凉山半细毛羊3号染色体遗传连锁框架图的构建

研究基于四川凉山半细毛羊资源参考家系,选取位于绵羊3号染色体的9个多态微卫星位点,共275个个体,构建了凉山半细毛羊3号染色体的遗传连锁框架图。结果表明:9个位点等位基因数目为3~9个,杂合度为0.404~0.766,多态信息含量为0.378~0.738。构建的3号两性平均遗传连锁框架图的总长为339.7cm,与USDA图谱位点顺序一致,图谱总长较USDA长。可在此基础上增加标记和群体样本数构建更精细的遗传连锁图,并对具有重要经济性状的基因座进行精细定位。     

家鸡豆冠基因定位的研究

构建家鸡1号染色体短臂部分连锁图谱及豆冠冠型基因的定位。通过测交选择豆冠冠型基因型纯合的2只吐鲁番斗鸡(♂)和6只玫瑰冠鸡(♀)为亲本,采用F2代试验设计建立F2代494只,依据己公布的家鸡遗传连锁图谱,分别在1号染色体上筛选了13对微卫星标记,运用MapMaker/EXP 3.0和MapDraw 2.1软件绘制遗传连锁图谱,并结合记录的表型性状值对冠型性状进行定位分析。经卡方检验F2代冠型符合9∶3∶3∶1的遗传定律。在连锁分析中除MCW0007位外,其余12个微卫星座位在试验群体中均表现较高的基因杂合度和多态信息含量。对冠型性状进行初步的分析,结果显示,MCW0428、ADL0319、LEI0174和MCW0058标记位点LOD值＞3,表明这4个微卫星位点与豆冠冠型基因存在连锁关系,其中LEI0174与豆冠基因遗传距离最近为0.12 cM。     

牛X染色体的辐射杂交图（BTAX）

本研究构建了一个详尽的牛X染色体辐射图谱，其含有微卫星和表达基因在内的20个新标记。以5000rad处理90个杂交细胞系，构建了全基因组辐射杂交板。各个标记的保留频率范围从XIST基因的7％～8％到TGLA325基因的31．1％。在6．0 LOD分数标准下把所有位点定位在5个连锁群中，从X染色体标记分析连锁图可以看出连锁群包含重复的微卫星位点，因此，这些连锁群可以被相应定位。这张RH图和牛细胞遗传图的标记序列是一致的。因此，牛与人的比较图谱包括5个区段的基因，而且其序列是保守的(虽然其反向在带有长短臂的染色体模式图中不同)，3个区段的颠倒解释了2个X染色体全 部基因顺序的差异。     

肉用绵羊2号染色体GDF8区域4种微卫星标记多态性研究

选择了2号染色体GDF8区域可能与生产性能相关性较大的4个高度多态微卫星基因座 （BM81124，TEXAN2，FCB128，BMS1591），分析这些位点在 Dorset、Suffolk和Texel 3个肉羊品种的多态分布情况。结果表明，这4个微卫星标记在3个绵羊品种中的等位基因数分别为:10、12、7、11，其多态信息含量/杂合度分别为:0.7778/0.8045、0.712/0.7520、0.7551/0.7852、0.8057/0.8289，可见这些微卫星位点在3个绵羊品种中具有比较丰富的多态性。因此它们可以作为进行生产性状与标记间连锁分析的遗传标记，用于进一步的QTL定位研究。     

绒山羊X染色体7个微卫星标记的遗传连锁图谱的构建

本研究利用内蒙古白绒山羊的7个父系半同胞家系共794个个体,用X染色体上的7个微卫星标记进行了系谱确认,构建了绒山羊X染色体遗传连锁图。结果表明,7个标记的等位基因数变化范围为9～14,杂合度在0.585～0.918之间,平均杂合度为0.726;多态信息含量在0.759～0.897之间,平均多态信息含量为0.834。构建的内蒙古白绒山羊X染色体遗传连锁图总长度139.4 cM,与英国罗斯林研究所公布的SM4.7绵羊连锁图标记顺序一致,可用于下一步的QTL定位研究。     

Booroola羊Fec^B基因图谱研究进展

从美利奴绵羊中衍生出来的Booroola羊携带增加排卵数和产羔数的一个常染色体突变基因（Fec^B)。该位点已被定位到绵羊6号染色体上。新西兰研究小组已经克隆了额外标记并且绘制了绵羊6号染色本和Fec^B位点的连锁图谱，还构建了绵羊的酵母人工染色体文库，并开始筛选文库来鉴别跨越Fec^B区间的大量DNA克隆。这些将被用来定位突变，并阐明突变如何增加Booroola绵羊的排卵数。     

8区域4种微卫星标记多态性研究

 选择了2号染色体GDF8区域可能与生产性能相关性较大的4个高度多态微卫星基因座 （BM81124，TEXAN2，FCB128，BMS1591），分析这些位点在 Dorset、Suffolk和Texel 3个肉羊品种的多态分布情况。结果表明，这4个微卫星标记在3个绵羊品种中的等位基因数分别为:10、12、7、11，其多态信息含量/杂合度分别为:0.7778/0.8045、0.712/0.7520、0.7551/0.7852、0.8057/0.8289，可见这些微卫星位点在3个绵羊品种中具有比较丰富的多态性。因此它们可以作为进行生产性状与标记间连锁分析的遗传标记，用于进一步的QTL定位研究。     

家兔分子遗传研究进展

1　家兔核基因组研究进展随着分子生物学技术的快速发展 ,家畜基因组分析已逐渐成为广大动物遗传育种学家研究的前沿 ,其目的是将各物种的全部遗传物质尽可能详细地描述 ,并制成遗传连锁图谱 ,标明各基因位点和标记位点在染色体上的相对位置、排列顺序 ,为确定这些遗传位点间如何相互作用提供遗传基础。相对来说 ,对猪、牛、绵羊、鸡等畜禽的基因组研究较多。到 1 998年 6月 30日 ,英国罗斯林研究所基因组数据库中牛的基因位点数为 2 338个 ,微卫星标记为 1 2 85个 ;绵羊的基因位点数为 1 2 1 6个 ,微卫星标记为 584个 ;猪的基因位点数为 1 …     

青海高原牦牛遗传多样性研究

以中心产区简单随机抽样在青海省西宁市共抽取青海高原牦牛76头,用垂直平板聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）和水平淀粉凝胶电泳技术检测21个编码血液蛋白（酶）结构基因座及12个微卫星位点的多态性,并进行中性检验及连锁不平衡分析。结果表明：在所检测的21个血液蛋白基因座中,有6个存在多型,多态位点百分比为28．57％,12个微卫星位点全部为多态,共检测出63个等位基因;两层次标记所反映的群体内遗传变异水平均较低,21个血液蛋白基因座平均有效等位基因数、观察杂合度、期望杂合度和多态信息含量分别为1．118、0．0665、0．0729和0．0603,12个微卫星位点相应指标分别为2．9005、0．4138、0．5325和0．4903;除Alp外,其余5个血液蛋白多态基因座和12个微卫星位点均为中性基因。除Alp-CA、LDH1-ADH两对血液蛋白基因座和8对微卫星显著（P〈0．05）或极显著（P〈0．01）处于连锁不平衡状态外,其余13对血液蛋白基因座和58对微卫星均处于连锁平衡状态（P〉0．05）;另外,6个血液蛋白多态基因座、12个微卫星位点或是两者的合并数据从群体水平上均处于连锁平衡状态（P〉0．05）。     

绒山羊11号染色体7个微卫星标记的连锁图谱的构建

本试验利用内蒙古白绒山羊5个家系中的632个个体,用11号染色体上的7个微卫星标记,构建绒山羊11号染色体遗传连锁图。结果表明,7个标记的等位基因数变化范围为8~14,杂合度在0.5886~0.9348之间,平均杂合度为0.8612,各标记的多态信息含量在0.7712~0.8990之间,平均多态信息含量为0.8472。构建的遗传连锁图总长度127.7 cM,其中标记ILSTS028与INRA108间距最大,为41.2 cM;ILSTS049和INRA131间距最小,为5.1 cM。     

SLC11A1基因在山羊中的染色体定位和遗传变异研究

溶质载体家族11成员A1(SLC11A1)基因与抗传染病有关。试验对6个品种427只山羊进行染色体定位、相应的功能结构域和3′非翻译区(3′-UTR)微卫星的遗传变异研究。通过双色荧光原位杂交,将SLC11A1定位于山羊2号染色体上;同时运用单链构型多态性筛查了SLC11A1外显子2、10和15的多态性。结果发现,在各山羊品种中,SH3结合基序、蛋白激酶C磷酸化位点或2个N-连接糖基化位点没有变异。外显子15的变异是由于存在两个微卫星多态性。山羊3′-UTR的上游GT重复(GTn)的基因分型结果显示有8个等位基因(GT11、GT12、GT14-GT19),但缺失GT13(牛中存在)。大多数山羊都有等位基因GT16,但没有等位基因是一个品种独有的。遗传分化系数为0.084。微卫星在山羊的遗传连锁分析中是DNA的信息标记。     

3个纯系商品肉鸡MHC微卫星标记的遗传多样性研究

分析了3个纯系商品肉鸡MHC和非-MHC位点的遗传多态性。用Southern杂交技术检测MHC-Ⅰ型和Ⅳ型位点，并判定RFLP的基因型。在这些肉鸡品系中，检测到4种MHC一Ⅱ型和8种Ⅳ型基因型，它们的基因频率不同。检测了各个品系的特异性MHC基因型。杂合度(59％～67％)显示这些品系的MHC位点具有高度的多态性，MHC位点至少9％的遗传变异是由品系差异引起的。为了检测非-MHC基因，对这3个品系肉鸡非MHC基因组上41微卫生位点进行研究，结果发现它们的微卫星位点存在遗传变异；每个位点等位基因数范围为1～8个。每个品系的平均等位基因数分别为3．5、2．8、3．1。座位的杂合度范围为0％～89％。通过对固定指数(Fst)的分析，发现该基因微卫星座位的遗传差异19％是品系间差异造成的。对MHC和非-MHC座位进行Hardr-Weinberg平衡定律检验，结果2个位点处于连锁不平衡。这可能是由遗传选择或非等位基因存在造成的。本研究主要阐明了商品代肉鸡的群体分子遗传特性和遗传结构。MHC和非-MHC位点的研究结果表明：肉种品系仍具有丰富的遗传多样性，可为继续提高肉鸡的生产性能提供有用的基因资源。     

湖羊保种群和商品群遗传多样性的微卫星分析

为了了解实施湖羊保种措施后群体遗传多样性状况,试验根据绵羊6号染色体遗传图谱和多胎FecB基因有关资料,选择位于绵羊FecB基因附近的6个微卫星位点(BMS2508、LSCV043、300U、GC101、Bulge5、471U)作为标记,分析其在湖羊保种群和普通商品群以及带有湖羊血统的中国美利奴肉用多胎品系杂交群中的遗传多样性。结果表明:6个微卫星位点均为多态性位点,在3个绵羊群体中分别检出34个、33个和29个等位基因,其中21个等位基因为3个群体所共有;平均多态信息含量分别为0.5054,0.4559,0.5329;保种群的有效等位基因数、遗传多样性和杂合度等均高于普通群,表明湖羊保种群具有较高的基因多样性。结果说明湖羊保种效果显著,但同时应加强稀有频率基因的保护。     

绵羊微卫星标记与部分毛用性状的关系研究

根据GenBank在绵羊1、6号染色体上选取了14个微卫星基因座，对被测绵羊群体所有的表型数据资料按基因型分组进行方差分析和多重比较，得出结论：ILSTS004、OarAE101、OarJMP8和BM1434个微卫星标记可以对羊毛自然长度性状进行标记；BM1824，BM6438和BM6506可以对羊毛细度进行标记。在绵羊6号染色体上的OarAE101、BM143和OarJMP83个位点之间或附近存在控制羊毛自然长度的QTLs；在绵羊第1号染色体的BM1824，BM6438和BM6506区域可能存在控制羊毛细度的QTLs。     

绵羊第6号染色体微卫星标记的研究进展

微卫星标记是目前应用广泛的分子遗传标记技术,其在绵羊遗传育种中有着十分重要的作用。通过国内外对绵羊第6号染色体微卫星标记的研究结果进行分析,发现绵羊的多胎性状、体重性状、产毛性状密切相关,微卫星标记主要分布在第6号染色体上,而且第6号染色体上丰富的微卫星标记有利于评定绵羊的亲缘关系及遗传多样性,对于指导绵羊品种选育及遗传多样性评价具有重要的指导意义。     

利用14个微卫星标记分析新疆北疆绵羊群体遗传多样性

研究利用14个微卫星标记,对新疆北疆9个绵羊群体的遗传多样性和系统发生关系进行了分析。结果表明:14个微卫星位点在9个绵羊群体中的多态信息含量(PIC)除BM1824、OarCP20为低、中度多态外,其余12个微卫星均为高度多态。绵羊群体的平均PIC为0.711,H为0.740,No为9.2,Ne为4.760。中国美利奴羊和新疆细毛羊与其他7个绵羊群体遗传距离较远;巴什拜羊与杂交F_1代、杂交F_2代和杂交F_3代遗传距离较远;哈萨克羊、阿勒泰羊、巴什拜羊和也木勒羊遗传距离较近;各绵羊品种与其来源、育成史和地理分布一致。     

凉山半细毛羊初生重QTL的研究

选取凉山半细毛羊7个父系半同胞家系,利用绵羊1号染色体上11个微卫星标记,通过聚合酶链式反应（polymerase chain reaction,PCR）对凉山半细毛羊初生重QTL进行了研究。QTL分析的结果表明,在其中一个家系B3K5055中,1号染色体微卫星标记ILSTS004与CSSM004之间检测到影响初生重的QTL,其LOD值为3.338,位于置信区间95%（2.73）和99%（3.49）之间。     

微卫星标记与考力代羊体重体尺性状遗传关系研究

本试验用单标记法研究考力代绵羊1号染色体ILSTS004~CSSM004和BM6506~MCM130之间的12个微卫星位点ILSTS004、MCMA008、MNS0094、CSSM004、BM6505、BMS4008、CSRD0298、TGLA415、BM8246、RM0509、URB0038、MCM0130,与其绵羊初生重、断奶重、体重(8月龄)、体高、体长、胸围、管围的遗传关系,结果ILSTS004位点不同基因型对初生重影响极显著(P<0·01)、对体重影响显著(P<0·05),CSSM004位点对体长影响显著(P<0·05),其余位点对体重等性状无显著影响(P>0·05)。其中,ILSTS004位点:基因型101099个体的初生重显著高于基因型095093(P<0·05),基因型101099个体的体重显著高于基因型103103(P<0·05);CSSM004基因型196196个体的体长显著大于基因型202202(P<0·05)。提示在1号染色体微卫星位点ILSTS004附近可能存在影响绵羊初生重、体重的数量性状位点(QTL),ILSTS004可作为其遗传标记之一;在CSSM004附近可能存在影响体长的QTL,CSSM004可作为其遗传标记之一。     

西门塔尔牛乳中体细胞数与微卫星标记的相关分析

本研究利用微卫星技术对中国西门塔尔牛育种核心群中的152头母牛第6号染色体上的9个微卫星位点进行检测，测定各位点的基因型。利用SAS程序中的GLM过程对8个微卫星位点进行体细胞数相关性的最小二乘方差分析，找出不同位点及各位点基因型对体细胞数的影响差异。     

微卫星标记BMS1714和INRA61在甘肃高山细毛羊中的遗传多样性研究

为了研究甘肃高山细毛羊的遗传多样性,为地方山羊品种的选种、选育及保种工作奠定基础.本研究选取位于绵羊第25号染色体上的微卫星标记BMS1714和INRA61,对其进行遗传多样性研究.结果表明:微卫星标记BMS1714和INRA61在甘肃高山细毛羊上呈现多态性.BMS1714基因座有10个等位基因,其片段大小在121～138 bp之间;BMS1714基因座多态信息含量(PIC)、有效等位基因数(Ne)、平均杂合度(He)分别为0.714,4.029,0.731.INRA61基因座有11个等位基因,其片段大小在279～292bp之间;INRA61基因座的PIC、Ne、He分别为0.776,5.127,0.809.由此表明,微卫星位点BMS1714和INRA61在甘肃高山细毛羊上均为高度多态位点,可用于甘肃高山细毛羊的遗传多样性分析.