四川黄牛品种线粒体DNA 遗传多样性研究

测定了四川黄牛5个品种的线粒体细胞色素b部分片段（420bp）42个个体以及28个个体线粒体DNA控制区（D-loop）的全序列，结合已报道的中国8个黄牛品种22个个体的线粒体DNA控制区（D-loop）全序列，分析结果表明：四川黄牛的部分Cytb基因片段有5个变异位点，7种单倍型可分为以2个单倍型为主的2大类型；线粒体DNA控制区检测到64个变异位点，28种单倍型，单倍型H1～H23为普通黄牛类型，单倍型H24～H28为瘤牛类型的单倍型。在四川黄牛中，67．86％为普通牛类型，32．14％为瘤牛类型。研究结果表明四川黄牛主要有2类母系来源。     

基于线粒体DNA序列探讨中国紫貂的起源

为了研究中国紫貂的起源,试验利用PCR方法和直接测序技术对中国境内分布的18只野生紫貂线粒体DNA控制区全序列进行了测定和群体分析.结果表明:所获得的7个单倍型序列长度介于1 073～1 134 bp之间,在保守序列区CSB1与CSB2之间存在AC串连重复序列,长度介于198 ～258 bp,这是导致紫貂线粒体控制区序...     

中国部分山羊品种线粒体DNA D-loop序列遗传多样性分析

分析了中国部分本地山羊品种(18个品种200个体)以及在中国饲养的引入品种(4个品种25个体)线粒体DNA控制区(D-loop)的全序列,结合已报道的世界其它地方的山羊(15个品种77个体)以及2只野山羊的线粒体DNA控制区(D-loop)全序列共304个体,研究结果表明:山羊线粒体DNA控制区约为1 212 bp,检测到228个变异位点,203种单倍型,单倍型多样度为0.993±0.001;核苷酸多样度0.018±0.001。中国部分山羊的变异类型主要为类型A和B,而在巴基斯坦山羊中还检测到类型C和D。比较分析结果表明中国山羊遗传多样性和基因交流比中国黄牛品种要高。     

猪核线粒体假基因的分布特征研究

核线粒体假基因(NUMT)是线粒体DNA插入到核基因组中的DNA片段。目前,已经发现越来越多的真核生物基因组存在线粒体假基因现象。猪线粒体假基因在核基因组中的分布尚未见报道。研究通过猪线粒体基因组全序列与核基因组全序列进行比对,由BLAST程序鉴别出132个NUMT。结果表明:这些NUMT的大小在37～4 453bp,其中90%的NUMT长度处于40～1 000 bp的范围内,NUMT与相应的线粒体DNA片段之间的同源性数值范围为66%～100%。此外,鉴定出的NUMT序列几乎涵盖了包括线粒体DNA控制区在内的全部线粒体基因组,包括30个完整的线粒体基因,分布于猪的1、4、5、7、11、13、14、15、17号染色体上,近50%的NUMT定位在14号染色体上。     

家兔全血基因组DNA提取方法

以肝素钠抗凝的皖系长毛兔全血为材料,以常规的酚氯仿抽提法为基础,采用改进的方法提取基因组DNA.结果表明,提取的基因组DNA纯度高,用琼脂糖凝胶电泳检测基因组DNA,主带清晰、无拖尾现象.     

鸡核基因组中存在核线粒体DNA的实验证据

实验应用脉冲场电泳方法获得鸡核DNA,根据鸡线粒体DNA序列设计引物,以总DNA和核DNA为模板通过PCR扩增、测序和筛选鸡BAC文库方法。结果表明:鸡核DNA中普遍存在线粒体基因16S R NA、tR NA-Leu和部分ND1的同源序列;在鸡的总DNA为模板PCR中,扩增产物含有核线粒体DNA(numtDNA)产物;同时发现,该段numtDNA序列存在2个碱基突变位点。研究结果提示,在涉及PCR相关技术的mtDNA研究中,numtDNA的影响是不能忽视的。     

天祝白牦牛基因组DNA提取方法的试验研究

以改进的Miller盐析法为基础方法,通过优化操作规程、改进操作步骤等手段,提取纯化了白牦牛抗凝全血样品中的基因组DNA,并对其纯度、浓度进行了检测分析.结果表明:该方法简便易行,所获基因组DNA纯度高,浓度适宜,适用于RAPD、RFLP等遗传多态性的分析研究.     

从绵羊全血提取DNA的改进方法

以小尾寒羊冷冻全血为材料，介绍了提取DNA的改进方法。试验表明，提取的DNA纯度高，产量在正常范围之内，PCR扩增效果良好，可以用于分子遗传学实验。     

山羊粪便总DNA提取方法的比较

本试验比较了从山羊粪便中提取总DNA的四种方法的优缺点,旨在为后续实验提供合适的提取方法。笔者首先采用PBS缓冲液过夜处理粪便标本,继而通过酚-氯仿抽提法、CTAB抽提法、天根试剂盒法和OMEGA试剂盒法提取样品总DNA。结果显示：酚-氯仿抽提法提取的DNA完整性不好,且纯度低;CTAB法提取的DNA浓度和纯度都较高,但完整性不好;试剂盒法提取方便,操作简单,时间短,但提取的浓度较低,其中天根试剂盒法提取的DNA纯度高,完整性好。综合考虑,天根试剂盒法是提取山羊粪便总DNA的最佳方法。     

草坪草ctDNA提纯方法探讨

以4种草坪草高羊茅Festuca elata、黑麦草Lotium perenne、狗牙根Cynodon dactylon、中华结缕草Zoysia sinica为材料,用改进的差速离心法分离叶绿体, CTAB法提取叶绿体DNA(ctDNA),琼脂糖电泳检测ctDNA含量。结果显示,改进CTAB法提取ctDNA的纯度高、谱带清晰、完整叶绿体比例高;且CTAB法与常用高等植物ctDNA的分离提纯方法相比,省去传统的密度梯度离心法耗材、耗时步骤,具有简便、快速、得率较高等优点。实验表明,改进CTAB法为禾本科植物ct DNA的提取提供参考,适于生物实验教学和科研活动。     

黑龙江大沾河湿地国家级自然保护区鸟类多样性及其保护

为了掌握黑龙江大沾河湿地国家级自然保护区的鸟类多样性和认识保护区目前存在的问题,我们通过查阅资料、鸟类环志和鸟类救护的方法对保护区的鸟类多样性进行了研究。结果表明黑龙江大沾河湿地国家级自然保护区分布有鸟类202种,国家Ⅰ级重点保护鸟类有东方白鹳、白头鹤、丹顶鹤、金雕4种,国家Ⅱ级重点保护鸟类有白枕鹤、苍鹰、鸳鸯等33种,鸟类多样性极其丰富。在鸟类保护工作方面,目前虽然保护区已经开展了大量的保护工作,但仍然存在经济发展与鸟类保护相矛盾、人为干扰严重、自然资源利用过度和环境污染加剧等问题。针对存在的问题,本文通过研究提出了保护区在今后鸟类多样性保护和管理方面的科学意见。     

野生动物粪便在濒危物种遗传结构研究中的应用

粪便DNA提取的质量与动物的取食、样品采集地的环境温度、粪便的保存方法有着密切的关系。对于含纤维素较高的食物通过动物的肠道时会有较多的肠道细胞脱落，因此可以提高样品中DNA的含量；当样品采集地的环境温度较高时容易使粪样中的DNA降解，将会降低样品中DNA的含量；然而生活在不同生境类型内的动物，应采取不同的粪便保存方法，这样可以提高样品的质量。在粪便DNA提取方法中，常规法是一种简单、省时、经济的方法。随着粪便DNA分析技术的发展，这项技术在将来的濒危物种遗传结构的研究中会得到广泛的应用。     

微生物总DNA的提取

目前,对微生物多样性的研究越来越多地从传统的培养方法转向分子生物学方法,现代分子生物学技术的蓬勃发展解决了不可培养微生物研究的难题,使肠道微生物的研究进入了一个新的发展阶段,而肠道微生物总DNA的提取是整个分子生物学方法的关键.主要总结了前人提取土壤、植物、粪便、瘤胃和肠道微生物DNA的试验方法,介绍了微生物总DNA的纯化方法,为用于分子生物学研究的肠道微生物总DNA的提取提供依据.     

中国鹤类动物发生疾病统计分析

依据已有文献资料记载,分析了中国近25a来鹤类动物发生的疾病。丹项鹤、白鹤、黑颈鹤、白枕鹤、灰鹤、蓝鹤、蓑羽鹤、白头鹤,共8种鹤有发病资料,丹项鹤疾病占统计总数的64．12％。营养因素、寄生虫、细菌是引起鹤发病的主要原因,有机磷中毒是造成野生鹤大批死亡的主要原因,球虫病、血液原虫病是造成圈养鹤大批死亡的主要疾病。幼鹤腿部疾病和痛风是主要的营养性疾病,吸虫、球虫、住白细胞原虫是导致发病主要的寄生虫,巴氏杆菌、大肠杆菌是引起发病的主要细菌,有机磷是造成中毒的主要原因,新城疫病毒、马立克病毒、疱疹病毒亦可引起鹤发病。加强饲养管理与合作,改善环境条件,提高饲养人员的业务素质,完善保护法律和落实措施,是减少疾病发生和死亡有效措施。     

Polymerase chain reaction detection of Salmonella spp. in fecal samples of pet birds

The aims of this study were 1) to determine the prevalence of Salmonella in clinically ill birds in aviaries in Ankara, Turkey, and 2) to compare conventional culture and polymerase chain reaction (PCR) for detection of Salmonella in feces from clinically ill pet birds. In the study, 185 fecal samples (feces and/or swabs) collected from the pet birds kept in the seven different aviaries in the city of Ankara were investigated for the existence of Salmonella spp. by bacterial isolation and PCR. The conventional isolation and identification methods were performed for Salmonella isolation from fecal cultures. Suspected colonies were confirmed with the Salmonella polyvalent O antiserum and serogrouped with Salmonella group-specific antiserum. PCR was performed after the fecal swabs were incubated for 18 hr in 10 ml of tetrathionate broth. Three (1.63%) out of 185 fecal samples were found to harbor Salmonella spp. by conventional identification tests and were found to belong to serogroup B. Five (2.7%) swab samples were found to harbor Salmonella DNA by PCR tests. As a conclusion, PCR following incubation of clinical samples in pre-enrichment broth seemed to be a fast and practicable method for Salmonella spp. diagnosis when compared to protracted labor-intensive conventional culture techniques.     

光敏生物素标记EDSV-DNA探针检测鸡减蛋综合症(EDS)的研究

应用光敏生物素标记EDSV－DNA与pUC19重组质粒DNA做探针，检测人工发病减蛋综合症蛋鸡的粪便、蛋、输卵管样品，以新城疫病毒（NDV）、传染性囊病病毒（IBDV）、传染性支气管炎病毒（IBV）、包涵体肝炎病毒（IBHV）作对照。实验结果显示：探针能特异地检出EDS病鸡粪便、输卵管、蛋清样品中的病毒，与NDV、IBDV、IBV及IBHV均呈阴性反应。探针灵敏度达10pgEDSV-DNA。     

云南临沧机场鸟类调查

2005年9-10月采用样带调查法，并结合社会访问调查法，对临沧机场及其周边的鸟类进行实地调查。本次共观察到鸟类124种，其中：有国家Ⅱ级重点保护鸟类鸳鸯、普通蔫、白鹇、灰鹤等17种；中白鹭、黑翅鸢、雀鹰、苍鹰、普通蔫、红隼、灰鹤、白胸苦恶乌、灰头麦鸡、草鹗、红角鹗、领鸺鹞、斑头鸺鸱、雕鹗、普通夜鹰、家燕、小云雀、白鹤鸽、田鹨、白喉红臀鹎、红尾伯劳、大山雀、普通朱雀、酒红朱雀、暗胸朱雀、家鸽等26种为云南临沧机场对航空飞行有潜在威胁较大的鸟类。     

提取东北虎毛发DNA两种方法的比较研究

研究东北虎毛发DNA的水煮抽提法，并将传统的酚仿抽提法和水煮法进行比较。水煮法即通过对细胞的煮沸和冷却，使细胞破裂、蛋白质变性，从而获得用于PCR扩增的模板DNA。通过测定OD值并计算浓度和纯度，同时进行琼脂糖电泳检测、PCR扩增和PAGE电泳检测，分析2种方法提取东北虎毛发DNA的质量差异。结果表明：水煮法提取东北虎毛发中DNA是一种快捷、简便、经济、高效的方法。     

大熊猫粪便DNA纯化及其PCR检测

建立了二氧化硅法纯化大熊猫粪便中DNA的技术 ,所得DNA可用于PCR扩增 ,而传统的有机溶剂提取的DNA不能去除粪便中抑制PCR反应的成分 ,使扩增结果呈假阴性。     

Validation of the usefulness of 26S rDNA D1/D2, internal transcribed spacer, and intergenic spacer 1 for molecular epidemiological analysis of Macrorhabdus ornithogaster

Macrorhabdus ornithogaster (MO) is an infectious fungus that causes gastric damage in birds. In this study, we established nested and seminested polymerase chain reaction (PCR) methods that specifically amplify the domain D1/D2 region (D1/D2) of 26S ribosomal DNA (rDNA), internal transcribed spacer (ITS) of rDNA, and intergenic spacer (IGS) 1 region from avian feces. Phylogenetic analysis of MO collected from Japanese pet birds showed little genetic variation; analysis based on these regions did not distinguish between host species order, differences in MO shape, or host gastrointestinal symptoms. These regions were found to be unsuitable for molecular epidemiological studies of MO and further investigation into other genetic regions is required.