多位点序列分型技术在凝结芽孢杆菌菌株分类中的应用

本文通过16S rRNA基因和多位点序列分型(MLST)技术,对凝结芽孢杆菌不同菌株进行亲缘关系分析.试验选取国内具有代表性的15株凝结芽孢杆菌菌株,菌株纯化后提取基因组DNA,采用传统的16S rRNA基因分子鉴定和MLST技术相结合进行分析.其中MLST采用5个管家基因:adk、recF、sucC、rpoB和spo...     

甘肃部分地区奶牛乳房炎金黄色葡萄球菌的细菌多位点序列分型与毒力检测

为研究甘肃地区牛源金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的耐药情况、基因型总体结构特征及毒力因子的分布情况,从甘肃省东、中和西部3个地区的3个县市采集41头罹患临床型乳房炎奶牛的93份乳样,采用鉴别培养基分离纯化细菌.采用K-B法对分离株进行耐药性分析,常规PCR方法检测mecA抗性基因和14种常...     

禽源多杀性巴氏杆菌多位点序列分型研究

为了解国内禽源多杀性巴氏杆菌流行情况,对分离自18省份的84株多杀性巴氏杆菌采用荚膜多重PCR分型和多位点序列分型对其血清型和基因型进行鉴定。结果表明:禽源多杀性巴氏杆菌主要以血清A型为主,占96.4%(81/84);多位点序列分型可将禽源多杀性巴氏杆菌分为5种ST型,其中ST129为主要流行型,占94.0%(79/84)。本研究为我国禽源多杀性巴氏杆菌的流行病学监测和基因多样性提供了数据支持。     

牛支原体中国株的多位点序列分型

为了解中国牛支原体的流行趋势,本试验应用已经建立的牛支原体分型方法,将中国的15株牛支原体进行MLST分型,同时结合数据库中已有的11株中国株的ST型,分析牛支原体中国株的种群结构及进化关系。分型结果显示,15株分离株均获得一样的等位基因号及ST型;共计26株中国株分属于3个ST型,即R-ST10(16/26),RST33(9/26),R-ST34(1/26),而且彼此之间只有1个等位基因的差异,10型和33型之间的差异是rpoD基因,33型和34型之间的差异是danA基因;说明目前牛支原体中国株的种群结构相对单一,流行菌株相对稳定。     

MLST分型技术在链球菌属中的相关参数

MLST分型技术是一种基于核酸序列测定的基因分型方法,该方法对多个管家基因进行序列分析,通过不同管家基因的分型来确定最终的序列分型。论文介绍了MLST技术在无乳链球菌、停乳链球菌似马亚种、肺炎链球菌、化脓性链球菌和猪链球菌中的管家基因数目,引物序列和扩增片段大小,以期为微生物的分型奠定基础。     

鸡滑液支原体的分离鉴定与多位点序列分型

为明确国内鸡滑液支原体（Mycoplasma synoviae,MS）的流行情况,本研究在2016~2021年间,从山东、四川、河北等10省份共计分离到54株MS,通过多位点序列分型（multilocus sequence typing,MLST）方法对分离株进行基因分型,同时结合国内外的分离株信息,进一步分析了不同菌株间的进化关系。结果表明,54株MS分离株可分为9种ST型,分别是34、44、93、95、96、102、103、148、153,主要流行的ST型为ST34和ST93;按照进化关系可分为A-I 共9类,其中最主要的流行株为A类和E类。通过对国内外MS流行株进行遗传进化分析,可依据地域将其分为亚洲株、欧洲株、北美株和其他株,其中,中国分离株有独特的地域进化关系。本研究结果丰富了国内的MS流行病学数据,对防控与净化MS具有重要意义。     

一种副猪嗜血杆菌新型分型方法——多基因位点序列分型

副猪嗜血杆菌(Haemophilus parasuis,Hps)为革兰氏阴性菌,属于巴氏杆菌科嗜血杆菌属,是猪副猪嗜血杆菌病的主要致病菌.应用多基因位点序列分型技术对副猪嗜血杆菌进行分型,具有简便快速、重复性强、分辨率较高、所得数据标准等优点.并且还可通过互联网实现实验室间数据共享及比较.通过试验对多基因位点序列分型(MLST)技术的原理、方法及结果进行了阐述.以期为副猪嗜血杆菌的分型提供参考.     

牛源多杀性巴氏杆菌血清分型及毒力相关基因的检测研究

为确定新疆北疆部分地区疑似病例中分离的牛源多杀性巴氏杆菌（Pasteurella multocida,Pm）流行的血清型、ST型及毒力相关基因的分布情况,本研究以分离的17株牛源Pm为研究对象,采用荚膜多重PCR分型法、脂多糖多重PCR分型法（LPS-mPCR）、多位点序列分型法（MLST）及PCR方法检测17株Pm分离株的荚膜型、脂多糖型、MLST型及7类共25个毒力相关基因的分布情况。结果显示,13株Pm的荚膜脂多糖型为A：L3型,ST型均为ST1型,4株Pm荚膜脂多糖型为B：L2型,ST型均为ST44;17株Pm毒力相关基因（exbB、exbD、fimA、fur、hgbA、hsf2、nanB、oma87、ompA、ompH、plpB、psl、ptfA、sodA、sodC、tonB和tbpA）的检出率高达100%,toxA基因的检出率为0。结果表明,从新疆北疆部分地区规模化牛场疑似病例中分离的Pm主要血清型为A：L3：ST1型。     

细菌核心基因组多位点序列分型(cgMLST)与溯源评价

细菌分型与溯源对食品安全监管、流行病学调查具有重要意义.全基因组分型技术以全基因组多位点序列分型(whole genome multilocus sequence typing,wgMLST)、核心基因组多位点序列分型(core genome multilocus sequence typing,cgMLST)、全基因...     

2018—2019年我国部分地区猪肺炎支原体多位点序列分型

为了解我国猪肺炎支原体种群结构和进化关系，2018—2019年采集山东、广西、河南、江西、云南、天津、湖南等地猪组织样品1 242份，进行猪肺炎支原体荧光定量PCR和巢式PCR检测，并对测序确认的87份阳性样品，采用adk、rpoB、tpiA 3个管家基因作为分型参考进行多位点序列分型（MLST），并对3个管家基因均扩增成功的阳性样品进行p146基因分型，分析我国猪肺炎支原体种群结构，并结合pubmlst数据库公布的151个序列类型（ST）进行eBURST分析。结果显示：有24份阳性样品的3个管家基因全部扩增且测序成功，共分为10个ST，均为国内外首次报道；10个ST分为3个克隆复合体（CC）和4个独特型，其中ST128占41.7%（10/24），样品来自江苏、河南和广西，为本次检测的主要流行型。结果表明，我国猪肺炎支原体分布较广，具有一定的基因型独特性。本研究为我国猪肺炎支原体的流行病学数据库研究提供了新资料，有助于掌握国内猪肺炎支原体基因型分布情况，进一步完善了猪肺炎支原体流行病学数据库。     

乳房链球菌对克林霉素耐药基因的定位

采用试管稀释法和纸片法测定9株乳房链球菌对克林霉素的耐药性，通过PCR反应检测克林霉素的耐药性基因，并进行测序比较。发现克林霉素对乳房链球菌的抗菌活力较强，克林霉素耐药基因同时存在于乳房链球菌的染色体和质粒上。     

奶牛源乳房链球菌毒力与耐药性分析

乳房链球菌是导致奶牛乳房炎的主要病原菌之一,但近年来研究发现乳房链球菌也与奶牛子宫内的感染相关,导致子宫内膜炎的发生.采集甘肃省不同地区5个牧场患有子宫内膜炎奶牛的子宫黏液样品48份,共计分离得到18株乳房链球菌.然后通过CAMP试验来检测分离菌株的协同溶血作用,采用普通PCR检测10种已知毒力基因(hasA、hasB...     

乳房链球菌GAPC基因的克隆及原核表达

为了重组表达乳房链球菌表面脱氢酶GAPC基因,为免疫学研究提供目标蛋白,用PCR方法从石河子分离株的基因组DNA中扩增出GAPC基因,用T/A克隆法将其插入PBST载体,并构建原核表达载体pET-32a（＋）-GAPC。用BL21（DE3）/pET系统表达Trix-GAPC融合蛋白,SDS-PAGE和Western blot分析鉴定表达产物。结果表明,PCR扩增产物经测序,证实与GenBank中乳房链球菌（AF421900.1）GAPC的基因序列同源性为99%。SDS-PAGE显示,经IPTG诱导后BL21（DE3）/pET-32a（＋）-GAP总蛋白中出现一条分子质量为55ku的新蛋白带。Western blot分析显示,GAPC蛋白可与乳房链球菌多克隆抗血清发生特异性反应。该研究已成功表达了GAPC,为GAPC在细菌致病中作用的研究以及相关疫苗的制备奠定了基础。     

奶牛乳房炎性乳房链球菌GapC重组蛋白的免疫保护性研究

为研究奶牛乳房炎性乳房链球菌GapC蛋白的免疫保护性,本研究采用纯化后的GapC重组蛋白与免疫佐剂乳化后制备疫苗,免疫家兔后采用间接ELISA法检测抗体效价,并以小鼠为实验动物进行攻毒试验.结果显示,抗体效价高达1:128 000,GapC蛋白免疫组对乳房链球菌的保护率较高,达70％,而全菌体免疫组的保护率仅为30％,表明GapC蛋白具有很高的免疫原性,为奶牛乳房炎的预防控制和进一步研究有效疫苗提供实验依据.     

禽源结肠弯曲杆菌的耐药性分析与MLST分型

为了解禽肉结肠弯曲杆菌的耐药表型和分子型,采用琼脂平板稀释法和多位点序列分型(Multilocus Se-quence Typing,MLST)技术分别对54株禽肉结肠弯曲杆菌进行耐药性及分子分型研究。耐药性试验结果得到单重耐药菌株有41株(75.9%),分别是对环丙沙星耐药有9株(16.7%)、对强力霉素耐药有23株(42.6%)和对红霉素耐药有9株(16.7%);多重耐药菌株有10株(18.5%),其中4株(7.4%)对环丙沙星和强力霉素耐药,1株(1.9%)对环丙沙星和红霉素耐药,4株(7.4%)对红霉素和强力霉素耐药,1株(1.9%)对环丙沙星、红霉素和强力霉素耐药;所有菌株对硫酸庆大霉素敏感。MLST得到了38个(含1个新的)等位基因(allele);26个(含8个新的)序列型(Sequence type,ST);2个已知序列型克隆系(ST clonal complexes),ST-828克隆系(45株,83.3%)和ST-1150克隆系(3株,5.6%),以及5个(6株,11.1%)没有序列型克隆系。耐药性与序列型和序列克隆系相关性比较,相关性不大。结果提示,禽肉结肠弯曲杆菌出现了对环丙沙星、红霉素和强力霉素的单重及多重耐药菌株;禽肉中结肠弯曲杆菌主要流行ST-828克隆系;耐药性与序列型及序列克隆系相关性差,揭示耐药菌株来源广泛。     

乳铁素参与乳房链球菌对乳腺上皮细胞的粘附

免疫印迹试验表明，试验用的3株乳房链球菌（Streptococcus uberis)菌株均可与乳铁素（Lactoferrin)结合。培养基中加入乳铁素或乳清可以显著促进细菌与乳腺上皮细胞之间的粘附，抗乳铁素抗体可以特异性地抑制乳铁素或乳清预处理细菌与乳腺上皮细胞的粘附。乳铁素在细菌和细胞之间起着桥梁分子作用。有助于细菌与乳腺上皮细胞之间的粘附和乳腺感染的建立。     

副溶血弧菌海产品分离株及临床分离株的多位点序列分型

选取毒力调控基因toxRS和看家基因gyrB、recA作为靶基因,对浙江沿海地区40株副溶血弧菌海产品分离株与8株临床分离株进行多位点序列分型。toxRS的多态性位点比例(10.2%)虽低于gyrB(12.0%)与recA(25.4%),但与gyrB均可分辨出最多的序列型(38),具有最强的分辨力(0.986)。3个基因串联后可分出44个序列型,分辨力达0.994。副溶血弧菌分离株呈现出较大的多样性。各地的海产品分离株分布于A群、B群,而临床分离株则主要集中于A群;C群仅包括1个临床分离株。其中临床分离株C2、C5、C7与海产品分离株F24属于同一个序列型,由此可推测该序列型在地域上分布较为广泛并可引起人发生胃肠炎等。因而副溶血弧菌所引起的对公共卫生的潜在风险性不容忽视。     

The ability of four strains of Streptococcus uberis to induce clinical mastitis after intramammary inoculation in lactating cows

AIM: To compare the ability of four strains of Streptococcus uberis at two doses to induce clinical mastitis in lactating dairy cows after intramammary inoculation in order to evaluate their usefulness for future experimental infection models.

MATERIALS AND METHODS: Four field strains of S. uberis (26LB, S418, and S523 and SR115) were obtained from cows with clinical mastitis in the Wairarapa and Waikato regions of New Zealand. Twenty-four crossbred lactating cows, with no history of mastitis and absence of major pathogens following culture of milk samples, were randomly allocated to four groups (one per strain) of six cows. Each cow was infused (Day 0) in one quarter with approximately 10⁴ cfu and in the contralateral quarter with approximately 10⁶ cfu of the same strain. The other two quarters remained unchallenged. All four quarters were then inspected for signs of clinical mastitis, by palpation and observation of the foremilk, twice daily from Days 0–9, and composite milk samples were collected from Days 0–8 for analysis of somatic cell counts (SCC). Quarters were treated with penicillin when clinical mastitis was observed. Duplicate milk samples were collected and cultured on presentation of each clinical case and on Day 4 from challenged quarters with no clinical signs.

RESULTS: Clinical mastitis was diagnosed in 26/48 (54%) challenged quarters. Challenge with strain S418 resulted in more cases of mastitis (12/12 quarters) than strains SR115 (7/12), 26LB (6/12) or S523 (1/12), and the mean interval from challenge to first diagnosis of mastitis was shorter for S418 than the other strains (p<0.001). The proportion of quarters from which S. uberis could be isolated after challenge was less for strain 26LB (1/6) than SR115 (6/7) (p<0.05), and SCC following challenge was lower for strain S523 than the other strains (p<0.05).

CONCLUSIONS: There were significant differences between the strains in the proportion of quarters developing clinical mastitis, the interval to mastitis onset, SCC following challenge and the proportion of clinical cases from which S. uberis could be isolated. These results illustrate the difference in the ability of S. uberis strains to cause mastitis and the severity of the infections caused.

CLINICAL RELEVANCE: Experimental challenge models can be used to compare infectivity and pathogenicity of different strains of mastitis-causing bacteria, the efficacy of pharmaceutical products and host-responses in a cost-effective manner.