瘤胃细菌DNA提取方法的研究与优化

为优化出可获得完整瘤胃细菌总DNA的方法,以满足分子生物学研究需要,试验采用3种DNA提取方法对瘤胃细菌DNA进行提取并对提取效果进行了比较。结果表明:细菌基因组试剂盒法提取的DNA其OD_(260)/OD_(280)值在1.8以上,电泳无杂带,DNA的提取效果最佳,PCR扩增效果较好;珠磨-CTAB法提取的DNA其OD_(260)/OD_(280)值在1.8以上,电泳结果存在少量杂带;水煮法提取的DNA其OD_(260)/OD_(280)值在2.0以上,无电泳条带,DNA严重降解。推荐采用细菌基因组DNA试剂盒法和珠磨-CTAB法对瘤胃细菌进行DNA提取。     

辽东栎基因组DNA提取方法比较与优化

针对辽东栎叶片组织中多糖含量高严重影响基因组DNA的提取问题,比较了改良SDS法、改良CTAB法1和改良CTAB法2等3种方法的处理效果。结果表明：用改良SDS法提取DNA多糖杂质多,易降解、褐化严重;用改良CTAB法1提取DNA难以去除植物组织中的多糖类杂质;而改良CTAB法2提取的DNA,杂质少,纯度高。     

超声波提取牛奶中细菌DNA方法的优化

本试验通过采集乌鲁木齐燕儿窝种牛场2003年5月份所有泌乳奶牛的牛奶样品,使用不同超声波功率（0、100、120、140、160 W）处理后,采用十六烷基三甲基溴化铵（CTAB）、十二烷基磺酸钠（SDS）法提取牛奶中细菌DNA,并通过DNA浓度、纯度和细菌通用引物扩增16S rDNA的V6-V8区判定DNA的质量,筛选出提取牛奶中细菌DNA的最佳方法。结果表明,未使用超声波处理样品,直接采用CTAB、SDS法提取出的DNA无法扩增出细菌16S rDNA V6-V8区,而使用不同超声波功率（100、120、140、160 W）处理后能扩增出细菌16S rDNA V6-V8区,其中超声波功率140 W处理样品10 min并结合CTAB法提取牛奶中细菌DNA的浓度最高,为203.35 μg/mL。因此,超声波功率140 W处理样品并结合CTAB法提取牛奶中细菌DNA的方法最优,能满足从分子水平上进一步研究乳房炎相关细菌的要求。     

奶牛血液保存条件和DNA提取方法的优化

本文研究中国荷斯坦牛血液在不同温度、时间保存的条件下（4℃保存0d为A组；-70℃保存30d为B组；4℃保存7d为C组）对DNA提取效果的影响和对比试剂盒法（E）、试剂盒改良法（F）、酚-氯仿法（G）提取中国荷斯坦牛血液基因组DNA的效果。试验结果表明：A组与B组差异不显著（P〉0．05）；A组、B组与C组差异显著（P〈0．05）。4℃保存0d对DNA提取效果影响最小。在A组中，E与F差异不显著（P〉0．05）；E、F与G差异显著（P〈0．05）。综合各方面因素。试剂盒改良法最好。     

牛凝固血基因组DNA提取方法的比较及优化

为筛选出一种从牛凝固血中高效获得基因组DNA的方法,本研究选择64个凝固血样,分别进行匀浆破碎和手动剪碎的预处理,结合酚-氯仿抽提和试剂盒提取方法,提取基因组DNA,并选择抗凝血作为参照,对试验耗时、DNA数量和质量进行比较。结果表明:通过对牛凝血块进行匀浆破碎预处理,不仅缩短了蛋白酶K的消化时间,而且获得了高质量基因组DNA,浓度和纯度均达到抗凝血提取效果(P0.05)。酚-氯仿提取法相比试剂盒法,虽然得到更多量的DNA,但是DNA质量下降,而且试验耗时增加。本研究证实,匀浆破碎预处理后的牛凝固血样可以作为高质量基因组DNA的样本来源,并可替代抗凝血,解决生产中抗凝血不易获得和采集的问题。     

动物DNA提取方法概述

近年来有很多关于动物DNA提取方法的探究,由于野外取材的局限,大部分DNA的提取都是从处理过材料中操作的,比较常见的有:酒精标本、甲醛标本、石蜡标本等,也有从陈旧皮张、动物毛发、血痕、粪便等中提取DNA的,这些报道已有很多,但很少有将这些方法进行对比综合报道,本文将近年来常见的动物DNA提取方法做了一个总结,希望为分子生物学研究积累一定的资料。     

动物产品的DNA提取方法

采用以异硫氰酸胍法为基础的提取方法分别提取牛肉、山羊肉、鸡肉、猪肉干、鱼粉、牛奶粉、牛奶、鱼油以及牛油中的DNA,18S rDNA片段的PCR扩增结果表明各样品已提取到DNA,且DNA中不含抑制PCR的物质。牛肉、牛奶粉、牛奶、加入牛肉DNA的鱼油和牛油的牛源性成分PCR检测结果为阳性;山羊肉和加入山羊肉DNA的鱼油的羊源性成分PCR检测结果为阳性;牛、羊源性成分PCR产物经酶切鉴定为非假阳性。这些结果显示本研究建立的动物产品DNA提取方法是可行的。     

奶牛瘤胃微生物DNA提取法的研究与优化

试验通过对提取瘤胃微生物DNA常用的方法进行比较,优化出一种可以获得完整瘤胃微生物总DNA片段的方法,使其能进一步满足PCR的扩增要求以及后续的分子生物学研究。试验的瘤胃液样本取自3只装有瘘管的荷斯坦奶牛,将方法适当改进。结果表明:珠磨-CTAB法提取的总DNA片段长度大于20 kb,OD260/OD280在1.8以上,DNA的提取效果最稳定。同时对所提的DNA样本应用PCR方法进行了检测,成功扩增出长度分别为1 500 bp、1 000 bp左右的瘤胃细菌和古细菌的16S rDNA序列。结果证明了该方法所提取的瘤胃微生物DNA可以应用到后续的试验研究工作中。     

白色瘤胃球菌DNA提取的优化试验

<正>由于纤维素酶具有降解纤维素的能力,在饲料工业上功效卓著,但是纤维素酶菌株产酶量低、活力低、成本高及储存加工影响酶稳定性等问题一直困扰着人们,所以筛选高纤维素酶活性的菌株和对菌株进行生物技术的改造是人们研究的主要方向之一。反刍动     

家兔全血基因组DNA提取方法

以肝素钠抗凝的皖系长毛兔全血为材料,以常规的酚氯仿抽提法为基础,采用改进的方法提取基因组DNA.结果表明,提取的基因组DNA纯度高,用琼脂糖凝胶电泳检测基因组DNA,主带清晰、无拖尾现象.     

快速提取桑树线粒体DNA的方法

线粒体是进行呼吸的细胞器,在绿色植物中占有重要地位.它具有相对独立的遗传物质线粒体DNA(mtDNA).研究表明,细胞质雄性不育、抗除草剂等性状与mtDNA有关,因此,mtDNA的研究越来越受重视.另外,mtDNA还被用来研究植物系统发育、分类等.然而mtDNA的快速、高效提取是限制深入研究的重要因素.传统的方法利用梯度离心提取mtDNA,其成本高,耗时长,产率低,对设备要求也较高.本文根据盖树鹏等提取mtDNA方法加以改进,简单、快速提取了桑树mtDNA,为从分子水平研究桑属种质资源的系统发育、分类提供了基础.     

适于蚁蚕的基因组DNA提取方法

昆虫基因组DNA提取是对昆虫在分子水平上进行研究的关键,提取的DNA的纯度、浓度及完整性是进行基因工程各项研究所必须的条件。本研究主要对应用4种方法,以柞蚕蚁蚕时期组织材料为样品提取DNA后进行比较分析。结果发现,利用BIOMIGA试剂盒,置于36℃条件,经50μL蛋白酶K 70℃消化6h后,5μLRNase A酶37℃消化10min,提取的DNA质量较好。且样品易于保存,保存时间长,提取时间短的优点,对提高柞蚕研究效率具有实用价值。     

提取动物组织DNA的方法比较

传统方式提取DNA大多运用氯仿、苯酚以及异丙醇等其他相关的试剂,此提取DNA的方式纯度相对而言比较低,实验过程非常的复杂、耗时之多,并且还有可能产生毒性的物质。所以,运用商品化的试剂盒针对DNA进行提取,显得更加的简洁、便利。本文首先介绍了试剂盒提取DNA方法的相关内容,并以两种动物组织DNA提取方法的比较为具体的案例进行了分析。     

微孢子虫DNA提取方法的比较

本实验采用陈秀改进法、SDS法、CTAB法和TEK改进法对四种微孢子虫SD1、SD2、SD3、SD4基因组DNA进行抽提,并对抽提效果做了对比,结果表明,陈秀改进法对SD1、SD2、SD3基因组DNA抽提效果较好,TEK改进法对SD2、SD3、SD4基因组DNA抽提效果较好,SDS法和CTAB法对四种微孢子虫基因组DNA的抽提效果均不理想,     

猪粪样DNA提取方法的比较

哺乳动物胃肠道中存在约30个属500多种不同的细菌,约1×1014个活细菌,其形成了复杂而动态平衡的微生态系统,对宿主营养物质的消化、吸收及免疫机制激活等起着十分重要的作用[1].这微生态平衡失调,机体正常的生理功能就会发生紊乱,导致疾病的发生、流行,对畜牧养殖业尤其是规模化养殖等带来极大的潜在威胁.因而,近年来对胃肠道微生物区系结构及其多样性研究成为热点,但由于胃肠道的特殊生存环境,目前有60%～80%的微生物是无法用传统的分离培养技术进行研究, 从而阻碍了人们对胃肠道微生物结构及其多样性的客观认识.     

白色瘤胃球菌DNA提取的优化试验研究与分析

白色瘤胃球菌实为一种瘤胃内纤维分解菌,其利用所分泌的纤维素酶,来降解纤维素.本试验利用白色瘤胃球菌这一特性,首先基于DNA提取对其加以优化,为深入研究奠定基础.     

普氏原羚粪便DNA提取方法的改进与比较

为提高普氏原羚粪便DNA提取效果,在总结传统提取粪便DNA方法的基础上,设计了新的提取方法.该方法以NaCl替代TE溶解粪便样品.增加溶茵酶用量以减少蛋白酶K用量.经琼脂糖凝肢电泳和PCR扩增12SrRNA片段对改进方法与传统提取粪便DNA方法进行比较,发现用改进方法提取的DNA质和量均比传统方法好,且可满足一般分子生物学实验的需要.扩增的普氏原羚12SrRNA片段已经测序.并递交GenBank,登录号为EU247756.新方法不仅克服了传统提取法中DNA降解严重的问题.而且有效地解除了粪便DNA对Taq酶的抑制作用.为普氏原羚遗传多样性保护提供技术支持.     

小鼠基因组DNA提取方法比较研究

脱氧核糖核酸(DNA)作为大部分有机体和病毒的遗传物质,与生物的遗传与变异息息相关。很多研究都是基于核酸分析的基础开展的,对核酸的纯度要求很高。本研究采用4种常用方法提取小鼠基因组DNA,以探讨不同提取方法对DNA质量的影响。结果表明,酚/氯仿抽提法获得的DNA纯度较好,无RNA污染,但有少许蛋白质未剔除;试剂盒法提取到的DNA纯度高、核酸浓度大且无污染,但片段较小,可进行常规的PCR等核酸水平研究。     

犊牛盲肠微生物总DNA的提取方法

采用反复冻融法、玻璃珠法和超声波+反复珠磨的方法提取犊牛盲肠的微生物总DNA,并对以上三种方法进行比较,从中确定最佳的方法,以实现普通实验条件下成功提取符合PCR扩增要求的DNA.经紫外分光光度分析表明,超声波+反复珠磨的方法所得的DNA的A<,260>/A<,280>的比值为1.81,0.8%琼脂糖凝胶电泳结果显示,所提DNA片段分子量大于20 kb,适于酶解和PCR扩增要求.以提取的DNA样品为模板,利用细菌通用引物,对其16S rDNA进行PCR扩增,获得了1.7 kb大小特异性很好的预期条带.这是研究犊牛盲肠微生物的关键一步.     

禽类全血DNA不同提取方法的比较

以4个不同禽类品种(金定鸭、长乐灰鹅、象洞鸡和闽南火鸡)为试验材料,采用4种不同方法从其全血中提取DNA,比较不同方法的DNA提取效率。结果表明:由于品种之间DNA存在差异,DNA的质量和产率也有显著差异,金定鸭全血DNA用树脂法效果最佳;长乐灰鹅和闽南火鸡全血DNA用酚-氯仿法效果最佳;而盐析法是提取象洞鸡全血DNA的最佳方法。