肉牛QTL定位研究进展

牛基因组计划的完成,为牛的育种提供了极其重要的遗传信息,使得科学家在基因组水平进行选择成为可能。从肉牛生长性状的数量性状基因座（quantitative trait loci,QTL）、肉质性状的QTL、繁殖性状的QTL以及抗病性状的QTL4个方面进行综述,以期为肉牛的育种研究提供参考。     

宁夏地区荷斯坦奶牛遗传参数估计

利用2008-2016年出生的27 444头宁夏地区荷斯坦奶牛生产性能（dairy herd improvement,DHI）数据及体型线性评分数据计算乳脂率（fat percentage,FP）、乳蛋白率（protein percentage,PP）、体细胞评分（somatic cell score,SCS）、305 d产奶量（milk yield of 305 days,MYD）、初产日龄（age at first calving,AFC）、产犊间隔（calving interval,CI）和体况评分（linear classification scores,LCS）的遗传参数。利用DMU v 6.0软件,采用AI-REML模块结合EM算法并配合多性状动物模型,以季节、场、年份、胎次和动物个体加性遗传效应作为模型的影响因素。计算结果表明,宁夏地区奶牛的FP、PP、SCS、MYD、AFC、CI和LCS的遗传力分别为0.14、0.19、0.19、0.31、0.37、0.10和0.07,同时得出了奶牛不同性状的育种值、遗传相关和奶牛生产性能指数2（China performance index 2,CPI2）值。本研究通过对宁夏地区奶牛DHI数据的深挖和遗传评估,准确地把握了宁夏奶牛群体结构特征,对于奶牛的选种选配、育种规划和选择指数的构建有重要意义。     

利用广义线性方法定位家畜抗性等级性状的QTL

在广义线性模型的框架内模拟研究了家畜抗性等级性状的QTL定位方法，QTL参数的估计采用最大似然方法，比较了阈模型方法与一般线性方法的QTL定位效率，并对影响等级性状QTL定位效率的主要因素（QTL效应、性状的遗传力）进行了模拟研究。试验为多个家系的女儿设计，资源群体大小为500头。结果表明：在QTL位置参数估计及检验功效方面，阈模型方法具有一定的优势，对抗性等级性状QTL定位的功效也高于线性方法。另外，性状遗传力和QTL效应的大小对QTL定位的准确度也有直接的影响，随着性状遗传力QTL效应的增大，2种方法QTL定位的效率均有不同程度的提高。     

肉鸡中影响脂肪性状的QTL的检测和定位

绝大多数鸡中QTL（数量性状位点）的研究是用两个极端品系杂交的F2代群体.目前,生长性状和脂肪性状的QTL在F2代群体中的绘制是用生长速度快和生长速度慢的两个家系杂交、肉鸡和蛋鸡杂交、红色原鸡和产蛋鸡的杂交以及高脂肪含量和低脂肪含量的家系杂交.而且,非极端品系的杂交（蛋鸡-蛋鸡杂交,肉鸡-肉鸡杂交）也能得出生长性状和脂肪性状的QTL.     

奶牛重要经济性状的QTL作图

对奶牛产奶性能的５个性状（泌乳量、乳脂率、乳脂量、蛋白率和蛋白量）以及２个重要的次级性状（乳房炎发病率和繁殖力）ＱＴＬ作图的方法和进展进行综述，并讨论了奶牛ＱＴＬ定位中存在的问题。     

猪数量性状QTL定位研究进展

人类基因组计划和分子生物学技术的发展，推动了猪基因图谱的研究进展，使猪的QTL定位研究取得长足的进展，从而为利用分子标记进行数量性状位点的鉴别和定位奠定了坚实的基础。目前，对影响猪的数量性状的QTL的研究已成为国际上的研究重点，并已取得了一定的成果。猪主要性状的QTL定位结果见表1。     

中国西门塔尔牛次级性状与生产性状的遗传统计分析

利用6个种畜场1980--2000年问1634头母牛的繁殖性状和生产性状记录,以及现场测定的泌乳速度和乳成分含量等资料,对中国西门塔尔母牛的4类次级性状：繁殖性状（产犊间隔、空怀天数、妊娠期）、体型性状（整体评分、后肢、乳房体型性状：前乳房附着、后乳房宽度、后乳房高度、乳头位置、乳房均衡、乳房静脉）、生产效率性状（泌乳速度、使用年限）、健康性状（体细胞数评分）和生产性状（产奶量、乳脂量、乳蛋白量、乳脂率、乳蛋白率）共19个性状进行了遗传统计分析。应用动物模型并借助MT—DFREML方法估计了上述19个性状的遗传参数,得到它们的遗传力分别为：0．08、0．07、0．08、0．16、0．15、0．41、0．11、0．07、0．10、0．23、0．18、0．42、0．13、0．25、0．35、0．32、0．23、0．20和0．21。泌乳速度与生产性状为负的遗传相关（-0．22～-0．10）,与使用年限和整体评分有着较高的遗传相关,分别为0．87和0．61;体细胞数与生产性状以及使用年限存在着不利相关;使用年限与泌乳速度、整体评分、产奶量为正遗传相关（O．61、0．14、0．42）,与体细胞数存在有利相关（遗传相关为-0．23）。乳房性状与生产性状、次级性状都有着较密切的关系,其中以前乳房附着、后乳房宽度、乳头位置和乳房静脉与这两种性状的关系最为密切,其遗传相关为-0．36～1．00,表明对乳房性状进行选择能够使生产性状与次级性状得到改良。环境对次级性状的影响较大,不同饲养管理制度和泌乳阶段是影响泌乳速度、使用年限和体细胞数的主要环境因素。     

奶牛产奶性状候选基因研究进展

产奶性状是奶牛的主要经济性状，主要包括产奶量、乳脂量、乳蛋白量、乳脂率、乳蛋白率5个方面。产奶性状改良是当今遗传育种界的研究热点之一。利用候选基因策略寻找影响产奶性状的主效基因，从而应用于奶牛产奶性状的改良，从分子遗传学角度来说是可行的。本文综述了与奶牛产奶性状有关的基因：乳蛋白基因、Weaver基因、催乳素基因、生长素和生长素受体基因、淀粉酶基因、核外基因和其他基因（DGAT1和DGAT2基因、垂体特异性转录因子）以及主效QTL的研究进展。     

肉牛QTL定位研究进展

牛基因组计划的完成,为牛的育种提供了极其重要的遗传信息,使得科学家在基因组水平进行选择成为可能.从肉牛生长性状的数量性状基因座(quantitative trait loci,QTL)、肉质性状的QTL、繁殖性状的QTL以及抗病性状的QTL4个方面进行综述,以期为肉牛的育种研究提供参考.     

四倍体鸭茅产量及其构成因素的QTL定位

产量相关性状是复杂的数量性状,对鸭茅的单株产量及构成因素进行QTL分析,可提高育种中对产量性状优良基因选择的效率,同时为鸭茅遗传改良、基因克隆及分子标记辅助育种提供理论依据。以四倍体鸭茅“楷模”和“01436”为亲本杂交而成的作图群体为试验材料,于2014年对洪雅、宝兴两个不同生境下鸭茅株高、旗叶长、倒二叶长、旗叶宽、倒二叶宽、茎粗、花序长、分蘖数、单株干重等9个产量相关性状进行了表型鉴定及相关性分析。此外,在已构建的高密度鸭茅分子遗传图谱的基础上,采用MapQTL 5.0进一步对这些性状QTL定位分析。结果表明,绝大多数性状在亲本间呈显著差异且都整体表现出连续变异,符合数量性状遗传的特征;相关性分析表明,大多数产量相关性状均与干重极显著正相关,与单株干重相关性最好的依次为分蘖、株高;QTL分析发现,控制该9个农艺性状的QTL共60个,洪雅38个,宝兴22个,这些QTL分别定位于分子连锁图谱的1、2、3、4、5共5个连锁群上,单个QTL的贡献率为5.7%~24.7%,单个性状QTL个数为2~15个。其中,控制株高、花序长的QTL各12个,控制倒二叶长、茎粗的QTL各4个,控制旗叶宽、倒二叶宽的QTL各2个,控制单株干重的QTL有6个,影响分蘖的QTL为3个,与旗叶长相关的QTL最多15个。     

河北省中国荷斯坦牛产奶和体型性状遗传参数分析

旨在探究河北省中国荷斯坦牛产奶和体型性状的遗传参数,为育种提供参考.本研究收集了2012-2018年河北省133个牛场8 891头中国荷斯坦母牛第一胎次的3个产奶性状记录(产奶量、乳脂率和乳蛋白率)和26个体型性状记录,利用DMU软件,以场年季、产犊月龄、鉴定年季和鉴定员效应为固定效应,以个体的加性遗传效应为随机效应,...     

泌乳性状遗传标记研究进展

乳蛋白质决定着乳产品的品质和风味。研究表明乳蛋白类型及其基因多型性与泌乳性状如产乳量、乳脂率、乳蛋白量及乳蛋白率有很强的相关性。本文就乳蛋白作为泌乳性状遗传标记的研究做一简要评述。     

奶牛乳质性状相关基因及其单核苷酸多态性的研究进展

乳质性状为奶牛重要的经济性状,主要包括乳蛋白量、乳蛋白率、乳脂量和乳脂率等。乳质性状改良是当今遗传育种界的研究热点之一,利用候选基因策略寻找影响乳质性状的功能基因或功能性单核苷酸多态,并将其应用于奶牛乳质性状的分子育种实践已经成为后基因组时代的发展趋势。目前针对乳质性状的功能基因或功能性单核苷酸多态已经开展了大量的研究工作,作者就参与泌乳调控的乳质相关基因、脂肪合成与次生物质代谢通路,以及其他一些与乳质性状相关基因及功能性单核苷酸的研究现状进行简要综述。     

不同选择指数对中国荷斯坦种公牛综合育种值排名的影响

本研究旨在探讨包含不同性状的综合选择指数对荷斯坦种公牛排队的影响。收集了全国199个牛场的664 284头荷斯坦牛产奶量、乳脂率、乳蛋白率、乳脂量、乳蛋白量、体细胞数以及35 281头荷斯坦牛的体型性状。然后采用多性状动物模型BLUP法预测生产性状和体型性状的育种值,计算3种不同综合选择指数下47头种公牛的综合育种值,并对其排队进行了比较。结果显示,使用包含产奶量、乳脂率、乳蛋白率、体细胞评分4个性状的综合选择指数（TMI1）和包含乳脂量、乳蛋白量、体细胞评分3个性状的综合选择指数（TMI2）对公牛的排队一致性很高,秩相关为0.94;只包含生产性状的综合选择指数（TMI1、TMI2）和加入了体型性状的综合选择指数（TMI3）对公牛的排队差异很大,秩相关分别为0.76和0.67。这些结果提示,乳脂量、乳蛋白量可以替代产奶量、乳脂率、乳蛋白率纳入综合选择指数,体型性状进入综合选择指数对评价种公牛综合遗传素质具有重要作用。     

中国荷斯坦牛RPL23A和ACACB基因对产奶性状的遗传效应分析

作者所在团队前期通过奶牛乳腺上皮组织转录组测序及荷斯坦公牛全基因组重测序研究发现RPL23A和ACACB基因是奶牛乳蛋白和乳脂性状的候选功能基因,本研究旨在探究这两个基因是否对奶牛产奶性状具有显著遗传效应。以北京地区7个牧场的1059头中国荷斯坦母牛为试验群体,采集尾根静脉血并提取基因组DNA,通过飞行时间质谱方法检测SNP位点基因型,利用SAS9.4软件的MIXED过程进行关联分析。结果表明,RPL23A基因的SNP位点g.20146771C>T与第1泌乳期5个产奶性状达到显著或极显著关联(P=0.0001~0.0416),其优势等位基因为T;ACACB基因的g.63878254T>C位点与第1泌乳期产奶量、乳脂量和乳蛋白量呈极显著关联(P<0.01),其优势等位基因为C;g.63962768G>A位点与第1泌乳期产奶量、乳脂量、乳脂率和乳蛋白率关联显著或极显著(P=0.0001~0.0391),其优势等位基因为A。综上,RPL23A基因主要影响中国荷斯坦牛产奶量和乳蛋白,ACACB基因对产奶量和乳脂具有显著遗传效应,3个SNP位点可考虑作为遗传标记用于标记辅助选择培育奶牛高乳蛋白乳脂新品系和选育提高。     

中国荷斯坦牛PIN1基因对产奶性状的遗传效应分析

前期研究通过荷斯坦公牛全基因组重测序鉴定到17个奶牛产奶性状候选功能基因,其中,肽基脯氨酸顺反异构酶基因(PIN1)参与甘油三酯代谢、甘油磷脂代谢以及mTOR信号通路,且位于产奶量和乳蛋白量性状QTL区间.为进一步系统分析PIN1基因是否对奶牛产奶性状具有遗传效应,本实验基于40头公牛的基因组DNA混池,采用PCR产物...     

Evaluation of the potential effects of abortion on the productive performance of Iranian Holstein dairy cows

Calving records from the Animal Breeding Center of Iran collected from January 1983 to December 2007 and comprising 1 163 594 Holstein calving events from 2552 herds were used to evaluate the potential effect of abortion occurrence on 305‐day milk yield, milk fat yield, fat percentage of milk and milk protein yield in Iranian Holsteins. Statistical analyses of production traits were performed using a linear mixed model procedure. Normal‐calved cows had greater 305‐day milk production, fat yield and protein yield of milk than abortive‐calved cows (P < 0.05). However, abortive‐calved cows had the greater milk fat percentage than normal calved cows (P < 0.05). The linear and quadratic effects of age of dam were significant on all of the studied traits (P < 0.05). The results of regression analysis showed that increase in the quadratic effect of age can cause an increase in the fat percentage of milk for all calvings including normal and abortive calvings. Because abortion is one of the most important conditions that limit a cow's ability to produce, maintaining the general health of cattle is important in minimizing the risk of abortion problems.     

影响西农萨能奶山羊产奶性状的非遗传因素分析

本试验旨在探究母羊出生年度、季节、胎次、泌乳阶段4个固定效应对西农萨能奶山羊产奶性状的影响。以西北农林科技大学萨能羊原种场2006-2018年的645只泌乳母羊为研究对象,每月采集乳样1次,采样日早、晚各采集1次,将两次乳样等比例混合后,采用乳成分分析仪测定乳脂率、乳蛋白率、乳糖率、总脂固形物、非脂固形物、密度、冰点和酸度共8个指标,结合羊场产奶量记录,采用固定效应模型,通过SAS 9.4软件进行表型的描述性统计分析,再采用GLM模型进行固定效应对产奶性状的影响分析。结果表明,西农萨能奶山羊平均300 d产奶量为507.67 kg,乳脂率为3.58%,乳蛋白率为3.20%,乳糖率为4.19%;总固形物含量为12.21%,非脂固形物含量为8.46%;出生年度、胎次对产奶量影响极显著（P<0.01）,出生季节对产奶量影响不显著（P>0.05）;泌乳阶段、出生年度对乳脂率等8个乳成分性状均有极显著影响（P<0.01）,胎次对除乳蛋白率和总固形物的其他6个乳成分指标均存在极显著影响（P<0.01）。综合以上试验结果,胎次及泌乳阶段是影响西农萨能奶山羊产奶性状的两种主要非遗传因素,第3、4胎母羊产奶性能最佳,泌乳早期的乳品质更优,揭示了对种群进行良种选育工作和羊饲养管理的重要性,也为后期进行奶山羊经济性状遗传评估和群体遗传改良提供理论基础。     

上海地区荷斯坦牛体型外貌与产奶性状的相关分析

体型外貌性状是奶牛重要的选种指标,是奶牛保持高产、稳产、健康长寿的关键所在。本研究的目的在于探寻上海地区荷斯坦牛体型外貌与产奶性状的相互关系。、随机选取上海市28个奶牛场总计871头第二泌乳期荷斯坦母牛作为研究对象,记录并测定其305d产奶量、乳脂率、乳蛋白率3个产奶性状,体型外貌性状采用9分制评分结果．利用相关分析方法确定体型总分及7个体型外貌性状与各产奶性状之间的关系,结果表明,体型总分与305d产奶量、乳脂率呈极显著正相关（P〈O．01）;体躯容量性状和产奶量呈极显著正相关：肢蹄性状与乳脂率、乳蛋白率呈极显著正相关,与产奶量显著正相关（P〈O．05）;尻部性状与乳脂率呈显著正相关．。最终得出肢蹄、体躯容量、尻部性状是影响荷斯坦牛产奶性状的最主要因素,体型外貌鉴定评分对于筛选高产、优质荷斯坦母牛及选种选配工作具有指导意义。     

中国荷斯坦牛乳房性状、体型总分与产奶性状的相关分析

研究利用武汉市58头公牛的971头女儿2006—2007年间的体型性状鉴定记录及2001—2007年间的生产性能测定记录,配合动物模型,采用REML方法进行参数估计,探讨了乳房性状、体型总分与产奶性状之间的关系。结果表明:乳房性状与产奶性状之间的表型相关较小。后乳房宽度与产奶性状之间存在强的遗传正相关(0.44～0.89)。后乳房高度与305 d产奶量(0.27)、305 d乳脂量(0.16)存在遗传正相关,而与305 d乳蛋白量(-0.32)存在遗传负相关。前乳房附着与产奶性状基本不存在相关。悬韧带与305 d产奶量存在遗传正相关(0.79)。乳房深度与305 d产奶量存在遗传负相关(-0.20)。体型总分与305 d产奶量、305 d乳脂量、305 d乳蛋白量存在较强的遗传正相关,故加强乳房性状和体型总分的选择对提高奶牛的生产性能有益。