DNA分子标记技术及其在小麦育种及遗传研究中的应用

本文介绍了几种常用的DNA分子标记,如RFLP、RAPD、AFLP、SSR、STS、SNP等,并简要综述了分子标记技术在小麦遗传育种研究中的应用现状,包括基因标记与定位、遗传图谱构建、外源染色体鉴定与标记、种质资源鉴定和辅助育种等。     

分子标记技术及其在植物营养性状基因研究中的应用

常用的分子标记技术主要包括 RFL P、AFL P、RAPD等。利用分子标记技术已经构建了许多作物的分子遗传图谱。植物营养性状一般是多基因控制的数量性状 ,其遗传机制采用传统的方式很难研究 ,而应用分子标记技术并利用有关的分子图谱则可以对这些复杂的数量性状进行比较方便的研究。由于起步较晚 ,分子标记技术在植物营养性状中的应用还不太普遍 ,主要集中在植物耐低养分胁迫和耐矿质元素毒害等几方面。本文介绍了主要分子标记技术的基本原理 ,利用分子标记进行数量性状基因定位的一般方法 ,分子标记在植物营养学研究中的应用和展望。     

分子标记技术及其在植物营养性状基因研究中的应用

常用的分子标记技术主要包括RFLP、AFLP、RAPD等。利用分子标记技术已经构建了许多作物的分子遗传图谱。植物营养性状一般是多基因控制的数量性状，其遗传机制采用传统的方式很难研究，而应用分子标记技术并利用有关的分子图谱则可以对这些复杂的数量性状进行比较方便的研究。由于起步较晚，分子标记技术在植物营养性状中的应用还不太普遍，主要集中在植物耐低养分胁迫和耐矿质元素毒害等几方面。本文介绍了主要分子标记技术的基本原理，利用分子标记进行数量性状基因定位的一般方法，分子标记在植物营养研究中的应用和展望。     

DNA分子标记技术在小麦遗传育种中的应用综述

在简述DNA分子标记的种类和特点的基础上,综述了分子标记技术在小麦遗传育种研究中主要应用于遗传图谱构建、基因标记和定位、品种鉴定和指纹图谱绘制、物种亲缘关系和遗传多样性研究及分子标记辅助育种等方面的现状,并对分子标记技术的发展和应用前景进行了展望。     

DNA分子标记技术在印楝研究中的应用进展

总结了国内外有关DNA分子标记技术在印楝研究中的应用情况。对RAPD、AFLP、SSR等DNA分子标记技术分别在印楝的遗传多样性、基因流和异交率的测定、体细胞无性系变异方面进行详细的叙述,并指出了DNA分子标记技术在印楝中的发展方向。     

分子标记技术在杉木研究中的应用

综述了分子标记技术在杉木种质资源鉴定、群体遗传多样性研究、遗传连锁图谱构建和数量性状位点(QTL)定位及分子标记辅助选择育种等方面的应用进展,指出目前该方面研究存在的问题,并展望了分子标记技术在杉木研究中的应用前景     

91份俄罗斯玉米自交系的遗传多样性分析

为了有效提高俄罗斯玉米种质资源的利用效率,拓宽黑龙江省玉米自交系的遗传基础,利用SSR分子标记技术研究91份俄罗斯玉米自交系的遗传多样性,并对其进行聚类分析。结果表明,50个多态性SSR标记共检测到248个等位基因,平均4.96个;位点多态性信息指数(PIC)平均为0.67,表明俄罗斯玉米自交系的遗传多样性较为丰富。聚类分析(邻近法)结果将俄罗斯玉米自交系划分为8个类群,类群I占25.27%,兰卡斯特和瑞德群各占20.88%,旅大红骨和塘四平头分别占13.19%和9.89%;类群II、类群III和P群分别占4.40%、3.30%和2.20%。俄罗斯玉米自交系类群I种质资源较为丰富,可能与光温不敏感特性有关。在遗传多样性分析基础上,利用11个SSR标记构建了91份俄罗斯玉米自交系特异分子身份证,为黑龙江省玉米杂种优势利用及育种实践提供了科学依据。     

菠菜转录组SSR位点分析及其分子标记的开发

简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记具有多态性高、重复性好、共显性等特点,己广泛用于蔬菜作物遗传育种研究中.本研究利用MISA软件对菠菜(Spinacia oleracea)转录组SSR位点信息进行分析,开发适用于菠菜的SSR分子标记,并对不同菠菜材料的遗传多样性进行分析.结果显示,在获得的44 796条基因簇(Unigene)中检测出2 045个SSR位点,检测出2 045个SSR位点,分布在1 940条Unigene上,发生频率为4.33％,平均距离为19.81 kb.菠菜SSR中以单、三、四核苷酸重复为主,分别占总SSR的19％、65％和7％,重复长度主要为18～24 bp,占菠菜总SSR的93.55％,以重复次数6次和7次为主,分别占菠菜总SSR的31.42％和31.05％.菠菜转录组中单核苷酸重复类型为A/T,二核苷酸重复主要为GA/TC和AG/CT,三核苷酸重复主要以CAA/TTG、GTT/AAC、GAA/TTC、TGT/ACA和GAT/ATC为主.本研究共设计了2 199对SSR特异位点引物,随机挑选218对引物对9个不同类型的菠菜材料进行扩增检测,其中38对表现出多态性.利用UPGMA做图进行聚类分析,9份菠菜材料聚为3类.本研究通过对菠菜转录组SSR位点信息分析及其分子标记的开发,获得了多态性较为丰富的SSR位点,为菠菜遗传多样性的分析、遗传图谱的构建及分子标记辅助育种提供了基础资料.     

杜鹃分子标记的研究进展

文章对近年来杜鹃分子标记的研究工作进行了梳理和总结,综述了ISSR、AFLP、RAPD、SSR及SRAP等分子标记在杜鹃的应用,并展望应用前景和提出了建设性意见,为日后开展杜鹃品种鉴定及遗传多样性分析、分子标记辅助育种、构建统一的分类系统及分子标记研究等提供参考依据。     

我国“应县小黑豆”对SCN4号生理小种抗性的SSR及ISSR分子标记研究

本研究以"应县小黑豆"×"晋豆23"杂交组合F2群体为材料,用塑膜钵柱法进行抗性鉴定,利用分离体分组分析法(BSA)结合SSR和ISSR标记技术对抗性基因进行分子标记筛选和定位,旨在实现大豆孢囊线虫抗性育种中亲本和杂交后代的分子标记辅助选择.筛选到2个与抗SCN基因座位连锁的分子标记Satt038和ISSR811.Satt038片段含180bp和185 bp,为共显性标记,在F2群体中的分离比为121;ISSR标记ISSR811为显性标记,片段长350bp,F2群体分离比为13.2个标记在F2群体中呈孟德尔式遗传.通过JOINMAP分析,微卫星标记Satt038、ISSR标记ISSR811与抗SCN基因座位的遗传距离分别为26.9cM和10.2 cM.还探讨了分子标记Satt038和ISSR811用于大豆抗SCN育种进行分子标记辅助选择的可能性.     

微卫星标记在鱼类遗传及育种研究中的应用

微卫星标记在鱼类遗传多样性、种群遗传结构分析、基因组作图等方面的研究中发挥着较大的作用,并逐渐应用到鱼类分类、亲本鉴定及资源保护与育种等工作中。     

不同生态区谷子品种表型鉴定及SSR遗传多样性分析

为了明确不同生态区谷子品种的遗传多样性和遗传结构,本研究对175份来源不同的谷子品种进行29个表型性状鉴定和36对简单序列重复（SSR）标记分析。结果表明,谷子数量性状的平均遗传多样性指数最高,质量性状最低;不同类性状中,单穗码数、开花至成熟日数和粒色遗传多样性指数最高,分别为2.082 8、2.012 5和1.078 7。36对SSR引物中,共检测到401个等位基因,平均11.4个,Shannon指数和多态性信息含量（PIC）平均为2.017 2和0.810 6;标记B142、B225的Shannon指数和PIC值最高,是评价谷子遗传多样性的理想SSR标记。不同生态区表型和SSR标记多样性比较结果表明,春谷中晚熟区（ML）遗传多样性指数最高,春谷早熟区（EM）次之,夏谷区（SS）最低;春谷中晚熟区谷子品种有10个性状指标最高,且全生育期最长。春谷中晚熟区不同类型材料中,汾阳的质量性状遗传多样性指数和SSR标记Shannon指数均最高,长治数量性状遗传多样性指数最高,太原Ⅱ的生育期遗传多样性指数最高;不同类型材料间差异较低,其中7个数量性状指标差异未达显著水平;汾阳的株高最高,出谷率最...     

Inferences for genotyping error rate in ancestry identification from simple sequence repeat marker profiles

Genotyping errors can cause difficulties in a variety of scientific analyses including enetic mapping of diseases, ancestry identification, and gene environment interaction etection. This work develops maximum likelihood approaches to estimating genotyping rror rates in the context of calculating ancestry probabilities from simple sequence epeat (SSR) marker profiles. The likelihood function is based on the probabilities for bserved alleles at each marker locus given ancestral genetic profiles. Simulations are sed to demonstrate and evaluate the likelihood approach to inferences. Simulation results ndicate that the quality of inferences is impacted by the relationship (parents or randparents) of the closest ancestors. We apply the methods to a data set of maize SR marker profiles provided by Pioneer Hi-Bred International, Inc. where the results ndicate a low error rate.     

我国部分冬小麦新品种（系）SSR标记遗传差异的研究

本研究利用53对SSR引物对全田1999－2000年北方冬麦区及黄淮冬麦区观察圃中选出的48个新品种（系）进行遗传差异研究，共检测出58个SSR位点上的367个等位变异，平均每个位点有6.33个等位变异，其中B组每个位点的等位变异最多，这表明B基因组化更快，分化更大。48个品种（系）在全基因组及A、B、D基因组聚类结果表明这些品种的相似系数聚类的范围较小，为0.75－0.98。全基因组聚类结果与品种的系谱来源及育成地区相吻合。研究结果表明我国冬小麦品种的种质基础相对较狭窄。加强不同来源种质的利用和特异亲本类型的培育对我国冬小麦遗传改良非常重要，利用5个多态性高的SSR标记就可以将这48个小麦新品种（系）区分开，每个品种（系）都有各自独特的指纹图谱。     

寒兰株系间遗传多样性和亲缘关系的SSR分子标记分析

本研究筛选了从春兰和莲瓣兰中开发的7个SSR位点的引物,用于37个寒兰株系的遗传多样性和亲缘关系研究。研究结果表明,7个SSR位点的引物在寒兰中均具有非常好的通用性,而且每个位点在不同的株系中具有特有等位基因,特别是位点CSSR05、CSSR11和195。株系具有的特有等位基因可以用于株系鉴别。7个位点在寒兰株系间具有...     

Assessing genetic diversity of Polish wheat (<Emphasis Type="Italic">Triticum aestivum</Emphasis>) varieties using microsatellite markers

Fifty-three wheat cultivars have been genotyped using 24 SSR (simple sequence repeat) markers in order to evaluate genetic similarities among Polish wheats, i.e. 53 spring and winter cultivars; ‘Chinese Spring’ was taken as reference. ll but one SSR marker allowed to identify DNA polymorphisms, giving in total 166 alleles (including nulls), from 3 to 13 alleles per marker with mean of 7.22. Based on marker data, genetic similarities were calculated and a dendrogram was created. ‘Spring’ cultivars were less diverse than winter ones, showing the biggest similarity to ‘Chinese Spring’. Four sister cultivars (Nutka, Tonacja, Zyta and Sukces), formed a cluster of very similar materials, of which Zyta and Sukces had the highest similarity indices. Parental lines Jubilatka and SMH 2182 were more distant from each other (genetic similarity of 0.227). It was possible to differentiate all the wheats using only four SSR markers: Xgwm186, Xgwm389, Xgwm459 and Xgwm577.     

Comparison of genetic variation among accessions of <Emphasis Type="Italic">Aegilops tauschii</Emphasis> using AFLP and SSR markers

Genetic diversity of 54 accessions of Aegilops tauschii from five countries was assessed using sequence-tagged microsatellites (or simple sequence repeats, SSRs) and amplified fragment length polymorphisms (AFLPs). In the case of AFLP analysis, a total of 256 amplification products obtained, 234 of them were polymorphic across all the 54 accessions. A total of 224 fragments were obtained from the 24 SSR primers and 219 of fragments were polymorphic across all the genotypes screened. Based on both AFLP and SSR markers, the highest percentage of polymorphisms were obtained in Iranian and accessions of unknown origin. The highest polymorphic information content (PIC) value was observed for SSRs (0.82) while the highest marker index (MI) value was for AFLPs (8.5) reflecting the hyper-variability of the first and the distinctive nature of the second system. Principal co-ordinate analysis (PCO) revealed congruent patterns of genetic relationships for both data sets, but did not group accessions strictly according to their geographical origins. Poor correlation was found between AFLP and SSR marker loci. This low association may be due to low number of AFLP and SSR markers. These results show that molecular markers can help to organize the genetic variability and expose useful diversity for breeding purposes.     

基于EST-SSR标记的MCID法鉴定冬瓜种质资源

种质资源鉴定是研究与利用冬瓜种质资源的基础。为了明确冬瓜种质资源遗传多样性,本研究基于表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)分子标记的人工绘制品种鉴别示意图(MCID)法鉴定40份冬瓜种质资源。利用筛选出的7对引物对冬瓜种质资源进行PCR扩增,应用MCID法构建冬瓜品种鉴定图。结果表明,利用7对引物扩增的特征性谱带能够将冬瓜品种在分子水平上区分开,同时能够构建40份冬瓜种质资源的品种鉴定图。利用Ntsys2.10e软件进行聚类分析,在遗传相似系数0.77处,将冬瓜资源分为3个类群。品种鉴定图能够快速地找到区分品种的引物,比聚类图更加直观。基于EST-SSR标记的MCID法是一种有效的冬瓜资源鉴定方法。本研究对冬瓜资源鉴定具有重要意义。     

利用SSR对60个玉米自交系进行杂种优势群划分初探

用SSR对60个玉米自交系的DNA进行分子标记和杂种优势群划分研究。利用14对SSR引物在供试材料中检测出57个等位基因变异,每对引物检测等位基因2～7个,平均为4．07个,多态信息量变化范围为0．389～0．832,平均为0．692。自交系间遗传相似系数变幅为0．058～0．756,UPGMA聚类分析表明,供试自交系可分为五个类群。利用这14对具有较高多态性信息量的引物,可以对供试材料进行初步鉴定。