代谢组学在家养动物遗传育种中的应用研究

对家养动物遗传育种中的代谢组学进行分析,为通过代谢组学进行动物经济性状遗传基础的研究提供依据。     

转录组学在骆驼科动物中的应用研究进展

骆驼生活在恶劣的自然环境中,拥有特殊的生物学特性。目前,骆驼的转录组(RNA-seq)水平研究较少。文章对骆驼科动物的转录组学研究方面进行了综述,揭示了骆驼在渗透调节和水分保留中涉及水重吸收和葡萄糖功能的基因网络,以及其在耐盐性、水代谢、抗癌性、被皮毛色等方面的一些机制,分析了现阶段转录组学在骆驼科动物研究中面临的问题与挑战,并对未来骆驼科动物转录组学研究趋势进行了展望,为骆驼科动物独特生物学特点的生理机制研究提供参考。     

家养动物代谢组学研究进展

自古以来,家养动物是我国农牧民重要的经济来源,也是满足人民的营养以及生活各方面需求的重要生物。代谢组学是根据生物体内所有代谢物进行定量分析,并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式的重要技术手段,可能会为家养动物的科学饲养,疾病治疗提供帮助。本文阐述了家养动物(牛羊猪鸡等)关于代谢组学研究的最新进展,为今后科研人员对代谢组学研究提供参考。     

MicroRNA在家养畜禽脂肪沉积调控中的研究进展

动物脂肪组织主要负责能量的储存和代谢,也是重要的内分泌器官,参与机体生理功能的调控。在家养动物中,脂肪沉积对动物的生长性能、繁殖性能均有直接或间接的影响,同时是影响肌肉品质的主要因素之一。因此,研究动物体内脂肪组织发育和脂肪沉积不仅有助于对人类医疗保健的进一步认知,也对畜牧业发展很重要。而MicroRNA(miRNA)是一类短链非编码小RNA分子,长度18～25 nt,广泛存在于动植物中,可以作为调控脂肪沉积的一种方式。研究表明,miRNA能够参与动物生殖、生长发育、新陈代谢和疾病发生等生物学过程,对维持正常的生命活动具有重要意义。本文重点综述了miRNA在脂肪正常发育、异位增生以及在家养畜禽脂肪沉积中的作用,以期为相关研究提供参考。     

营养组学研究体系及其在家养动物上的应用

家养动物的营养代谢与其生长性能、产品品质和排泄物的数量及成分密切相关。营养组学整合了基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学和微生物组学的研究方法,在家养动物营养代谢研究中具有传统营养研究方法无法比拟的优点。应用营养组学研究体系改善家养动物的生长性能和产品品质,有利于家养动物养殖业健康持续发展。本文就营养组学研究体系及其在家养动物的应用作一阐述。     

转录组学在茶树研究中的应用进展

转录组学主要是从RNA水平上研究物种基因表达情况,可用于功能基因的挖掘、次生代谢物研究和物种抗逆抗病分子机制研究,对于探索作物重要农艺性状机理、种质资源创新和新品种选育具有重要的促进作用。介绍了转录组学的主要技术方法、原理以及在茶树研究中的进展,以期为茶树现代分子育种提供参考。     

单细胞转录组测序技术及其在动物繁殖中的应用进展

动物繁殖在动物种群发展和生命进化的过程中起到群落延续、物种演化、进化变异等至关重要的作用。繁殖是各种生殖细胞的动态变化和互作效应的结果,对生殖细胞动态变化机制进行解析是了解动物繁殖过程的基础。单细胞转录组测序技术在群体细胞中以单细胞维度深入解读信息,逐步成为解读细胞类群异质性、关键基因筛选、相关通路表达、细胞互作等具有复杂性、多样性、动态性的生物学问题的首要选择。目前,单细胞转录组测序技术已经开始从动物生殖细胞的角度对动物繁殖的相关机制进行更深入的探究,以此进一步研究动物繁殖的相关过程。因此,本文主要对单细胞转录组测序技术的相关内容以及其在动物繁殖中的相关应用进行总结。     

高通量转录组测序技术在猪肉品质研究中的应用进展

猪肉中基因的表达决定了蛋白质的种类、结构和功能,从而决定了肉品质,而肌内脂肪(IMF)和肌纤维(MF)是影响肉品质的关键物质。本文主要综述了高通量转录组测序技术在研究猪肉品质相关的IMF和MF转录组的应用,重点阐述了其研究进展。     

动物消化道微生物培养组学研究进展

自然环境中绝大部分微生物仍"尚未被培养",这极大限制了人们对微生物功能的研究,以及微生物资源的开发和利用.培养组学基于微生物基因组信息获得目标微生物的最佳生存环境,利用膜扩散型培养技术、微流控型培养技术和细胞分选培养技术等从自然环境中分离、培养"尚未被培养"的微生物,并通过高通量组学技术加以鉴定.已成功应用于小鼠、白蚁...     

转录组测序——RNA-Seq技术在动物疾病检测中的应用研究进展

从第二代测序技术发展起来的转录组测序技术(RNA-Seq),具有不受物种限制、更高分辨率、背景噪音低、重复性高、成本低廉等优点;被广泛应用于遗传育种、癌症筛查、病原检测等各个领域。目前在野生动物疾病预防诊断工作中还没有该技术应用的报道。本文从RNA-seq技术在动物病毒病、细菌病、寄生虫病三个方面的应用进展进行了阐述,以期能尽早将该技术应用到野生动物疾病防治工作中,为野生动物预防与抵抗病原体感染提供解决策略。     

转录组测序技术在生物学研究中的现状及展望

高通量测序技术在当前生物学研究中占据了越来越重要的地位,而转录组学的研究更是占据了很大区域。本文针对Illumnina测序对转录组测序的应用前景、发展概况以及存在的问题进行综述,并对Pacbio测序原理进行剖析,对Nanopore公司开发的MinlON四代测序进行展望,阐述整个转录组测序技术的发展。     

培养组学在动物肠道微生物应用的研究进展

肠道微生物被称为动物的“隐藏免疫器官”,不仅能参与宿主代谢还能影响宿主的免疫系统,对维持机体健康至关重要。作者主要介绍了培养组学的发展历程及其对动物肠道微生物研究的重要意义、传统微生物培养方法和分子生物学方法在研究微生物时各自的优、缺点。培养组学是基于传统微生物培养方法同时采用多种培养条件进行微生物培养,再辅以基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)和16S rRNA基因测序技术建立的一种新型微生物分离、鉴定方法,该方法将传统微生物培养技术与分子生物学技术的优点融为一体。该方法在挖掘“新微生物”的研究中,具有发现、找到并获得的优势;在微生物的研究中可定制分离目标菌株进行验证,并能通过丰富注释清楚地了解肠道微生物组。此外,分析了培养组学分别在家禽肠道、猪肠道、反刍动物肠道等动物肠道的研究应用现状,提出了环境条件对肠道微生物的影响,如人类接触对肠道菌群的影响、同物种不同性别肠道菌群的差异,以期为培养组学在动物肠道微生物的研究运用中提供参考。     

单细胞转录组测序技术在动物肠道中的应用研究进展

高通量测序技术的发展是实现单细胞转录组测序的基石。高通量测序技术基于单细胞分辨率完成组织细胞分型、分析基因表达模式、揭示基因调控关系。文章介绍了3种单细胞转录组测序技术（10×Gnomics、Smart-seq2、Drop-Seq）的原理，阐明了微生物屏障、化学屏障、物理屏障和免疫屏障的组成和功能。通过单细胞转录组测序技术揭示动物肠道免疫的细胞异质性研究，以期为肠道健康的深入研究提供参考。     

单细胞转录组测序技术原理及其应用

基因转录调控及其机制分析是后基因组时代生物学研究的重点之一。常规研究往往建立在细胞群体或者组织上,一般表现出的是细胞的综合反应,难以判断单个细胞的情况,而在肿瘤、疾病预防等方面都需要对少量或单个细胞进行研究,因此,单细胞研究技术必不可少。常规的基因组扩增技术难以消除内含子的影响,并且无法用来阐述某些类型或某些特殊单个细胞之间基因表达的异质性,而转录组测序从RNA入手,将其反转录为cDNA后再进行大量扩增,可以完美地消除内含子的影响。本文主要就单细胞分离技术、单细胞转录组测序技术、高通量测序技术进行综述,并列举了现阶段的研究进展,分析了该项技术在各个领域的应用以及在家畜育种中的应用前景。     

代谢组学在动物营养和饲料领域中的研究进展

代谢组学是近年来利用现代分析技术(如核磁共振、质谱等技术)新发展起来的一门组学技术,目前已广泛用于病理生理学、药理学、毒理学的研究,虽在动物营养和饲料领域的应用刚刚起步,但已显示出广阔的应用前景。作者主要阐述了代谢组学的概念、研究方法及其在动物营养和饲料研究中的应用,为更全面、深入地运用代谢组学技术进行动物营养和饲料研究提供参考。     

家养动物福利研究进展

家养动物的广泛应用使人们对家养动物福利越来越重视,家养动物福利不仅是对家养动物本身的保护,更重要的是对各种不良因素的有效控制和条件改善及对动物健康的保证,而不是那种不宰不杀的极端"动物保护"。文章对家养动物福利的概念、意义、国内外现状及改善现状的措施进行了重点论述。     

转录组学在牧草上的应用进展

牧草是发展草地畜牧业的重要基础。随着高通量测序技术的发展,转录组测序在牧草种质资源评价、重要性状形成机制以及优异基因资源挖掘、分子标记开发等方面已有较广泛的应用。本文从生长发育、生物胁迫适应机制、非生物(盐碱、极端温度、干旱、营养亏缺、重金属等)胁迫适应机理、逆境转录因子挖掘和分子标记筛选等方面对当前有关牧草转录组学研究进展进行综述并展望,以期为相关研究工作的开展提供参考。     

代谢组学在水产动物毒理学研究中的应用

大量研究显示污染水体中含有的有毒物质可以影响水产动物健康生长,甚至导致水产动物大量死亡。然而,人们对很多毒性物质的作用机理的认识还有待深入的研究。代谢组学具有快速、高通量、灵敏度高、选择性强的特点,可以快速检测出生物体在毒性物质作用下的不同时间和不同组织中大量的内源性代谢物质,同时可以与其他组学技术,如转录组、代谢组联合分析毒性物质的作用机理。因此代谢组学技术对促进毒理学的研究、揭示毒性物质的作用机理具有重要意义。文章介绍了代谢组学技术,并总结了近年来代谢组学在水产动物毒理学研究中的应用。