日本沼虾4个地理群体遗传变异的RAPD分析

采用随机扩增多态DNA（RAPD）技术对取自六安、龙感湖、淮南和高淳等4个地理群体的日本沼虾（Macrobrachium nipponense）各30个个体进行遗传多样性分析。在事先优化的反应条件下。所使用的OPP、OPX2个系列40个随机引物中，有16个引物扩增出清晰稳定的片断。共产生173个位点。大小在250～2000bp，利用PopGen1．32进行分析，日本沼虾多态位点为75个（多态性片断的比例为43．4％），Shannon信息指数为0．1771～0．2466。遗传距离显示日本沼虾群体间有一定遗传分化。其中高淳群体和龙感湖群体之间遗传距离最大（0．1712）．六安群体和淮南群体之间最小（0．1146）。用UPGMA对4个地理群体进行聚类分析，六安和淮南群体首先聚在一起。高淳和龙感湖群体最后。     

太湖日本沼虾的生长特性

2004年11月至2005年12月对梅梁湾和贡湖日本沼虾种群生长情况进行了研究.结果表明,梅梁湾日本沼虾体长范围为11.8～88.9 mm,体重范围为0.02～15.76 g,平均体长为(30.6±12.1) mm,平均体重为(1.20±0.89)g.贡湖日本沼虾体长范围为9.5～73.7 mm,体重范围为0.02～8.60 g,平均体长为(32.9±9.5)mm,平均体重(1.00±0.95)g.2004年11月至2005年2月日本沼虾种群生长基本处于停滞状态,3月开始生长,6月群体规格达到最大,7月因世代交替群体规格变小,8～12月围网内的群体规格逐月增大,围网外9月以后因开始大规模捕捞,群体规格迅速减小.梅梁湾日本沼虾的平均规格小于贡湖日本沼虾,肥满度极显著小于贡湖日本沼虾(P＜0.01).     

江苏地区日本沼虾种质资源的RAPD分析

用RAPD技术研究了江苏地区10个日本沼虾群体的遗传多样性和亲缘关系。以40个随机引物(10个碱基)对沼虾基因组DNA进行扩增,选取其中18个扩增产物多态性好的引物进行分析。结果共扩增出234个DNA片段,大小在250~2000 bp之间;126个位点表现为多态位点,多态位点比例为53.85%。常州湖繁保区的日本沼虾遗传多样性最高,遗传多样性指数为0.1742;宿迁骆马湖池塘养殖的日本沼虾遗传多样性最低,遗传多样性指数为0.1263。UPGMA聚类分析表明,常州湖繁保区的日本沼虾和苏州太湖胥口镇渔洋山西南侧水域的日本沼虾亲缘关系最近,总体上亲缘关系和地理位置呈正相关。     

罗氏沼虾不同群体生化遗传变异的比较分析

应用聚丙烯酰胺凝胶电泳法对罗氏沼虾浙江养殖群体和缅甸新引进的野生群体的11种同工酶进行生化遗传分析。结果表明,11种同工酶由25个基因位点所编码。养殖群体中G6PDH-1,MEP-1和EST-3位点具有多态性;而缅甸新引进的野生群体中除上述3个基因座位外,还检测到GDH-1基因座位具有多态性。缅甸新引进的野生群体的多态基因座位比例(16％)和群体平均杂合度(0．0501)都明显高于浙江养殖群体(12％和0.0431)。2群体的遗传相似度和遗传距离分别为0．9963和0．0037。     

罗氏沼虾不同群体生化遗传变异的比较分析

应用聚丙烯酰胺凝胶电泳法对罗氏沼虾浙江养殖群体和缅甸新引进的野生群体的11种同工酶进行生化遗传分析.结果表明,11种同工酶由25个基因位点所编码.养殖群体中G 6 PDH-1,MEP-1和EST-3位点具有多态性;而缅甸新引进的野生群体中除上述3个基因座位外,还检测到GDH-1基因座位具有多态性.缅甸新引进的野生群体的多态基因座位比例(16%)和群体平均杂合度(0.0501)都明显高于浙江养殖群体(12%和0.0431).2群体的遗传相似度和遗传距离分别为0.9963和0.0037.     

海南沼虾(♀)×日本沼虾(♂)的人工种间杂交及其RAPD分析

运用人工授精方法,进行海南沼虾(♀)×日本沼虾(♂)杂交试验,获得了可育的F1代杂种,并对F1代及其双亲进行了RAPD分析。共进行6批杂交试验,4批抱卵,3批获得杂交虾,成活率分别为30%,48%,64%。形态上,F1代兼有双亲特征,但偏向父本。RAPD扩增结果显示,海南沼虾和日本沼虾的扩增带型存在显著的差异,F1杂种兼有双亲的特征带,父、母本之间的遗传距离为0.785 6,父本与F1的遗传距离为0.410 9,母本与F1的遗传距离为0.423 8。从分子水平确认了日本沼虾(♀)和海南沼虾(♂)种间杂交的成功,并为进一步寻找经济性状相关分子标记提供了条件。     

海南沼虾(♀)×日本沼虾(♂)的人工种间杂交及其RAPD分析

运用人工授精方法,进行海南沼虾(♀)×日本沼虾(♂)杂交试验,获得了可育的F1代杂种,并对F1代及其双亲进行了RAPD分析。共进行6批杂交试验,4批抱卵,3批获得杂交虾,成活率分别为30%,48%,64%。形态上,F1代兼有双亲特征,但偏向父本。RAPD扩增结果显示,海南沼虾和日本沼虾的扩增带型存在显著的差异,F1杂种兼有双亲的特征带,父、母本之间的遗传距离为0.785 6,父本与F1的遗传距离为0.410 9,母本与F1的遗传距离为0.423 8。从分子水平确认了日本沼虾(♀)和海南沼虾(♂)种间杂交的成功,并为进一步寻找经济性状相关分子标记提供了条件。     

日本沼虾不同地理种群的遗传多样性研究

笔者采用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对6个地理种群(微山湖、洪泽湖、太湖、龙感湖、洪湖、珠江)的日本沼虾各30个个体进行了遗传多样性分析.在筛选出的18个引物中共检测到201个位点,大小在100～2000bp之间.多态位点141个,多态位点比例70.15%;各种群的多态位点数为30～99不等,多态位点比例为21.13%～55.93%.日本沼虾中国不同地理种群的平均遗传杂合度为0.2446,各种群内平均遗传杂合度为0.1132～0.2071.Shannon信息指数(Ⅰ)为0.1695～0.2950.日本沼虾6个地理种群的两两地理种群间遗传分化指数Gst值在0.2116～0.4442之间.种群间总的遗传分化指数Gst0值为0.4858,Nm值在0.6257～1.8628之间,表明日本沼虾种群间已经发生显著或重要分化.同时发现OPX-830bp、OPI-360bp为珠江种群区别于其他种群的特征标记.聚类分析结果表明,洪湖种群与龙感湖种群,洪泽湖种群与微山湖种群分别先聚在一起,再与太湖种群聚类.最后与珠江种群聚合在一起.     

雅江报春天然居群RAPD遗传多样性

用随机扩增多态性DNA(RAPD)标记检测3个雅江报春天然居群的遗传多样性。结果表明,28个引物共扩增出173条片段,平均每个引物扩增出6条,其中多态性带纹为82条(47·4%)。材料间的平均遗传距离为0·4584,17个植株可被聚为四类。居群间随海拔差异的增大,遗传距离增大,遗传关系较远。居群内木格措居群遗传多样性较高,木格错居群与理塘居群遗传关系较近,康定居群与木格错居群分离出差异较大的个体。     

利用RAPD标记分析青麻种质资源的遗传多样性

利用随机扩增多态性DNA(RAPD)分子标记技术对来自全国各地的48份青麻种质资源的遗传多样性进行了检测.结果表明,青麻具有丰富的遗传多样性,在48份青麻种质资源中.17条RAPD引物扩增出191条带,多态性条带比率(PPB)为87.43%,扩增产物片段大小在0.I-3.0kb之间.     

4个罗非鱼群体遗传多样性的RAPD分析

采用50个随机引物对奥利亚罗非鱼（Oreochromis aureus）和3个尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus）群体即无锡品系、埃及品系和吉富品系进行RAPD分析,共筛选出13个重复性好的引物,其中引物S1255扩增的2500bp片段具有群体特异性,可作为区分奥利亚罗非鱼和尼罗罗非鱼的分子标记;用PopGen1．32软件进行遗传多样性分析,结果表明：奥利亚罗非鱼、无锡品系、埃及品系和吉富品系罗非鱼群体内的多态位点率分别为22．03％、52．54％、58．47％、62．71％,基因多样性指数分别为0．0912、0．2166、0．2448、0．2705,Shannon信息指数分别为0．1323、0．3136、0．3537、0．3881。无锡品系、埃及品系和吉富品系罗非鱼群体内遗传相似性指数分别为0．8194、0．7886和0．7704,遗传变异水平较高,遗传多样性丰富。奥利亚罗非鱼的群体内遗传相似性指数为0．9279,群体的遗传纯度高,遗传变异水平较低。无锡、埃及、吉富品系尼罗罗非鱼与奥利亚罗非鱼之间的遗传距离分别为0．1370、0．2235,0．1986,说明奥利亚罗非鱼和埃及品系尼罗罗非鱼杂交可能产生更强的杂种优势。     

基于RAPD的风信子遗传多样性分析

利用RAPD分子标记法,对20个风信子品种的遗传多样性以及亲缘关系进行研究。结果表明,筛选出的12条随机引物共扩增出93条指纹谱带,其中多态性条带67条,占扩增条带总数的72.0%;使用NTSYS-pc2.10对扩增出的条带进行统计分析,得到20个风信子品种的遗传相似系数及亲缘关系树状图,以遗传相似系数0.83为分界线将20个风信子品种分为2个大类,发现各品种间亲缘关系相对较近;相同色系的品种在聚类中基本聚为一类。风信子在引进栽培过程中,在环境的驯化作用下产生了一些芽变品种,这些品种提高了风信子种群遗传多样性的丰富程度。本研究通过RAPD技术对风信子种质资源进行研究,为风信子进一步创新种质资源提供了基础。     

华南三地观光木遗传多样性的RAPD分析

报道了广东南昆山和始兴都亨、广西靖西三地的观光木Tsoongiodendron odorum居群基因多态性研究的初步结果，应用随机扩增多态DNA（RAPD）分子标记方法，从108个10个碱基的随机引物中获得了18个多态性标记，在3个居群共42个样株中，共检测到78个位点，其中多态位点66个，占84.62%，显示该物种的基因多样性较高，聚类分析结果表明，样品可分为3个居群；广东境内的2个居群间相似性较高，相似性系数达0.832,广西与广东都亨和南昆山2个居群间的相似性较低，相似性系数分别为0.772和0.768，南昆山居群内的基因多样性最高，广东始兴都亨居群的基因多样性最低。广西居群居中。     

基于RAPD技术的韭菜品种间遗传多样性分析

为了研究韭菜种质资源的多样性和品种间的相似问题,利用RAPD分子标记技术分析了我国11个地区15个韭菜品种间的遗传多样性。结果表明,采用20条RAPD引物,共扩增出136个条带,其中多态性位点98个,平均多态性比率为72%。依据15个韭菜品种间的Nei’s遗传距离进行UPGMA聚类分析,在遗传距离为0.34处将15个韭菜品种分为4个类群:第1类群包含独根红、兰州白根和南京马鞭韭3个品种;第2类群包含汉中冬韭、上海强韭-3和上海强韭-6 3个品种;第3类群包含四季青、桂林小红根、天津大青苗、新疆白根和嘉兴雪莲5个品种;第4类群包含天津大金钩、环韭、平丰苔韭和抗寒薹韭4个品种。韭菜品种间遗传相似性和来源地之间没有必然的联系。     

不同自然分布区刺梨遗传多样性的RAPD分析

 收集了 4省 30个野生刺梨样品 ,采用 16个随机引物扩增的RAPD标记 ,对不同自然分布区刺梨的遗传多样性进行分析。这些引物共产生 94条带 ,其中 6 2条 (6 5 .96 %)表现多态性 ;样品的多态性百分率、样品组合的相似系数及聚类分析结果都表明 ,来自贵州的样品蕴藏有最丰富的遗传多样性 ,贵州的刺梨是进一步遗传改良最重要的遗传资源 ;而川西的 5个样品的遗传差异性最小 ;来自鄂西高海拔地区的 3个样品具有较高的遗传差异性 ,其果实性状上表现出很大的特异性 ,在刺梨的新品种培育上显示了特殊价值。     

基于RAPD技术的狼蛛科五种蜘蛛的遗传多样性分析

采用RAPD技术对狼蛛科5种蜘蛛的遗传多样性进行了研究。从100个10 bp寡核苷酸随机引物中筛选出10个有效的随机引物对基因组DNA进行了扩增,共记录187条片段,平均每个引物18.7条。种群内多态位点比例在16.98%~44.20%之间,平均遗传多态度0.112 0,Shannon多样性指数0.162 5。从统计结果来看,5种蜘蛛没有普遍存在的位点,种间遗传多样性较丰富,种内的遗传多样性较低,外部形态相似的种间遗传距离较近,亲缘关系较近。     

Genetic Diversity Analysis of PVY Resistant Potato Varieties （Clones） by RAPD Markers

DNA fingerprints of 37 PVY resistant potato varieties (clones) were generated using PCR-based RAPD analysis. All 37 varieties were differentiated by banding patterns obtained from 17 primers that generated 164 polymorphisms. Similarity matrices were calculated with the simple matching coefficient. The genetic distance value among them was between 0.27 and 0.50, with average value being 0.35. The average link clustering algorithm was used to construct a dendrogram with Statistica. They were classified into three groups according to clustering results, and the results presented some geographic relationship. Dendrogram showed close genetic relationships between a number of varieties (clones) of similar pedigree. This study has shown that RAPD marker is a useful tool for potato variety identification, differentiation, and estimation of genetic relationships.     

朱砂根群体遗传多样性RAPD分析

在对朱砂根形态变异系统观测的基础上,进一步采用RAPD标记技术在DNA水平上对其种内遗传多态性进行检测。结果表明,朱砂根5个群体平均等位基因数A为1.805 2,有效等位基因数Ne为1.460 0,Ne i氏基因多样度H为0.269 9,Shannon多样性指数I为0.406 7。总的群体基因多样性达0.270 6,其中群体间的基因多样性Dst为0.089 4,群体内的基因多样性Hs达0.181 2,群体内的基因多样性高于群体间的基因多样性。说明朱砂根群体间和群体内均存在着丰富的遗传变异,并以后者为主要变异来源。检测结果还表明,15个样本并不足以代表一个群体的遗传多样性,30个样本所代表的群体,其遗传多样性参数则相对一致和稳定。