蛋白质组学研究方法及应用的研究进展

蛋白质是细胞生理功能的具体执行者,并常以蛋白复合体或与核酸相互作用的形式来发挥作用。蛋白质组代表在一定时间和特定条件下,1个细胞、组织或生物个体所表达的全部蛋白,因此蛋白质组会随着时间和空间的改变而发生动态变化。蛋白质组学从整体水平研究蛋白质组的结构、功能、表达模式及其相互作用的方式。根据研究内容的不同,蛋白质组学可分为表达蛋白质组学、结构蛋白质组学和功能蛋白质组学等。研究蛋白质组学有助于了解蛋白的结构、细胞的功能、生命的本质及活动规律,为疾病的诊断、治疗、疫苗及新药开发提供科学依据。研究蛋白质组学的常用手段主要有：双向聚丙烯酰胺凝胶电泳、质谱、酵母双杂交系统及蛋白芯片法等,文章将对蛋白质组学常用的技术方法及应用进行综述。     

蛋白质组学在动物营养中的应用

蛋白质组学是指从蛋白质序列、结构、相互作用、表达、定位以及修饰等方面对一种细胞或一种生物所表达的全部蛋白质进行研究.本文对蛋白质组学的主要研究内容、相关技术及其在动物营养中的应用进行了综述.     

家蚕蛋白质组研究进展

蛋白质组学是后基因组学研究的重要内容,是功能基因组学研究的重要组成部分。近几年来,家蚕蛋白质组的研究越来越受到人们的重视,包括家蚕丝腺、血液、脂肪体、中肠、马氏管等10多种组织器官的蛋白质组都已成为人们研究的热点,大量高水平家蚕蛋白质组学研究论文相继发表。本文将对近几年内家蚕蛋白质组学的研究进展做归纳整理,并对家蚕蛋白质组学未来的发展趋势进行展望。     

牛肉品质蛋白质组学研究进展

蛋白质组学是后基因组时代出现的一个新研究领域。中国牛肉目前仍需要大量进口,提高牛肉肉品质一直是我国畜牧和食品行业科研工作者尽心研究的一大课题。随着基因组学的发展,从蛋白质水平研究肉品质及形成机理,对提高肉品质有着重要的意义。肌肉主要由水及蛋白质等成分组成,且肌肉的性状以及品质主要就是由蛋白质来表达的。因此,研究牛肉蛋白质组学对认知以及调控牛肉的品质具有重要意义。本文主要对蛋白质组学的研究技术及其在牛肉品质研究中的应用做简要介绍。     

微生物蛋白质组学研究现状

正随着人类基因组的绘制成功,标志着后基因组时代的到来。由于基因的功能主要是通过其表达的蛋白质来实现,要了解该基因的全部信息,必须对其编码的蛋白质进行深入研究。蛋白质组学分析为研究微生物的生命活动和细胞功能提供了广阔的视野。因此,蛋白质组学在生命科学研究中具有十分重要的位置,随着研究的不断深入,蛋白质组学必将对人类的生活和生产带来十分重大的影响。本文主要就目前微生物蛋白质组学的研究现状进行简要阐述。     

差异蛋白质组学在乳蛋白研究中的应用进展

蛋白质组学是后基因时代的重要研究方向之一,有助于了解乳蛋白的组成、表达水平及修饰状态等,在乳蛋白的研究中具有广泛的应用前景。而差异蛋白质组学是蛋白质组学研究的主要内容之一,可反映蛋白质的动态本质。本文主要就差异蛋白质组学在乳蛋白含量及组分、疾病生物学标记的鉴定及乳蛋白热处理的变化等方面的研究进行综述。     

内蒙古白绒山羊蛋白质谱鉴定

为了建立内蒙古白绒山羊主要组织蛋白质表达谱,并通过生物信息学分析鉴定,构建山羊蛋白质组数据库。采用液相色谱串联质谱方法分析内蒙古白绒山羊18个组织的总蛋白,共鉴定出2 788种蛋白质,其中高可信度蛋白质1 889种,得到蛋白质表达谱中的蛋白质表达量排序。本试验首次构建了内蒙古白绒山羊全身主要组织蛋白质表达谱,为山羊蛋白质组学研究提供基础数据。     

蛋白组学技术在牦牛、犏牛生产领域的研究进展

生物体中,基因决定蛋白质的水平,但是几乎所有蛋白质发挥活性功能都需经过复杂的修饰过程,故而仅仅研究基因的表达水平并不能了解生物体蛋白的功能水平。蛋白质组学某种程度上是对基因组研究的一种补充,通过研究蛋白质的活性功能及蛋白质之间的相互作用等以全面揭示基因组表达,更好地揭示生命活动的现象与规律。文章简述了蛋白质组学的基本分类与核心技术,并重点阐述了蛋白质组学在牦牛及犏牛育种、繁殖、食品3个方面的研究应用,并对牦牛和犏牛蛋白质组学的应用发展进行了展望。     

蛋白质组学技术在人乳与牛乳中的研究进展

乳蛋白是生命最初阶段中最为重要的营养功能成分,并且种类多样、含量丰富.通过一系列的遗传改变、丰富的蛋白质翻译后修饰,使乳蛋白的构成变得非常复杂、数量异常庞大.采用蛋白质组学方法对乳蛋白进行系统、整体地研究,可以认识乳蛋白质在构成以及调控一些生命活动中的规律.这样能够非常全面、深入地表明乳蛋白质的表达水平.本文阐述了蛋白质组学中的主要技术,包括双向电泳技术、高效液相色谱技术、同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)技术、质谱技术以及生物信息学技术.分别讨论了蛋白质组学技术在人乳、牛乳中的应用,并对人乳与牛乳的差异蛋白质组学进行讨论.利用蛋白质组学技术分析人乳与牛乳蛋白,能够更有目的地加强对人乳与牛乳的认识,旨在为婴幼儿食品以及乳制品提供理论依据.     

低蛋白质氨基酸平衡饲粮对猪肠道健康影响的研究进展

肠道不仅是动物消化吸收的重要器官,也是重要的免疫和内分泌器官.饲粮蛋白质及其消化产物可以通过对胃肠道激素、微生物菌群和相关基因的调控来影响猪的肠道健康,而低蛋白质氨基酸平衡饲粮可有效缓解断奶仔猪腹泻,对肠道健康和功能具有重要作用.本文综述了低蛋白质氨基酸平衡饲粮对猪肠道屏障、消化吸收功能和抗氧化能力等方面的影响,并探讨...     

牛肌肉中的蛋白质组学研究进展

蛋白质组学的研究是生命科学进入后基因时代的特征,它已在医学、畜牧学、食品科学以及农业等领域得到广泛的研究与应用。牛肉因其蛋白质含量高、脂肪含量少、血红素铁丰富等,深受人们的喜爱。但目前对我国而言,牛肉仍需要大量进口,因此对于如何提高牛肉品质一直是我国畜牧和食品行业科研工作者不断努力研究的一大课题。随着基因组学的深入研究发展,从蛋白质水平研究牛肌肉及其形成机制,对提高牛肉品质有着重要的意义。肌肉主要是由水、蛋白质等成分构成,其性状及品质主要是由蛋白质来表达的。因此,研究蛋白质组学在牛肌肉中的认知对于调控牛肉的品质具有重要意义。本文主要对蛋白质组学的研究技术及其在牛肌肉中的研究做简要介绍。     

基于质谱的蛋白质组学技术及其在绒毛用羊中的应用

蛋白质组学(proteomics)是指应用蛋白质分离、鉴定和定量的技术研究蛋白质组的一门学科,与之对应的蛋白质组学技术随之快速发展,基于质谱的蛋白质组学技术更是在相关领域广泛应用。作者主要就蛋白质的相互作用、差异蛋白质组学和蛋白质的定量研究,一些基于质谱的蛋白质组学技术的原理和优缺点,以及绒毛用羊毛囊研究现状和基于质谱的蛋白质组学技术在绒毛用羊中的应用进展等方面进行了综述。最后,对蛋白质组学技术在绒毛用羊毛囊研究中的应用前景做出展望。     

纳米铜对大鼠肝脏毒性的蛋白质组2-DE图谱分析

为获取纳米铜对大鼠肝脏毒性的蛋白质组表达图谱,试验通过构建大鼠纳米铜中毒模型,采用双向凝胶电泳技术获取了大鼠纳米铜中毒组和对照组肝脏的蛋白质2-DE图谱,结合PDQuest 8.0软件分析发现200 mg/kg纳米铜组大鼠肝脏2-DE图谱中有27个蛋白质斑点表达上调,16个蛋白质斑点表达下调,共有43个差异蛋白质点。试验利用蛋白质组学技术研究大鼠纳米铜肝脏蛋白质组学,为在蛋白质水平阐明纳米铜的毒性作用机制奠定基础。     

家蚕差异蛋白质组学研究

2003年4月15日,美、英、德、日、法、中等6个国家共同宣布了人类基因组序列框架图的完成,这标志着生命科学进入了后基因组时代。到目前为止,已有大肠杆菌、秀丽线虫、果蝇、拟南芥、酿酒酵母、小鼠、家蚕等数十种生物的基因组序列图完成测序,并且还有上百种生物的基因组测序正在进行。蛋白质组学作为功能基因组学研究的主要内容,其研究模式主要有3种:第1种是检测蛋白质组理化参数的完全蛋白质组学;第2种是研究蛋白质间的相互作用;第3种是差异蛋白质组学——即通过比较分析不同状态下蛋白质表达图谱,实现对体内代谢调控的动态监测。近年来,越…     

桑树蛋白质组学研究进展

蛋白质是生理功能的执行者,是生命活动的直接体现者,要对生命的复杂活动有全面和深入的认识,就必须进行蛋白质组学方面的研究。桑树可作为果桑、菜桑和饲料桑等进行种植,是中国重要的经济林树种,为适应其多元化的育种目标,需要了解其分子机制,为此要加强桑树蛋白质组学方面的研究。本研究总结了桑树蛋白质提取方法及分离鉴定技术、生物与非生物胁迫和桑树不同组织器官的蛋白质组学研究的最新进展,以期为桑树分子生物学研究提供理论参考。     

番鸭呼肠孤病毒人工感染雏番鸭肝的蛋白质组学分析

应用蛋白质组学技术研究人工感染番鸭呼肠孤病毒(MDRV)的番鸭肝和健康对照番鸭肝的蛋白质组差异,为深入研究MDRV的致病机制奠定理论基础。通过二维双向凝胶电泳技术和MALDI-TOF-TOF质谱仪分析获取MDRV感染组与健康对照组之间的差异表达蛋白质,并运用蛋白质搜索鉴定软件Mascot 2.3.02鉴定蛋白质。结果共鉴定出38个差异表达蛋白质。比较感染组和健康对照组结果,感染组番鸭肝中有10个表达下调的蛋白质和17个表达上调的蛋白质,7个表达蛋白质仅出现在健康对照组,4个表达蛋白质仅出现在感染组。MDRV感染组的番鸭肝有肝细胞、神经细胞和肌肉细胞受损现象,同时存在细胞修复机制。差异蛋白质组学为MDRV分子发病机制的分析提供了一个新途径。     

感染新型鸭呼肠孤病毒雏番鸭和健康雏番鸭的肝蛋白质组学的差异

应用差异蛋白质组学研究感染新型鸭呼肠孤病毒(NDRV)番鸭后的肝和正常番鸭肝的蛋白质组差异,为深入研究NDRV的致病机制奠定良好理论基础。通过二维双向凝胶电泳技术和MALDI-TOF-TOF质谱仪分析获取NDRV感染组与非感染对照组之间的差异表达蛋白质,并运用蛋白质搜索鉴定软件Mascot 2.3.02鉴定蛋白质。结果共鉴定出26个差异表达蛋白质。感染组和非感染对照组比较,感染组肝中有9个表达下调的蛋白质和12个表达上调的蛋白质,3个表达蛋白质仅出现在非感染组,2个表达蛋白质仅出现在感染组。NDRV感染组的番鸭肝有肝细胞受损现象。差异蛋白质组学为NDRV分子发病机制的分析提供了一个新途径。     

植物低温胁迫蛋白质组学研究进展

寒害是一种主要的非生物胁迫因子,限制了许多植物的产量和地理分布,寒害胁迫能引起大量蛋白质在种类和表达量上的变化。蛋白质组学是后基因组时代功能基因组学研究的新兴学科和热点领域。蛋白质组学的分析有助于详细了解寒害胁迫的伤害机制以及植物的适应机制,目前已应用于拟南芥Arabidopsis thaliana、水稻Oryza sativa等模式植物,以及其它一些草本、木本植物上,对发生变化的蛋白质的种类及功能等进行了鉴定。     

应用双向电泳分析2株不同毒力的副猪嗜血杆菌蛋白质表达的差异

副猪嗜血杆菌是猪常见细菌性疾病的病原之一,临床表现为多发性纤维素性浆膜炎、关节炎和脑膜炎。运用蛋白质组学技术对不同毒力的副猪嗜血杆菌(Haemophilus parasuis)进行比较研究,明确差异蛋白质信息,对揭示其致病机制具有重要意义。本试验通过应用建立的双向电泳方法对选取同为4型的2株不同H.parasuis临床分离株(菌株A和菌株B)进行蛋白质组学研究,二者相互比较,共鉴定出10个差异表达蛋白质,其中菌株A有3个蛋白质表达量为增加,分别是谷氨酰tRNA合成酶、半胱氨酸合成酶和假设蛋白;菌株B有7个蛋白质表达量为增加,包括Yae T蛋白(omp85)、CTP合酶、天冬氨酰tRNA合成酶(有3个)、尿苷激酶、SecB蛋白。差异蛋白质的功能主要集中在蛋白质合成、氨基酸合成和嘧啶合成。研究结果进一步丰富了H.parasuis的毒力因子和致病机制的相关信息,也为今后开展H.parasuis免疫蛋白质组学研究奠定了基础。     

不同产丝量家蚕品系后部丝腺的蛋白质组学分析

家蚕幼虫后部丝腺是合成和分泌丝素蛋白的重要器官。为从蛋白质水平探究不同家蚕品系产丝量差异的原因,应用蛋白质组学研究方法,选取3个产丝量有较大差异的家蚕品系Ndx、大造和21-872为材料,通过双向电泳和基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术对各品系5龄第5天幼虫后部丝腺表达的差异蛋白进行鉴定,查找与丝蛋白合成相关的蛋白质。结果表明,茧丝突变品系Ndx后部丝腺的蛋白质表达水平与普通丝量品系大造和高丝量品系21-872有差异,差异表达蛋白种类主要为应激反应相关蛋白、能量相关蛋白、蛋白质合成相关蛋白和一些酶类,其中核糖体磷酸化蛋白P0和P2、蛋白质二硫化物异构酶、丝素轻链蛋白Fib-L以及丝素蛋白P25等在Ndx后部丝腺的含量明显低于其它2个品系。推测在茧丝突变品系Ndx的后部丝腺中,上述蛋白质表达量的变化可能是导致其不能正常吐丝结茧的原因。