兔出血症病料中病毒核酸成分的分别鉴别

将兔出血症病毒（ＲＨＤＶ）感染死亡兔肝反复冻融，分别经氯仿抽提，聚乙二醇（ＰＥＧ）沉淀浓缩，蔗糖垫底超速离心，Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ４Ｂ柱层析及蔗糖密度梯度离心，得到纯化的ＲＨＤＶ。电镜观察，ＲＨＤＶ粒子无囊膜，大小为３２～３４ｎｍ，核要酸展层法显示，病毒基因组核酸长度约为７．０ｋｂ。用苯酚抽提法从上述病毒悬液中提取的核酸，在琼脂糖凝胶电泳呈现２条主带，当以λＤＮＡ－ＨｉｎｄⅢ消化物为分子量标准时，它     

免疫复合物法从病料中提取小鹅瘟病毒核酸的研究

本报道应用免疫复合物法从病料中提取小鹅瘟病毒核酸。将病死雏鹅肠及内容物研磨成乳状，冻融，氯仿抽提，按10：1加入小鹅瘟特异高免卵黄抗体，并于37℃反应2h后，离心沉淀病毒抗体复合物，再经蛋白酶K消化，酚、酚：氯仿：异戊醇、氯仿：异戊醇抽提，乙醇沉积。TE溶解核酸后电泳鉴定。提取核酸为一条带，与标准毒株核酸迁移率一致。     

兔出血症病毒核酸类型的研究

应用聚乙二醇(PEG)沉淀、离子交换层析等方法提取和纯化兔出血症病毒;用酚-氯仿、异戊醇等抽提病毒核酸,再以RNase和DNase分别酶切处理病毒核酸后,经Agarose核酸凝胶电泳分析,结果表明,兔出血症病毒的核酸类型为RNA。     

兔瘟病毒的提取及结构蛋白鉴定

将已确诊为兔瘟的送检病死兔 ,通过人工感染增殖 ,采取死亡兔的肝磨碎 ,并反复冻融后 ,分别经氯仿抽提、聚乙二醇 (PEG ,MW6 0 0 0 )沉淀浓缩、高速离心、DEAE5 2离子交换层析提取和纯化兔瘟病毒 ,通过SDS -聚丙烯酰胺凝胶电泳进行分析 ,结果只出现一条病毒结构蛋白带 ,证明用DEAE5 2层析方法得到的病毒较纯     

鸭瘟病毒基因组核酸的制备

用鸭瘟病毒国内标准株DPV34F2接种10—l2日龄的非免疫鸭胚，37℃培养5d后，收获清亮尿囊液，采用高速离心结合切向超滤的方法浓缩纯化含毒尿囊液。然后通过改进的酚：氯仿抽提法提取其中的病毒基因组核酸，用4对特异引物对抽提物进行PCR鉴定。结果表明，应用上述方法可以获得较完整的鸭瘟病毒基因组核酸。     

免瘟病毒的提取及结构蛋白鉴定

将已确诊为免瘟的送检病死兔，通过人工感染增殖，采取死亡兔的肝磨碎，并反复冻融后，分别经氯仿抽提、聚乙二醇（ＰＥＧ，ＭＷ６０００）沉淀浓缩、高速离心、ＤＥＡＥ５２离子交换层新析提取和纯化兔瘟病毒，通过ＳＤＳ－聚丙烯酰胺凝胶电泳进行分析，结果只出现一条病毒结构蛋白带，证明用ＤＥＡＥ５２层析方法得到的病毒较纯。     

猪精液提取蓝耳病病毒核酸的方法比较

为筛选从猪精液中提取微量蓝耳病病毒(PRRSV)核酸的有效方法,将蓝耳病(变异株)弱毒苗稀释成不同滴度(TCID₅₀/mL)的病毒液,与健康猪常温精液混合作用。分别用Trizol法、磁珠法、离心柱法提取含毒精液中的病毒RNA,用荧光RT-PCR试验检测病毒RNA,结果表明,当精液中病毒滴度高于0.1 TCID₅₀/mL时,3种病毒RNA提取方法均可检出。离心柱法对猪精液中PRRSV核酸提取灵敏度最高,可检出0.01 TCID₅₀/mL滴度的病毒,稳定性好。     

兔出血症病料中病毒核酸成分的分析鉴别

将兔出血症病毒（ＲＨＤＶ）感染死亡兔肝反复冻融，分别经氯仿抽提，聚乙二醇（ＰＥＧ）沉淀浓缩，蔗糖垫底超速离心，Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ４Ｂ柱层析及蔗糖密度梯度离心，得到纯化的ＲＨＤＶ。电镜观察，ＲＨＤＶ粒子无囊膜，大小为３２～３４ｎｍ。核酸展层法显示，病毒基因组核酸长度约为７．０ｋｂ。用苯酚抽提法从上述病毒悬液中提取的核酸，在琼脂糖凝胶电泳呈现２条主带；当以λＤＮＡ－ＨｉｎｄⅢ消化物为分子量标准时，它们分别位于相当于２０ｋｂ（Ａ带）和２．０ｋｂ（Ｂ带）的位置。用ＤＮＡｓｅ、ＲＮＡｓｅ及Ｓ１核酸酶消化试验分析表明，Ａ带是一种双股ＤＮＡ，而日带为单股ＲＮＡ。在Ｎｏｒｔｈｅｒｎｂｌｏｔ中只有Ｂ带可以与德国提供的ＲＨＤＶ－ｃＤＮＡ克隆探针发生杂交反应，而Ａ带不与该探针显示任何反应。此外，用相同方法也可从临床健康兔肝得到在电泳中的表现与Ａ带一致的核酸提取物。本研究表明，在我国流行的ＲＨＤ病料中，出现的约７．０ｋｂ的单股ＲＮＡ是ＲＨＤＶ病原特异的。     

不同禽鸟类传染性法氏囊病病毒分离物核酸及结构蛋白的比较

将从鸡、鸭和麻雀体内分离到的ＩＢＤＶ用ＳＰＦ鸡胚增殖，采用氯仿抽提，聚乙二醇沉淀和蔗糖密度梯度离心的方法纯化病毒，鉴定结果表明，这种方法可有效地将病毒与杂蛋白分开。用异硫氰酸胍－酚－氯仿－抽提一步法提取病毒ＲＮＡ，电泳分析表明，三种ＩＢＤＶ均由双节段ＲＮＡ组成，大、小基因片段的电泳迁移率毒株间无差异。ＳＤＳ－ＰＡＧＥ分析表明，各ＩＢＤＶ的结构蛋白带谱相同，但各蛋白带的相对百分含量有差异，表明这些不     

基于宏基因组学的鸭源样本中坦布苏病毒检测方法的建立

利用二代高通量测序技术建立检测鸭源样品中坦布苏病毒的方法。首先将样品过滤和经核酸酶处理,再利用等温链位移扩增(SPIA)技术快速制备样品总cDNA,最后经磁珠纯化和文库构建后,通过Ion Torrent进行高通量测序获得基因组信息。结果显示,通过SPIA扩增和核酸文库制备的优化,可从微量病原样本中获得327pmol/μL的核酸文库样本。Ion Torrent测序共获得1 725 436条reads,约6.2M数据,平均109bp。数据拼接并Blast发现,病原样品的核酸序列可注释鸭坦布苏病毒全部基因组数据,与首次发生在我国的鸭坦布苏病毒BYD-1株参考序列的同源性为100%。将所测病毒序列与其他5种黄病毒科成员进行同源性比对,发现与近3年发生在我国的鸭坦布苏病毒同源性最高,在98%以上。且NS基因进化树分析与鸭坦布苏病毒处于同一分支上,符合鸭坦布苏病毒特征。本研究建立的基于未知病原SPIA扩增结合高通量测序检测方法,可同步获知坦布苏病毒基因的核酸信息。     

藏猪呼吸道疾病临床样本中病毒的宏基因组学分析

为了解我国川西高原地区藏猪呼吸道疾病综合征(porcine respiratory disease complex, PRDC)相关病毒的种类和流行情况，本研究从四川省甘孜藏族自治州地区采集藏猪呼吸道样本共计119份，其中健康藏猪鼻拭子66份(来自6个猪场),PRDC明显症状的藏猪鼻拭子、肺组织及肺泡灌洗液53份(11个猪场)。将健康组和发病组样本制成两个pool样提取总核酸反转录成cDNA,建库后使用Illunima novaseq测序。经序列分析表明，健康藏猪呼吸道样品主要以细菌噬菌体为主，动物相关病毒仅检测到疱疹病毒科(Herpesviridae)的mardivirus。发病组样本的病毒种群包括14个病毒科的16种病毒，可引起PRDC的病毒有猪圆环病毒2型(PCV-2)、细环病毒(TTSuV)、猪细胞巨化病毒(PCMV)和非洲猪瘟病毒(ASFV)等。使用SOAPdenovo软件组装出两株PCV-2,三株TTSuV和一株Porprismacovirus的全基因组。遗传演化分析结果显示，两株PCV-2属于PCV-2d亚型，三株TTSuV均属于k2型，其中SCgz-1属于k2b亚型，S...     

保存液对唾液样品中非洲猪瘟病毒核酸保护效果的研究

本实验旨在评价保存液对唾液中非洲猪瘟病毒核酸的保护效果。通过以下分组进行实验:A组,5 ml唾液+50μl阳性样本(100倍稀释);B组,5 ml唾液+5μl阳性样本(1000倍稀释);C组,棉签沾取100倍稀释样品放入保存液;D组,棉签沾取100倍稀释样品放入生理盐水;E组,原唾液(空白)样本。在1 h、7 h、22 h和35 h这个四个时间点,分别通过柱式和磁珠法提取非洲猪瘟病毒的核酸,并通过荧光定量PCR检测样品中的病毒核酸含量,结果表明,无论是柱式法还是磁珠法提取,A、B和D组的Ct值随着时间推移均在变大,而C组(保存液)Ct值趋于稳定,说明保存液对非洲猪瘟病毒降解具有一定的减缓效果。     

不同传染性法氏囊病病毒结构蛋白VP_2表达差异性分析

将在不同时间、地域从传染性法氏囊病 (IBD)发病鸡群中获得的 15个IBDV株分别用SPF鸡、鸡胚和鸡胚成纤维细胞增殖 ,经氯仿处理后 ,采用聚乙二醇沉淀、超速离心和不连续蔗糖密度梯度离心的方法纯化病毒 ,检测表明 ,病毒主要分布于 40 %蔗糖层。对纯化病毒进行SDS_PAGE分析 ,结果显示 ,病毒结构蛋白VP2 在不同毒株表达量有较大差异。本实验为IB DV主要保护性抗原VP2 高表达疫苗的研究奠定了基础     

贵州省传染性法氏囊病病毒野毒株核酸乃结构蛋白比较研究

采用氯仿抽提、聚乙二醇沉淀，再经差速离心和蔗糖密度梯度离心，从病变法氏囊组织中提取出较纯的传染性法氏囊病病毒。病毒核酸电泳分析表明，４株ＩＢＤＶ分离株均由双节段ＲＮＡ组成，大小基因片段的电泳迁移率毒株间无差异，ＳＤＳ－ＰＡＧＥ分析表明，ＩＢＤＶ分离株均由４条主要的结构蛋白带组成，近年从免疫鸡群中分离的地方强毒ＪＨ株及引自中监所的Ｉ型强毒Ｊ１Ｃ７株，其主要结构蛋白带与早年分离的ＩＢＤＶ野毒株相似，电     

利用深度测序技术鉴定疑似桑花叶卷叶病感病桑树叶片中的相关病毒

植物通过小干扰RNA(siRNA)介导的RNA干扰机制来防御外来病毒感染,通过对感病植物材料小RNA(sRNA)的深度测序,获得这一过程中产生的与病毒序列高度一致的siRNA序列信息,可以快速地鉴定侵染植物的病毒组成。以采集自浙江省桐乡市桑园疑似感染桑花叶卷叶病(原称桑花叶型萎缩病)的桑树叶片为材料提取总RNA,构建sRNA文库并进行深度测序,对测序得到的总sRNA进行组装后,比对鉴定出桑花叶卷叶病相关病毒(mulberry mosaic leaf roll-associated virus,MMLRa V),并分别得到占MMLRa V 2个组分全基因组14.19%和21.86%的核酸序列。进一步以感病桑叶组织的总RNA为模板,通过RT-PCR扩增获得部分MMLRa V基因组序列,经Sanger测序确定采集的感病桑树叶片中只存在MMLRa V。通过生物信息学方法分析表明,MMLRa V来源siRNA在基因组中的长度分布、5'端碱基偏好性及热点区分布等具有明显特点。研究结果显示,利用siRNA深度测序技术鉴定桑树病毒是非常高效的手段。     

鸡传染性法氏囊病毒增殖和纯化方法的研究

本试验通过IBDV标准毒株(IBDVBC6/85F4)和IBDV河北分离株分别接种于SPF鸡胚以及鸡胚成纤维细胞(CEF)。吸取接毒后2～5天内死亡鸡胚的尿囊液和绒毛尿囊膜,及细胞病变达到80%时的细胞培养液。经反复冻融,利用氯仿沉淀病毒,聚乙二醇6000浓缩病毒,蔗糖梯密度低温超速离心和葡聚糖G-200凝胶柱过滤等方法纯化病毒。经分光光度计检测,病毒的蛋白含量为1.377毫克/毫升,琼脂扩散试验证实被检抗原为IBDV。     

病毒宏基因组学在动物病毒研究中的应用及研究进展

近年来,新发人畜共患病呈现逐年递增的趋势,人类想要征服新发人畜共患病,就必须提前发掘潜在的新的致病性病原,并针对新病原进行基因组分析、流行病学调查、致病机制及疫苗开发等方面的研究。病毒宏基因组学是在宏基因组学基础上发展起来研究特定环境中病毒的新兴技术,该技术结合深度测序技术(第二代、第三代测序技术)已经在人类、动物、特定环境中挖掘出大量的新病毒,该技术不依赖于病毒培养及病毒序列,在国内外被广泛应用于新发人畜共患病病原的挖掘与临床诊断。就病毒宏基因组学在动物病毒研究中的应用及研究进展进行了介绍。     

猪流感病毒核酸检测装甲RNA质控样品的研制

为研制一种可以应用于猪流感病毒(SIV)核酸检测的质控品,本研究选取MS2噬菌体装甲RNA(Armored RNA)作为RNA病毒核酸检测质控样品,将MS2噬菌体成熟酶蛋白基因、衣壳蛋白基因、包装位点及SIV M基因克隆于表达载体pET-32a中,经原核表达后,利用Cellufine sulfate层析柱纯化,RT-PCR和实时荧光RT-PCR鉴定表明制备的装甲RNA(AR-SIVM)病毒样颗粒中包装有SIV M基因。稳定性研究显示,AR-SIVM可以耐受RNase的降解,并且在-20℃和4℃至少可以保存3个月。试验结果表明,AR-SIVM作为SIV核酸检测质控样品,能够实现对检测全过程(核酸提取、反转录和PCR)的质量控制。     

不同禽鸟类传染性法氏囊病病毒分离物核酸及结构蛋白的比较

将从鸡、鸭和麻雀体内分离到的ＩＢＤＶ用ＳＰＦ鸡胚增殖,采用氯仿抽提、聚乙二醇沉淀和蔗糖密度梯度离心的方法纯化病毒,鉴定结果表明,这种方法可有效地将病毒与杂蛋白分开。用异硫氰酸胍－酚－氯仿－抽提一步法提取病毒ＲＮＡ,电泳分析表明,三种ＩＢＤＶ均由双节段ＲＮＡ组成,大、小基因片段的电泳迁移率毒株间无差异。ＳＤＳ－ＰＡＧＥ分析表明,各ＩＢＤＶ的结构蛋白带谱相同,但各蛋白带的相对百分含量有差异,表明这些不同ＩＢＤＶ分离株的同源性和变异。本文还对ＩＢＤＶ的纯化和变异进行了讨论。     

用蔗糖密度梯度离心法提纯禽脑脊髓炎病毒

用蔗糖密度梯度离心法进行了禽脑脊髓炎病毒的纯化.将禽脑脊髓炎病毒(AEV)L2Z株、Van Roekel株和1143株分别经卵黄囊接种6日龄SPF鸡胚,接毒后13天,收集脑、消化道及胰腺,用玻璃匀浆器制成10%的组织悬液.组织悬液经3次反复冻融后,以4500r/min离心15min,取上清液.而后用氯仿处理,取水相,经冷冻真空浓缩,进行不连续蔗糖密度梯度离心.取出含AEV的组分,用PBS稀释后超速离心除去蔗糖,得到提纯的病毒.病毒样品经2%磷钨酸负染,于电镜下观察可见典型的病毒粒子,大小为24～28nm.