《中国蔬菜》2011·20 学术论文导读

ISSR标记技术在马铃薯遗传育种研究中的应用 基于PCR基础上发展起来的SSR分子标记技术具有共显性、多态性高、重复性好、稳定性好、操作简单等优点。本文简述了SSR分子标记技术的基本原理与特点，重点对马铃薯SSR引物的开发及其在马铃薯品种鉴定、遗传图谱构建与数量性状基因定位、分子标记辅助选择育种的研究现状进行了分析，并对其应用前景进行了展望。     

SSR标记在果树遗传育种中的应用

每个SSR序列的基本重复单元次数在不同基因型间的差异,从而形成其座位的多态性.SSR技术在果树育种中,主要应用在构建遗传图谱、DNA指纹图谱的建立种质资源的遗传多样性等.本文主要简述了SSR标志的原理和特点,并从亲缘关系和遗传多样性、遗传连锁图谱构建及基因定位、DNA指纹和品种鉴定、分子标记辅助育种等方面介绍了近年来SSR技术作为一种新的DNA分子标记技术在果树上的应用现状及前景.     

SSR分子标记及其在植物遗传育种中的应用

分子标记技术是基于生物体基因组的遗传分析方法,在植物的亲缘关系分析、遗传多样性分析、遗传图谱构建、分子辅助育种、品种鉴定等研究中已有广泛应用。其中微卫星分子标记(Simple sequence repeats,SSRs)技术作为一种新世纪遗传学研究工具,以其信息量大,重复性好、可靠性高和多态性丰富等优点,在植物遗传育种研究中表现出很大的优势。本文简要介绍了简单重复序列(SSRs)标记的分布、功能、技术优缺点和产生多态性的机理,并对SSR标记在植物遗传多样性、遗传图谱构建、基因定位与克隆、分子标记辅助育种等研究中的应用情况进行了综述,为植物资源利用、开发和保护等研究领域的应用提供参考。     

SSR标记技术在马铃薯遗传育种研究中的应用

基于PCR基础上发展起来的SSR分子标记技术具有共显性遗传、多态性高、重复性好、稳定性好、操作简单等优点，本文简述了SSR分子标记技术的基本原理与特点，重点对马铃薯SSR引物的开发及其在马铃薯品种鉴定、遗传图谱构建与数量性状基因定位、分子标记辅助选择育种的研究现状进行了分析，并对其应用前景进行了展望。     

分子标记技术及其在辣椒遗传育种上的应用

分子标记的创新、发展与应用对辣椒分子生物学和辣椒生物技术起了积极的推动作用.本文介绍了RFLP、RAPD、AFLP、SSR分子标记及其在辣椒物理图谱的构建、DNA指纹分析、基因定位以及遗传育种、资源研究和品种改良等方面的应用.     

SSR技术及其在果树上的应用

SSR(Simple sequence repeat)技术以其丰富的多态性、共显性遗传、重复性好和操作简便等优点日益受到重视,已成为植物遗传和育种研究中不可缺少的分子标记。对SSR技术的原理和特点作了简要的介绍,较详细地分析了如何获得SSR引物,特别是综述了果树上SSR引物的研究现状,同时将其与其它几种主要的分子标记进行了比较分析,认为SSR标记检测的位点多态性水平明显高于RFLP,而且重复性优于RAPD;着重介绍了SSR技术在果树种质资源和构建果树遗传图谱及基因定位等研究中的应用现状;指出SSR技术将在果树科研上起到重要的作用。     

AFLP技术及其在果树遗传育种上的应用

分子标记是继形态学标记、细胞学标记和生化标记之后发展起来的一种新的遗传标记形式，是DNA分子碱基序列变异的直接反映。分子标记不受内外环境、发育阶段和组织器官的影响，数量极多，多态性高，与基因表达与否无关，且操作简单，检测迅速，因此在农业科研中得到了广泛的应用。果树基因组高度杂合，而且具有童期，因此遗传育种的难度较大、周期长、效率不高，分子标记在果树上的应用大大提高了果树遗传育种的效率。果树上常用的分子标记方法有RFLP、RAPD、AFLP、SSR和ISSR等。     

南瓜作物分子标记辅助育种研究进展

现代分子育种中,利用分子辅助育种改良植物品种的重要经济性状已成为主要途径。综述了RFLP、RAPD、AFLP、SSR、ISSR等分子标记在南瓜种质亲缘关系及种质资源遗传多样性、遗传图谱构建、杂交种纯度鉴定及优势分析和QTL定位等方面的研究进展,并展望了南瓜分子标记辅助育种的前景。     

分子标记在葡萄遗传育种研究中的应用

分子标记是随着分子生物学技术的发展出现的一类重要的遗传标记,近年来发展迅速。分子标记技术是研究葡萄起源和新品种选育的重要工具,目前已在葡萄遗传育种等方面的研究中得到广泛应用。该文综述了近年来分子标记在葡萄种质资源鉴定、分子遗传图谱构建以及分子标记辅助育种等方面的应用,评述了分子标记在葡萄遗传育种等方面的应用前景以及目前存在的问题,以期为优质葡萄种质资源的挖掘和分子标记辅助育种提供一定的理论依据。     

ISSR标记在芋遗传多样性研究中的应用前景

ISSR是在SSR基础上发展起来的一种分子标记技术,兼具SSR、RAPD、RFLP、AFLP等分子标记的优点。对运用形态学和分子生物学手段研究芋的遗传多样性进展进行了综述,并对ISSR分子标记技术在芋种质资源遗传多样性和亲缘关系、种质资源鉴定和指纹图谱构建、基因定位和分子标记辅助选择等方面的应用前景做出了分析和展望。     

厚皮甜瓜遗传多样性的SSR分析

采用61对SSR特异引物对46份厚皮甜瓜材料进行分析,其中52对扩增出条带,47对引物具有多样性,扩增带分子量在150～1500bp,187条谱带中154条谱带具有多态性,多态率占82.35%,平均每个引物可扩增出3.60条带。同时,对材料网纹、果形、单果质量、有无条带、果皮颜色、果肉颜色、肉质、种子、有无麝香味、裂叶、是否自落和花性型等12个性状进行了田间调查,经过phylip软件和NTSYS软件分析后,计算出材料间遗传距离,并做出SSR分子标记和性状2个聚类图。结果显示,46份材料的遗传距离在0.0188～1.2119,而单一性状气味、果皮颜色、果肉颜色和表面网纹的遗传距离都小于0.1,十分接近;2种聚类分析结果存在较大差异,这与供试材料的亲缘关系十分复杂,大部分材料来源相近,具有相同的亲本,和回交亲本存在一定关系。     

基于SSR分子标记的栽培种茄子遗传多样性分析

用105对茄子SSR引物对34份茄子高代材料进行遗传多样性分析。试验结果表明：47个标记在供试材料中有多态性,共检测出148个多态性位点。多态性信息含量（PIC）的变化范围是0.025 4～0.909 3,显示了较高的多态性。供试材料遗传相似系数在0.63～0.93之间,供试材料之间的遗传差异不大,遗传基础相对狭窄。利用UPGMA聚类分析,将供试材料归为两大类4个亚类,SSR分子标记与果实性状聚类分析结果基本一致。     

分子标记技术在西瓜甜瓜上的应用

近十几年来,AFLP、RAPD和SSR等分子标记技术的应用,加速了瓜类作物遗传和育种的步伐。根据有关文献介绍了分子标记技术在西瓜甜瓜遗传图谱构建、遗传多样性和物种亲缘关系、分子标记辅助选择、品种(系)指纹图谱构建及杂种纯度鉴定等研究领域的应用进展,其中,RAPD技术是一种高效的基因组DNA多态性分析技术,有快速、简便、高效等优点,主要综述了RAPD技术在西瓜、甜瓜遗传育种研究中的广泛应用,并探讨了该技术在使用中存在的问题及应用前景。     

砧用南瓜种质资源形态学性状与SSR标记分析

搜集了设施黄瓜嫁接栽培中常用的47 份砧用南瓜种质资源,利用63 个形态标记和40 对南瓜SSR 标记,对其进行遗传多样性及亲缘关系鉴定。结果表明,砧用南瓜的8 个质量性状（嫩瓜皮色、瓜形、主蔓色、瓜面斑纹、叶面白斑、叶形、嫩瓜斑纹和嫩瓜斑纹色）和23 个数量性状的多样性指数大于1.00;SSR 标记共检测到167 个等位变异,平均每个SSR 位点的等位基因数为4.18 个,变幅2 ~ 8 个,平均多样性指数为0.62,变化范围0.16 ~ 1.18。非加权算术平均法（UPGMA）聚类分析表明,砧用南瓜63 个形态学性状将47 份种质划分为4 个类群,大部分品种集中于一个类群中;40 对多态性SSR 标记将所有种质划分为3 个类群,大部分品种的分子标记与形态学标记的聚类结果相似。已搜集的47 份砧用南瓜种质资源遗传多样性并不丰富,亲缘关系较近;SSR 标记CMTm11 具有极高的多态性,可用于砧用南瓜种质分子标记辅助选择;嫩瓜皮色等8 个质量性状和大部分数量性状都可以作为形态标记辅助种质资源评价及新品种选育。     

Comparative analysis of genetic diversity in Citrus germplasm collection using AFLP,SSAP, SAMPL and SSR markers

In this study we evaluate the informativeness and efficiency of Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP), Sequence-Specific Amplified Polymorphism (S-SAP), Selectively Amplified Microsatellite Polymorphic Loci (SAMPL) and Simple Sequence Repeat (SSR) markers for genetic diversity, phylogenetic relationship among the Citrus species and mapping ability of the marker system. The SSR exhibited relatively higher level of polymorphism information content in terms of the expected heterozygosity, than that of the AFLPs, SSAPs and SAMPLs. For each marker system, average level of the discriminating potential was very close to the actual discriminating potential. Similarity matrices showed weak, yet significant correlations when Mantel's test was applied. The highest positive (0.72) correlation was found between the AFLP and SSAP markers. The SSR and SAMPL markers were poorly correlated. The dendrogram topology among the four marker systems had high similarity. Taken together, the SSAP and SAMPL were highly efficient in detecting genetic similarity in Citrus, while the SSR may be more useful for segregation studies and genome mapping in Citrus. The SSAP and SAMPL markers could be useful for Citrus genome mapping in combination with AFLP and SSR markers. To our knowledge, this was the first detail report of a comparison of performances among AFLP, SSR and retrotrasposon based molecular marker technique on a set of samples of Citrus. Our result provides guidance for future efficient use of these molecular methods in genetic analysis of Citrus sp. and its relatives.     

Assessment of genetic relationships among 29 introduced and 49 local sweet cherry accessions in Turkey using AFLP and SSR markers

Summary

The characterisation of sweet cherry (Prunus avium L.) genetic resources in Turkey may help to increase their use in breeding programmes worldwide, as Turkey is the centre of origin of sweet cherry. Amplified fragment length polymorphism (AFLP) and simple sequence repeat (SSR) markers were therefore used to analyse genetic diversity among a total of 78 local and introduced sweet cherry cultivars. Four AFLP primer combinations, and six SSR primer pairs for sweet cherry were used for genetic diversity analysis. A genetic similarity matrix was calculated using the combined data from AFLP and SSR analyses with simple matching coefficient. Genetic similarities among the sweet cherry genotypes studied were higher than 42%. No two accessions had an identical AFLP and SSR marker profile, indicating that all 78 genotypes were unique. An UPGMA dendrogram, based on the similarity matrix, revealed 18 separate Groups at or above the 70% similarity level. While some Groups consisted of both introduced and local genotypes, other Groups had only local genotypes. This result suggests that there was broad genetic diversity among the local Turkish sweet cherry genotypes, which was not present in the introduced sweet cherry accessions. The genetic variation present in local Turkish sweet cherry genotypes may be useful for future breeding programmes. We found that the use of both SSR and AFLP marker systems was effective for distinguishing between genetically-close sweet cherry genotypes. These marker systems can be used to complement pomological and morphological markers during the characterisation and identification of sweet cherry genotypes.     

SSR标记及其在葡萄上的应用

SSR(simple sequence repeat)作为第2代基于PCR的一种新型DNA分子遗传标记,数量丰富、多态性高、重复性好、分布于整个基因组、特异位点扩增、发生频率高、共显性遗传。对SSR引物开发,SSR标记在葡萄品种鉴别、系谱重建、遗传图谱构建、商业品种保护等方面的研究进展进行了综述,并指出了未来的研究方向。