淮南猪遗传特异性的RAPD分析

试验用150个10碱基随机引物对引入品种杜洛克猪、长白猪、大约克猪及河南地方品种淮南猪4个猪种基因组池DNA进行了RAPD分析。电泳检测结果发现,其中72个引物扩增出明显的多态性条带,共检测到911条扩增片段,其中多态性片段462条,占50.71%。统计分析结果表明,大约克猪与长白猪之间的遗传距离指数为0.0064,遗传关系最近;淮南猪与杜洛克猪、大约克猪遗传距离指数相近,分别为0.0068、0.0069,遗传关系较近;淮南猪与长白猪遗传距离指数为0.0072,遗传关系最远。结果显示,河南省地方品种淮南猪与其他引入品种之间有遗传的相似性,也存在差异,同时也证明了RAPD技术可以作为分子标记,很好地检测猪种群内的遗传变异及区分不同猪种的遗传检测方法。     

用RAPD技术研究9个家猪群体的遗传结构

利用RAPD技术对9个家猪群体的遗传多样性进行研究，包括13／17罗伯逊易位纯合子猪、易位杂合子猪及正常核型猪的3个群体、丹系长白猪群体、加系双肌臀杜洛克猪群体、加系双肌臀大约克猪群体、加系双肌臀长白猪群体、及欧洲猪与易位杂合子猪产生的2个杂交后备猪群体。用17条已筛选出的产生多态性的随机引物对模板DNA进行扩增，共得到384条清晰稳定的多态型片段，片段长度在200～4000bp之间。根据多态性结果计算出群体间的共有带率F及遗传距离指数D，并以此绘制出群体的亲缘关系树状聚类图，确定了它们间的亲缘关系。     

不同品种猪SLA-DQA、FUT1和MUC4基因遗传变异初析

为了解析地方猪种淮南猪抗逆性强的分子机制,试验采用PCR-RFLP方法对4个猪种(淮南猪、杜洛克猪、大白猪和长白猪共计395头)的猪耳组织白细胞抗原(SLA)-DQA基因、α-1岩藻糖转移酶基因1(FUT1基因)和4型黏蛋白(MUC4)基因进行多态性分析。结果表明:4个猪种在SLA-DQA基因座位存在多态性,AA型在4个猪种中基因型频率最高,淮南猪为中等多态,其他3个猪种为低度多态,淮南猪与长白猪、大白猪品种间基因型分布差异极显著(P0.01),淮南猪与杜洛克猪品种间基因型分布差异不显著(P0.05);FUT1基因座位也存在多态性,GG基因型在4个猪种中基因型频率最高,淮南猪、大白猪和杜洛克猪都是中等多态,长白猪是低度多态,淮南猪与长白猪品种间基因型分布差异极显著(P0.01),淮南猪与大白猪、杜洛克猪品种间基因型分布差异不显著(P0.05);MUC4基因座位同样也存在多态性,AA基因型在淮南猪、长白猪和大白猪中基因型频率最高,AG基因型在杜洛克猪中基因型频率最高,淮南猪和杜洛克猪都是中等多态,大白猪是低度多态,淮南猪与长白猪、杜洛克猪品种间基因型分布差异极显著(P0.01),淮南猪与大白猪品种间基因型分布差异显著(P0.05)。说明淮南猪在这3个基因上都有着较高的遗传多样性,更适合用于抗病育种研究的实践中。     

哈萨克羊、阿勒泰羊、巴什拜羊遗传多样性的AFLP分析

利用11对AFLP引物组合,检测了哈萨克羊、阿勒泰羊、巴什拜羊池DNA遗传变异,构建了各品种的AFLP DNA 指纹图谱,根据AFLP分析结果,统计了每个引物组合在各品种中检测到的多态性条带,计算了3个品种的遗传相似系数,并据此构建了UPGMA聚类关系图,分析了它们的遗传关系.结果表明:11对AFLP引物组合在3个地方绵羊品种中共检测到310条带,平均每个引物组合产生28.18条带,变化范围在25～34条,其中多态性条带32条,占扩增总带教的10.32%,每对引物平均扩增多态性带2.909条.品种间的遗传相似系数以哈萨克绵羊与阿勒泰绵羊的最高(O.699),哈萨克绵羊与巴什拜绵羊最小(0.592),聚类结果与这些羊的育成史、分化及地理分布一致.     

47个亚、欧、美洲野生、地方和培育猪群的AFLP多态性及群体遗传关系研究

采用双色荧光标记技术,检测21个中国地方猪类群、19个欧美商业猪类群、5个亚欧美野猪类群、1个中国培育猪种、1个杜洛克×中国野猪杂种群体总共47个类群基因组DNA池的AFLP多态性,22种引物组合产生312个AFLP多态标记。根据多态标记信息,计算47个类群间的遗传相似系数,并构建UPMGA聚类关系图。结果表明,中国地方猪、中国野猪与欧美商业猪群、欧美野猪间存在明显的遗传分化,提示中国地方猪起源于亚洲野猪,而欧美商业猪种由欧美野猪驯化而来。杜洛克猪、长白猪和大白猪不同类群间的遗传相似性较高,但也存在一定的遗传分化。南昌白猪与大白猪、PIC L95系与太湖猪有着很近的亲缘关系,真实反映了其育成历史。嘉兴黑猪与梅山猪、冠朝猪、藤田花猪、上犹花猪和万安花猪等地方猪群遗传关系的研究结果与其形态学、地理分布和现行分类情况相一致,认为AFLP技术是遗传多样性和群体遗传学研究的一项有效的技术手段。     

中国地方猪种微卫星和血清蛋白基因座的遗传多样性

采用FAO-ISAG联合推荐的27个微卫星DNA标记和8个常用血清蛋白多态性标记对55个中国地方猪品种和3个引入猪品种（杜洛克猪、长白猪、大白猪）进行遗传多样性分析。通过计算基因频率、平均遗传杂合度、多态信息含量,F-统计量、Hardy-Weinberg平衡检验和遗传距离并进行系统聚类分析,评估其种内遗传变异和种间遗传关系。以两种标记的联合聚类结果为基础。将55个中国地方猪种分为9类。探讨了各猪种之间的遗传关系,本研究为我国地方猪品种资源的保护和合理利用提供了科学的依据。     

二花脸猪和杜洛克猪的RAPD分析

利用６０个随机引物对二花脸猪（太湖猪的一个类群）和杜洛克猪的基因组ＤＮＡ进行ＲＡＰＤ分析,其中４８个引物可扩增出清晰的ＲＡＰＤ带型,８个引物可扩增出多型式片段。一个引物（ＯＰＢ１３）可在两品种间扩增出一条稳定的重复性好的多态片段,其大小约为１８９０ｂｐ。结果表明,二花脸猪、杜洛克猪群内遗传距离指数分别为０．０３７１、０．０３４５,遗传多样性指数分别为０．４８６、０．４３１,两品种间存在着ＤＮＡ分子     

新疆6个地方绵羊品种遗传多样性的AFLP分析

本试验旨在从分子水平研究绵羊品种之间的遗传多样性,为科学评价新疆地方绵羊种质资源提供依据。利用筛选出的8对E+3/M+3引物,对6个地方绵羊品种基因组DNA进行AFLP扩增。根据AFLP分析结果,统计了每个引物组合在各品种中检测到的多态性条带和特异性条带,计算了6个绵羊品种的遗传相似系数和遗传距离,并构建了UPGMA聚类关系图。结果表明,8对引物组合共得到334条清晰可辨条带,平均每个引物组合产生41.75条多态性标记,多态性条带为103条,多态位点百分率为30.838%,同时各品种中还检测出特异性条带。通过UPGMA聚类分析,将6个地方绵羊品种种群划分为2类。因此,6个地方绵羊品种均得到较丰富的遗传多样性,其遗传相似系数和聚类结果与各绵羊品种的地理分布及现实状况相吻合。     

地方鸡种与隐性白羽鸡遗传变异的AFLP指纹

利用6对AFLP引物组合对我国12个地方鸡种和引进鸡种隐性白羽鸡进行了遗传检测,统计了每个引物组合在各个品种中检测到的多态性条带和特异性条带,计算了13个鸡种的遗传相似系数和遗传距离,并据此构建了UPGMA聚类关系图,分析了所研究鸡种的遗传关系.结果表明:6对AFLP引物组合在13个鸡种中共检测到290条多态性条带,平均每个引物组合产生48.3奈多态性标记,同时在每个品种群体中还检测到了数量不等的特异性条带,其中寿光鸡和东乡黑鸡最多,为9条,旧院黑鸡、兴义矮脚鸡和隐性白羽鸡最少,为1条.13个鸡种聚为4类,其中隐性白羽鸡单独聚为一类,鸡种间的遗传相似系数及聚类结果与各个鸡种的地理分布、现实状况相吻合,从而表明AFLP指纹用于我国地方鸡种的遗传多态性分析、品种鉴定及品种间亲缘关系分析是可行的.     

广西5个猪种和国外3个猪种mtDNA D-loop序列遗传多样性及进化分析

为了比较广西猪种和国外3个猪种的遗传资源多样性和进化关系,利用文献报道的1对引物测定了广西5个地方猪种(巴马香猪、东山猪、桂中花猪、陆川猪、环江香猪)共85个样本的mtDNA D-loop序列,结合已报道的国外3个猪种(杜洛克猪、大约克猪和长白猪)的45条mtDNA D-loop序列,进行单倍型、遗传多样性和系统发育树分析。结果表明,8个群体样本的130条序列共定义38种单倍型;广西各猪种之间遗传距离较小,远小于其与国外猪种杜洛克猪、长白猪间的遗传距离;构建的NJ分子系统进化树将所分析样本分为2个独立的支系:一支包含了所有广西地方猪种和部分大约克猪的单倍型,另一支则全部是3个国外猪种的单倍型,广西猪种和3个国外猪种有着两个明显不同的母系起源。陆川猪在系统树上分布较为紧密,其他4个猪种都很分散,表明陆川猪母源血统单一,其他4个猪种母源血统遗传背景比较复杂,彼此之间有基因交流。广西猪种母系资源没有受到国外引进猪种资源的影响,在其开发利用中依然适合用作母本。     

不同猪种肉质相关基因Hal、RN和FTO的多态性研究

为了明确肉质相关基因氟烷基因(Hal)、酸肉基因(RN)和脂肪肥胖相关基因(FTO)在国内外不同猪种群体间的遗传变异特性,本研究以大约克、长白、杜洛克和金华猪等猪种群体为研究对象,应用PCR-RFLP技术分别检测了Hal、RN和FTO基因的多态性,并分析了FTO基因上2个多态位点g.276G＞T和c.594C＞G的遗传变异情况.结果表明:(1)在杜洛克猪中发现了Hal的基因型HalN Haln,其频率为0.166,但未发现基因型Haln Haln,其它猪种群体中仅检测到了基因型HalN HalN;(2)在已检测的所有猪种群体中只检测到RN基因的rn/rn基因型,未发现rn/RN和RN/RN基因型;(3)在FTO的g.276G＞T位点上,金华猪呈现单态,其它猪种群体均呈现多态.在FTO的c.594C＞G位点上,4个猪种群体均呈现多态,3个外来猪种群体均以CC基因型频率较高,而金华猪则以GG基因型频率较高.研究结果提示,由于Hal基因在养猪生产中的利弊双重性,因此在某些猪种群体中仍然存在较高频率的HalN Haln基因型.此外,结合FTO基因的生理功能和已有的研究结果,可在特定的猪群中将其作为影响猪肉质性状的候选基因.本研究发现FTO的基因型分布在我国优良地方猪种金华猪与国外3个种猪群间存在较大差异,为深入研究不同品种猪的肉质形成机理提供了基础数据.     

猪PLSCR4基因外显子区PCR-RFLP遗传多态性分析

本研究利用PCR-RFLP技术对我国6个地方猪种、中国野猪以及杜洛克、约克夏和长白3个国外猪品种,共307头猪的磷脂爬行酶基因(PLSCRs)外显子区的遗传变异进行了研究。结果表明:PLSCR4第7外显子处存在T68C的同义突变,第8外显子处存在G4A的错义突变;在T68C突变位点处,杜洛克、约克夏、长白猪、二花脸、五指山和民猪6个猪群优势等位基因为T,荣昌和野猪群体中优势等位基因为C;在G4A突变位点处,杜洛克、约克夏、长白猪、二花脸、五指山和民猪群体中优势等位基因为G,藏猪、荣昌、金华及野猪群体中优势等位基因A。     

部分引进猪种α1-岩藻糖转移酶基因多态性研究

本研究采用PCR RFLP技术对4个引进猪种杜洛克、约克夏、长白猪和皮特兰共计122头猪的FUT1基因进行了多态性分析。结果表明：4个猪种在该FUT1基因座位存在多态性，但抗性基因型AA仅在杜洛克和皮特兰猪中分布。卡方检验结果表明，长白猪与皮特兰间FUT1基因基因型分布差异极显著，长白猪与杜洛克猪之间差异显著，约克夏与皮特兰间差异也显著。     

品种、季节、胎次、采精月龄及采精间隔对猪精液品质的影响

【目的】探究品种、公猪出生胎次、公猪同窝仔猪数、公猪乳头数、采精季节、采精月龄和采精间隔对猪精液品质的影响,以及不同品种对精液质量稳定性的影响。【方法】选取909头杜洛克、长白、大白种公猪为试验群体,收集2021年4月至2022年4月27 408条精液测定记录,采用混合线性分析模型和方差分析探究品种、公猪出生胎次、公猪同窝仔猪数、公猪乳头数、采精季节、采精月龄和采精间隔对精液体积、精液密度、精子活力、直线前进运动精子比例、精子畸形率、总精子数及各精液性状稳定性的影响。【结果】从不同品种对精液品质的影响来看,长白猪精液体积和总精子数均显著高于大白猪、杜洛克猪(P<0.05),杜洛克猪精液密度显著高于大白猪和长白猪(P<0.05),杜洛克猪、大白猪精子活力均显著高于长白猪(P<0.05),大白猪直线前进运动精子比例显著高于长白猪和杜洛克猪(P<0.05),长白猪和大白猪精子畸形率均显著低于杜洛克猪(P<0.05);从不同公猪出生胎次对精液品质的影响来看,1～3胎出生的公猪具有较高的精液品质;从不同采精季节对精液品质的影响来看,精液密度、精子活力和总精子数秋、冬...     

The Genetic Diversity and Phylogenetic Relationships of Five Guangxi Pig Breeds and Three Exotic Pig Breeds by Analysis of mtDNA D-loop Sequences

In order to compare the genetic diversity and phylogenetic relationships between Guangxi pig breeds and three exotic pig breeds,one pair of primers was used to amplify 85 mtDNA D-loop sequences of five Guangxi pig breeds (Bama Xiang pig,Dongshan pig,Guizhong spotted pig,Luchuan pig,Huanjiang Xiang pig),and we downloaded 45 mtDNA D-loop sequences of three exotic pig breeds (Duroc,Yorkshire,Landrace) from GenBank.Then the haplotype,genetic diversity and phylogenetics analysis were carried out.The results showed that 38 haplotypes were identified in 130 sequences,and the mean distances among Guangxi pig breeds were smaller than that among Duroc,Landrace and Guangxi pig breeds.The NJ phylogenetic tree classified all samples into two clusters.One contained all of Guangxi pig breeds and partial Yorkshire,the other was composed wholly of exotic pig breeds,which mean there were two distinct maternal origins.In the cluster of Guangxi pig breeds,Luchuan pig were clustered,and the others were rather dispersive.It indicated that Luchuan pig had simple maternal bloods,and the other breeds had complex maternal bloods,and they had gene flow with each other.The maternal pig resources in Guangxi were not affected by the introduction of exotic pig breeds,and they were still suitable for use as a female parent in their development and utilization.     

不同猪种ESR基因多态性的PCR-RFLP分析

运用PCR-RFLP方法,检测了杜洛克、约克夏、长白猪、皮特兰、梅山猪、二花脸猪、枫泾猪、荣昌猪、苏太猪等9个国内外猪种的ESR基因PvuⅡ位点多态性。结果表明,在约克夏猪、二花脸猪、枫泾猪和苏太猪中检测到了AA、AB、BB 3种基因型,在杜洛克猪、皮特兰猪中检测到AB、BB 2种基因型,在长白猪、梅山猪、荣昌猪中只检测到了AB基因型。在本研究中不同品种的A、B基因频率差异显著,总体上在国外猪群体中A等位基因为优势等位基因,而地方猪种中B等位基因为优势等位基因。     

品种及杂交组合效应对育肥猪猪肉羟脯氨酸和pH值的影响

通过对不同品种及杂交组合氟烷基因显性纯合子育肥猪肌肉中羟脯氨酸和pH值2个指标的测定,来分析品种及杂交组合效应对猪肉质的影响。试验结果表明,品种及杂交组合效应对猪肉的嫩度有影响。在屠宰后的前4 d大长猪(大白猪×长白猪)猪肉中羟脯氨酸含量低于长大猪(长白猪×大白猪),说明其嫩度要好于长大猪;猪肉离体后pH值先下降后上升。随着冷藏时间的延长,长白猪和大白猪猪肉pH值的升高速度要比杜洛克猪、长杜猪(长白猪×杜洛克猪)、长大猪、大长猪的速度要慢,说明长白猪和大白猪肉的货架期较长。长白猪与大白猪正反交,对肌肉pH值影响差异不显著(P>0.05)。     

13/17罗伯逊易位纯合子、杂合子猪及3个引进品种核仁组成区(Ag-NORs)的多态性

对 1 3/ 1 7易位纯合子猪、杂合子猪及杜洛克、长白、约克夏猪的核仁组成区 ( Ag-NORs)的多态性作了研究 ,结果表明 ,杜洛克、约克夏猪 Ag-NORs定位于 8号和 1 0号染色体的次缢痕区 ,而 1 3/ 1 7易位纯合子猪、1 3/ 1 7易位纯合子猪×约克夏猪 F1代 Ag-NORs的遗传方式符合孟德尔定律 ;Ag-NORs在细胞间、个体间及品种间数目均有差异 ,而且品种差异显著大于品种内个体间差异。 1 3/ 1 7易位纯合子猪、杂合子猪 ,以及长白、杜洛克、约克夏猪 Ag-NORs均数分别为 1 .99、1 .98、2 .0 0、2 .0 5、2 .0 6,说明 Ag-NORs在品种、个体及细胞间具有多态性。这种多态性与猪的起源和杂交育种时所用亲本品种的血缘成分有关 ,因此可作为遗传标记 ,用以分析家畜的亲缘关系     

Heritability of susceptibility to scrotal herniation in swine

Data on 5,711 Duroc-sired, 2,227 Landrace-sired, and 2,494 Yorkshire-sired male pigs born over a 9-year period were used to evaluate the genetic influence on scrotal herniation. Differences in frequency of this defect among boar breeds (Duroc, Landrace, and Yorkshire) were significant (P less than 0.01). Differences among sires within the Duroc and Landrace boar groups were significant (P less than 0.001 and P less than 0.05, respectively), but differences within the Yorkshire group were not significant. Frequency of scrotal hernia among male full siblings of affected males was consistently higher than the overall frequency of the defect among progeny in each of their respective breed of boar groups. Percentage of affected pigs among male full siblings of affected males for Duroc, Landrace, and Yorkshire groups, respectively, was 3.0, 3.0, and 2.7 times greater than the overall percentage affected in their respective breed groups. Heritability of susceptibility to scrotal hernia development was estimated to be 0.29 +/- 0.17, 0.34 +/- 0.23, and 0.34 +/- 0.19 in Duroc, Landrace, and Yorkshire-sired pig groups, respectively.