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相似文献
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1.
椰子基因组DNA的提取及RAPD反应体系的优化   总被引:1,自引:0,他引:1  
以椰子叶片为实验材料,探索了椰子基因组DNA的提取方法,并对影响RAPD反应的各因素进行了优化,建立了椰子的优化反应体系和程序。试验最终建立的椰子RAPD反应总体积为20μL,各有关成分的最佳浓度分别为Mg2+2.5 mmol/L,Taq DNA0.75 U,dNTP 0.2 mmol/L,Primer 1μmol/μL,模板DNA2.5 ng/μL。PCR循环程序为:94℃预变性1.5min;94℃变性20 s,36℃退火20 s,72℃延伸45 s,35个循环;最后72℃延伸3 min。  相似文献   

2.
葡萄基因组DNA的提取及RAPD反应体系的优化   总被引:2,自引:0,他引:2  
[目的]建立适合该地区部分葡萄品种RAPD扩增反应体系.[方法]采用阿克苏地区部分葡萄品种(系)为试材,采用改良的CTAB法提取葡萄基因组DNA,对影响葡萄RAPD反应的Mg2+、Taq酶、dNTPs、引物、模板DNA浓度进行优化.[结果]其最佳反应体系为:模板DNA 100 ng,dNTPs 0.1 mmol/L,Mg2+2.0 mmol/L,引物0.3 μmol/L,Taq酶1.5 U,反应体系总体积为20 μL.[结论]改良的CTAB法具有步骤少、费用低、效率高等特点,比较适用于葡萄基因组 DNA的提取.优化后的体系,扩增产物稳定,条带清晰,重复性好.  相似文献   

3.
峨眉含笑基因组DNA提取及RAPD反应体系的优化   总被引:8,自引:0,他引:8  
以峨眉含笑嫩叶为材料,研究了峨眉含笑基因组DNA提取方法及RAPD反应条件。结果表明:采用改良的CTAB方法,提取的DNA质量较高,适宜于RAPD-PCR分析。在25μL反应体积中,RAPD分析的优化反应体系为:1.5 mmol/L Mg2+、0.8 mmol/L dNTP、240 nmol/L随机引物、80 ng DNA、1.0 U Taq DNA聚合酶。  相似文献   

4.
芨芨草基因组DNA提取与RAPD反应体系优化   总被引:1,自引:0,他引:1  
本文选出适合芨芨草Achnatherum splendens (Trin.) Nevski基因组DNA提取方法,对RAPD反应体系中的一些重要参数进行优化,包括模板浓度、Mg2+、dNTP、引物和Taq酶浓度,建立了适合芨芨草RAPD分析的PCR反应体系.即在12.5uL的反应总体积中Mg2+浓度为1.5mmol·L-1,dNTPs 浓度0.2mmol·L-1,Taq酶0.5U,20ng模板DNA,10bp附机引物3.2pmol.反应程序为:前6个循环为95℃变性30s,35℃复性45s,72℃延伸80s,后36个循环为94℃ 45s,36℃ 40s,72℃ 70s,最后72℃延伸10 min.该反应体系具有良好的稳定性和重复性.  相似文献   

5.
红花基因组DNA的提取及RAPD体系的优化   总被引:3,自引:0,他引:3  
用多种方法提取红花老叶及嫩叶DNA,进行比较,最后确定老叶DNA的提取用高盐低pH法,嫩叶用Michael等的方法.设计两次正交实验来确定红花RAPD体系中各成分的浓度,最终确定了一个既稳定又能扩增出最多条带的适合红花的RAPD最优体系,即25 μL反应液中,dNTP 200 μM, Mg2+1.5 mM,引物0.8 μM,Taq酶1U,模板30~60 ng.  相似文献   

6.
[目的]研究石鲽基因组DNA的提取及其RAPD体系的建立和优化。[方法]以石鲽为试材,按常规酚/氯仿抽提法提取其基因组的DNA,对影响RAPD反应的各因素进行优化,建立了石鲽的最佳RAPD反应体系和程序。[结果]采用常规酚/氯仿抽提法获得的DNA完全能够满足RAPD分析的要求。通过优化建立一套适合石鲽的稳定的RAPD反应体系:反应体系总体积为25μl,包括10×buff-er2.5μl,MgCl22 mmol/L,dNTPs 0.15 mmol/L,引物0.2μmol/L,模板30 ng,Taq酶1 U。扩增程序为:94℃预变性5 min,45次PCR循环(94℃变性45 s,36℃退火45 s,72℃延伸2 min和72℃延伸10 min。利用该体系对OPK和OPV系列共40条引物进行扩增,发现其中部分引物能产生稳定、清晰的条带。[结论]该体系为石鲽遗传多样性以及相关分子标记的研究奠定了基础。  相似文献   

7.
以假臭草叶片为材料,对影响其随机扩增多态DNA(RAPD)反应的各因素进行优化.建立了假臭草RAPD的优化反应体系和程序,即在10μL反应体系中,5ng(/10μL)模板DNA,1.0μmol/L随机引物F15,150μmol/LdNTPs,2.0mmol/LMg^2+,1.0UTaqDNA聚合酶;扩增程序为95℃预变性4min,95℃变性40S,36℃退火40S,72℃延伸1min,10个循环,后94℃变性30s,35℃退火30s,72℃延伸1min,35个循环,72℃延伸5min,4℃保温。  相似文献   

8.
用于RAPD分析的油菜总DNA的快速提取   总被引:12,自引:1,他引:12       下载免费PDF全文
通过 CTAB法、纯化法和简便法所提 DNA质量效率和 PCR-RAPD扩增效果的比较 ,优化和建立了无液氮处理 ,可用于 RAPD分析的油菜总 DNA的提取方法。该方法能在油菜生长发育早期进行单株微量的提取 ,快速进行 RAPD分析和品种鉴定  相似文献   

9.
金花梨基因组DNA提取及其RAPD分析   总被引:4,自引:0,他引:4  
以金花梨嫩芽为试材 ,通过在磨样时添加不同量的抗氧化剂Vc ,对CTAB法作了一定的改进 ,比较了不同处理的提取效果 ,再分别以成熟叶片、新梢和嫩芽为材料 ,采用改进的CTAB法提取基因组DNA ,进一步比较了不同材料的提取效果 ,并以金花梨及其 18个变异单系的基因组DNA为模板 ,4 0个随机引物进行RAPD分析。结果表明 :以嫩芽为试材 ,在磨样时每克鲜样添加 0 10g的Vc ,能够提取到高质量的基因组DNA ;采用改进的CTAB法 ,用成熟叶片、新梢和嫩芽均能提取到可直接用于RAPD分析的基因组DNA ;大部分引物可以在不同模板上扩增出条带 ,但仅有 5个引物可以同时在金花梨及其 18个变异单系基因组DNA上扩增出条带 ;用RAPD结果对金花梨及其 18个变异单系进行聚类分析  相似文献   

10.
苦瓜基因组DNA提取和RAPD分析   总被引:5,自引:0,他引:5  
采用4种CTAB法和改良SDS法对苦瓜的基因组DNA进行了提取,结果表明,改良SDS法提取的DAN质量较差,主要表现在多糖类物质去除不彻底;4种CTAB法都适合苦瓜DNA的提取,提取的DNA均适于RAPD分析,尤以改良CTAB法最为简单,快速。  相似文献   

11.
褐飞虱种群的DNA的提取及RAPD分析   总被引:6,自引:0,他引:6  
以福建省5个不我的褐飞虱种群为虫源,通过对褐飞虱基因组DNA提取和RAPD分析方法的摸索,结果表明,用CTAB方法提取的5个种群的基因组DNA,无降解情况,RNA去除较为干净,可用于褐飞虱的DNA提取;随机引物筛选结果为,所用的45个随机引物中5个引物扩增结果完全相同,7个引物出现多态性,扩散带数为49条具多态笥,占42.85%。利用Nei氏相似系数,对5个种群的RAPD-PCR结果进行分析,结果  相似文献   

12.
野生猕猴桃DNA的提取及RAPD分析体系的建立   总被引:1,自引:0,他引:1  
采用3种不同的方法,即经典CTAB法、改良CTAB法和氯化苄法提取野生猕猴桃基因组DNA,效果均较好,其中改良CTAB法提取的DNA质量最高,DNA降解少,杂质含量少。通过对循环次数、DNA模板用量、DNA聚合酶的种类和浓度等因素的研究,建立了野生猕猴桃RAPD分析体系,从PCR扩增程序和反应体系两个方面对野生猕猴桃RAPD分析体系进行了优化,并验证了优化后的体系,扩增谱带清晰、多态性强,稳定性好。  相似文献   

13.
长白山杜鹃花基因组DNA提取及RAPD体系的建立   总被引:1,自引:0,他引:1  
采用改良的CTAB法提取杜鹃花的基因组DNA,所得的DNA纯度高、质量好,可用于RAPD分析.筛选出的杜鹃花RAPD反应的最佳体系为25μL反应体系中包括模板DNA20~200ng.引物10pmol,dNTPs100μmol·L-1,TaqDNA聚合酶0.5U,Mg2 2.5 mmol·L-1,10xbuffer缓冲液2.5 mmol·-1,其余部分用无茵超纯水补充.PCR扩增程序为94℃预变性5 min;94℃变性1 min,37℃退火1min,72℃延伸2min,40次循环;72℃最终延伸7min.应用优化后的反应体系PCR扩增获得的RAPD指纹图谱带型清晰,重复性好,为长白山杜鹃花品种鉴定、分类的研究提供了一定基础.  相似文献   

14.
旨在筛选出绣线菊属 RAPD 反应的最佳体系,为绣线菊属植物种质资源遗传多样性和亲缘关系的研究奠定基础.试验以 10 种绣线菊属植物为材料,采用改良 CTAB 法进行冬芽和嫩叶的总 DNA 提取并对影响 RAPD 扩增效果的因素进行优化.通过单因素优化筛选出最佳的 20μl 反应体系10×Taq buffer 2μl,Taq 酶 1.0U,0.15mmol/L dNTP,DNA 2ng/μl,引物 0.21μ mol/L,Mg2 2.0mmol/L;反应程序94℃预变性 4min,然后进行 40 个循环94℃变性 45s,37℃退火 1min,72℃延伸 1min.最后72℃延伸5min,4℃终止反应.结果发现,采用改良 CTAB 法所提取绣线菊冬芽的 DNA 达到 RAPD 反应的要求.筛选体系扩增出清晰稳定的多态性条带,可用于对绣线菊属遗传育种方面的研究.  相似文献   

15.
为获得一种较为理想的杨树基因组DNA的提纯方法,根据提取植物基因组DNA的经验,优化了Clark利用CTAB提取植物基因组DNA的方法。加入了一系列的去除蛋白、酚类物质,利用MgCl2沉淀DNA,通过与三种常规的提纯方法进行比较,经紫外检测和电泳检测,结果表明优化的方法获得了高质量的DNA,是较为理想的杨树基因组DNA的提纯方法。能满足RAPD及其他分子生特学研究的需要。在试验中还利用该方法提纯了五个品种的杨树基因组DNA,采用RAPD分子标记技术,在引物S174作用下成功地进行了PCR扩增及品种鉴定。  相似文献   

16.
枸杞基因组DNA的提取及RAPD反应体系的优化   总被引:2,自引:0,他引:2  
张磊  任贤 《安徽农业科学》2009,37(30):14611-14613
[目的]研究枸杞基因组DNA的提取及RAPD反应体系的优化。[方法]采用了进一步优化的CTAB法提取枸杞基因组DNA,检测所提取的DNA的浓度范围,并对RAPD反应体系进行了科学、合理的优化。[结果]结果表明,浓度范围在3.5~5.5μg/μl,完全能够满足RAPD—PCR的要求。[结论]该方法具有步骤少、费用低、效率高等特点,比较适用于枸杞基因组DNA的提取。  相似文献   

17.
笔者通过比较快速提取方法和常规方法提取的DNA的质量和RAPD扩增结果,建立了一种适合番茄RAPD分析的快速,简单,成本低的DNA提取方法。该方法的材料不用液氮和Rnase消化处理。  相似文献   

18.
蜜蜂DNA提取纯化与RAPD反应体系的建立   总被引:5,自引:9,他引:5  
以意大利蜜蜂为材料,研究了蜜蜂DNA的提取以及对RAPD分析的影响因素,包括模板浓度、Mg^2 、dNTP和引物,建立了适于蜜蜂RAPD分析的PCR反应体系,即20μL反应体系中,包括10mmol/L Tris—HCl(pH8.3)、50mmol/L KCl、20~60ng DNA、3.0mol/L MgCl2、0.2mmol/L dNTP、0.5μmol/L随机引物和1.5unit Taq聚合酶。扩增程序为:94℃预变性5min,94℃变性1min,36℃退火1min,72℃延伸2min,40个循环:最后在72℃延伸10min.  相似文献   

19.
8种水稻基因组DNA提取方法的比较   总被引:2,自引:0,他引:2  
[目的]寻找操作简便、耗时短、成本低的水稻基因组DNA提取方法。[方法]分别以水稻幼嫩黄化叶片和老叶片为材料,用8种方法提取其中的DNA,测定所提DNA的浓度和纯度,并对其进行PCR扩增和电泳检测,比较各方法的提取效果。[结果]8种方法提取的DNA浓度分别为35.15、30.80、67.30、26.15、23.55、8.95、48.05、54.26μg/ml,方法③提取的DNA浓度最大,但PCR扩增效果较差;改进的SDS法(方法⑦、⑧)提取的DNA纯度较高,PCR扩增产物电泳条带较亮,但这2种方法操作程序复杂,成本较高,提取每份样品的成本分别为14、31元,远高于其他提取方法。[结论]除方法③外,其余5种简化方法均能得到较高质量的水稻基因组DNA,且提取成本远低于传统SDS法。  相似文献   

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