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应用微卫星标记对12个中国地方乌骨鸡品种遗传多样性的研究 总被引:9,自引:11,他引:9
利用27个微卫星DNA标记对12个地方乌骨鸡品种进行遗传多样性分析,通过计算等位基因频率、多态信息含量、杂合度、有效等位基因数和遗传距离,评估各品种内遗传变异和各品种间遗传相关,并根据遗传距离对12个鸡品种进行了聚类分析。结果表明,各乌骨鸡群体的遗传多样性较为丰富,并具有较高的选择潜力。平均杂合度最高的是竹乡鸡,为0.670;最低的是江山乌骨鸡,为0.581。27个微卫星标记中4个为中度多态座位,1个低度多态座位,22个为高度多态座位;LEI0234与LEI0192分别检测到了10.3与12.2个等位基因。以标准遗传距离为准,遗传距离最近的为沐川乌骨鸡与略阳鸡,为0.1002,而乌蒙乌骨鸡与略阳鸡最远,为0.2546。通过UPG—MA法聚类后,略阳鸡、沐川乌骨鸡、兴文乌骨鸡、盐津乌骨鸡、竹乡鸡首先聚为1类,江山乌骨鸡、郧阳白羽乌鸡、余干乌骨鸡聚为1类;金湖乌凤鸡、丝绒乌骨鸡和丝毛乌骨鸡聚为第3类;乌蒙乌骨鸡独为一类。 相似文献
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5个山羊品种的遗传结构及多样性研究 总被引:1,自引:0,他引:1
用25个微卫星标记,对5个山羊品种进行遗传多样性分析。共检测到199个等位基因,并进行哈代-温伯格平衡检验,5个群体基本处于遗传不平衡状态。在25个座位中,除BMS1943在罕山白绒山羊上(PIC为0.493)表现为中度多态外,其余座位均为高度多态。以等位基因为基础,得出座位的平均杂合度为0.436-0.820之间,群体平均杂合度在0.592-0.738。对各微卫星标记进行F-统计分析,Fst的变化范围是从BMC1206的0.011到BMS1943的0.078;群体每代迁移数在2.972-23.115,平均值为8.884。计算了遗传分化系数,结果表明群体间变异程度不高。内蒙的罕山白绒山羊和乌珠穆沁绒山羊有较大的基因流值(15.753),说明其交流比较活跃。计算了共祖遗传距离,并进行了UPGMA和NJ聚类分析,内蒙的罕山白绒山羊和乌珠穆沁绒山羊聚到一起。 相似文献
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甘肃高山细毛羊优质毛品系15个微卫星位点的遗传多样性分析 总被引:2,自引:0,他引:2
研究对甘肃高山细毛羊优质毛品系的15个微卫星位点进行了遗传多样性检测.计算了各位点的等位基因频率(P)、杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(Ne).结果表明:15个微卫星位点中有1个未检测到多态,其余14个均表现出高度多态性.多态性标记在该群体中的平均等位基因数为10个,平均多态信息含量PIC=0.83,平均杂舍度H=0.85,平均有效等位基因数Ne=7.1.说明甘肃高山细毛羊优质毛品系的遗传多样性丰富,遗传变异程度较高,基因一致度较差,变异性较大,具有较大的选择潜力.这14个位点可以作为有效的遗传标记,用于甘肃高山细毛羊优质毛品系遗传多样性分析及其与各生产性状的相关性研究. 相似文献
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8个微卫星位点在甘肃高山细毛羊肉毛兼用品系中的遗传多样性研究 总被引:2,自引:1,他引:2
利用8个微卫星位点对甘肃高山细毛羊肉毛兼用品系进行遗传检测,计算了等位基因频率、有效等位基因数、群体杂合度和多态信息含量。结果表明,位点BM3501的有效等位基因数、群体杂合度和多态信息含量都最高(Ne=7.30,H=0.866,PIC=0.848);位点BM3413的有效等位基因数、群体杂合度和多态信息含量都最低(Ne=2.33,H=0.573,PIC=0.478);8个微卫星位点在甘肃高山细毛羊肉毛兼用品系中多态性丰富,除位点BM3413表现为中度多态外,其余位点均表现为高度多态。因此,甘肃高山细毛羊肉毛兼用品系遗传杂合度较高,遗传多样性丰富,选择余地较大;8个微卫星位点可用于甘肃高山细毛羊肉毛兼用品系遗传多样性评估,并可用于对其羊毛性状和肉用性状的进一步研究。 相似文献
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用凉山半细毛羊 8个父系半同胞家系群体作为资源参考家系研究了该品种基因组第 1号染色体上的 13个微卫星(Microsatellite)标记的等位基因频率、多态信息含量 (PIC)、杂合度 (Heterozygosity)和用这些标记进行亲子鉴定和系谱确证的能力 ,并进行了不同世代和家系间遗传信息比较研究 ,在此基础上建立了该染色体的遗传连锁图 ,为估计凉山半细毛羊第 1号染色体上的重要经济性状QTL奠定了基础。结果表明 ,凉山半细毛羊 1号染色体上的 13个标记的等位基因数 ,基因频率和基因杂合度 ,PIC等在不同性别间差异不显著 ,不同世代和不同家系间有显著差异。 相似文献
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凉山半细毛羊横交群重要经济性状遗传率及其相关分析 总被引:1,自引:0,他引:1
本文用父系半同胞组内相关法估计了凉山半细毛羊横交群初生重,断奶重,育成重,成年重,断奶毛长,育成毛长,成年毛长和成活毛量遗传率分别为0.153、0.220、0.283、0.562、0.250、0.363、0.409和0.384。体重,毛长和成年污毛量之间存在正遗传相关或表型相关,在它们之间可以进行早期或间接选择。 相似文献
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利用10个微卫星标记对新疆13个绵羊群体的遗传多样性和遗传分化进行了分析。通过计算多态信息含量(PIC)、平均杂合度(H)、群体内近交系数(Fis)、遗传分化系数(Fst)、总群体近交系数(Fit)和基因流(Nm)等参数,评估各品种遗传多样性和品种间遗传分化。结果表明:13个绵羊群体10个微卫星标记的平均多态信息含量为0.6803;平均杂合度为0.7192,其中中国美利奴羊平均杂合度最高为0.7530,山区和田羊最低为0.6754;13个绵羊群体总近交系数为0.1066,群体内近交系数为0.0565,群体间基因分化系数为0.0531,说明5.65%的遗传变异来自群体间,94.35%的遗传变异来自群体内个体间的差异;基因流Nm平均值为4.4621(3.0808~7.4589),说明各种群间存在或者在过去某个时期发生基因交流;各种群间平均遗传距离较低,为0.1702,平均遗传一致度数值较高,为0.8448,也再次证明了新疆13个绵羊群体间分化程度不高。基于Nei′s标准遗传距离运用UPGMA聚类法获得的新疆13个绵羊群体的聚类图与其品种育成史和地理分布基本相一致。 相似文献
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《畜牧与兽医》2014,(7):37-40
采用平均信息与期望最大结合约束似然法用不同混合动物模型估计贵州半细毛羊的生长性状遗传参数,并采用赤池信息量准则(AIC)指数对不同模型进行比较。各模型中均包含固定效应、随机效应和残差效应。不同模型对随机效应做了不同的考虑:模型1中随机效应包括个体加性遗传效应、模型2中包括个体加性遗传效应、母体遗传效应;模型3中包括个体加性遗传效应、永久环境效应。各模型估计的初生重遗传力为:0.208 90.380 2;断奶重遗传力为:0.253 60.380 2;断奶重遗传力为:0.253 60.292 6;周岁重遗传力范围:0.224 60.292 6;周岁重遗传力范围:0.224 60.344 2;成年体重遗传力范围:0.221 20.344 2;成年体重遗传力范围:0.221 20.399 6;模型间比较结果表明:对于初生重和断奶重,模型2估计效果最优;对于周岁重和成年重,模型1估计效果最优。生长性状中初生重、断奶重受母体遗传效应影响显著;周岁重和成年重受母体效应影响不显著。 相似文献
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选取凉山半细毛羊7个父系半同胞家系,利用绵羊1号染色体上11个微卫星标记,通过聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)对凉山半细毛羊初生重QTL进行了研究。QTL分析的结果表明,在其中一个家系B3K5055中,1号染色体微卫星标记ILSTS004与CSSM004之间检测到影响初生重的QTL,其LOD值为3.338,位于置信区间95%(2.73)和99%(3.49)之间。 相似文献
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青海半细毛羊血液生化遗传多态性的研究 总被引:2,自引:4,他引:2
张才骏 《青海畜牧兽医杂志》2004,34(1):3-5,14
采用聚丙烯酰胺凝胶电泳和火焰光度法对91只青海半细毛羊血液中HB,K,TF,ES,AMY1,AMY2和TLP总共7个基因座的多态性进行了研究。结果为:①在青海半细毛羊的HB,K,TF,ES,AMY2,和ALP)总共6个基因座上发现多态性,多态性基因座比例为85.7%;②每个基因座实有的平均等位基因数为2.5714个(1~7个),有效等位基因数为2.0061个(1.0000~4.0797个),基因平均杂合度为0.4086,基因均质度指数为0.2727;③青海半细毛羊与其主要亲本新疆细毛羊和藏羊间的基因分化系数为0.0898(8.98%);④青海半细毛羊与青海细毛羊(0.0286)及新疆细毛羊(0.0309)的遗传距离较小,而与藏羊的遗传距离较大(0.0777)。 相似文献
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我国十个鹅品种的遗传结构及遗传分化研究 总被引:1,自引:0,他引:1
利用多态性丰富的15个微卫星标记对列入国家级畜禽保护名录的10个鹅品种群体遗传结构、遗传分化及基因流进行研究.结果表明:10个鹅群体总近交系数(Fit)为-0.044,群体内近交系数(Fis)为-0.408,群体间基因分化系数(Fst)为0.257,3个固定指数只有Fst 达到极显著水平(P<0.01).鹅群体内近交系数(Fis)均为负值.各个鹅群体间,豁眼鹅与伊犁鹅的基因流值最小(Nm=0.416),四川白鹅与伊犁鹅间基因流值最大(Nm=1.430).结合基因流和STRUCTURE分析结果,10个地方鹅品种可划分为四类:兴国灰鹅、豁眼鹅和太湖鹅为一类,四川白鹅、狮头鹅和乌鬃鹅为一类,酃县白鹅和皖西白鹅为一类,雁鹅和伊犁鹅为一类,这种聚类结果与各个品种的选育历史和地理分布等一致. 相似文献
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4个微卫星标记分析6个鸭群体之间的遗传关系 总被引:14,自引:4,他引:14
利用4对微卫星引物(AJ272577、AJ272578、AJ272579和AJ272580)对6个鸭群体(绍鸭、番鸭、樱桃谷鸭、北京鸭(Z4、Z1)和奥白星鸭)300只鸭的等位基因频率、群体多态信息含量、有效等位基因数、杂合度和遗传距离进行了检测。结果表明:4个微卫星基因座在6个鸭群体中均存在多态性,可以用于鸭的遗传多样性评估;且基因座AJ272578变异最大,基因座AJ272579变异最小,从不同群体来看,北京鸭Z1的遗传变异最大,奥白星鸭的遗传变异最小。基于Nei氏标准遗传距离,采用UPGMA方法构建了系统发生树,将绍鸭和樱桃谷鸭归为一类,北京鸭Z1、奥白星鸭和北京鸭Z4归为一类,番鸭归为一类。鸭的微卫星基因分型技术为检测品种(群体)之间的遗传关系提供了一个有用的工具。 相似文献
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云南48—50支半细毛羊新品种各性状遗传参数的研究 总被引:1,自引:1,他引:0
本文对云南48-50支半细毛羊的6个数量性状及2个阈性及2个阈性状进行了遗传参数的估计。结果明几个主要经济性状(剪毛后体重,成年羊毛长,剪毛量及羊毛细度)均具有中等以上遗传力。此外对两个阈性状(油法汗色和毛嘴类型)遗传力的估计表明油汗色和毛嘴类型为高度遗传性状,受环境影响不大。在遗传原研究中发现6个数量性状之间存在显著的正相关或负相关,即各性状间并非独立,而是紧密联系,在选育工作中有必要纵观全局, 相似文献
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江西7个地方鸡品种遗传多样性的微卫星分析 总被引:5,自引:1,他引:5
选用30个多态性较好的微卫星标记.检测了丝毛鸟骨鸡、康乐鸡、宁都三黄鸡、余干乌骨鸡、瓦灰鸡、崇仁麻鸡、东乡绿壳蛋鸡等江西省7个地方鸡品种的遗传多样性。利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(h)、多态信息含量(PIC)、群体间的Nei氏标准遗传距离(Ds)和DA遗传距离。结果表明.30个微卫星位点中有24个微卫星位点在7个鸡群体中的多态信息含量均为高度多态.可作为有效的遗传标记用于鸡品种的遗传多样性和系统发生关系的分析;在7个品种中.杂合度最低的是余干乌骨鸡.为0.6155.杂合度最高的是崇仁麻鸡.为0.6525,各地方鸡品种的杂合度都偏高,反映了群体的遗传多样性非常丰富;7个鸡品种间的DA、Ds遗传距离远近关系一致.但DA距离均比Ds距离大;用UPGMA法对DA和Ds的聚类结果相同.7个鸡品种被聚为3类.余干乌骨鸡、瓦灰鸡、康乐鸡、宁都三黄鸡聚为一类.崇仁麻鸡、东乡绿壳蛋鸡聚为一类.丝毛乌骨鸡独自为一类。 相似文献
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<正> 1.何为亚热带绵羊新区我认为,所谓亚热带绵羊新区,是指我国非传统绵羊饲养区。这里过去有的地方曾有零星饲养,但人们从未把它做为一项产业对待,从总体上讲已无人过问,认为是失败的。现在经几年试验,认为饲养半细毛羊是成功的,可建立我国新的半细毛羊基地。据此,像湖南南山牧场,四川川东的红池坝、仙女山,湖北鄂西的个别地区都属养绵羊新区。贵州灼甫牧场理应为老区。 相似文献