小鼠肝再生过程中脂质代谢相关通路中基因的表达谱变化

1材料与方法 1．1材料 试验动物：9周龄的雄性C57BIV6小鼠，自由采食和饮水，每天光照12h，黑暗12h。试剂：TRIzol试剂（Invitrogen）；RNeasy Total RNA Mini Kit（Qiagen）；基因芯片Genechip mouse genome 43020（Affymetrix）；17启动子引物序列（Affymetrix）。     

类固醇代谢相关基因在大鼠肝再生中表达模式和作用分析

为在基因转录水平了解类固醇代谢相关基因在大鼠肝再生(Liver regeneration,LR)中作用,文章通过搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得了参与上述代谢活动的基因,用基因芯片检测了它们在大鼠再生肝中表达情况,初步证实上述基因中83个基因与肝再生相关.肝再生启动(PH后0.5～4 h)、G0/GI过渡(PH后4...     

氧化磷酸化相关基因在大鼠肝再生中表达模式

为在基因转录水平了解氧化磷酸化相关基因在肝再生(liver regeneration,LR)中的作用,通过搜索网站资料和查阅相关论文等方法获得上述基因,用Rat Genome 230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中表达变化,初步证实上述基因中31个基因与肝再生相关.它们表达的相似性分为均上调、上调占优势、均下调、下调占优势、上调和下调相近等5类,分别涉及9、1、15、4和2个基因,共表达上调42次、下调102次,表明肝再生中表达降低基因多于表达加强基因.它们表达的时间相关性分为12组,表明肝再生中细胞生理生化活动具有阶段性.根据芯片结果推测,肝再生早期和前期氧化磷酸化反应和ATP合成减少,中期和后期增强.其中,31个肝再生相关基因起重要作用.     

家禽脂质代谢相关基因及miRNAs研究进展

[目的]研究鸡脂质代谢相关进展,以期为后续探究调控禽类脂质代谢的具体分子机制提供依据.[方法]通过查阅相关文献,对调控鸡脂质代谢的关键基因、microRNAs和信号通路等相关研究进展进行了全面的总结和分析.[结果]鸡脂质代谢是一个复杂的生物过程,相关基因之间的互作关系,miRNA对靶基因的调控方式以及调控禽类脂质代谢的...     

水稻胚乳贮藏物代谢相关基因响应花后高温胁迫的微阵列分析

【目的】揭示花后高温条件下水稻灌浆过程中胚乳淀粉和蛋白贮藏物代谢相关基因的表达谱,并阐明部分重要功能基因对花后高温胁迫的响应表达模式。【方法】利用人工气候箱设高温(日均温度32℃,日最高温36℃/日最低温28℃)和适温(日均温度22℃,日最高温26℃/日最低温18℃)2个温度处理,并在水稻开花后的不同时期取样,对水稻胚乳贮藏物代谢各类相关基因的表达谱与表达模式进行高通量的cDNA微阵列检测。【结果】在水稻胚乳贮藏物代谢的相关基因中,以对高温胁迫响应表现较迟钝的基因居多,其高温处理与低温处理之间的杂交信号(nARVOL)比值(称R值)大致在0.8—1.2,但随高温处理时间的持续,呈上调或下调差异表达的基因数量均有明显增加;花后高温对胚乳糖代谢和淀粉合成类基因表达的调控效应,不仅随各个基因的功能类型、代谢途径和灌浆进程的差别变化而异,而且其表达丰度及其上调或下调幅度在很大程度上还与该功能基因的同工型(或酶亚基)有关;高温处理下水稻胚乳中的谷蛋白、醇溶蛋白和球蛋白类基因多呈下调表达特征,但也会随其所调控的蛋白亚基组分的不同而异,从而对胚乳贮藏蛋白的亚基构成和组分变化产生较大影响;与胚乳白贮藏物代谢密切相关的糖信号传导类基因、核糖体蛋白类基因和逆境防御蛋白类基因普遍比直接参与胚乳贮藏物合成路径的功能基因对高温胁迫响应表现敏感。【结论】花后高温胁迫对水稻胚乳灌浆贮藏物代谢的调控相当复杂,涉及到众多的功能基因位点。     

缺刻缘绿藻转录组测序及脂质代谢相关基因注释

为了能深入地了解缺刻缘绿藻花生四烯酸(ArA)和脂质的代谢过程,利用Roche 454 GS FLX测序仪对该藻转录组进行高通量的焦磷酸测序。得到高质量读序(read)382 468条,占原始读序的97.14%,平均每条读序长322 bp,总大小达123 Mb。经CAP3软件拼接得到22 714条重叠群、25 621条singleton。将这些序列与公共数据库进行同源性搜索、比较、基因功能注释和分类。基于转录组中所注释的基因构建缺刻缘绿藻脂质代谢途径:脂肪酸是在叶绿体内从头合成,然后游离脂肪酸进入胞质,由内质网进行三酰甘油的合成,最后可能在油体蛋白作用下形成油滴并储在于细胞中。ArA自油酸是开始经过多个去饱和酶及延长酶的作用而产生的。油酸是由硬脂酰-ACP去饱和酶作用而形成的,而棕榈油酸是在叶绿体的糖脂上被去饱和而产生的。三酰甘油最终被分解成自由脂肪酸和丙酮酸,而长链脂肪酸是以酰基-辅酶A的形式逐级降解的。     

PPAR-γ基因对脂质代谢调控机制的生物信息学分析

过氧化物酶体增殖激活受体γ(PPAR-γ)是具有重要生物学功能的转录因子,可调控脂肪细胞分泌的多种蛋白质因子基因的表达,促进脂肪细胞分化。它与肥胖、Ⅱ型糖尿病、心血管疾病、癌症的发病风险相关联。研究基于TRANSFAC数据库信息,利用MEME/MAST方法对PPAR-γ进行全基因组范围的靶基因生物信息学定位,并对获得的靶基因进行了GO和KEGG分析,探讨PPAR-γ基因对脂质代谢影响的分子机理。结果表明,PPAR-γ靶基因显著富集于36个GO节点(P<0.05),并参与了10个KEGG代谢通路(P<0.05),这其中大部分GO节点和KEGG代谢通路与脂质代谢密切相关。研究有助于理解PPAR-γ基因对脂质代谢影响的分子机理;同时,对于肥胖和糖尿病等复杂疾病的诊断、预防和治疗具有积极意义。     

脂肪氧化酶同工酶对水稻种胚脂质代谢的影响

[目的]研究脂肪氧化酶同工酶对水稻种胚脂质代谢的影响。[方法]对LOX-1和LOX-2缺失品种皖鉴2090以及LOX-3缺失品种冲腿和正常品种汕优63的种子进行人工加速老化处理,研究不同脂肪氧化酶同工酶缺失水稻种子游离脂肪酸和脂质过氧化产物的变化。[结果]种子老化处理期间,皖鉴2090的游离脂肪酸含量低于冲腿和汕优63,其增加速率慢于冲腿和汕优63;多聚不饱和脂肪酸含量始终较高,其降低速率慢于冲腿与汕优63;丙二醛含量始终最低,其增加速率最慢。冲腿的游离脂肪酸增加速率、多聚不饱和脂肪酸降低速率均介于皖鉴2090和汕优63之间。[结论]LOX-1、LOX-2缺失可降低水稻种子脂质过氧化水平和过氧化速率,LOX-3缺失可减轻水稻种子脂质过氧化水平。     

家蚕Notch信号通路基因的表达研究

[目的]研究家蚕Notch信号通路基因的表达情况。[方法]在实验室前期工作的基础上,用特异引物对家蚕的Notch信号通路上下游基因进行克隆,并对这些基因在家蚕5龄幼虫不同组织部位的表达进行研究。[结果]这些基因在各组织的表达量不同,其中fringe和groucho在家蚕头部表达量较多,在丝腺、精巢、卵巢中的表达量较少;notch在家蚕尾部表达量较少,在其他组织中表达量无明显差别。[结论]该研究为进一步研究家蚕Notch信号通路奠定了基础。     

农华麻鸭肝脏组织多胺代谢与增殖相关基因表达的研究

旨在研究农华麻鸭肝脏组织多胺代谢与增殖相关基因表达的发育规律。选取0、30、60、90、120日龄的农华麻鸭各8只,采用高效液相色谱测定鸭肝脏组织中多胺含量,利用qRT PCR分析鸭肝脏组织多胺代谢及增殖相关基因的相对表达量。结果表明,鸭肝脏生长发育过程中,亚精胺和精胺始终维持较高水平,精胺含量随日龄增长先升后降,在60日龄达到峰值为1 377.43 mg/kg;腐胺和亚精胺在0日龄含量最高,分别为131.60 mg/kg和694.64 mg/kg,后继随日龄增长腐胺和亚精胺含量逐渐降低。多胺代谢和增殖相关基因表达及相关性分析表明,多胺代谢与增殖相关基因呈一定规律性表达,SSAT、SPMS、ODC、APAO、GATA4、CCND1、HGF和PCNA的相对表达量随日龄增长先升后降。精胺与VEGF、HGF、PCNA、GATA4基因表达量显著相关;亚精胺与VEGF、CCND1、HGF显著相关;腐胺与VEGF、HGF显著相关。HGF和VEGF与SMOX、SPDS、ODC显著相关;GATA4和CCND1与SSAT、SPMS、ODC显著相关;PCNA与SSAT、SPMS、GATA4、CCND1基因表达量显著相关。多胺代谢相关基因可通过介导多胺合成和分解代谢途径维持肝脏多胺池稳态,进而调控肝脏生长发育。     

铅与维生素C对小鼠肝脏脂质过氧化的影响

以五周龄昆白系小鼠为试验动物,在饲喂小鼠普通日粮基础上每天灌喂一定量铅(Pb)、维生素C(Vc)、Vc Pb,Vc用量200mg/kg,Pb四个浓度分别为1.2g/L、0.4g/L、0.13g/L、0.043g/L,饲喂期三周,检测小鼠肝脏中铅与丙二醛(MDA)含量以及超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化氢酶(CAT)、过氧化物酶(POD)的活性变化。结果表明:铅在小鼠肝脏中大量蓄集,并引起MDA含量增加;加Pb组与空白对照组相比SOD酶活性降低,且随着铅浓度的降低而升高;CAT活性测定显示:Pb1、Pb2组与空白对照组相比差异显著(p<0.05),Pb3组差异极显著(p<0.01),除Vc Pb4组与Pb4组相比差异不显著(P>0.05)外,其他Vc Pb组与其对应加Pb组比较,均差异显著(p<0.05);POD活性测定表明:Vc组与空白组相比差异极显著(p<0.01),Pb1、Pb3组与空白组比较差异显著(p<0.05),Pb2、Pb4与空白组比较差异极显著(p<0.01),除Vc Pb1组与Pb1组差异不显著(P>0.05),其他Vc加Pb组与单独加Pb组相比差异极显著(p<0.01)。因此,Pb可增强小鼠肝脏脂质过氧化,而Vc可减轻铅引起的过氧化损伤。     

油脂来源及使用量对小鼠生长、健康、血脂和肝脏胆固醇代谢指标的影响

【目的】观察饲料中添加不同种类和不同剂量的油脂对小鼠生长性能、健康状态、血脂指标和肝脏胆固醇代谢关键基因相对表达量的影响,探讨日粮中不同油脂来源及使用量对肝脏胆固醇代谢的作用机制,为哺乳动物筛选较为适宜的油脂类型及其添加量提供理论参考。【方法】试验选取3周龄体重16-19 g的健康昆明种小鼠48只,随机分为4组,每组4个重复,每个重复3只。4组分别饲喂正常小鼠饲料（对照组）和添加4%豆油（B组）、4%乳化椰子粉（L组）以及8%乳化椰子粉（H组）的饲料14 d。试验期间,记录每天的饲喂次数、每次饲喂量、饲料剩余量,所有试验动物均自由采食和饮水。分析试验期间小鼠的体重变化和平均日采食量（ADFI）、平均日增重（ADG）以及料重比（F/G）等生长性能指标,分析小鼠的血液分布和健康指数等健康状态指标,测定小鼠的肝脏重以及甘油三酯（TG）、总胆固醇（TC）、高密度脂蛋白胆固醇（HDL-C）、低密度脂蛋白胆固醇（LDL-C）等血清脂质指标,运用实时荧光定量PCR技术检测小鼠肝脏组织中胆固醇7-α羟化酶（CYP7A1）、低密度脂蛋白受体（LDLR）和3-羟-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶（HMGCR）这3个基因的mRNA表达水平。【结果】①生长性能方面,添加4%豆油组的小鼠体重变化、平均日采食量和肝脏脏器指数与对照组差异显著（P＜0.05）,而平均日增重、料重比和肝脏重与对照组差异不显著（P＞0.05）;添加4%乳化椰子粉组的小鼠各生长性能指标与对照组差异不显著（P＞0.05）;8%乳化椰子粉显著提高小鼠的平均日采食量（P＜0.05）,其他指标差异不显著（P＞0.05）。②健康状态方面,各试验组小鼠的血液分布和健康指数与对照组相比均无显著性差异（P＞0.05）。③血脂指标方面,与对照组相比,添加4%豆油显著降低了小鼠血清中TC和HDL-C含量（P＜0.05）,对TG和LDL-C的影响差异不显著（P＞0.05）,添加4%乳化椰子粉对小鼠的各项血脂指标均无显著性影响（P＞0.05）,添加8%乳化椰子粉能显著降低血清TC含量（P＜0.05）,但对TG、HDL-C和LDL-C无显著性影响（P＞0.05）;④肝脏胆固醇相关基因方面,添加8%乳化椰子粉组肝脏中CYP7A1基因mRNA表达量显著高于对照组（P＜0.05）,而4%豆油组和4%乳化椰子粉组与对照组相比无显著差异（P＞0.05）。肝脏HMGCR基因和LDLR基因mRNA表达水平与对照组差异不显著（P＞0.05）。【结论】日粮中添加豆油增加了小鼠日采食量和体重等指标,降低了血清总胆固醇和高密度脂蛋白胆固醇;高剂量乳化椰子粉的添加提高了小鼠日采食量,降低了血清总胆固醇,并增加了肝脏CYP7A1基因mRNA的表达。相比于添加高剂量乳化椰子粉,低剂量乳化椰子粉在改善小鼠脂代谢方面应用效果并不好。添加油脂可能是通过调控肝脏中胆固醇代谢相关酶的基因表达量来影响小鼠肝脏胆固醇的代谢,从而维持体内的胆固醇代谢的稳态。     

动物肝再生模型研究进展

对动物肝再生模型进行了综述,包括部分肝切除模型、门静脉分支结扎模型、化学药物损伤模型。     

Effect of Betaine on the Regulation of the Lipid Metabolism in Laying Hen

The experiment was conducted to investigate the effects of betaine on lipid metabolism of laying hens. 1 600 ISA brown laying hens of 20 weeks of age were alloted randomly into 4 groups each with 4 replicates of 100 layers, the layers were given a corn-soybean basal diet with 0,400,600 and 800 mg/kg betaine respectirely. Results indicated that supplementation of 600 mg/kg betaine significantly improved lay performance, and increased egg production 8.67 % ( P ＜ 0.04), decreased feed/egg ratio by 9.02 % ( P ＜ 0.03) compared with control, but there were no significant differences in egg weight and feed intake. It was found that supplementation of 600 mg/kg betaine decreased weights of abdominal fat by 19.63 % (P ＜ 0.02)and 22.35%(P＜0.02), and decreased liver fat by 8.52%(P＜0.05) and 16.28%(P＜0.01) in 50 and 70 weeks of age respectively. Compared with control, in 70 weeks of age, activity of LPL in abdominal fat was decreased by 44.83% (P ＜ 0.01), HSL activity in abdominal fat increased by 50.0% (P ＜ 0.02), and MDH activity in liver was decreased by 28.74% (P＜0.03). Supplementation of 600 betaine increased levels of T3 by 43.29%( P ＜ 0.05) and 43.95 % ( P ＜ 0.02) in 50 and 70 weeks of age respectively, and increased the concentration of cAMP in hypothalamus and anterior pituitary by 59.89% ( P ＜ 0.01) and 24.03% ( P ＜ 0.05) respectively in 70 weeks of age. The concentration of serum gluclose (GLU) , FFA and phospholipid were increased by 44.50% (P＜0.03), 19.66%(P＜0.03) and 71.66% (P＜0.01) in 50 weeks of age. The concentration of serum gluclose (GLU), FFA and phospholipid were increased by 16.25% ( P ＜ 0.05), 22.51% ( P ＜ 0.02) and 22.42%(P＜0.01) in 70 weeks of age.     

甜菜碱调控蛋鸡脂肪代谢的机理研究

 对甜菜碱影响产蛋鸡脂肪代谢的机理研究结果表明 ,日粮中添加 6 0 0mg/kg甜菜碱促产蛋效果最佳 ,全程平均产蛋率比对照组提高了 8.6 7% (P <0 .0 4 ) ,料蛋比下降了 9.0 2 % (P <0 .0 3) ;日粮中添加 6 0 0mg/kg甜菜碱使蛋鸡5 0周龄和 70周龄腹脂率分别下降了 19.6 3% (P <0 .0 2 )和 2 2 .35 % (P <0 .0 2 ) ,肝脂率分别下降了 8.5 2 % (P <0 .0 5 )和16 .2 8% (P <0 .0 1) ;70周龄蛋鸡腹脂中LPL酶活性下降了 4 4 .83% (P <0 .0 1) ,HSL酶活性提高了 5 0 .0 % (P <0 .0 2 ) ,肝脏中NADPH生成酶MDH活性下降了 2 8.74 % (P <0 .0 3) ;甜菜碱使 5 0周龄和 70周龄蛋鸡血清中T3 水平分别提高了4 3.2 9% (P <0 .0 5 )和 4 3.95 % (P <0 .0 2 ) ,T4水平无明显差异 ,70周龄下丘脑和腺垂体中cAMP含量分别提高了 5 9.89%(P <0 .0 1)和 2 4 .0 3% (P <0 .0 5 ) ;甜菜碱使 5 0周龄和 70周龄蛋鸡血清中葡萄糖浓度分别提高了 4 4 .5 0 % (P <0 .0 3)和16 .2 5 % (P <0 .0 5 ) ,磷脂浓度提高了 71.6 6 % (P <0 .0 1)和 2 2 .4 2 % (P <0 .0 1) ,游离脂肪酸水平提高了 19.6 6 % (P <0 .0 3)和 2 2 .5 1% (P <0 .0 3)。     

表达谱基因芯片技术及其在动物基因组研究中的应用

将对表达谱基因芯片的原理、分类、技术流程、优点和在动物基因组研究中的应用以及存在问题作一综述,并对其应用前景进行展望。