一种适于PCR检测病毒诱导基因沉默番茄植株的微量DNA提取方法

【研究目的】为了寻找一种适用于病毒诱导的基因沉默番茄叶片PCR检测的快速、简单、成本低的DNA提取方法。【方法】笔者根据PCR反应的要求,用改良的CTAB法,实现了微量番茄叶片基因组DNA的快速提取。【结果】提取基因组DNA所用的组织量虽少,所得的DNA经过电泳检测虽有降解,但足以用于PCR检测,以其作模板扩增中国番茄黄化曲叶病毒诱导的硫黄素酶(Su)基因沉默植株中病毒组分中的DNAmβ和1.7A,片段大小分别为500bp、1300bp。测序结果证明是相应基因的部分片段。【结论】该方法的材料不需要使用液氮,可以单人大批量提取,并在基因沉默的番茄植株中能稳定而准确的规模化PCR检测。     

茶叶多酚氧化酶的基因克隆

本试验以嫁接可可茶为材料,提取了高质量的茶树基因组DNA,以纯化的DNA为模板,利用FS和RX引物组合进行PCR扩增,结果扩增出了约1800bp的片段,与预期大小一致。所克隆的PPO基因与其它茶树PPO基因的同源性达到98％,氨基酸序列同源性达到91％,确认为茶叶多酚氧化酶基因。     

绵羊外周血中游离DNA提取及SRY基因检测

[目的]外周血中游离的DNA主要是指存在于血浆/血清等循环系统里的一些小片段DNA,应用在一些疾病的诊断以及非创伤性产前诊断方面.研究三种方法从绵羊外周血浆/血清中分离提取游离DNA,建立高效的外周血游离DNA提取方法,并对SRY基因进行PCR扩增.[方法]利用加热法、酚氯仿法以及试剂盒法对500 μL血浆/血清中游离的DNA进行提取.根据游离DNA片段大小的特点分别设计扩增产物大小为168 bp的检测引物和178 bp的SRY基因引物进行普通PCR检测.[结果]利用加热法、酚氯仿法、试剂盒法都提取到了游离的DNA,PCR后通过琼脂糖凝胶电泳检测到了168 bp的目的片段.同时利用PCR扩增到了178 bp的SRY基因目的片段.[结论]不同的提取方法均可有效提取分离绵羊外周血血清和血浆中游离的DNA片段,能够用于SRY基因的检测.     

信号芋螺基因组DNA提取方法的优化

高质量的基因组DNA的获取是芋螺毒素基因克隆及基因组文库构建的关键。笔者采用4种方法提取信号芋螺（Conus litteratus)的不同组织器官的DNA，并综合比较了各组DNA的浓度和纯度、DNA片段的大小和完整性。结果表明，由改良的DNA快速提取试剂盒法提取的DNA纯度和浓度较好；4种组织器官中，腹足纯度较高，是更合适的提取组织；肝胰脏和毒管获取的DNA产率最高，但片段完整性差，污染严重；PCR反应获得了跟预期大小一致的特异扩增产物。因此，信号芋螺基因组DNA的提取最佳方法为改良的DNA快速提取试剂盒法，提取部位为腹足组织，可以获得高质量的基因组DNA，且符合后续实验要求。     

枇杷核基因组DNA提取方法的改良及其SSR分析

[目的]获得高质量基因组DNA,探讨并改进快速提取枇杷基因组DNA的方法。[方法]比较了3种传统的基因组DNA提取方法并对CTAB法进行改良,同时以27对适用苹果属扩增的SSR特异引物,对15种枇杷品种和2个组合的杂交后代进行PCR扩增,分析品种扩增片断多态性构建聚类关系树,统计了杂种后代等位性位点。[结果]改良CTAB法所提取的DNA具有良好的质量;27对引物15个品种中扩增出33个多态性片段,用NTYST软件进行分析聚为6类;一个杂种杂交后代扩增出32条片段,确定22个等位位点。[结论]改良CTAB适合于快速提取枇杷基因组DNA,SSR在枇杷基因组中具有多态性。     

低盐固态发酵酱油生产过程中大豆DNA降解变化

为研究酱油生产过程中大豆DNA降解情况,为酱油生产不同阶段大豆转基因成分检测提供引物序列和检测方法,用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法提取大豆和蒸煮后大豆DNA,针对内源大豆凝集素基因和外源抗草甘膦基因设计引物进行PCR扩增;用试剂盒提取成熟酱醅、生酱油和酱油中的DNA,进行PCR扩增或巢式PCR扩增。结果表明,高温高压蒸料后大豆DNA片段长度降解到1 500 bp以下,发酵后的酱醅中检测不到500 bp左右大豆DNA片段。生酱油和成品酱油经大豆DNA提取和PCR扩增未见条带,用巢式PCR扩增可以检测到200 bp以下的内源基因、外源基因DNA片段。低盐固态发酵酱油生产过程中造成DNA片段长度降解的2个主要工艺是蒸煮和发酵,淋油过程去除了大量大豆DNA,成品酱油可用巢式PCR进行转基因成分检测。     

犬弓首蛔虫卵卵壳裂解方法研究

[目的]为犬弓首蛔虫卵壳的鉴定奠定基础.[方法]采用3种联合作用方法对犬弓首蛔虫卵壳进行裂解,提取虫卵基因组DNA,然后用犬弓首蛔虫的ITS2特异性引物进行PCR扩增.[结果]DNA提取试剂对虫卵卵壳的作用不明显,PCR扩增结果未见预期片段;冻融后抽提DNA对虫卵卵壳有一定作用,但大多数虫卵还保留基本形态,PCR扩增结果也未见预期片段;冻融15次+蛋白酶K消化2次过夜,然后抽提DNA,虫卵大多数被裂解,利用PCR扩增到目的片段.[结论]破坏犬弓首蛔虫卵的卵壳采用冻融+蛋白酶K消化的联合方式效果明显,关键因素是作用时间.     

一种快速、简便提取大豆油DNA的方法及转基因大豆油的检测

【目的】DNA的提取是GMO（Genetically modified organism）作物检测中重要步骤，DNA的质量关系到GMO检测的成败。【方法】本研究以大豆油为材料，探索出一种快速、简便的提取大豆油DNA的方法。【结果】该方法能从10 ml大豆油中提取0.4 μg高纯度DNA，可用于PCR检测。提取市场上出售的十几种精练大豆油的DNA, 针对 35S、Nos、EPSPS和Lectin 基因进行了PCR检测，分别扩增出不同的目的片段。【结论】大豆油中有残存的DNA碎片，在转基因大豆油中能扩增出外源基因的片段。本研究为大豆油的外源基因的检测提供了可行方法。     

一种适合于PCR扩增的真菌基因组DNA提取方法

以药用真菌灰树花和蛹虫草以及4种植物内生担子菌为材料,优化一种适用于PCR扩增的高质量基因组DNA提取方法.结果表明,采用改良SDS法提取药用真菌和植物内生担子菌基因组DNA的数量和质量都较为理想,A260/A280为1.8～1.9,DNA产量在110-170μg·g-1湿菌体.将提取的DNA作为模板PCR扩增rDNA ITS片段,扩增条带清晰,结果稳定、准确.该方法简便易行,成本低廉,适合富含蛋白质和多糖的真菌基因组DNA的提取.     

节杆菌基因组DNA提取方法的改良

[目的]研究比较了节杆菌的不同DNA提取方法,以获得高质量的基因组DNA。[方法]采用反复冷冻研磨、甲苯处理对细胞进行预处理,随后进行CTAB抽提,并与细菌基因组提取试剂盒进行比较。[结果]改良的CTAB法提取的DNA,纯化之后经电泳检测表明,基因组DNA条带清晰,量度均一,DNA片断大小一致;以上述DNA为模板进行PCR扩增,条带单一、特异性强,其中利用经甲苯方法提取的DNA快速、简便、经济实用,可作为PCR扩增的模板进行后续的基因操作和分子生物学研究。[结论]改良的CTAB法能够有效地提取节杆菌基因组DNA,纯度达到要求。     

一种适于PCR扩增的快速提取猪基因组DNA的碱裂解法

以大白猪背最长肌、脾脏、耳组织为材料,用碱裂解法和酚-氯仿法分别提取猪基因组DNA,用紫外分光光度计、琼脂糖凝胶电泳、PCR扩增检测DNA的产量和质量,结果发现2种方法提取的DNA产量没有明显差异。通过猪MC4R、TEF-1基因特异引物进行PCR扩增均能得到目的条带。碱裂解法提取的DNA原液稀释5倍、10倍后作为模板均获得了较为稳定的扩增产物。该结果表明,简单、快速、无毒的碱裂解法适用于动物定性PCR检测时DNA的提取。     

3种桑蟥基因组DNA提取方法比较研究

为了探寻一种高效、稳定、廉价的桑蟥基因组DNA提取方法,通过采用CTAB法、蛋白酶K法和盐析法3种方法研究桑蟥基因组DNA的提取。对提取的DNA进行分光光度值的测定以及COI基因的扩增鉴定。结果表明：3种方法均可以提取基因组DNA,蛋白酶K法和CTAB法DNA获得率优于饱和NaCl法提取的DNA,3种方法提取的DNA都可用于PCR扩增实验。因此,在实际工作中可根据实验目的、条件选取最适合的方法。     

青蒿组织中快速有效DNA提取方法的研究(英文)

[Objective] The objective of this study is to explore a rapid and efficient method of extracting genomic DNA from Artemisia abrotanum. [Method] Three methods of Cutting [Method],Liquid Nitrogen [Method] and Quartz Sand [Method] based on SDS method were employed to extract Artemisia abrotanum genomic DNA from tender leaf at seedling stage,tender spike and old leaf at heading stage. The obtained DNAs were detected by absorbance detection,agarose gel and PCR amplification. [Result] Cutting [Method] performed better than the other two methods compared in purity,extracting cycle and cost,accordingly more suitable for PCR amplification. The results also show that young spike is the best material for extracting genomic DNA from Artemisia Annua.     

An Improved Method of Extracting Artemisia abrotanum Genomic DNA

[Objective] The objective of this study is to explore a rapid and efficient method of extracting genomic DNA from Artemisia abrotanum. [Method] Three methods of Cutting [Method],Liquid Nitrogen [Method] and Quartz Sand [Method] based on SDS method were employed to extract Artemisia abrotanum genomic DNA from tender leaf at seedling stage,tender spike and old leaf at heading stage. The obtained DNAs were detected by absorbance detection,agarose gel and PCR amplification. [Result] Cutting [Method] performed better than the other two methods compared in purity,extracting cycle and cost,accordingly more suitable for PCR amplification. The results also show that young spike is the best material for extracting genomic DNA from Artemisia Annua.     

青蒿组织中快速有效DNA提取方法的研究

[目的]探索适合于快速有效的提取青蒿DNA的方法。[方法]以青蒿苗期幼叶、抽穗期幼穗及抽穗期老叶为材料,采用剪碎法、石英法及液氮法等3种方法提取DNA,并进行吸光度检测、琼脂糖电泳及PCR扩增以检测DNA提取效果。[结果]剪碎法提取的DNA纯度较高,适合于PCR扩增,同时节省了时间和成本。试验结果还表明,青蒿的抽穗期幼穗更适合于提取DNA。[结论]剪碎法是一种适合于提取青蒿DNA的快速有效的方法。     

An Improved Method of Extracting Artemisia abrotanum Genomic DNA

[Objective] The objective of this study is to explore a rapid and efficient method of extracting gonomic DNA from Artemisia abrotanum. [Method] Three methods of Cutting Method, Liquid Nitrogen Method and Quartz Sand Method based on SDS method were employed to extract Artemisia abrotanum genomic DNA from tender leaf at seedling stage, tender spike and old leaf at heading stage. The obtained DNAs were detected by ahsorbance de-tection, agarose gel and PCR amplification. [Result] Cutting Method performed better than the other two methods compared in purity, extracting cycle and cost, accordingly more suitable for PCR amplification. The results also show that young spike is the best material for extracting genomic DNA flora Artemis-ia Annua.     

玉米SSR分子标记技术操作规程的优化

[目的]建立玉米SSR标记技术操作规程,为其在生产中应用提供参考。[方法]以2个玉米杂交种(黔单16号、西山99)和4个玉米自交系(苏37、交51、黄C、4011)为试材,从玉米中提取基因组DNA,分别对不同DNA提取方法、SSR反应体系、PCR扩增程序和银染方法进行比较。[结果]采用SDS法、CTAB法提取DNA的扩增效果较好。玉米的最佳SSR反应体系为:1U Taq酶,1×Bufer,60ng模板DNA,2.0 mmol/LMg2+,0.15 mmol/LdNTPs,0.3μmol/L引物。最佳SSR扩增程序为:93℃,1 min;93℃,1 min;60℃,2 min;72℃,2 min,30个循环;72℃,5 min。用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶或6%变性聚丙烯酰胺凝胶来检测玉米SSR标记较好。[结论]采用优化的SSR标记检测体系,对贵州51份玉米杂交种进行遗传多样性分析,大多数引物扩出清晰条带。     

青蒿组织中快速有效DNA提取方法的研究

传统的CTAB法成本高、毒性较大且操作繁琐,往往仅在需DNA量较大的RFLP等分析中采用。SDS提取的DNA产率接近CTAB产率的2倍,但纯度、完整性不如后者。常用的植物DNA简易提取方法有碱处理法及高温水煮法等。这些简易提取方法大都速度快、成本低,但提取DNA质量差、保存时间短、不适于PCR扩增。该文以SDS法为依据,在此基础上比较了3种方法的提取效果,从而摸索出一种快速有效的提取青蒿DNA的方法（以下简称“剪碎法”）。     

转TGEV-S基因玉米中目的基因的PCR检测及优化

为提高转基因玉米中目的基因的检出效率,以猪传染性胃肠炎病毒纤突糖蛋白（TGEV-S）转基因玉米为材料,利用PCR方法检测样品中的目的基因.通过对PCR反应体系中4种不同DNA聚合酶和8种退火温度进行比较,建立和优化了转基因玉米中TGEV-S基因的PCR检测方法.对450株转基因玉米叶片DNA和种子DNA中的TGEV-S基因片段进行检测,并设计33对引物检测插入转基因玉米基因组DNA中的质粒pBAC9020DNA片段.结果显示,LA Taq酶对叶片DNA和种子DNA中TGEV-S片段的PCR扩增敏感性和特异性均优于其他Taq聚合酶,且退火温度为53～55℃时扩增效果较好.分别对450份转基因玉米叶片DNA和种子DNA检测结果显示阳性率分别为82.5％和76.3％.利用33对引物进行的PCR扩增及测序结果显示质粒pBAC9020基因片段已全部插入该玉米基因组DNA中.本试验建立的转TGEV-S基因玉米PCR检测方法敏感性和特异性高,为转基因玉米阳性植株的检测奠定了坚实的基础.     

三种天然橡胶树DNA提取方法的比较研究

为获得能适用于普通PCR反应的橡胶基因组DNA,以橡胶树叶片为材料,分别采取CTAB法、SDS法及盐析法提取基因组DNA。并通过琼脂糖凝胶电泳、限制性内切酶酶切对3种方法提取的DNA样品进行检测。将它们在DNA产量、质量等方面进行比较,结果表明CTAB法DNA提取率高于SDS法和盐析法;由CTAB法提取的橡胶树基因组DNA能完全酶切,能满足PCR等后续分子生物学研究的需要。