不同地区牛背最长肌营养成分对比分析

探索不同地区牛背最长肌的氨基酸、脂肪酸、微量元素等营养成分含量的差异。试验选取贵州、内蒙、新疆地区各6头36月龄左右公牛的牛背最长肌进行营养成分测定。结果表明：（1）内蒙地区牛背最长肌中甘氨酸、脯氨酸、丙氨酸等含量均显著高于贵州和新疆地区（P<0.05）;（2）内蒙地区牛背最长肌中硬脂酸、油酸等含量极显著高于贵州和新疆地区（P<0.01）;（3）贵州地区牛背最长肌中牛磺酸含量显著高于内蒙和新疆地区（P<0.05）;（4）新疆地区牛背最长肌中总胆固醇含量极显著低于贵州和内蒙地区（P<0.01)。综上所述,内蒙地区氨基酸、脂肪酸含量高;贵州地区牛磺酸含量高;新疆地区胆固醇含量低。     

5种miRNA在牛背最长肌中表达及其与肉质性状相关性研究

为研究miRNA表达水平与牛肉质性状的相关性,本研究以新疆褐牛和哈萨克牛背最长肌组织为研究对象,采用荧光定量PCR技术检测了背最长肌组织中的miR-320a、miR-152、miR-143、miR-451、miR-125a表达情况。结果显示：新疆褐牛背最长肌组织中miR-320a、miR-152、miR-143、miR-451表达水平显著高于哈萨克牛,miR-125a表达水平显著低于哈萨克牛。相关性分析显示：miR-320a、miR-152、miR-143、miR-451、miR-125a与脂肪含量呈极显著正相关;miR-320a、miR-152与肉豆蔻酸含量呈显著正相关,miR-143与肉豆蔻酸含量呈极显著正相关,miR-152、miR-125a与棕榈烯酸呈显著负相关,miR-143与亚油酸呈显著负相关;miR-320a、miR-152、miR-143与失水率呈显著负相关;miR-320a、miR-143与黄度值、pH呈显著正相关;miR-320a与红度值呈显著正相关。结果表明：miR-320a、miR-152、miR-143、miR-125a表达量增加促进肌肉组织脂肪沉积,其中mi...     

松辽黑猪背最长肌持水力相关基因的分析

为探讨松辽黑猪背最长肌持水力的分子遗传学机理,利用基因芯片技术对松辽黑猪群体内背最长肌持水力高和低的个体进行了转录分析,利用实时定量PCR对部分转录差异基因进行了检测。差异表达分析显示,共有657个基因显著变化;差异基因经G分类显示,主要参与脂肪细胞因子信号通路、胰岛素信号传导、氨基酸代谢、脂类代谢等生物学过程;所验证的PGM1、PPARGC1α、CXCL14基因与芯片结果基本一致。     

不同杂交组合肉牛背最长肌FAS mRNA表达及其对肌内脂肪沉积的影响

为了研究不同杂交组合肉牛肌肉FAS mRNA的表达规律及其对肌内脂肪沉积的影响,本试验选择16月龄的西杂、利杂、利草杂交共43头肉牛为研究对象,饲喂相同营养水平的日粮。于试验的第90、180、270天屠宰取背最长肌,索氏提取法测定肌内脂肪含量,荧光定量PCR方法检测FAS mRNA表达水平,分析不同屠宰阶段FAS mRNA变化规律及其对IMF沉积的影响。结果显示:随着肥育时间的延长,IMF含量呈升高的趋势,并且存在种间差异,利杂牛含量最高;FAS mRNA表达量呈升高趋势,相关分析表明,FAS mRNA表达量与IMF含量呈显著正相关(P0.01)。     

华西牛与雪龙黑牛背最长肌重量的全基因组关联分析

为了筛选华西牛和雪龙黑牛背最长肌重量相关的遗传标记和候选基因,试验以1 478头华西牛和452头雪龙黑牛为研究对象,对其背最长肌重量性状进行全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS),即测定其屠宰后背最长肌重量表型数据,利用Illumina Bovine-HD(770K)芯片对其基因组进行基因分型,采用FarmCPU模型和GEMMA模型对质控后的芯片数据进行GWAS,挖掘与华西牛和雪龙黑牛背最长肌重量显著相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点和候选基因。结果表明：华西牛与雪龙黑牛群体背最长肌重量表型性状均符合正态分布,且二者芯片数据经过质控后分别得到607 198,511 320个SNP位点,这些SNP位点在二者各个染色体上的分布比较均匀;利用FarmCPU模型在华西牛与雪龙黑牛群体分别检测到12个和9个与其背最长肌重量显著相关的SNP位点,且华西牛群体的显著SNP位点分别位于1,5,7,11,12,13,15,16,22,23号染色体上,鉴定到KCNAB1、PFN2、RNF13...     

金华猪和长白猪背最长肌不同肌纤维类型表达差异

为揭示国内外猪种肌纤维组成差异及其对肉质的影响,本实验以肉质优良的地方品种金华猪和肉质欠佳的外来良种长白猪为研究对象,在比较了180 d两猪种胴体性能及肉质差异的基础上,利用荧光定量PCR方法探讨了两猪种背最长肌4种肌球蛋白重链(MyHC)亚型基因(Ⅰ、ⅡA、ⅡX、ⅡB)mR NA表达量在30、90、150、180 d的差异。结果表明:180 d金华猪活体重、瘦肉率、眼肌面积、滴水损失极显著低于长白猪(P<0.01);背膘厚、肌内脂肪含量极显著高于长白猪(P<0.01)。金华猪背最长肌中含有更多的氧化型肌纤维,特别是Ⅰ型肌纤维,酵解型肌纤维特别是ⅡB型肌纤维含量极显著地低于长白猪(P<0.01)。本研究初步揭示了两猪种在生长发育过程中肌纤维组成的品种差异,为进一步通过营养调控肌纤维类型及组成,进而改善肉质提供基础数据。     

猪生长肥育期背最长肌LPL基因表达与肌内脂肪含量相关研究

选取健康、体重接近10 kg的杜洛克×长白×大约克去势公猪36头,体重达10,20,35,50,80,110 kg时各屠宰6头。从背最长肌提取总RNA,反转录为cDNA,以猪β-actin基因作为内参,利用实时荧光定量RT-PCR技术,对各阶段LPL mRNA进行相对定量分析;结合IMF含量及大理石纹评分,分析LPL基因表达水平对IMF含量等的影响。结果表明:LPL mRNA、IMF含量及大理石纹评分随体重增加均呈上升趋势,其中LPL mRNA表达量80 kg阶段显著高于10~50 kg阶段(P<0.05),肌内脂肪和大理石纹评分110 kg均高于10~50 kg阶段(P<0.01);IMF含量与大理石纹评分和LPL基因表达水平均呈现极显著正相关(P<0.01)。     

Myogenin mRNA丰度在金华猪和长白猪背最长肌中的表达

运用半定量RT-PCR方法对不同生长阶段金华猪和长白猪背最长肌中肌细胞生成素(Myogenin,MyoG)基因mRNA的表达丰度进行测定,分析与肌肉沉积的关系.结果表明:在2种猪35、80、125日龄均可检测到MyoGmRNA,金华猪背最长肌中MyoG基因的表达随着年龄和胴体瘦肉率的增加而增加,并且MyoG基因表达与胴体瘦肉率呈正比;而长白猪背最长肌中MyoG基因的表达恰好相反.除35日龄以外品种间无显著差异.     

利用配对RNA-seq数据筛选显著差异背膘厚度松辽黑猪背最长肌差异表达基因

本研究旨在利用转录组测序技术鉴定松辽黑猪背最长肌组织中的差异表达基因（DEGs）,找出与猪脂肪沉积相关的潜在候选基因。通过对松辽黑猪进行活体背膘厚测定,选择具有极端背膘厚的3对个体（高、低各3头）为研究对象。取背最长肌组织提取RNA,并对其进行双末端转录组测序,然后,基于edgeR包的配对方法筛选差异基因,并进行生物学功能富集分析。结果鉴定出590个差异表达基因,其中,188个基因在高背膘厚组猪背最长肌组织中高表达,402个基因在低背膘厚组猪背最长肌组织中高表达。通过生物学功能分析发现,有42条显著富集通路,鉴定出的与脂肪沉积相关的通路有脂肪酸代谢、不饱和脂肪酸的生物合成以及PPAR信号通路等,筛选出FABP3、FADS1、FADS2、OLR1、ACSL1、LIPA和PLIN2为脂肪沉积性状的候选基因。该研究结果为进一步探究松辽黑猪肌内脂肪分子调控机制提供了参考。     

miR-27a和miR-378在中外猪种背最长肌中的差异表达研究

为了研究miRNA表达量与肉质风味表型指标的相关性,试验采用荧光定量PCR技术(Q-PCR)检测了4个猪种背最长肌中miR-27a和miR-378的差异表达。结果表明:背最长肌组织中2种miRNA的表达水平在4个猪种中趋于一致。相关性分析显示,2种miRNA在背最长肌中的表达水平与肌内脂肪含量和硫胺素含量呈正相关,与肌纤维直径、眼肌面积和瘦肉率呈负相关。表明miR-27a和miR-378对猪肉品质具有正调控作用,而对猪胴体品质具有负调控作用。该研究可为阐明miRNA在猪肌肉生长和脂肪沉积过程中的调控机制提供基础数据。     

民猪和大白猪背最长肌差异表达基因的筛选与注释

为了筛选民猪和大白猪背最长肌中的差异表达基因,本研究采用高通量测序技术,构建了民猪(脂肪型)和大白猪(瘦肉型)背最长肌组织的数字基因表达谱,对差异表达的数字基因进行了筛选与注释,并进行了GO和通路的功能显著性富集分析.结果表明,民猪和大白猪分别获得5 000 000多条可用的标签数据(Clean tag),其中拷贝数大于100的标签所占比例最高,分别为88.62％和84.62％;完全比对到正义链上,且1个标签仅比对到1个基因的分别为2 351 788和2 388 175条.以大白猪为对照组,民猪与之相比,差异倍数在2倍以上的共有1 098个基因,其中44个上调表达,1 054个下调表达,有11个基因只在民猪中表达,256个基因只在大白猪中表达,差异表达基因中包括多个与肌内脂肪含量、脂类代谢、肉色、嫩度和肌肉生长发育相关的基因或转录子.民猪和大白猪分别预测到了23 853个和34 731个定位在猪基因组不同位置的新转录本,其中包含存在1个碱基错配的标签.民猪和大白猪之间的差异基因在细胞所处位置方面显著富集的条目有细胞质、膜旁细胞器、色素粒、水解性液泡、部分细胞内等共计18个;在基因分子功能方面显著富集的条目有蛋白结合和氧化还原酶活性2个;在参与的生物过程方面显著富集的条目有对压力的应答、对活性氧的应答和羧酸代谢过程等14个.显著富集的通路共计11个,按照P值从小到大的顺序,溶酶体、PPAR信号通路和胆汁酸合成通路为差异最显著的3个通路.本研究结果可为今后挖掘新基因和研究影响猪肉品质的遗传因素等提供理论依据.     

不同品种绵羊背最长肌PRKAG3和LPL基因的表达差异

选取体重接近的鄂尔多斯细毛羊与昭乌达肉羊各5只,屠宰后取背最长肌检测肌内脂肪含量,用荧光实时定量PCR法检测肌肉PRKAG3和LPL基因mRNA表达水平,分析其与肌内脂肪含量的关系.结果表明,鄂尔多斯细毛羊背最长肌IMF含量显著高于昭乌达肉羊(P＜0.01);鄂尔多斯细毛羊LPL基因mRNA的表达量与鄂尔多斯细毛羊的IMF含量呈负相关(-0.44);PRKAG3基因mRNA的表达量与昭乌达肉羊的IMF含量呈负相关(-0.42),但差异均不显著;鄂尔多斯细毛羊和昭乌达肉羊背最长肌PRKAG3基因mRNA的表达量差异不显著,而鄂尔多斯细毛羊LPL基因mRNA的表达量显著高于昭乌达肉羊(P＜0.01).     

滩羊和湖羊背最长肌全基因组甲基化差异分析

本研究旨在通过不同品种绵羊背最长肌的全基因组甲基化差异分析,鉴定差异甲基化区域（DMR）和差异甲基化基因（DMG）,为解析绵羊骨骼肌发育差异奠定基础。采用全基因组重亚硫酸盐测序（WGBS）技术开展了周岁龄滩羊、湖羊和滩湖F2代背最长肌全基因组DNA的甲基化水平检测和差异甲基化区域分析,探讨品种间DNA甲基化水平的差异。结果显示,全基因组范围内滩羊、湖羊和滩湖F2代胞嘧啶（C）甲基化（mC）率分别为3.55%、3.18%和3.56%,3个群体的甲基化水平基本一致。对滩羊和湖羊的甲基化水平进行比较,在不同序列环境下共检测到97 731个DMRs和10 784个DMGs。在CG、CHH、CHG序列环境下3个群体甲基化水平无显著差异。对DMGs通过基因本体（GO）和相关信号通路（KEGG）分析,共检测到419个GO条目和20个信号通路,显著富集在细胞过程、细胞组分、结合、长期抑制等相关条目中。筛选出5个与肌肉调控有关的候选基因ACTA2、ROCK1、CALD1、MYH3、MYH10。本研究绘制了滩羊、湖羊和滩湖F2代全基因组甲基化图谱,为表观遗传调控肌肉发育研究和肉质候选基因的筛选提供理论参考。     

miR-222在藏猪和DLY猪背最长肌和腰大肌中的表达差异研究

为了探究miR-222在藏猪和DLY猪背最长肌和腰大肌中的差异表达情况,试验选用雌性藏猪和DLY猪各6头,采用RT-PCR法检测miR-222和PGC1α在背最长肌和腰大肌中的表达情况。结果表明,在藏猪和DLY猪中miR-222在背最长肌的表达量均显著(P 0.05)高于腰大肌,而藏猪和DLY猪背最长肌的PGC1α表达量均显著(P 0.05)低于腰大肌。miR-222在猪背最长肌和腰大肌的表达特性,提示miR-222与猪的肌肉发育特性有关。     

不同发育阶段草原红牛背最长肌FABP4基因表达水平研究

实验采用实时荧光定量PCR技术对FABP4 mRNA在1、6、12和24月龄草原红牛背最长肌组织中的表达情况进行研究。结果表明:FABP4 mRNA在所检测的4个不同发育阶段均有表达,6月龄草原红牛背最长肌组织中FABP4 mRNA与另外3个时期差异极显著(P<0.01),而另外3个阶段之间差异不显著(P>0.05)。本实验为深入研究牛FABP4基因与肉质性状的相关关系奠定基础,为牛肉质性状候选基因的选择提供理论依据。     

不同月龄滩羊背最长肌组织的基因表达谱分析

为了解析滩羊肌肉生长发育的调控机理,本研究以1月、6月和10月龄滩羊的背最长肌组织为研究对象,采用转录组测序技术构建了其基因表达谱,并通过生信分析筛选与肌肉发育相关的关键候选基因。结果表明：1月龄组和6月龄组相比,表达上调基因为428个,下调基因为236个,1月龄组和10月龄组相比,表达上调基因为1 204个,下调基因为927个,6月龄组和10月龄相比,表达上调基因为254个,下调基因为188个。对不同比较组别的差异表达基因取交集发现：表达逐步上调的基因共10个,包括CSRP3、ARNTL和BDNF等促进肌肉发育的基因,而表达逐步下调的基因共16个,包括IGFBP5和ANGPT1等抑制肌肉发育的基因。qRT-PCR验证结果显示：CSRP3、IGFBP5等基因的表达趋势同转录组分析结果基本一致,提示上述26个基因适合作为下一步研究的候选基因。本研究成功构建了不同月龄滩羊背最长肌的基因表达谱,并通过生信分析筛选得到调控滩羊肌肉发育的关键候选基因,为深入解析滩羊肌肉发育的分子机制提供了可靠信息。     

猪背最长肌肌纤维类型的发育性变化及其品种和性别特点

4种肌球蛋白重链的异构体(MyHC Ⅰ、MyHC2a、MyHC2x、MyHC2b)分别特征性地对应4种不同类型的肌纤维(Ⅰ、2a、2x和2b)。选用生长速度快，但内质较差的瘦肉型猪大白猪和生长速度慢，但内质较好的肥胖型猪二花脸作为实验动物，采用相对定量RT-PCR方法，测定了背最长肌中Ⅰ、2a、2x和2b4种MyHC mRNA基因的表达，以探讨二花脸猪和大白猪背最长肌中Ⅰ、2a、2x和2b4种肌纤维类型比例的发育性变化，并分析了其品种和性别特点。结果表明：(1)3日龄MyHcⅠ型和2a型肌纤维的比例较高，2b型几乎没有分化；(2)从3日龄到20日龄，肌纤维组成发生了急剧的变化，MyHCⅠ型和2a型表达下调，比例下降，2b型肌纤维显著上升(P＜0．05)，且品种间无显著差异；(3)90日龄以后，二花脸公猪背最长肌中MyHCⅠ型和2a型的比例均显著高于大白猪，同时，大白猪背最长肌中酵解型肌纤维2b的比例增加迅速，显著地高于二花脸(P＜0.05)；(4)性别间比较，MyHCⅠ型纤维的比例无显著差异，90日龄和180日龄，二花脸母猪的MyHC2b的比例显著高于二花脸公猪(P＜0.05)。以上结果提示，大白猪和二花脸猪背最长肌肌纤维类型的差异主要表现在90日龄后，大白猪Ⅰ型纤维比例的显著下降和2b型纤维比例的显著增加与其肌肉的快速沉积有关；而二花脸猪背最长肌较高比例的MyHcⅠ型和2a型纤维与其优良的内质相关。     

延黄牛皮下脂肪与背最长肌中差异基因通路的GSEA分析

通过构建延黄牛皮下脂肪与背最长肌基因芯片表达谱,获得芯片探针总数22 810个,占牛基因组芯片总量的94.5%,杂交后检测到信号的探针13 674个,占检测探针总数的60%。通过基因富集分析方法得出,皮下脂肪中富集的通路主要包括脂肪代谢过程、免疫系统发育过程、磷脂代谢过程、脂类生物合成、细胞脂代谢过程、膜脂代谢过程、脂类转运等基本生物过程。背最长肌中富集的通路有肌肉发育,系统进程、多细胞生物过程调节,横纹肌发育,有机化合物氧化的能量衍生,骨骼肌发育系统等生物过程。为深入研究脂肪组织与肌肉组织的调控机制提供新思路。     

滇南小耳猪与DLY商品猪背最长肌营养成分比较分析

本试验为比较研究滇南小耳猪与DLY商品猪肉的营养价值,分别检测了53头滇南小耳猪和58头DLY猪背最长肌肉的水分、粗蛋白质、粗脂肪、灰分、氨基酸及脂肪酸等营养成分含量,比较分析其差异性。结果显示,滇南小耳猪背最长肌的水分含量极显著低于DLY商品猪背最长肌（P < 0.01）,粗蛋白质、粗脂肪含量极显著高于DLY商品猪（P < 0.01）,灰分含量差异不显著（P > 0.05）;其中滇南小耳猪背最长肌的7种必需氨基酸（苏氨酸、缬氨酸、蛋氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、苯丙氨酸）、肉豆蔻酸、棕榈酸、油酸、顺式异油酸、11-顺-二十碳烯酸,饱和脂肪酸、单不饱和脂肪酸、总脂肪酸含量均极显著高于DLY商品猪（P < 0.01）。综上所述,滇南小耳猪与DLY猪相比具有更高的营养价值和开发价值。     

不同杂交育肥牛背最长肌营养组分含量分析

多年来,宁夏以引进西门塔尔牛、利木赞牛和安格斯牛等国外良种牛为主推品种改良本地黄牛,生产了不同品种杂交改良的后代群体。为了探讨杂交牛肉品质遗传改良效果,笔者进行了不同品种杂交牛和不同营养水平育肥牛主要营养组分测试分析,旨在为培育宁夏肉牛新品种(系)提供参考,为同类