鸡THRSP α基因多态性与脂肪性状的相关性研究

THRSP（Thyroid Hormone Responsive Spot 14）在哺乳动物中是一种分子量较小的酸性蛋白质．由于该基因在肝脏、脂肪和乳腺等脂肪生成组织内表达,因此被认为该基因与脂肪生成相关．该研究利用杏花鸡与隐性白洛克鸡F2代全同胞个体资源群作为实验材料,利用琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶电泳技术检测了12个家系共439只个体THRSP α基因的基因型,对THRSP α基因与脂肪性状的相关性通过最小二乘法进行了系统分析．结果表明,THRSP α基因与脂肪带宽和腹脂重呈显著相关（p〈0.05）,由此可以认定该基因与腹脂性状密切相关,该基因可以作为研究腹脂性状的候选基因用于优质鸡的辅助育种中．     

鸡THRSP α基因多态性与脂肪性状的相关性研究

THRSP(Thyroid Hormone Responsive Spot 14)在哺乳动物中是一种分子量较小的酸性蛋白质. 由于该基因在肝脏、脂肪和乳腺等脂肪生成组织内表达,因此被认为该基因与脂肪生成相关. 该研究利用杏花鸡与隐性白洛克鸡F2代全同胞个体资源群作为实验材料,利用琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶电泳技术检测了12个家系共439只个体THRSP α基因的基因型,对THRSP α基因与脂肪性状的相关性通过最小二乘法进行了系统分析. 结果表明,THRSP α基因与脂肪带宽和腹脂重呈显著相关(p＜0.05),由此可以认定该基因与腹脂性状密切相关,该基因可以作为研究腹脂性状的候选基因用于优质鸡的辅助育种中.     

THRSPα基因多态性与鸡肉质、屠体及脂肪性状的关联分析

THRSP(甲状腺激素应答蛋白Spot 14)是在甲状腺素诱导下在肝脏中表达的一类小分子酸性蛋白质,主要在肝脏、腹脂和乳腺等脂肪生成组织内表达,因此THRSP基因被认为与脂肪生成相关。本研究利用杏花鸡与隐性白洛克鸡F2代全同胞个体资源群作为试验材料,检测了12个家系共439只个体的THRSPα基因的多态性,对THRSPα基因与肉质、屠体和脂肪性状的相关性通过最小二乘法进行了分析,结果表明该基因与脂肪带宽和腹脂重呈显著相关(P<0.05)。     

THRSPα基因多态性及其与鸭脂肪性状的相关性研究

从分子遗传学角度出发,在鸭THRSPα已获基因全长的基础上,选择合适的突变位点,将部分突变位点在随机群体中的多态性与肉鸭随机群体各性状进行关联分析。结果表明,8bp插入缺失位点缺失型纯合子DD型个体数极少,但DD型个体的腹脂重和腹脂率显著低于II和ID型个体;SacI位点无AA基因型,该位点与皮下脂肪厚性状有显著相关性。     

湛江三黄鸡2个脂肪性状相关基因的多态性及其与屠宰腹脂性状的相关分析

以102只湛江三黄鸡为材料,采用PCR-RFLP方法,分析FA SN基因和A-FA BP基因的多态性对其中30只个体进行屠宰测定以分析基因型与屠宰性状间的相关性.研究结果表明,HaeⅢ酶切扩增的FASN基因,检测出多态,B等位基因频率0.7828,明显高于C等位基因,基因频率分布态势与红色原鸡相同,而与多个培育鸡品种不同.HinfⅠ酶切A-FA BP基因,检测到突变,A等位基因频率0.9559,占绝对优势.基因型与屠宰和腹脂性状的相关分析表明,FASN基因位点为CC基因型鸡的腹脂率最低,而屠宰率以BB基因型鸡较高.     

KDR等6个基因多态性与鸡生长和体组成性状的相关研究

以东北农业大学高、低脂肉鸡双向选择品系第14世代群体(NEAUHLFG14)和AA肉鸡商业随机群体(AA群体)为试验材料,利用PCR-RFLP对鸡腹脂性状的全基因组关联分析(GWAS)鉴定出6个多态位点进行单核苷酸多态性(SNPs)检测,分析这些位点的多态性与鸡生长和体组成性状的关系。结果表明,在NEAUHLFG14中KDR基因的rs14483313位点多态性对腹脂重(AFW)和腹脂率(AFP)有显著影响(P<0.05),TUSC3基因的rs13548811位点对鸡后期体重有影响,EXOC1基因的GGaluGA263078位点在两个群体中都对7周龄体重(BW7)有显著影响(P<0.05)。TUSC3、PPAT、EXOC1和KIAA1211基因的突变位点对NEAUHLFG14极低密度脂蛋白(VLDL)浓度有显著影响(P<0.05),结果显示,6个基因可能是影响鸡腹脂性状的重要基因,但多态位点是否为功能性位点仍需进一步验证。     

鸡FABP基因多态性研究

采用PCR-RFLP方法对金水乌鸡、武定鸡、湖北红鸡、青脚麻鸡、矮黄鸡和隐性白羽肉鸡6个品种共计360只鸡的FABP基因进行多态性分析,选用HhaⅠ、HaeⅢ、HinfⅠ、BamHⅠ、EcoRⅠ和PstⅠ6种限制性内切酶对PCR产物进行单酶切,结果发现HhaⅠ-RFLP具有多态性,有AA和AB两种基因型,该基因座频率分布经独立性χ2检验,结果表明,蛋用品种湖北红鸡与其他品种间存在显著或极显著差异,群体中B基因频率占明显优势;矮黄鸡与隐性白羽肉鸡2个肉用品种鸡与其他品种间也存在显著或极显著差异,这2个品种的优势基因为A基因。     

ACOX3基因多态性对鸡体脂沉积的影响

文章通过分析酰基辅酶A氧化酶（Acyl-Coenzyme A Oxidases 3,ACOX3）基因单核苷酸多态性与鸡脂肪性状的关系,旨在了解该基因对鸡体脂沉积的影响。以东北农业大学高、低脂双向选择品系肉鸡为材料,采用PCR-RFLP方法检测ACOX3基因的多态性,并分析该基因多态性与鸡脂肪性状的关系。结果表明,ACOX3基因c.-228C>T突变位点在肉鸡高、低脂双向选择品系第10、11世代混合群体中,对腹脂重、腹脂率和血浆VLDL浓度有显著影响（P<0.05）;c.-442A>C突变位点在第8-11世代混合群体低脂系中,对腹脂重有显著影响（P<0.05）;c.27035A>G突变位点在第10、11世代混合群体低脂系中,对血浆VLDL浓度有显著影响（P<0.05）;c.16802C>T突变位点在第11世代低脂系中,对腹脂重、腹脂率有显著影响（P<0.05）。结果显示,ACOX3基因对鸡的体脂沉积有重要影响。ACOX3基因c.-228C>T突变位点对鸡脂肪性状有显著影响,可以尝试作为遗传标记对脂肪性状进行分子标记辅助选择。     

猪FATP1基因5'调控区多态性及其与脂肪性状的相关分析

脂肪酸转运蛋白1(Fatty acid transport protein 1,FATP1)是脂肪酸转运蛋白家族(FATPs)的一员,具有促进脂肪细胞吸收利用长链和极长链脂肪酸的功能,在脂肪沉积过程中发挥着重要的作用.采用直接测序法寻找FATP1基因5'调控区+64～-723 bp片段的单核苷酸多态性,在-586 bp处发现了一个T→C突变SNP(单核苷酸多态性)座位,利用PCR-RFLP的方法检测它在3个试验猪群体中的基因型,发现该座位在皮特兰和金皮F2代猪群中存在多态性,而在金华猪中仅表现为FATP1g-586T FATP1g-586T基因型.建立混合模型方程组分析该座位对188头金皮F2代猪脂肪性状的效应,结果显示,猪FATP1基因第-586座位的不同基因型与肩背膘厚、6～7肋背膘厚、最后一根肋骨处背膘厚、平均背膘厚和板油重显著相关(P＜0.05),表明FATP1基因5'调控区的第-586位上的T→C突变对猪脂肪沉积有一定的影响.     

MC4R基因多态性与鸡生长和体组成性状的相关研究

黑素皮质素受体4(melanocortin4receptor,MC4R)是G蛋白偶联受体(GProteincoupledreceptors,GPCRs)超家族的一个成员,在人和鼠的体重、能量稳态和采食量的调控中具有重要作用。实验以东北农业大学建立的高低脂双向选择肉鸡品系为研究材料,采用PCR-SSCP和测序方法检测MC4R基因编码区的SNPs,结果在编码区发现1个G315T的突变。最小二乘分析表明,该位点基因型在高低脂系6世代中与7周龄体重、屠体重呈显著相关(P<0.05),多重比较显示,AA型个体的7周龄体重、屠体重显著高于AB型的个体(P<0.05);在高低脂系8世代中基因型与1、5、7周龄体重、屠体重、胸肌重、胸肌率显著相关(P<0.05),多重比较结果表明,AA型个体的5、7周龄体重、屠体重、胸肌重显著高于AB型和BB型个体(P<0.05)。由结果可初步推测MC4R基因可能是影响鸡早期生长和肌肉性状的主效基因或与主效基因相连锁。     

类胰岛素生长因子Ⅱ(IGF2)基因多态性与鸡体脂性状的相关研究

 以肉鸡和3个地方品种(北京油鸡,石岐杂,白耳鸡)以及海兰蛋鸡为试验材料,用1对引物对类胰岛素生长因子Ⅱ(IGF2)基因的外显子2进行SNPs检测,探讨IGF2基因作为影响鸡脂肪性状候选基因的可能性。利用测序和单链构象多态(SSCP)的方法进行SNPs检测和基因型的分析。X2检验表明,139处点突变的基因型在各品种间差异极显著(P<0.01)。3种基因型与肉鸡屠体性状的最小二乘分析结果表明,BB基因型个体的腹脂重和腹脂率显著低于AB基因型的个体。初步推断IGF2基因可能是影响鸡脂肪性状的主效基因或与主效基因连     

不同冠型鸡H-FABP基因单核苷酸多态性与脂肪性状的关联分析

以H-FABP为候选基因设计8对引物,采用PCR-SSCP技术对单冠、玫瑰冠、豆冠、胡桃冠4种不同冠型鸡H-FABP基因进行多态性分析,探讨H-FABP基因各位点对不同冠型鸡腹脂质量、IMF性状的影响。结果表明,8对H-FABP基因引物中有6对具有SNP多态,而且6对引物均仅检测到A和B两个等位基因,4种冠型鸡的B基因在H-89、H-110、H-775位点中为优势基因,A基因在H-274、H-1910位点中为优势基因,4种冠型鸡的基因杂合度、多态信息含量均在0.5以下,H-FABP基因对单冠鸡、玫瑰冠鸡和胡桃冠鸡3种冠鸡的腹脂质量、IMF有极显著或显著影响,可作为这3种冠型鸡腹脂质量和IMF选育的候选基因。     

肉鸭PLIN基因PCR RFLP多态性与胴体、脂肪性状关联分析

研究PLIN基因外显子2和内含子2多态性与肉鸭部分产肉性状的关系。以361只北京鸭(Z2系、Z4系、Z2×Z4杂交系)和樱桃谷鸭为材料,利用PCR-RFLP方法和测序技术,对PLIN基因外显子2和内含子2进行SNPs位点检测,并对SNPs位点与部分产肉性状进行关联性分析。结果显示,在外显子2检测到C→T突变,分析表明,樱桃谷鸭群体中,胴体质量、全净膛质量和腹脂质量分数在CC和CT型之间差异极显著(P<0.01),腹脂质量和皮脂质量分数在CC和CT型之间差异显著(P<0.05);北京鸭Z4系群体中,全净膛质量在TT型与CC、CT型之间差异显著(P<0.05);北京鸭杂交系群体中,全净膛质量在CC和CT型之间差异显著(P<0.05)。在内含子2检测到C→T突变,分析表明,北京鸭Z4系群体中,全净膛质量在EE和DE型之间差异极显著(P<0.01),EE和DD型之间差异显著(P<0.05);北京鸭杂交系群体中,胸肌质量在DD和DE型之间差异极显著(P<0.01),皮脂质量分数在DD和EE型之间差异显著(P<0.05)。说明PLIN基因单核苷酸多态性对肉鸭胴体、脂肪性状有一定的影响,可作为影响胴体和肉质的候选基因,指导优良肉鸭品种的选育工作。     

THRSP基因C184T突变与秦川牛肉质性状相关性的研究

 【目的】研究秦川牛THRSP基因第一外显子184 bp处C/T错义突变与部分肉质性状的关系。【方法】选取405头相同饲养条件下无亲缘关系的18～20月龄的秦川牛,利用PCR-SSCP技术对THRSP基因进行个体基因型分析;运用SPSS统计软件中的GLM模型分析该SNP与93头秦川牛部分肉用性能指标的相关性。【结果】该位点引发THRSP基因第51个氨基酸由缬氨酸（GTG）变为丙氨酸（GCG）。多态信息含量为0.3583,属于中度多态,杂合度为0.4676,有效等位基因数为1.8783。卡方检验显示该位点处于Hardy-Weinberg不平衡状态（P＜0.01）。相关分析结果显示,该位点基因型与嫩度和系水力2个性状显著相关。多重比较结果显示,AA基因型个体的嫩度显著高于AB型（P＜0.05）,BB基因型个体的系水力显著高于AB型（P＜0.05)。【结论】这一位点可能是影响牛肉嫩度及系水力的主效QTN或与之紧密连锁,可做为肉牛肉质选育的候选分子标记。     

鸡HMG box蛋白1(HBP1)基因启动子区多态性与腹脂率关联分析

为探讨HMG box蛋白1(HMG box protein 1,HBP1)基因启动子区多态性对鸡腹脂率的影响,以东北农业大学高、低脂双向选择品系第十九世代肉鸡为试验材料,采用直接测序法检测HBP1基因多态性和个体基因型,共获得168个SNPs位点基因型.应用滑动窗口法对位于该基因启动子区54个多态性位点构建单倍型,分别...     

脂联素基因c.249 C>T突变对京海黄鸡部分主要经济性状的影响

以京海黄鸡为试验材料,采用PCR-SSCP技术,探讨脂联素基因第一外显子和部分第一内含子碱基突变对屠宰和母鸡产蛋性状的遗传效应。结果表明,脂联素基因c.249位C>T突变的3种基因型(AA、AB和BB)对京海黄鸡的活体质量、半净膛率、胸肌质量、腿肌质量、胸肌率和腿肌率差异均不显著(P>0.05)。BB型个体的300日龄产蛋数和66周龄产蛋数显著高于AB型个体(P<0.05)。BB型个体的腹脂质量和腹脂率显著高于AB和AA型个体(P<0.05)。Adipo基因座对京海黄鸡开产日龄,300日龄产蛋数,300日龄蛋质量和66周龄产蛋数的主效应指数(MEI)均小于1.21,而其对公母鸡的腹脂质量主效应指数(MEI)分别为8.68和7.40。说明该基因可能是调控脂肪沉积的主效基因或与主效基因连锁。     

猪PPAR基因多态性与脂肪性状相关的初步研究

以长×长×梅和长×大×二两个含 2 5 %太湖猪血统的杂交猪群为试验材料 ,用PCR -SSCP法检测了猪PPAR基因 ,结果在长×长×梅中发现AA、BB、AB三种基因型 ,在长×大×二猪中只发现AA和AB两种基因型。本研究还将 3种基因型与背膘等屠体脂肪性状进行方差分析 ,结果表明 :除肌内脂AA型高于AB型和BB型外 ,其他的脂肪性状AB型猪较其他型猪略高 ,但差异不显著。这提示我们 ,PPARγ1 基因中Met5 9Val突变也许并不适合作为猪的脂肪性状的候选基因 (遗传标记 ) ,或者需要在该基因的其他位置寻找新的单核酸多态性位点 ,继续探索PPAR基因对猪脂肪性状的影响。     

鸡Ghrelin基因C2100T位点与生长和脂肪性状的相关性

选取鸡Ghrelin基因C2100T多态位点,利用PCR-RFLP结合测序技术,对全同胞资源家系470只F2代家鸡进行基因型检测及标记-性状关联分析,并利用已有的mRNA测定数据分析该多态位点与Ghrelin基因mRNA表达量的关系.结果:(1)经PCR-RFLP检测出3种基因型,测序结果证实C2100T是形成酶切多态性的原因;(2)QTDT检验显示,C2100T与鸡1、6、9周龄体重和皮下脂肪厚度显著相关(P＜0.05),并且不同基因型个体性状平均值大小关系为CC＞CT＞TT;C2100T与其他生长性状和脂肪性状均没有显著相关性;(3)不同基因型个体腺胃中的Ghrelin基因mRNA表达量差异不显著,但含C等位基因个体的mRNA表达量相对T等位基因高.试验结果表明,鸡Ghrelin基因C2100T多态性与鸡的部分生长和脂肪性状存在显著相关性,且C等位基因有利于鸡的体重增长和皮下脂肪沉积.     

嗜乳脂蛋白基因外显子7多态性及其与奶牛产乳性状的相关性研究

采用PCR-RFLP对奶牛嗜乳脂蛋白基因的第7外显子进行了扩增,并用HaeⅢ进行酶切,产生了2个等位基因A(331+170 bp)和B(295+201 bp).分析不同基因型对个体乳脂率、乳蛋白、乳糖、干物质和305 d产奶成年当量等生产性能的影响.结果表明:AA基因型和A等位基因的频率分布在所试的4个群体巾都较高(>60%),从基因型奶牛的乳脂率、乳蛋白含量显著高于BB基因型(P<0.05),同时乳固形物含量和乳糖的含量也高于BB基因型,但不存在显著性差异;另外,AA 基因型奶牛的305 d产奶成年当量则显著低于BB基因型(P<0.05).对305 d成年当量、乳脂率、乳蛋白质含量、乳干物质含量和乳糖含量A基因的加性效应分别为-M5.34 kg/,胎次、0.07%、0.09%、0.09%和0.07%,A等位基因的显性效应分别为187.72 kg/胎次、0.007%、0.08%、0.04%和0.04%.