观赏竹芋DNA的提取与RAPD体系优化

文章用多种方法对观赏竹芋进行DNA的提取和RAPD体系优化研究,结果表明CTAB法较适合于观赏竹芋DNA的提取,RAPD体系优化还有待进一步确定。     

野蔷薇的DNA提取和RAPD反应体系的建立

以野蔷薇(Rosa multiflora)的冬末初春芽和夏初叶片为材料,研究了DNA的提取方法,并对影响随机扩增多态DNA(RAPD)的反应因素进行了优化.建立了适合野蔷薇RAPD的反应体系和反应程序,在20μL反应体系中,25ng模板DNA,2.0mmol/LMgCl2,0.2mmol/LdNTPs,1UTaqDNA聚合酶,0.1μmol/L引物.扩增程序为:94℃预变性4min,然后94℃变性45s,37℃退火1min,72℃延伸1min,37个循环,最后72℃延伸5min,4℃保存.     

番木瓜DNA提取与SRAP反应体系优化

对番木瓜基因组DNA的提取及SRAP反应体系的模板、引物、dNTP、Taq聚合酶等条件进行了优化。结果表明,在20μL反应体系中,最优反应体系为模板DNA 40 ng,引物浓度0.4μmol/L,Taq聚合酶0.4 U/20μL,dNTPs 0.2 mmol/L。番木瓜的SRAP-PCR程序为94℃预变性4分钟;94℃变性1分钟,35℃复性1分钟,72℃延伸1.5分钟,5个循环;94℃变性1分钟,52℃复性1分钟,72℃延伸1.5分钟,35个循环;最后72℃延伸10分钟,4℃保存。     

岩虱子RAPD反应体系的研究

利用RAPD（随机扩增多态DNA）技术对濒危植物岩虱子进行了RAPD反应体系的研究.以岩虱子叶片为材料,采用改良的CTAB法提取其基因组DNA,进行RAPD反应条件的优化试验.通过单因子试验分别研究了模板DNA用量、Mg^2＋浓度、dNTPS浓度、Taq酶的用量和引物浓度对RAPD反应的影响,建立了适于岩虱子RAPD分析的有效的稳定的反应体系,即在25μL总反应体系中,模板DNA的最适用量为10 ng、Mg^2＋的适宜浓度为2.0 mmol/L、dNTPs的适宜浓度2.2 mmol/L、Taq酶的用量以1 U、随机引物的浓度以2.5 μmol/L为佳.     

杏叶片DNA提取和荧光AFLP反应体系的建立

以杏嫩叶为材料,利用改进的CTAB法,提取到高质量的杏叶片总DNA,通过优化酶切、连接、预扩增、选择性扩增等试验条件,建立了高效稳定的杏荧光AFLP反应体系;筛选出多态性好的12对引物组合,均获得稳定、清晰的扩增图谱,可进行杏品种鉴定、种质资源的遗传多样性和亲缘关系分析等研究。     

李属植物DNA提取及RAPD反应体系的优化

以1号李,6号李和公主红为试材,对李属植物DNA提取方法进行改良并进行RAPD反应体系的优化.结果表明:改良CTAB(3%)法提取的DNA产量高,可满足RAPD扩增的需要.25 μL反应体系中,DNA聚合酶、Mg2 、引物、模板DNA和dNTPs 5种主要成分的适宜浓度或用量分别是:1.0 U、2.0mmol/L、10 pmol/L、20 ng和1.0mmol/L.     

山葡萄基因组DNA提取及RAPD鉴定

以雌花山葡萄（７３０６４）冷藏幼叶、香妃葡萄新鲜幼叶为试材,分别采用修改的ＣＴＡＢ法、高盐法、ＳＤＳ法提取基因组ＤＮＡ。结果表明,三种方法所提的ＤＮＡ纯度及产率有差别,从综合结果看,以ＣＴＡＢ法为好,所得ＤＮＡ不需经氯化艳梯度离心或柱层析,可直接用于ＲＡＰＤ分析。     

适于宁夏枸杞RAPD分析的DNA高效提取方法

采用优化的CTAB法提取枸杞叶片基因组DNA.利用紫外分光光度计、琼脂糖凝胶电泳检测所得DNA的浓度和纯度,并进行了RAPD初步扩增分析.DNA浓度在300 μg /mL,可达400 μg/g(叶片鲜重).OD260/OD280比值为1.44～1.6(理想值为1.8).结果表明:优化CTAB法所提取枸杞总DNA的纯度高、完整、量大,能满足RAPD扩增,条带清晰、稳定,并且提取操作的程序快速、简便,试验成本低、效率高.优化的CTAB法高效提取的枸杞基因组DNA不需经氯化铯梯度离心或柱层析纯化,可以直接用于RAPD分析.     

山葡萄基因组DNA提取及RAPD鉴定

以雌花山葡萄（７３０６４）冷藏幼叶,香妃葡萄新鲜幼叶为试材,分别采用修改的ＣＴＡＢ法,高盐法、ＳＤＳ法提取基因组ＤＮＡ。结果表明,三种方法所提的ＤＮＡ纯度及产率有差别,从综合结果看,以ＣＴＡＢ法为好,所得ＤＮＡ不需经氯化铯梯度离心或柱层析,可直接用于ＲＡＰＤ分析。     

快速微量提取番茄DNA及SSR-PCR反应体系的优化

以番茄叶片为试材,采用改进的CTAB法,电钻研磨,提取过程中加入醋酸铜,设计4因素3水平的正交试验对PCR反应体系进行优化,同时利用梯度PCR对退火温度进行选择选择。结果表明:优化的10μL反应体系含:1×buffer,1.2 mmol/L Mg2+,1.5 mmol/L dNTPs,1.2μmol/L引物,0.75 UTaqDNA聚合酶,10 ng模板DNA。扩增程序为:94℃预变性2 min;94℃变性30 s,49.2℃退火30 s,68℃延伸30 s,共35个循环;最后72℃延伸8 min。优化的反应体系可以用于SSR分子标记机的研究,在所有SSR引物中基本都能有效扩增;改进的CTAB法提取的DNA纯度更高。     

CTAB法高效提取苹果叶片DNA的研究

为研究CTAB法在正常条件和逆境条件下,从富含多酚和多糖等多种次生代谢物质的苹果树叶片中分离出高质量的基因组DNA,以抗旱能力较强的八棱海棠(Malus micromalusRehd. )和抗旱性较弱的平邑甜茶(Malus hupehensis pamp Reld.)幼苗为试验材料.用20%聚乙二醇(polyethylene glycol,PEG6000)模拟干旱,采取CTAB提取缓冲液,按一定比例加入PVP和β-巯基乙醇,用Tris平衡酚-氯仿-异戊醇除去蛋白质及杂质,在粗提时用异丙醇沉淀DNA,并用DNA洗液(10 mmol/L醋酸铵,75%乙醇)洗涤DNA,在纯化时用乙醇沉淀DNA,且没有加入RNase去除RNA的方法,分别提取2个品种正常和干旱胁迫的苹果属叶片总DNA,并对提取的DNA进行琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测.结果表明:此方法可有效去除次生物质对DNA的干扰,得到高质量、特征带形清晰的大量DNA.并就提取过程中遇到的问题,提出了相应的解决办法.     

辣椒基因组DNA提取方法研究

本项研究采用SDS法、CTAB法和高盐低pH法对辣椒(CapsicumannuumL.)叶片基因组DNA进行提取;紫外吸收检测法与琼脂糖凝胶电泳法对DNA的纯度进行检测。紫外吸收检测结果表明,SDS法提取的辣椒叶片DNA具有典型的天然DNA分子的标准紫外吸收光谱特点,其A260/A280在1.771～1.912之间。SDS法提取的DNA经琼脂糖凝胶电泳检测得到一条迁移率很低的整齐清晰的DNA谱带,所提取DNA的质量和产率均较高,用该法提取的辣椒DNA进行RAPD分析,DNA扩增效果较好,带形清晰、整齐,说明SDS法提取的DNA分子较为完整,能用作PCR模板来开展辣椒分子水平的研究。     

DNA提纯方法对9种菊属植物RAPD的影响

菊属植物组织中所含的多酚类、单宁、色素及多糖类物质是干扰RAPD扩增反应的主要成份。通过比较试验,使用十二烷基硫酸钠(SDS)法提取,DNA,并补加非水溶性聚乙烯吡咯烷酮(insoluble PVP),有效地去除了上述杂质,经纯化的DNA能很好地用于RAPD分析。试验还发现,4月上旬至5月中旬植物材料处于旺盛的营养生长状态时取材提取DNA较为适宜。     

苹果RAPD分析体系的建立

对富士苹果（Ｍａｌｕｓ　ｐｕｍｉｌａ　Ｍｉｌｌ．ｃｖ．Ｆｕｊｉ）ＲＡＰＤ（Ｒａｎｄｏｍ　Ａｍｐｌｉｆｉｅｄ　Ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃ　ＤＮＡ）分析体系的优化研究表明,ＲＡＰＤ反应体系中,ＤＮＡ、Ｔａｑ酶、引物和Ｍｇ２＋４种主要成分的最适用量分别为：２０ｎｇ、１．０ Ｕ、０．２ｕｍｏｌ·Ｌ－１和３．０ｕｍｏｌ·Ｌ－１。采用该优化体系,以 ＯＰＪ０３为引物,构建了我国及世界范围内苹果生产中重要的２８个品种的ＲＡＰＤ指纹图谱,分析了其遗传多样性,区分了供试的２８个苹果品种中的１５个,区分率达５３．６％。讨论了ＲＡＰＤ鉴定苹果品种的应用及其主要影响因素。