引:8,自引:0,他引:8
4种经优化的DNA提取方法即CTAB区室法、SDS区室法、CTAB常规法、SDS常规法提取猕猴桃嫩叶基因组DNA,效果均好。经综合对比分析,本实验认为CTAB常规法是适于AFLP分析最佳的提取方法,因其步骤简单、快捷,得到的基因组DNA降解少、杂质含量少,能获得高质量的DNA模板。通过对所得到的基因组DNA模板进行AFLP分析,得到了清晰的DNA指纹图谱。 相似文献
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SDS法提取石斛基因组DNA的研究 总被引:1,自引:0,他引:1
以密花石斛(Dendrobium densiflorum Lindley ex Wallich)为研究试材,对植物SDS方法提取基因组DNA中的若干影响因子诸如药品、试剂配制方法、DNA取材部位、蛋白质去除次数、DNA析出时间、提取样品水浴时间等进行了比较分析。结果表明:不同的SDS缓冲液配制方法提取效果差异较大,Wang's配方产率及纯度都较高;石斛花苞的DNA提取产率较叶片高,但纯度较叶片低;提取过程中,适宜的水浴时间当为30~40min,过短DNA产率下降,过长会引起DNA的降解,或最后产物中增加其他杂质;氯仿/异戊醇抽提次当为2~3次,对去除DNA中蛋白质、多糖及其它杂质有一定的作用,过多则DNA损失也明显;异丙醇沉淀时间10min时核酸析出量在80%以上,纯度相对较高,继续沉淀的产物中DNA含量及纯度明显变低,同时采取挑取絮状沉淀或再用无水乙醇纯化10min的方法,可减少蛋白质、多糖等其它杂质的影响。 相似文献
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以桃小食心虫(Carposina niponensis Walsingham)为材料,分别采用CTAB法,冰KAc法,SDS-PK法和试剂盒法提取桃小食心虫的基因组DNA.通过电泳、紫外光谱分析和ISSR-PCR扩增等检测手段,比较分析了DNA纯度.结果表明:CTAB法和SDS-PK法提取的DNA质量明显优于冰KAc法和试剂盒法,适用于PCR扩增.与其他方法比较,SDS-PK法提取的DNA经过PCR扩增后得到的多态性位点最多.因此,SDS-PK法是实验室提取桃小食心虫基因组有效、经济实用的方法. 相似文献
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稻飞虱基因组DNA提取方法的比较 总被引:1,自引:0,他引:1
以褐飞虱(Nilaparvata lugens Stal)为材料,分别采用SDS法,CTAB法,冰KAc法和饱和NaCl法提取褐飞虱的基因组DNA。通过电泳、紫外光谱分析和ISSR-PCR扩增等检测手段,比较分析了DNA数量与质量。结果表明: CTAB法和SDS法提取的DNA质量明显优于冰KAc法和饱和NaCl法,适于PCR扩增。并且SDS法提取的DNA经过PCR扩增后得到较多的多态性位点。因此,SDS法是实验室提取稻飞虱基因组有效,经济实用的方法。 相似文献