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相似文献
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1.
相对Shannon信息量与基因变异的测量   总被引:18,自引:1,他引:17  
在shannon信息量的基础上,建立了相对纯合度信息量SJ'(A^2)、相对杂合度信息量SH'(A^2)和相对信息量S'(A^2)的概念,并赋予它们以遗传学意义。与纯合度J和杂合度H进行了理论比较,结果表明,二者在数量规律性上有很好的一致性,而各相对信息量有更好的性质。1-SH'主要反映基因的确定度,SH'(A^2)主要反映基因的变异度;S'(A^2)与K无关,它能反映群体的遗传变异程度,亦能比较  相似文献   

2.
非平衡群体基因变异Shannon信息量的测量方法   总被引:1,自引:0,他引:1       下载免费PDF全文
在 Shannon信息量的基础上 ,对非平衡群体建立了群体基因型相对信息量S′( G) ,纯合体相对信息量 S′J( G)和杂合体相对信息量 S′H( G)的概念 ,并赋予遗传学意义。与基因一致度 J和基因多样度 D的理论比较表明 ,二者在数量规律上有很好的一致性 ,但又是相对独立的指标体系 ,且相对信息量还有新的内涵。 S′( G)既能表征基因变异 ,又能反映基因型水平上的遗传变异 ,S′J( G)主要反映纯合体的遗传变异 ,S′H( G)主要反映杂合体的遗传变异。各相对信息量既可反映群体的遗传变异程度 ,又能比较不同位点间的遗传变异程度  相似文献   

3.
相对Shannon信息量与基因变异的测量   总被引:3,自引:0,他引:3  
在shannon信息量的基础上,建立了相对纯合度信息量S′J(A2)、相对杂合度信息量S′H(A2)和相对信息量S′(A2)的概念,并赋予它们以遗传学意义。与纯合度J和杂合度H进行了理论比较,结果表明,二者在数量规律性上有很好的一致性,而各相对信息量有更好的性质。1-S′H主要反映基因的确定度,S′H(A2)主要反映基因的变异度;S′(A2)与K无关,它能反映群体的遗传变异程度,亦能比较不同位点间的遗传变异程度。  相似文献   

4.
应用平均基因杂合度、Nei的基因分化系数(Gst)、Lewontin的Shannon信息测度及Wright的固定指数(Fst)对陕西境内2个山羊群体存在多态的血液蛋白位点的基因频率进行了遗传变异分析。研究表明:山羊群体的遗传变异主要是由系统内血液蛋白的多态现象造成,系统间的遗传差异仅在8%以下;平均基因杂合度是度量群体遗传变异的最适指标,而Gst、Shannon信息测度值及Fst均可用于剖析遗传变异在系统内及系统间的分布  相似文献   

5.
山羊群体血液蛋白位点遗传分化研究   总被引:7,自引:2,他引:5  
应用平均基因杂合度,Nei的基因分化系数,Lewontin的Shannon信息测试及Wright的固定指数对陕西境内2个山羊群体存在多态的血液蛋白位点的基因频率进行了遗传变异分析。研究表明:山羊群体的遗传变异主要是由系统内血液蛋白的多态现象造成系统间的遗传差异仅在8%以下;平均基因杂合度是度量群体遗传变异的最适指标,而Gst,Shannon信息测度值在Fst均可用于剖析遗传变异在系统内及系统间的分  相似文献   

6.
油松天然群体遗传结构的研究   总被引:7,自引:0,他引:7  
本文运用同工酶电泳技术对油松大配子体的遗传结构进行了研究,分析材料为油松大配子体,共检测了4个群体4个酶系统(GOT、MDH、GDH、ALP)的10个基因位点。结果表明,油松群体在这几个酶系统上的遗传变异水平中等偏低,4个群体多态位点百分率平均为56.7%,等位基因平均数为1.76,平均期望杂合度0.159;群体内纯合体不足,杂合体过量,大都处于非平衡状态;群体间的分化程度较低,4个群体的平均遗传距离为0.011;同工酶测定的总变异中,只有1%来自群体间,其余的变异均来自群体内个体间  相似文献   

7.
利用IBV全长S1基因特异性引物,以纯化的3个标准株M41、H52、T和6个地方分离株(QD、ZZ、GZ、GJ、DL和YC)的基因组RNA为模板,用RT-PCR方法扩增出预期大小约1.73kbcDNA片段,经BAMHI和HindⅢ酶切插入到质粒pUC18中,并在大肠杆菌JM83中实现了克隆。对6个分离株的S1基因PCR产物进行HaeⅢRFLP分析,表明QD、TJ属于M41基因型,ZZ和GZ与T基因  相似文献   

8.
东北红豆杉天然群体过氧化物同功酶的遗传多样性   总被引:1,自引:0,他引:1  
东北红豆杉天然群体内的多态位点比例(P) 为0 .67 ,平均杂合度( He) 为0 .333 ,居群遗传变异型为HT= 0 .444 和Gst = 0 .169 .即总的基因多样性83 .1 % 来自群体内,16 .9 % 来自群体间.取自黑龙江穆棱的群体遗传性远离其他群体,建议加强该群体与其他群体间的基因交流.  相似文献   

9.
对扬州市动物园和扬州平山堂养殖场梅花鹿遗传变异以及行为性状进行研究,旨在为梅花鹿及其它动物品种分子标记和行为性状研究提供参考.采用筛选的14对微卫星引物,通过计算基因频率、平均杂合度、多态信息量、有效等位基因数目等,评估其遗传变异.根据微卫星位点信息,结合行为数据观察,利用SPSS 11.5分析程序,将位点信息与行为性状进行相关分析.结果表明,动物园梅花鹿群体14对微卫星位点的平均期望杂合度为0.441,观察杂合度为0.354,平均多态信息量为0.332,各位点基因分化系数平均为0.231.平山堂梅花鹿群体平均期望杂合度为0.372,观察杂合度为0.300,平均多态信息量为0.303,各位点基因分化系数平均为0.149.微卫星位点和梅花鹿行为性状的最小二乘分析表明,TGLA53和BM4107位点对修饰行为有显著影响;2AL2位点对观望行为有显著影响;2AL13和Mber14位点对卧息行为有极显著影响;BM6506位点对反刍和其他行为有显著影响;BL42位点对取食和卧息行为有显著影响.不同基因型个体均值的多重比较表明,对于动物园群体,在TGLA53、BM4107、2AL2、2AL13及BM6506位点,不同基因型之间在行为性状上差异显著(P<0.05).对于平山堂养殖场群体,在TGLA53,CEH-5、2AL10、BM4107、Mb33、Mber710及BM3628位点,各基因型之间在一些行为性状上亦存在显著差异(P<0.05).微卫星标记是评估梅花鹿遗传多样性较好的方法,微卫星位点和行为性状存在一定的相关性,但有待于进一步分析验证.  相似文献   

10.
试验研究了寒地粳稻(DS2#)成熟胚为受体的JQ700型基因枪转化,寒地粳稻(DS3#)下胚轴愈伤悬浮细胞与细胞团为受体的农杆菌LBA4404共培养转化,以及寒地粳稻(DS2GG#)未受精胚囊为受体的花粉管通道等转化途径的初步尝试。结果首先在基因枪转化途径上得到突破——成功地将NPTⅡ基因、GUS基因及抗虫基因(B.t)的DNA片段导入寒地粳稻(DS2#)成熟胚。以GUS基因组织化学法检测外源基因的表达,结果转化水稻细胞的短暂表达为阳性。经过一系列组织培养过程,诱导获得了绿色转基因水稻植株,取其叶片进行外源基因的稳定遗传与表达检测,结果GUS基因组织化学检测亦为阳性,Olympus倒置显微镜镜检结果——转基因水稻(DS2#)植株叶片的叶脉等维管组织中GUS基因表达更强烈。本文只是对转化途径进行研究,关于B.t基因的整合与表达的检测工作正在进行中  相似文献   

11.
【目的】从分子遗传学角度分析不同基因型迪庆藏猪群体不同组织中ADFP基因的表达差异,为迪庆藏猪的选育工作提供参考依据。【方法】利用PCR扩增测序方法对113头迪庆藏猪ADFP基因进行扩增测序,利用DNA-STAR 5.0对序列进行比对分析及多态性位点(SNPs)检测;同时利用实时荧光定量PCR方法对迪庆藏猪不同组织中ADFP基因相对表达量进行检测,并运用SPSS 20.0分析ADFP基因多态性对迪庆藏猪群体不同组织中ADFP基因表达水平的影响。【结果】在迪庆藏猪ADFP基因外显子6上发现3个SNPs,分别为SNP1(C→T)、SNP2(C→T)和SNP3(T→ C),其中SNP1和SNP2位点属于低度多态(PIC/He<0.25),SNP3位点属于中度多态(0.25He<0.5)。迪庆藏猪不同组织中ADFP基因相对表达量存在显著差异(P<0.05,下同),皮下脂肪中相对表达量最高,其次为肺脏、肝脏、脾脏、肾脏、腿肌和背肌,心脏中相对表达量最少;另外,ADFP基因SNPs不同基因型迪庆藏猪群体中各组织的相对表达量也存在显著差异,尤其在SNP2位点杂合基因型群体肾脏中相对表达量显著高于纯合基因型群体肾脏中相对表达量,表明ADFP基因SNPs变异对迪庆藏猪组织中ADFP基因表达具有影响。【结论】ADFP基因SNPs变异对迪庆藏猪组织中ADFP基因会产生差异表达,进而影响机体脂肪沉积,ADFP基因可作为迪庆藏猪肌内脂肪沉积的候选基因。  相似文献   

12.
用划痕标记染料示踪技术(SLDT)观察了几种植物水提取的混合液-罗甘口服液对香烟烟雾凝聚物(CSC)抑制V79细胞间隙连接通讯功能(GJIC)的影响。研究结果证实40ug/ml以上剂量CSC可阻断GJIC功能。0.5~12.5mg/ml剂量罗甘口服液对GJIC无抑制作用。预加罗甘口服液对CSC阻断GJIC功能起保护作用,表明罗甘口服液可抑制CSC的促癌作用。  相似文献   

13.
根据收集的亚洲10国70个家牛群体血红蛋白位点的基因频率,剖析了各家牛总群体的遗传分化程度。结果表明:总群平均基因多样度、基因分化系数、Shannon信息测值及固定指数,都反映出孟加拉国和印度尼西亚两国牛总群体的遗传分化程度较大,印度牛总群体的遗传分化程度较低。各总群的遗传变异来源在亚群内与亚群间分布不同,各总群的等位基因纯合度与其平均有效等位基因数呈明显的反变关系。  相似文献   

14.
林木基因型与地点最佳组合选择的研究   总被引:1,自引:5,他引:1  
分析了林木多点测定线性模型中主要分量的选择意义,提出了同时利用基因型效应值(G)、基因型×地点互作效应值(GSI)和地点效应值(S)的林木基因型与地点最佳组合选择方法,比较了它与基因型选择和适地适基因型选择方法的优越性,并在毛白杨无性系多点测定中进行了应用.  相似文献   

15.
对39份长豇豆资源进行煤霉病抗性鉴定,并考查主要的农艺性状,分析农艺性状的遗传潜力。结果表明遗传力(hB^2)以荚长、插种至初花天数、单荚重3个性状最高;遗传变异系(GCV)以单株鲜荚产量、早期产量最大,而相对遗传进行度(RGS)则以早期产量、早比等5个性状最大。比较抗品种(R组)和感品种(S组),R组品种的农艺性状表现差,但遗传潜力较大。文章最后还进行了农艺性状的相关分析。  相似文献   

16.
陕西栓皮栎天然群体同工酶遗传多样性研究   总被引:2,自引:0,他引:2  
利用凝胶电泳法研究了陕西省境内3个栓皮栎天然群体的遗传变异和分化情况,测定和分析过氧化物酶(POD),酯酶(EST),苹果酸脱氢酶(MDH)和乙醇脱氢酶(ADH)的多态位点百分率、等位基因平均数、等位基因频率、平均期望杂合度和基因分化系数,结果表明:陕西栓皮栎天然群体的遗传变异绝大部分在群体内,占总变异的95.1%,群体间变异仅占总变异的4.9%,多态位点百分率为75%,等位基因平均数为2.708,平均期望杂合度为0.388.  相似文献   

17.
由栽培二粒小麦和沙融山羊草形成的双二倍体,再和高大山羊草一起,替换了普通小麦细胞质,形成代换系。这个代换系的后代携带两个新的Gc基因。C-带分析表明:一个基因位于高大山羊草5S'染色体或类似5S'的染色体上,而另一个基因,位于沙融山羊草的4S'染色体上。  相似文献   

18.
应用 PCR- Am p- FL P技术对 75例陕西正常老年人群、94例老年动脉粥样硬化 (AS)患者与 71例陕西正常青年人群的 YNZ2 2 - VNTR(可变数目串联重复序列 variable num ber tandem repeats)位点进行多态性分析。结果显示 ,在正常青年人群中 YNZ2 2位点共检测出 2 9种基因型 ,1 0个等位基因 ,其片段大小在 1 6 8~ 938bp,杂合度为 70 .4 % ,多态信息量 (polym orphism inform ation content,PIC)为 0 .84 ;老年人群中 YNZ2 2基因点共检测出 2 0种基因型 ,9个等位基因 ,其片段大小在 1 6 8~ 798bp,杂合度为 2 4 % ,多态信息量 (PIC)为 0 .84 ,与青年群体的基因频率分布有显著差异 ;动脉粥样硬化 (AS)人群中 YNZ2 2基因点共检测出 2 3种基因型 ,9个等位基因 ,其片段大小在 1 6 8~ 72 8bp,杂合度为 2 4 .4 7% ,多态信息量为 0 .81。表明老年群体杂合度显著降低 ,最主要的是在基因型数目与大基因片段上老年群体与青年群体差异显著。 YNZ2 2位点多态性改变或不稳定可能是引起衰老的原因之一。  相似文献   

19.
嗜水气单胞菌胞外蛋白酶ECPase54的纯化及特性分析   总被引:31,自引:5,他引:31  
嗜水气单胞菌(Ah)J-1株的液体培养物上清在56℃或与乙二胺四乙酸(EDTA)或丝氨酸蛋白酶抑制剂苯甲基磺酰氟(PMSF)作用,其胞外蛋白酶(ECPase)的活力有不同程度的下降,将酪蛋白掺入丙烯酰胺聚合后,加Ah-J-1上清作SDS-PAGE37℃原位消化,染色,显示上清中存在至少5种分子量不同的蛋白酶,AhJ-1株的培养上清经硫酸铵沉淀,DEAE-纤维素离子交换层析和SephadexG-20  相似文献   

20.
利用30个微卫星标记,对乌珠穆沁羊、苏尼特羊、内蒙古细毛羊、宁夏滩羊、小尾寒羊和无角多赛特羊进行群体遗传分化研究。结果表明:6个群体总基因多样度(DT)为0.63,群体内基因多样度(DS)为0.56,群体间遗传分化系数(GST)为0.12,群体间遗传变异占总群体变异的12%,变异主要来自于品种内部;同属蒙古羊体系的国内5个绵羊群体彼此之间基因流(Nm〉5)较大,而与外来品种无角多赛特之间基因流(Nm〈5)较小。  相似文献   

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