枸杞属两个种的RAPD遗传多态性分析

采用优化的CTAB法提取宁杞1号和黑果枸杞的叶片基因组DNA,利用紫外分光光度计、琼脂糖凝胶电泳检测所得DNA的浓度和纯度,并进行PCR扩增。从101个引物中筛选出12个10 bp的随机引物对这两种枸杞的DNA样品进行RAPD扩增,共得到111条谱带,61条表现出多态性,多态性比率达54.95%。结果表明,宁杞1号与黑果枸杞的相似系数S=0.618,遗传距离D=0.382。     

德州驴RAPD遗传多态性分析

采用RAPD技术探讨了德州驴的遗传多态性。从20条随机引物中筛选出8条引物对德州驴56个个体的基因组DNA进行随机扩增。结果表明,8条随机引物共扩增产生了784条谱带,其中多态性条带为165条,多态比率在11.1%～37.5%之间;与其他驴的遗传多样性研究结果相比,德州驴的遗传多样性处于中等水平。     

彩色棉品种资源的RAPD多态性分析

运用RAPD技术对我国12个来源不同的彩色棉资源以及1个当地主栽白棉花品种进行多态性分析，采用Jaccard‘s遗传相似系数计算13个材料数据的遗传距离矩阵，NTSYS-PC 1．80软件进行聚类，绘制树状图。结果分析表明：12个彩色棉材料在相似系数为0．71处可分为4组，不同彩色棉品种间有较大的遗传差异，种质问的差异与材料来源有一定的相关性；在相似系数为0．52处，可将彩色棉与白棉区分开，遗传差异极大。     

葡萄孢菌遗传多态性DNA分子指纹RAPD分析

选用13个随机引物对葡萄孢菌14个种的全基因组DNA进行随机多态性扩增。共扩增出152条分子量在200—2000bp的DNA片段,多态检测率为98．8％。利用UPGMA方法对扩增的DNA片段聚类分析,结果表明：受试菌种相似率为种内(90％)大于种间(80％),具有丰富的遗传多样性,一些形态学上难以区分的相似种利用DNA分子指纹可被区别。此方法可供分类鉴定疑难种提供依据。     

茶树品种资源遗传多态性RAPD分析

探讨了采用ＲＡＰＤ分子标记法进行茶树及其近缘种分类和亲缘关系鉴别的可能性。结果表明,ＲＡＰＤ能有效地区分物种间和茶树种内变种间的差异,阿萨姆类型茶树和中国类型茶树的特异性ＲＡＰＤ分子标记分别为１２００ｂｐ的ＷＫＡ－２４ｂ。日本茶树品种与中国茶树品种具有较近的亲缘关系。部分越南茶树品种为中－印杂种。     

4个群体文蛤的RAPD分析

用建立的高重复性RAPD优化体系,对文蛤Meretrix meretrix4个不同地理群体（广西文蛤Gh、白壳文蛤Gb、山东文蛤S、江苏文蛤J）的个体进行RAPD分析,获得了较好的重复性条带。从20个随机引物中筛选出6个引物进行RAPD扩增,结果显示：Gb群体有11条特征带,Gh群体有2条,这些特征性RAPD扩增带可以作为这两个群体的RAPD分子标记;J群体和S群体没有明显特征带,可能预示这两个群体间遗传渐渗导致种质资源趋向同质化;Gh、S、J群体多态比例差别不大,为61．54％-62．86％,而Gb群体仅为33．33％。采用修正后的Shannon多态性指数方程进行遗传多态性分析,结果显示：Gh、S、J群体多态性指数分别为0．189、0．195、0．200、Gb群体仅为0．115。研究结果表明,文蛤不同群体的遗传地理分化明显,Gh、S、J群体遗传多样性水平较高,而Gb群体的遗传多样性较低,可能预示该群体分布范围较小、群体数量不大,应加强对其资源的保护。Gh与Gb群体为同一栖息地,除壳色和壳形态差异外,遗传多态性差距悬殊,已超出种内变异范围,二者是否为不同种或具生殖隔离的地理亚种,还待于深入研究。     

4个群体文蛤的RAPD分析

用建立的高重复性RAPD优化体系,对文蛤Meretrixmeretrix4个不同地理群体(广西文蛤Gh、白壳文蛤Gb、山东文蛤S、江苏文蛤J)的个体进行RAPD分析,获得了较好的重复性条带。从20个随机引物中筛选出6个引物进行RAPD扩增,结果显示:Gb群体有11条特征带,Gh群体有2条,这些特征性RAPD扩增带可以作为这两个群体的RAPD分子标记;J群体和S群体没有明显特征带,可能预示这两个群体间遗传渐渗导致种质资源趋向同质化;Gh、S、J群体多态比例差别不大,为61.54%⁶2.86%,而Gb群体仅为33.33%。采用修正后的Shannon多态性指数方程进行遗传多态性分析,结果显示:Gh、S、J群体多态性指数分别为0.189、0.195、0.200、Gb群体仅为0.115。研究结果表明,文蛤不同群体的遗传地理分化明显,Gh、S、J群体遗传多样性水平较高,而Gb群体的遗传多样性较低,可能预示该群体分布范围较小、群体数量不大,应加强对其资源的保护。Gh与Gb群体为同一栖息地,除壳色和壳形态差异外,遗传多态性差距悬殊,已超出种内变异范围,二者是否为不同种或具生殖隔离的地理亚种,还待于深入研究。     

茶树品种资源遗传多态性RAPD 分析

探讨了采用RAPD 分子标记法进行茶树及其近缘种分类和亲缘关系鉴别的可能性。结果表明, RAPD 能有效地区分物种间和茶树种内变种间的差异, 阿萨姆类型茶树和中国类型茶树的特异性RAPD 分子标记分别为1 200 bp 的WKA-24 a 和610 bp 的WKA-24 b 。日本茶树品种与中国茶树品种具有较近的亲缘关系。部分越南茶树品种为中-印杂种。图1 表1 参4     

中国部分栽培南瓜种质资源遗传多态性RAPD分析

从120个10-mers随机引物中筛选出9个具有特异多态性引物对我国部分地区收集到的一些栽培南瓜种质资源遗传多态性的RAPD(Random amplified polymorphic DNA)分析。结果表明,在检测到的60条带中,有59条具有多态性．平均每个引物检测到的条带数多达6．56条;中国栽培南瓜资源在DNA水平上具有丰富的遗传多样性。UPGMIA树形图显示。除N23外．可将30份材料归为中国南瓜种、印度南瓜种及美洲南瓜种3类,与传统分类学的结果相符。     

猪品种随机扩增多态DNA指纹分析

从 2 0个 10碱基随机引物中筛选出 12个引物对长白猪、哈白猪、大白猪、民猪、香猪、香哈杂交猪及长哈杂交猪共 4 1个个体的核 DNA遗传差异进行了 RAPD分析 ,共获得了 97个RAPD标记。品种内遗传相似度总体看来呈引入猪种→培育猪种→地方猪种递减的趋势 ,品种间遗传距离和聚类分析的结果是 :香哈杂交猪与香猪聚为一类 ,长哈杂交猪与长白、哈白、大白聚为一类 ,民猪单独聚为一类。本实验得出的结果与品种的形成历史及采样的实际情况是相吻合的     

长白山区野生软枣猕猴桃种质RAPD分析

以长白山区8个县市30个取样点采集的软枣猕猴桃样品叶片为试验材料,利用RAPD技术对其进行遗传多样性分析．用14个RAPD引物共扩增出104条带,其中多态带占82％．聚类分析结果表明,长白山区野生软枣猕猴桃各居群样品存在一定程度的地理区域聚类趋势,表明遗传变异与地理距离间没有显著的相关性．     

湖南主要柑橘资源的RAPD分析

应用RAPD分子标记技术分析了湖南省主要柑橘资源的亲缘关系,结果表明:用宜昌橙和香抽DNA作为模板,从120条引物中筛选到37条较适合RAPD分析的随机引物;用筛选出的37条引物对23份柑橘材料进行RAPD分析.其中12条引物扩增效果理想,共得到扩增位点82个,多态位点61个,多态性比例达74.4%,对23个试材的区分率达100%;对RAPD分析结果进行聚类分析,23份材料归并成六类.聚类结果与试材形态特征和生物学特性分类效果较一致,说明了RAPD分析的可靠性.     

RAPD技术鉴定苦瓜杂种一代的研究

利用RAPD技术对苦瓜杂种一代顶优苦瓜及其父母本的特异性进行分析,结果引物OPU19扩增的OPU19-1600bp片断在父本和F1中出现,在母本中不出现;对该一代杂种的F2、B1、B2代进行的遗传分析表明:OPU19-1600bp片断可能与父本的某一对基因连锁,在F2、B1、B2代中符合孟德尔一对显性基因的分离规律,从而证实其可用于区分杂交种与母本的自交种。     

不同来源棉花种质资源基于RAPD的遗传变异

为了挖掘棉花种质资源潜力并充分利用这些资源进行杂交育种工作，用16个引物对来自中国、美国、法国、澳大利亚等国家的35个棉花品种（系）包括转基因单、双价抗虫棉进行了RAPD分析，并对各品种的指纹图谱进行了聚类分析，明确了这些品种（系）的遗传多样性，这对科学地配制杂交组合，有目的的利用这些资源提供了科学依据。     

RAPD在苹果育种及种质资源研究上的应用

为了促进RAPD分子标记技术在苹果育种中更广泛地应用,对RAPD技术的原理、特点及其在苹果品种的鉴定、种质遗传基础研究、系谱分析、遗传图谱构建等方面的应用和发展进行了简要概述.     

8份树菠萝种质资源的RAPD分析

采用优化的RAPD技术对8份树菠萝种质资源进行检测,结果表明,8份种质材料间均存在遗传差异,不存在同物异名的现象。其中,无核树菠萝与无胶树菠萝之间的亲缘最近(相似系数为0.887),马来西亚树菠萝和湿苞树菠萝(相似系数为0.656)、湿苞树菠萝和无核树菠萝(相似系数为0.651)的亲缘关系最远。干苞、湿苞性状间的差异可能来自于基因组中个别或少数几个基因座位,其遗传物质的差别不代表材料间遗传物质总体的差别。     

3种鲍基因组DNA多态性的RAPD分析

利用随机扩增多态DNA技术检测了中间鲍Haliotis midae、皱纹盘鲍Haliotis discus hannai和九孔鲍Haliotis diversicolor supertexte3种鲍基因组DNA的多态性，初步进行了分子水平上的分类研究。经24个随机引物扩增，共得到376条多态性片段，片段长度为250—2500bp。根据片段的共享度计算出平均遗传距离指数，并采用UPGMA和NJ两种聚类分析方法进行处理得到系统树。在UPGMA聚类中，中间鲍与九孔鲍先聚在一起，有较近的亲缘关系，其次是皱纹盘鲍，而它们之间的遗传距离相差不大，NJ聚类图上就反映出3种鲍聚为3类，所以两种聚类分析结果基本一致，与它们形态上存在明显差异的结果基本吻合，说明RAPD技术可以作为鲍种质鉴定和分类的一种有效、简便的辅助手段。     

洋葱种质资源的RAPD分析

利用RAPD分子标记技术对52份洋葱(Allium cepa L.)种质资源进行遗传多样性聚类分析。从150个10 bp随机引物中筛选出28个扩增效果较好的引物进行扩增,80.3%的扩增条带表现出多态性。在遗传距离为0.150和0.132的水平上,52份材料分别被分为2类和5类,与生态型分类及以熟性、产量为特征的经济性状分类有一定的相关性。