口蹄疫病毒3C蛋白酶的结构及功能研究进展

口蹄疫病毒能引起牛、羊等偶蹄动物发生高度接触性的传染病口蹄疲,该病常常影响着全球畜牧业的发展.FMDV是小RNA病毒科口蹄疫病毒属的成员,口蹄疫病毒为单股正链RNA病毒,病毒基因组全长约8.5 kb,基因组分为5'非编码区、3'非编码区和一个开放阅读框(ORF).基因组的中部是一大的开放阅读框,编码一多聚蛋白,多聚蛋白在翻译的同时,经二级裂解后,形成3种病毒结构蛋白(VP0,VP3和VP1)和8种非结构蛋白(L,2A,2B,2C,3A,3B,3C和3D).其中3C全长639 bp,编码213个氨基酸.3C蛋白酶是小RNA病毒的共同裂解酶,在多聚蛋白成熟过程中起着极为重要的作用,且在抗病毒药物打靶方面具有一定研究价值.因此,对3C蛋白酶的结构及功能研究进展进行综述很有必要.     

鸡传染性法氏囊病TL株VP2基因克隆及部分特性分析

传染性法氏囊病病毒（Infectious Bursal Disease Virus IBDV）是引起禽免疫抑制性疾病的一种主要病原体，属于双链RNA病毒科，禽双节段RNA病毒属成员。其基因组由两个节段dsRNA（A、B）构成，大片段A长约3．4kb，编码一条多聚蛋白，该蛋白随后裂解为VP2、VP3和VP4。小片段B长约为2．9kb，编码VP1。其中VP2携带宿主保护性抗原决定簇，具有至少两到三个中和性抗原位点，可以诱导产生保护性中和抗体，并且有血清型特异性。Ⅰ型IBDV毒株的VP2cDNA核苷酸及相应氨基酸残基序列中，共同存在着一个高度可变区（AccⅠ～SpeⅠ）含有两个亲水区和一个七肽区。     

我国猪博卡病毒的流行现状及检测技术

<正>猪博卡病毒(PBo V)属于细小病毒科(Parvovirus)细小病毒亚科(Parvovirus)博卡病毒属(bocavirus),为无囊膜的单股DNA病毒,病毒粒子大小为25~30 nm,呈正二十面体结构。病毒基因组全长5.2 kb,编码3个主要的开放阅读框(ORF1~3),其中ORF1编码非结构蛋白NS1,ORF2编码衣壳蛋白VP1和VP2,     

猪库布病毒与检测方法的研究进展

猪库布病毒（Kobuvirus）属于微小RNA病毒科、库布病毒属,是无囊膜的单股正链RNA病毒,病毒粒子直径为30nm。基因组大小为8．2—8．3kb,含有一个大的开放阅读框,编码一个单一的多聚蛋白。这个多聚蛋白可裂解为3种结构蛋白（VP0、VP3和VP1）和7种非结构蛋白（2A～2C和3A-3D）。     

我国猪瘟病毒分子流行病学研究进展

猪瘟病毒(CSFV)属黄病毒科(Flavividae)瘟病毒属(Pestivinus)，它是一种有囊膜的单股正链RNA病毒，其基因组大小约为12.3kb，含有一个开放阅读框架(ORF)．它编码1个大的多聚蛋白，此多聚蛋白经病毒和宿主细胞酶的作用，形成4个成熟的结构蛋白，即农壳蛋白C和糖蛋白(Erns、E1、E2)，另外还包括至少7个非结构蛋白，其中E2是3种囊膜     

猫杯状病毒的分子生物学

猫杯状病毒（FCV）是猫的上呼吸道感染、口腔水疱性疾病及慢性胃炎等疾病的重要病原。该病毒具有典型的杯状病毒结构。其基因组为单股正链含polyA的RNA，全长约7．6kb，编码3个开放读码框（ORFs)。其中ORF1约5．3kb，编码1763个氨基酸（aa)的非结构蛋白；ORF2长约2．1kb，编码671aa的结构蛋白，ORF3位于基因组3‘末端，长320bp，编码106aa的蛋白。该病毒结构蛋白分子量为58－76kDa，分为6个区，各区具有特殊功能。非结构蛋白包括3C多肽，3C半胱氨酸蛋白酶和3DRNA依赖的RNA聚合酶样区等结构。FCV的基因工程疫苗研究已有一定的进并取得了相应的应用价值。FCV分子生物学的研究有助于研究该病毒的毒力和致病机理以及新型疫苗的研制。     

反向遗传学在猪繁殖与呼吸综合征病毒研究中的应用

<正>反向遗传学遵循"中心法则",在获得生物体基因组全部序列的基础上,通过对靶基因进行必要的加工和修饰,再按组成顺序构建含生物体必需元件的修饰基因组,让其装配出具有生命活性的个体^([1])。猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)为单股正链RNA病毒,基因组约为15 kb,有8个开放阅读框架(ORF),ORF1位于基因组的5′末端,编码病毒非结构蛋白,ORF2([1])。猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)为单股正链RNA病毒,基因组约为15 kb,有8个开放阅读框架(ORF),ORF1位于基因组的5′末端,编码病毒非结构蛋白,ORF2⁷位于基因组的3′     

猪繁殖与呼吸综合征病毒蛋白质研究进展

猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)是一种折叠的正义RNA病毒,属于动脉炎病毒科(Arteriviridae),尼多病毒目(Nidovirales)。除了动脉炎病毒科,尼多病毒目还包括冠状病毒科(Coronaviruses)。15.1~15.2 kb长的PRRSV基因组通过互相重叠的开放性阅读框编码蛋白质。ORF1a翻译过程中产生pp1a多聚蛋白。ORF1b表达产生了 pp1ab多聚蛋白。pp1a和pp1ab经病毒蛋白酶处理后又生成了14个非结构蛋白。一些非结构蛋白为蛋白酶(NSP1、NSP1β、NSP2和NSP4)、RNA-依赖性RNA聚合酶(NSP9)、解旋酶(NSP10)和核酸内切酶(NSP11)。ORFs2-5编码GP2-GP5,ORF6编码M,ORF7编码N蛋白。ORF2b完全包括在ORF2内,表达小的非糖基化E或2b蛋白。相当一部分的囊膜蛋白是nidoviruses所特有的,所有的结构蛋白都是感染所必需的。     

鸭甲肝病毒GX株全基因组序列测定及VP1蛋白生物信息学分析

为探讨鸭甲肝病毒(DHAV)GX株基因分型特点及主要衣壳蛋白(VP1)的生物学特性,本试验对其进行全基因组序列测定,并应用分子生物学软件将DHAV GX株与DHAV 3个血清型参考毒株进行序列比对分析。结果显示,其基因组全长7 800 bp,由5'和3'非编码区(UTR)和一个大开放阅读框(ORF)组成。其中,5'UTR和3'UTR的长度分别为652和369 bp;ORF长度为6 756 bp,编码2 251个氨基酸长的多聚蛋白,其编码产物至少有12个(VP0/VP3/VP1/2A1/2A2/2A3/2B/2C/3A/3B/3C/3D);在分类地位上DHAV GX株属于DHAV-3,其与DHAV-3参考株核苷酸、氨基酸同源性最高;与DHAV-3 FS株亲缘关系最近,在同一较小分支上。DHAV GX株结构蛋白VP1以第195—201、211—221位氨基酸区段为B细胞优势表位的可能性较大。提示,VP1基因可作为研制DHAV基因工程疫苗的优势候选基因。     

鹅细小病毒基因组结构特征研究进展

鹅细小病毒（Goose parvovirus,GPV）属细小病毒科,细小病毒属,由我国学者方定一1956年首次分离报道。GPV基因组约5 Kb,由左右2个完整的开放阅读框（open reading frame,ORF）组成：LORF（left ORF）和RORF（right ORF）。LORF编码非结构蛋白（nonstructural protein,NS）NS1和NS2,RORF编码VP1、VP2和VP3三种结构蛋白。本文针对近年来鹅细小病毒基因组结构特征的研究进展进行了综述。     

A组轮状病毒的基因组及其蛋白研究进展

轮状病毒基因组由11个片段组成,编码6种结构蛋白(VP1~VP4,VP6和VP7)和6种非结构蛋白(NSP1~NSP6)。文本对近年来A组轮状病毒基因组及其编码的结构蛋白和非结构蛋白的研究进展进行了综述。     

口蹄疫病毒的抗原结构学的研究进展

正口蹄疫病毒(Foot and mouth disease virus,FMDV)属于小RNA病毒科口蹄疫病毒属,完整的病毒粒子由衣壳包裹着单股正链RNA构成。FMDV基因组全长约为8.5 kb,主要分为5'端非编码区、编码区、3'端非编码区和多聚腺苷酸(poly(A))。5'端非编码区的5端共价连接病毒自身编码的非结构蛋白(VPg),而且还包含有S-片段、poly     

我国部分地区鸡贫血病毒全基因组核苷酸序列的比较与分析

鸡贫血病毒(Chicken anemia virus,CAV)是目前已知最小的动物病毒之一,为单股环状DNA,基因组长度为2.3 kb.CAV基因组单链有3个部分或完全重叠的开放阅读框(ORF),分别编码核衣壳蛋白VPl、相关蛋白VP2、细胞凋亡因子VP3 3种蛋白.至今发现的所有CAV毒株的抗原性都相同,均属于同一个血清型,但世界各地的CAV分离株之间毒力不同,基因组序列也存在一些差异.     

猪嵴病毒病原特性及检测技术研究进展

猪嵴病毒（porcine kobuvirus,PKV）是近年来在健康猪和腹泻猪粪便中新检测到的小核糖核酸病毒科嵴病毒属成员,可能引起猪的腹泻,对养猪业造成重大经济损失。研究发现,PKV广泛分布在猪中,在腹泻和临床健康猪中均已被检测到,阳性率从3.9%~100.0%各不相同。一个典型的PKV病毒粒子直径为30 nm,基因组全长为8 120 bp,包括1个含2 488个氨基酸的开放性阅读框（ORF）;PKV是典型的小RNA病毒科的基因组结构：1个5'非编码区,1个L蛋白,结构蛋白P1（VP0、VP3和VP1）,非结构蛋白P2（2A、2B和2C）和P3（3A、3B、3C和3D）,1个3'非编码区和1个Poly（A）尾巴。PKV的2B编码区存在30个氨基酸的缺失,VP1蛋白是小RNA病毒科变异最频繁的结构蛋白,其含有主要的抗原表位,可促进机体产生中和抗体。检测PKV的方法有反转录聚合酶链式反应（RT-PCR）、TaqMan探针实时荧光定量RT-PCR和逆转录环介导扩增（RT-LAMP）方法。作者对PKV的分类学、流行概况、基因组结构、遗传特性及检测技术等研究现状做一简要概述,以期为进一步研究及了解PKV提供参考。     

新型鸭肝炎病毒全基因组序列分析

为了解新型鸭肝炎病毒(DHV)基因组变异情况,本研究将广东地区分离到的1株,山东地区分离到的2株与1型DHV(DHV-1)无抗原交叉性的新型DHV(N-DHV)全基因组序列测定的结果进行了分析。结果表明,N-DHV基因组全长7786nt～7788nt,仅有一个ORF,其结构具有典型的微RNA病毒科病毒基因组特征。ORF编码一个2251aa的聚合蛋白,该蛋白经3Cpro切割产生3个结构蛋白(VP0、VP3、VP1)和8个非结构蛋白(2A1、2A2、2B、2C、3A、3B、3C、3D)。与其他N-DHV毒株及DHV-1的抗原性相关VP1蛋白氨基酸序列比对表明,3株病毒之间及与国内分离的N-DHVG株的同源性均在98%以上,与韩国N-DHV同源性均大于92%,与中国台湾地区N-DHV同源性为80.1%～80.9%,与DHV-1的同源性为76.9%～77.3%。3株病毒与韩国N-DHVVP1氨基酸差异位点主要集中在C-端的高变异区。依据微RNA病毒科人肠病毒属血清型分型标准,GD株、SD01株、SD02株与韩国N-DHV和G株属于同一血清型,而与DHV-1和中国台湾地区新型DHV属于不同的血清型。     

鸡传染性法氏囊病病毒VP3基因的克隆与原核表达

IBDV是一种无囊膜的双节段双股RNA病毒，属于双RNA病毒科（Birnaviridae），禽双链RNA病毒属（Avibirnavirus），IBDV基因组由A、B两个双链RNA节段组成，A节段编码VP2、VP3、VP4、VP5蛋白，B节段编码VPI蛋白。     

猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒主要结构蛋白基因在持续感染中的遗传变异分析

猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒(PRRSV)属套式病毒目、动脉炎病毒科、动脉炎病毒属的成员.PRRSV基因组全长约15 kb,为不分节段的单股正链RNA病毒,含9个开放阅读框(ORF),每个ORF都和前一个ORF有部分重叠,其中ORF5、ORF6和ORF7编码病毒的主要结构蛋白.     

猪瘟病毒抗原表位的研究进展

<正>猪瘟病毒(CSFV)是黄病毒科瘟病毒属成员,为单股正链RNA病毒,病毒核酸长约为12.3 kb,由5'-非编码区(5'-UTR)、一个开放阅读框(ORF)和3'-非编码区(3'-UTR)构成,开放阅读框编码3 898个氨基酸的前体蛋白,在合成过程中被病毒自身编码的或宿主细胞内的蛋白酶水解为4种结构蛋白和8种非结构蛋白,迄今为止发现与抗原相关的蛋白     

蓝舌病病毒基因产物及其生物学功能

蓝舌病病毒(bluetongue disease virus,BTV)是呼肠孤病毒科环状病毒属的双股RNA病毒,其核酸由3个大片段(L1～L3)、3个中片段(M4～M6)和4个小片段(S7～S10)等10个节段组成,分别编码7种结构多肽(VP1～VP7)和4种非结构多肽(NS1、NS2、NS3a、NS3b)。通过dsRNA基因组进行体外翻译,再根据各基因与所编码蛋白的关系,查明了各基因编码的蛋白质及其分子质量和功能。     

猪瘟病毒HL-LY地方株E2基因在毕赤酵母中的高效表达

猪瘟是由猪瘟病毒（CSFV）引起的危害养猪业的主要传染病之一，CSFV是以单股正链RNA为遗传物质的黄病毒科瘟病毒属成员。是一种致死性疾病，给养猪业造成了巨大的经济损失口。其基因组大小约为12．3～12．5kb，只含有一个大的开放阅读框架（ORF），编码一个3900个氨基酸的大多聚蛋白一，此多聚蛋白经病毒和宿主细胞的蛋白酶作用，可形成4个成熟的结构蛋白，即衣壳蛋白C和糖蛋白E0、E1、E2，另外还包括7个非结构蛋白一。