利用RAPD标记研究中国芥菜型油菜遗传多样性

利用ＲＡＰＤ标记,对以我国西北和西南为主的６８个芥菜型油菜地方品种和４个加拿大引进品种（系）的遗传多样性进行了研究。通过３１个随机引物的ＲＡＰＤ分析,表明选用的７２个品种（系）间存在广泛的遗传变异,多态性位点比率达８５．３１％。经ＵＰＧＭＡ聚类分析将它们划分为６大类群,从聚类图可得如下结论：（１）地理差异和生态环境对遗传差异有重要影响,即来自同一省份的品种基本上聚在同一类群中。（２）我国冬播和春播     

贵州省白菜型油菜的RAPD遗传多样性分析

为了解贵州地方油菜种质资源的遗传多样性,选取136份贵州省白菜型油菜,通过RAPD分子标记,进行遗传多样性分析.筛选了17个随机引物获得172个标记住点,其中106个位点具有多态性,多态率达61.6%.在遗传距离为0.94上,可以分为4个类群,从聚类结果看出:来源相同或相近地区的种质基本上能聚为一簇,但它们的亲缘关系与其产地的地理分布又并不是完全一致,可能是由于贵州特殊地理环境、人为因素等的影响.     

贵州白菜型油菜地方品种遗传多样性分析

利用RAPD技术对65个贵州白菜型油菜地方品种的遗传多样性进行了研究。从78个引物中筛选出16个多态性和重复性好的引物对供试材料进行标记分析。16个随机引物共扩增出153个位点条带,其中137个表现出多态性,占89．5％;主要分布于150～1800bp,平均每个引物扩增出8．6条多态性条带。遗传距离的变化幅度为0．1431～0．9904,遗传相似性变异范围为0．3714—0．8667。65个参试品种中遗传距离最小的是凤冈花油菜（2）和麻江花油菜（2）,为0．1431;遗传相似性为0．8667。结果表明：贵州白菜型油菜品种间具有丰富的遗传多样性,并表现出比较明显的地域性。     

23份芥菜型油菜同工酶遗传多样性分析

采用酯酶(EST)、淀粉酶(AMY)和过氧化物酶(POD)同工酶电泳,对23份芥菜型油菜材料进行了遗传多样性分析。同工酶电泳共检测到3种酶的多态型条带26条,酯酶和淀粉酶都存在着丰富的多态性。带型分析结果表明,酯酶EST-2、EST-3特征带可能与材料地理来源有关,淀粉酶AMY-2、AMY-3、AMY-4和AMY-5特征带可能与控制籽粒颜色基因的表达有关。参试23份材料的遗传相似系数在0.625~1.0,聚类分析可将其分为冬播型和春播型为主的两大类群,冬播型类群中全部为黑籽材料,春播型类群中包含了所有参试的8个黄籽材料和4个黑籽材料。不同芥菜型油菜品种之间因其类型、籽粒颜色及地区等因素差异而存在较大的遗传差异。     

中国西南地区芥菜型油菜资源遗传多样性分析

 【目的】研究中国西南地区丰富的芥菜型油菜资源遗传多样性，为芥菜型油菜资源的保护和育种利用提供有益的数据。【方法】选取以西南地区为主的73份芥菜型油菜资源，分别进行14个随机引物RAPD标记多态性分析结果的聚类分析和15个主要植物学性状量测数据的聚类分析。【结果】RAPD标记多态性分析结果的聚类分析显示为3大类，共15个亚类：四川盆地资源为第1大类，含川东、川南、川北和重庆来源等6个亚类；盆周及盆周高原和云南部分资源为第2大类，分川东南、川西南和川西北来源等4个亚类；云贵高原及长江两岸为第3大类，以贵州、云南来源的资源为主，分贵阳周边、金沙江流域和云南中部来源等5个亚类。植物学性状量测数据的聚类分析显示为4大类，共14个亚类：第1大类以川东南、重庆和云南来源的资源为主，分3个亚类；第2大类以川南、川北、云南和贵州来源的资源为主，分4个亚类；第3大类以贵州、四川来源的资源为主，分4个亚类；第4大类以川西北来源的资源为主，含3个亚类。【结论】西南地区芥菜型油菜资源间差异明显，具有丰富的遗传多样性；RAPD标记多态性分析结果和植物学性状量测数据的聚类分析结果，显示分类主要遵循地域和生态环境规律，可分清芥菜型油菜资源间的亲缘关系和遗传距离远近；在分子水平上，分类结果可能更深入和准确可靠。     

芥菜遗传多样性的RAPD分析

随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）是一种新的分子标记技术,利用ＲＡＰＤ标记对芥菜（Ｂｒａｓｓｉｃａ ｊｕｎｃｅａ Ｃｏｓｓａ）１６个变种的遗传多样性进行了分析,从６０个１０ｂｐ随机引５物中筛选出２７个有效的,这２７个有效引物共扩增出３３６条ＤＮＡ带,其中２７５条为多态性带,占总数的８１．８５％,平均每个引物扩增出的ＤＮＡ带数为１２．４４,不同引物扩增出各自不同的ＤＮＡ指纹图谱,大部分图谱均有特征或特     

三峡库区10个芥菜型油菜品种的SSR标记聚类分析

[目的]用SSR分子标记研究三峡库区芥菜型油菜品种的遗传多样性。[方法]使用9对SSR引物,对10份来自三峡库区的芥菜型油菜品种进行遗传多样性分析。[结果]聚类结果表明,在遗传距离0.47处可将供试材料分为3类。[结论]地理和生态条件是影响三峡库区芥菜型油菜类群的主要因素。     

52份滇西南地区野生油菜遗传多样性的RAPD分析

 选用9条多态性和重复性好的随机引物对来自滇西南地区的52份野生油菜资源进行遗传多样性分析,共获得87个RAPD标记位点,其中有63个标记位点具有多态性,多态率达72.41％。根据87个标记位点的信息,用Popgene1.32软件分析,结果显示居群总的遗传变异(Ht)为0.3899,遗传分化系数(Gst)为0.4875,基因流(Nm)为0.5256,平均期望杂合度(He)为0.3890,Shannon指数(I)为0.5739。利用UPMGA法建立了云南省52份野生油菜的亲缘关系聚类图,在遗传距离为0.498上,52份野生油菜居群被分为6个类群,27号居群 、3号居群、10号居群、37号居群分别是一个单独的类群,16号居群与51号居群为一个类群,其它45个居群聚为一大类群。     

地黄品种遗传多样性RAPD分析

用CTAB法提取10个地黄品种幼叶的基因组DNA，用紫外分析法和琼脂糖凝胶电泳方法检测基因组DNA的纯度、大小和浓度。结果表明，从80条RAPD引物中分别筛选出适合于地黄RAPD标记分析的引物17条。17条RAPD引物对10个地黄品种（系）扩增出177条带，多态条带比率（PPB）为61．58％，平均多样性指数（I）为0．3135，遗传相似系数（GS）在0．63～0．93，平均GS为0．7545。RAPD标记的聚类分析结果，将10个地黄品种分为2类：第1类含有6个品种，包括组培85—5、大田85—5、组培9302、金白地黄、金状元和大田9302；第2类含有4个品种，包括北京1号、大红袍、地黄9104和野生地黄。     

芥菜型油菜与甘蓝型油菜种间杂种后代的RAPD分析

 为了揭示芥菜型油菜与甘蓝型油菜种间杂种后代的遗传分离规律 ,用芥菜型油菜四川黄籽作母本与甘蓝型油菜 10 47自交系杂交 ,杂种F1人工自交或用 10 47自交系花粉回交 ,然后将亲本、杂种F1、F2 和BC1代用 16个随机引物进行PCR扩增。共扩增出 98条带 ,其中双亲共有的带 35条 ,四川黄籽特异带 30条 ,10 47特异带 33条。带型统计分析结果表明在芥甘杂种后代中来自 10 47的遗传物质比来自四川黄籽的遗传物质更能传递给后代 ,这种趋势与杂种后代植株的育性无关 ,在回交后代中四川黄籽的遗传物质比在自交后代中丢失更快。并对造成芥甘种间杂种后代分离扭曲的原因进行了探讨。     

贵州辣椒地方品种分子遗传多样性分析

在辣椒基因组的75个SSR标记中选出多态性丰富的17个,用于检测48个贵州辣椒地方品种,按类平均法作聚类分析.在遗传距离0.51阈值处,将参试材料分为五类:第一类含3个品种;第二类只有1个品种;第三类为2个品种;第四类分为5个亚类,第一亚类6个材料,第二亚类9个材料,第三亚类15个材料,第四亚类9个材料,第五亚类2个材料;第五类只有1个品种.参试材料的7种果型分别归于不同的类或亚类中,表明聚类结果与果型有一定的关联,同果型材料问遗传差异较小,但少数同果型的材料分布在不同类群中,与其他同果型材料间有较大遗传差异.另外,17个标记平均可检测3.8个等位基因.平均多态信息量为0.6.平均标记索引系数为2.32,48个品种同的遗传距离在0～0.566,说明,贵州辣椒种质资源的遗传多样性相对较丰富,具有良好的应用前景.     

福建笋子芥种质资源遗传多样性的RAPD分析

从200个随机引物中筛选出10个引物,对11份笋子芥材料进行RAPD分析,并对笋子芥遗传多样性和分类进行研究.结果表明:10个引物共扩增出93个位点,其中多态性谱带65条,多态性程度为69.9%;平均每个引物产生9.3条多态性谱带,每个引物可扩增出7-13条,谱带大小为100-2000 bp.聚类分析结果表明,遗传距离为0.38时,11份笋子芥可聚成四大类群.     

基于RAPD技术的韭菜品种间遗传多样性分析

为了研究韭菜种质资源的多样性和品种间的相似问题,利用RAPD分子标记技术分析了我国11个地区15个韭菜品种间的遗传多样性。结果表明,采用20条RAPD引物,共扩增出136个条带,其中多态性位点98个,平均多态性比率为72%。依据15个韭菜品种间的Nei’s遗传距离进行UPGMA聚类分析,在遗传距离为0.34处将15个韭菜品种分为4个类群:第1类群包含独根红、兰州白根和南京马鞭韭3个品种;第2类群包含汉中冬韭、上海强韭-3和上海强韭-6 3个品种;第3类群包含四季青、桂林小红根、天津大青苗、新疆白根和嘉兴雪莲5个品种;第4类群包含天津大金钩、环韭、平丰苔韭和抗寒薹韭4个品种。韭菜品种间遗传相似性和来源地之间没有必然的联系。     

贵州省甘蓝型油菜主推品种的SSR遗传多样性分析

[目的]从分子水平上了解贵州省甘蓝型油菜主推品种的遗传多样性。[方法]利用国家油菜区域试验DNA指纹鉴定使用的40对SSR引物对贵州省9个甘蓝型油菜主推品种进行多态性检测,并进行聚类分析。[结果]试验共扩增出条带191个,其中多态性条带143个,多态性比率为75%。经聚类分析,9个油菜品种被分为A、B 2簇,其中A簇包含7个品种,B簇为贵州省油料研究所选育的2个品种。A簇在相似系数0.643 4处又分为A1、A2 2个亚簇,A1亚簇为贵州省油菜研究所选育的3个品种,A2亚簇为贵州省油料研究所选育的另4个品种。[结论]同一单位选育出的品种都有更为接近的遗传背景;在该研究所用品种中,贵州省油料研究所选育的品种遗传基础相对较广,但黔油17与黔油29的遗传相似性系数达0.87,遗传基础较为相近。     

甘薯抗、感茎线虫病品种遗传多态性的RAPD分析

利用田间自然诱发方法对 100余份甘薯品种连续进行 3年茎线虫病的抗性鉴定,选取其中 21份抗、感性稳定的品种作为供试材料,含高抗品种 10个、抗病品种 2个、感病品种 2个、高感品种 7个。以徐 781和栗子香的总DNA为模板,从 70个随机引物中选出 16个引物对其进行随机扩增,均得到了稳定的RAPD图谱。扩增出的片段分子量为 0 3~2 0kb,条带数在 1至 9之间,共扩增出 119个条带,其中, 84 03%的谱带为多态性带。利用NTSYS PC软件中的Simqual程序估算DNA的相似系数,UPGMA程序构建遗传相关树状图。遗传多态性的RAPD分析可为甘薯抗茎线虫病品种选育的亲本组配提供依据。     

Genetic Diversity Analysis of PVY Resistant Potato Varieties （Clones） by RAPD Markers

DNA fingerprints of 37 PVY resistant potato varieties (clones) were generated using PCR-based RAPD analysis. All 37 varieties were differentiated by banding patterns obtained from 17 primers that generated 164 polymorphisms. Similarity matrices were calculated with the simple matching coefficient. The genetic distance value among them was between 0.27 and 0.50, with average value being 0.35. The average link clustering algorithm was used to construct a dendrogram with Statistica. They were classified into three groups according to clustering results, and the results presented some geographic relationship. Dendrogram showed close genetic relationships between a number of varieties (clones) of similar pedigree. This study has shown that RAPD marker is a useful tool for potato variety identification, differentiation, and estimation of genetic relationships.     

基于RAPD技术的狼蛛科五种蜘蛛的遗传多样性分析

采用RAPD技术对狼蛛科5种蜘蛛的遗传多样性进行了研究。从100个10 bp寡核苷酸随机引物中筛选出10个有效的随机引物对基因组DNA进行了扩增,共记录187条片段,平均每个引物18.7条。种群内多态位点比例在16.98%~44.20%之间,平均遗传多态度0.112 0,Shannon多样性指数0.162 5。从统计结果来看,5种蜘蛛没有普遍存在的位点,种间遗传多样性较丰富,种内的遗传多样性较低,外部形态相似的种间遗传距离较近,亲缘关系较近。